如何解决: EnrichR网站不响应？
如何解决: EnrichR网站不响应？
提问于 2019-08-20 16:55:47
我遇到了工作中的EnrichR，有什么解决方案吗？
install.packages("enrichR")
library(enrichR)
dbs <- listEnrichrDbs()
`EnrichR website not responding`
dbs <- c("GO_Molecular_Function_2015", "GO_Cellular_Component_2015", "GO_Biological_Process_2015" , "ChEA_2016" ,"KEGG_2016")
enriched <- enrichr(c("Runx1", "Gfi1", "Gfi1b", "Spi1", "Gata1", "Kdr"), dbs)
`EnrichR website not responding`或者，有没有什么快速的方法(不是一个接一个地)从Enrichr那里获得完整的富集表？
首先要感谢大家！
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2019-08-29 09:16:13
原始的@MaayanLab #Enrichr和服务器运行良好。#Enrichr最近被稍微修改了一下，这破坏了R包。R包是由@W_Jawaid独立开发的包装器，他最近修复了这个问题。请查看此帖子：https://github.com/wjawaid/enrichR/issues/21。2.0版和更早的版本有一个bug - Github现在提供的2.1版正在工作。它应该会在你加载包的时候测试网站。CRAN在8月份放假，所以2.1还没有到那里。
TL;DR
现在GitHub上可用的2.1版应该可以修复这个问题。install.packages("devtools") devtools：：install_github(“wjawaid/富R”)
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/57570038
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