我在path
上保存了一个现有的LMDB zarr存档(大约6 6GB)。现在,我想合并元数据以提高读取性能。
下面是我的脚本:
store = zarr.LMDBStore(path)
root = zarr.open(store)
zarr.consolidate_metadata(store)
store.close()
我得到以下错误:
Traceback (most recent call last):
File "zarr_consolidate.py", line 12, in <module>
zarr.consolidate_metadata(store)
File "/local/home/marcel/.virtualenvs/noisegan/local/lib/python3.5/site-packages/zarr/convenience.py", line 1128, in consolidate_metadata
return open_consolidated(store, metadata_key=metadata_key)
File "/local/home/marcel/.virtualenvs/noisegan/local/lib/python3.5/site-packages/zarr/convenience.py", line 1182, in open_consolidated
meta_store = ConsolidatedMetadataStore(store, metadata_key=metadata_key)
File "/local/home/marcel/.virtualenvs/noisegan/local/lib/python3.5/site-packages/zarr/storage.py", line 2455, in __init__
d = store[metadata_key].decode() # pragma: no cover
AttributeError: 'memoryview' object has no attribute 'decode'
我使用的是zarr 2.3.2
和python 3.5.2
。我有另一台运行python 3.6.2
的机器,在那里它可以正常工作。这可能与python版本有关吗?
发布于 2019-07-09 02:29:33
谢谢你的报告。应该用gh-452修复。请对其进行测试(如果可以)。
如果您能够分享更多关于为什么在您的案例中读取性能会受到影响的信息,那么了解这一点会很有趣。:)
https://stackoverflow.com/questions/56904331
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