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社区首页 >问答首页 >Python IOError:[Errno 5]输入/输出错误?

Python IOError:[Errno 5]输入/输出错误?
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Stack Overflow用户
提问于 2018-09-18 07:31:34
回答 2查看 39.1K关注 0票数 11

我在一个远程服务器上运行一个使用nohup的python脚本。

  • 首先,我使用VPN和SSH
  • 连接到远程计算机;其次,我使用以下命令运行python脚本:

nohup python backmap.py mpirun -np 48 &

python脚本包含以下行:

代码语言:javascript
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frame = []
file_in = open("Traj_equil_prot.pdb", "r")
for line in file_in:
    if line.startswith('TITLE'):
        frame.append(line[127:134])

import os
for fileNum in range(631, 29969):
    os.system("./initram-v5.sh -f Traj_equil_prot_frame" +  str(fileNum) + ".pdb -o Traj_equilprot_aa_frame" + str(frame[fileNum]) + ".gro -to amber -p topol.top")

脚本一整天都运行得很好。但现在它崩溃了,当我再次尝试重新启动它时,我得到了以下错误:

回溯(最近一次调用):文件"",第1行,in IOError: Errno 5输入/输出错误

该文件位于工作目录中。我再次尝试断开/连接,但仍然存在同样的问题。我不知道我错过了什么。有什么需要帮忙的吗?

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回答 2

Stack Overflow用户

发布于 2018-09-26 06:08:24

我也有同样的问题,我曾经使用下面的命令运行我的脚本:

代码语言:javascript
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python MY_SCRIPT.py &

脚本将在后台运行,输出将显示在终端上,直到您注销或退出。

通过注销,脚本仍然在运行,但是它的输出没有地方显示,因此,当脚本想要显示一些东西(例如,调用print)时,将会发生异常。

解决方案:

我已经将输出通过管道传输到实际终端显示之外的其他地方:

代码语言:javascript
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python MY_SCRIPT.py >/dev/null &

有关更多详细信息,请查看此链接:

https://stackoverflow.com/a/38238281/6826476

票数 20
EN

Stack Overflow用户

发布于 2018-09-18 08:08:48

我最终修复了这个问题,打开文件"file_in",修改它(例如,只需在注释行中添加一个点)并保存更改。

票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/52376942

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