我在一个远程服务器上运行一个使用nohup的python脚本。
nohup python backmap.py mpirun -np 48 &
python脚本包含以下行:
frame = []
file_in = open("Traj_equil_prot.pdb", "r")
for line in file_in:
if line.startswith('TITLE'):
frame.append(line[127:134])
import os
for fileNum in range(631, 29969):
os.system("./initram-v5.sh -f Traj_equil_prot_frame" + str(fileNum) + ".pdb -o Traj_equilprot_aa_frame" + str(frame[fileNum]) + ".gro -to amber -p topol.top")
脚本一整天都运行得很好。但现在它崩溃了,当我再次尝试重新启动它时,我得到了以下错误:
回溯(最近一次调用):文件"",第1行,in IOError: Errno 5输入/输出错误
该文件位于工作目录中。我再次尝试断开/连接,但仍然存在同样的问题。我不知道我错过了什么。有什么需要帮忙的吗?
发布于 2018-09-26 06:08:24
我也有同样的问题,我曾经使用下面的命令运行我的脚本:
python MY_SCRIPT.py &
脚本将在后台运行,输出将显示在终端上,直到您注销或退出。
通过注销,脚本仍然在运行,但是它的输出没有地方显示,因此,当脚本想要显示一些东西(例如,调用print)时,将会发生异常。
解决方案:
我已经将输出通过管道传输到实际终端显示之外的其他地方:
python MY_SCRIPT.py >/dev/null &
有关更多详细信息,请查看此链接:
发布于 2018-09-18 08:08:48
我最终修复了这个问题,打开文件"file_in",修改它(例如,只需在注释行中添加一个点)并保存更改。
https://stackoverflow.com/questions/52376942
复制相似问题