我有一个很大的,266个顶点的有向图。我想要拆分一些路径,这样我就可以使用构成它们的属性的数据在两个路径之间运行t检验或方差分析。问题是我想要处理边缘属性,特别是。我不知道该如何解决这个问题。
我正在研究的每条路径都有20或21个顶点,所以我也在考虑使用重复测量测试。
让我们使用这个:
inst2 = c(2, 3, 4, 5, 6)
motherinst2 = c(7, 8, 2, 10, 11)
km = c(20, 30, 40, 25, 60)
df2 = data.frame(inst2, motherinst2)
df2 = cbind(df2, km)
g2 = graph_from_data_frame(df2)
tkplot(g2)
假设我想创建一个数据帧,其中5-10和8-3作为数据帧,它们的边属性(km)作为行中的值。
所以它是这样的:
5-10 3-8
1 30 25
我该怎么做呢?有没有一种方法可以让我只指定我的根节点,并仅基于此来创建一个数据帧?即使是两个独立的ones...then,我也可以稍后再绑定。
发布于 2017-12-15 06:23:18
我不认为你真的需要事先把它转换成图表。您可以使用expand.grid
来获取所有可能的边组合,以便相互测试。
start <- 1
end <- 2
df3 <- df3[df3$isnt2 %in% c(start, end) | df3$motherinst2 %in% c(start, end),]
ind <- expand.grid(1:nrow(df2), 1:nrow(df2))
df3 <- data.frame(df2[ind[[1]], ], df2[ind[[2]], ])
现在,您可以子集到所需的开始和结束节点以进行测试。
发布于 2017-12-15 08:53:58
这就是你要找的吗?
inst2 = c(2, 3, 4, 5, 6)
motherinst2 = c(7, 8, 2, 10, 11)
km = c(20, 30, 40, 25, 60)
df2 = data.frame(inst2, motherinst2)
df2 = cbind(df2, km)
require(igraph);
g2 = graph_from_data_frame(df2)
让我们从名为g2
的igraph
对象开始。
# Store as dataframe
df <- with(as_data_frame(g2), setNames(rbind.data.frame(km), paste(from, to, sep = "-")))
df;
# 2-7 3-8 4-2 5-10 6-11
#1 20 30 40 25 60
注意,考虑到您是从dataframe
开始的,您也可以直接执行以下操作:
df <- with(df2, setNames(rbind.data.frame(km), paste(inst2, motherinst2, sep = "-")))
https://stackoverflow.com/questions/47822242
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