请避免替换以@开头的行
请避免替换以@开头的行
提问于 2019-04-10 17:23:05
我使用了sed 's/^/LP1-/'，但此命令还更改了以@开头的行。
@SQ SN:NbV1Ch16 LN:148804966
@SQ SN:NbV1Ch17 LN:145611047
@SQ SN:NbV1Ch18 LN:144482707
@SQ SN:NbV1Ch19 LN:137831541
@RG ID:OZBenth8_.fastp.fq.gz SM:OZBenth8_.fastp.fq.gz LB:OZBenth8_.fastp.fq.gz PL:ILLUMINA
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem OZBenth8_R1.fastp.fq.gz
HWI-ST945_0069:8:1101:1475:2032#NNNNNN 99 NbV1Ch07 110148523 60 100M = 110148853 430 CCAAAAAGCACAGCTGGACCAAACCGGCCCAAATATTGATAGCCGTCAGACTACGCCATGAGCGGAGTCCCCCAAGTTCGTTTGATAGAAAATTCAGGAC
CCCFFFFFHHHHHJJJJJJJJJJJHJJJJJJJJJJJJJIJJJIIJJJJJJJJHHHFFFDECEEDDDDDDDDDDDDACDEDDDDDDDEDDDDDDDDDDDDD NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:68 RG:Z:OZBenth8_.fastp.fq.gz
HWI-ST945_0069:8:1101:1475:2032#NNNNNN 147 NbV1Ch07 110148853 60 100M = 110148523 -430 AATCTTCTTCCAATTCCATGGCGGCCCAAAGTCACACGGCCTCTTCACTTTCTGAGGTTGCAAGAAGAACCACACAAAAAATATTGGGGGCTAAAATCCC
DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDEEEEC=FFFHHHJJJJJJJIJHGIJJIBJJJIIJJJIJJJJJFIHJHJJJJJJJJJJJJJHHHHHFFFFFCCC NM:i:1 MD:Z:54T45 MC:Z:100M AS:i:95 XS:i:65 RG:Z:OZBenth8_.fastp.fq.gz
HWI-ST945_0069:8:1101:1446:2101#NNNNNN 83 NbV1Ch16 133875416 44 100M = 133874965 -551 ATATGTCTTATTCTTCTTCGACGAGTTTCAATCTAAAATTCAGTCAAAACCAAGTCTAATCTTCACCAAAACCCCTCAAAATTGAGATATAAACTCCTAA
DDDDDD如何排除要更改的以@开头的行？
先谢谢你，
回答 3
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2019-04-10 17:24:30
您可以使用
sed 's/^[^@]/LP1-&/'在这里，^[^@]用^匹配行位置的开头，[^@]匹配除@之外的任何字符。LP-&将匹配替换为LP1-和与[^@]匹配的字符。
请参见online sed demo。
要同时修改空行，请使用$替换，即行尾锚点：
sed -E 's/^([^@]|$)/LP1-&/'或使用GNU sed的BRE POSIX：
sed 's/^\([^@]\|$\)/LP1-&/'Stack Overflow用户
发布于 2019-04-10 19:18:50
您可以在s命令前加上一个否定的地址：
sed -s '/^@/!s/^/LP1-/'Stack Overflow用户
发布于 2019-04-13 08:31:48
通过gnu sed，
sed 's/^([^@])/\1LP1-/'页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/55609068
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