问将任意目录分配给Maven/Gradle中的软件包

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我正在做一个结构不同寻常的项目。它不是由构建系统构建的，而是由IntelliJ IDEA集成开发环境构建的。我知道，这种方法通常是很差和脆弱的。但我不得不接受这一点。

IDEA的关键特性是能够将任意包分配到目录。我正在做的项目很大程度上依赖于这个功能(这个项目非常复杂和古老)。

我创建了简化的项目，只是为了说明。例如，可以将两个目录reports和database保留在com.mycompany.internal包中，并将com.mycompany.external包分配给rest目录：

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而在磁盘上，结构如下：

└───src
    ├───database
    ├───reports
    └───rest

据我所知，像Maven和Gradle这样的构建系统可以处理多个源根。例如，在Gradle中可以指定几个目录：

sourceSets {
    main {
        java {
            srcDirs 'src'
            srcDirs 'src1'
            srcDirs 'src2'
        }
    }
 }

但在Java内部，它需要以下层次结构(根据src包)：

└───src
    └───com
        └───mycompany
            ├───internal
            └───external

似乎没有办法改变Maven/Gradle的这种开箱即用的行为...嗯，我可以使用Ant作为替代(它非常灵活)，但这种方法太过迫切和乏味。或者我需要为Maven/Gradle编写新的插件来生成IDEA项目文件？