我有一些R代码可以在RStudio中完美地执行,但当我在cmd中运行它时,我得到了以下错误。
Installing package into 'C:/Users/Anish/Documents/R/win-library/3.5'
(as 'lib' is unspecified)
Error in contrib.url(repos, "source") :
trying to use CRAN without setting a mirror
Calls: install.packages -> contrib.url
Execution halted
我将我的包作为install.packages("plyr")
包含在我的代码中。我也尝试过在install.package
函数中使用repos和source。
发布于 2019-05-07 20:56:22
使用
install.packages('plyr', repos = "http://cran.us.r-project.org")
发布于 2021-08-09 02:28:11
原因很可能是因为RStudio对R进行了配置,以便它知道如何检查系统包,以及在本地不可用时从哪里下载它们,而从命令行看,R可能缺少该配置。从命令行检查R.home(component = "home")
。在返回的文件夹中查找类似Rprofile
的文件。在我的系统中,这一行被注释(sight):
$ grep -i "options(repos" /usr/lib64/R/library/base/R/Rprofile
# options(repos = c(CRAN="@CRAN@"))
在与我最初编写的计算机不同的计算机上重新运行R标记文档时,我遇到了同样的错误。为了修复它,我在文档的第一个R块中显式地设置了repos
选项,然后knitr
开始工作,而不是陷入这个错误。该错误意味着您的R会话正在尝试使用contrib.url包安装包,但是R-language选项没有告诉它从哪里获取包。
下面是我在Rmd文档的第一个R块中介绍的代码行。我是从https://github.com/eddelbuettel/littler/issues/23得到这个想法的。
options(repos = list(CRAN="http://cran.rstudio.com/"))
就包下载而言,这将使您从命令行获得与从RStudio环境更接近的行为。
我建议在您运行的脚本的顶部设置该选项。当然,最佳实践是根据您的期望配置R语言,并通过阅读how to customize R的R.profile文件与您的受众用户共享该配置。
https://stackoverflow.com/questions/55244209
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