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无法使用Sympy solve找到符号解决方案
EN

Stack Overflow用户
提问于 2020-09-25 19:30:29
回答 1查看 71关注 0票数 1

我正在研究一个描述分子荧光发射的动力学模型。

我能够通过实验测量四个参数:两个寿命(τ1,τ2),荧光量子产率(ϕf)和辐射率(kr)。

我的模型包含三个未知率: kMR、kRM和knr。我有一组包含所有这些值的三个方程,我想使用渐近来解决这三个未知数。

代码如下:

代码语言:javascript
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from sympy import *                                                                                                                                         
                                                                                                                                                            
kr, k1, k2, phi, kMR,kRM,knr = symbols('kr k1 k2 phi kMR kRM knr', real=True)                                                                               
                                                                                                                                                            
                                                                                                                                                            
#kr = 0.00014                                                                                                                                               
#k1 = 1/9                                                                                                                                                   
#k2 = 1/49                                                                                                                                                  
#phi= 0.005                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                            
Phi = kr/(kr+kMR-kMR*kRM/(kRM+knr))                                                                                                                         
X = kr + kMR                                                                                                                                                
Y = kRM + knr                                                                                                                                               
K1 = (X+Y+sqrt(X**2-2*X*Y+Y**2+4*kMR*kRM))/2                                                                                                                
K2 = (X+Y-sqrt(X**2-2*X*Y+Y**2+4*kMR*kRM))/2                                                                                                                
                                                                                                                                                            
solutions = solve([K1-k1,K2-k2,Phi-phi],(kMR,kRM,knr))                                                                                                      
print(solutions) 

如果我取消对测量值的注释,几秒钟内就会找到一个数值解。然而,我的测量很容易出错,所以我有兴趣探索整个解决方案空间,看看模型对每个参数有多敏感。我在不同的实验中也有不同的测量值。因此,我希望根据测量值获得kMR、kRM和knr的符号表达式。不幸的是,如果我运行它,它就不会收敛。

你能帮我得到我正在寻找的符号解吗?

谢谢!

EN

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2020-09-25 20:10:18

我不确定solve到底在做什么,但我建议你重写你的方程,不带平方根,你可以用unrad来做。例如,你的第一个方程是:

代码语言:javascript
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In [50]: K1 - k1                                                                                                                               
Out[50]: 
                                _____________________________________________________________________
                               ╱                       2                                           2 
      kMR   kRM   knr   kr   ╲╱  4⋅kMR⋅kRM + (kMR + kr)  - (2⋅kMR + 2⋅kr)⋅(kRM + knr) + (kRM + knr)  
-k₁ + ─── + ─── + ─── + ── + ────────────────────────────────────────────────────────────────────────
       2     2     2    2                                       2                                    

In [51]: from sympy.solvers.solvers import unrad                                                                                               

In [52]: unrad(K1 - k1)                                                                                                                        
Out[52]: 
⎛  2                                                                   ⎞
⎝k₁  - k₁⋅kMR - k₁⋅kRM - k₁⋅knr - k₁⋅kr + kMR⋅knr + kRM⋅kr + knr⋅kr, []⎠

应用这一点给出了一个多项式系统,其解可能是原始系统解的超集。

这给了我们:

代码语言:javascript
运行
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In [53]: eq1 = unrad(K1-k1)[0]                                                                                                                 

In [54]: eq2 = unrad(K2-k2)[0]                                                                                                                 

In [55]: solve([eq1, eq2, Phi-phi], [kMR, kRM, knr])                                                                                           
Out[55]: 
⎡⎛  k₁⋅k₂⋅φ                   k₁⋅k₂⋅(k₁⋅φ - kr)⋅(k₂⋅φ - kr)            k₁⋅k₂⋅kr⋅(φ - 1)      ⎞⎤
⎢⎜- ─────── + k₁ + k₂ - kr, ──────────────────────────────────, ─────────────────────────────⎟⎥
⎢⎜     kr                      ⎛                            2⎞                              2⎟⎥
⎣⎝                          kr⋅⎝k₁⋅k₂⋅φ - k₁⋅kr - k₂⋅kr + kr ⎠  k₁⋅k₂⋅φ - k₁⋅kr - k₂⋅kr + kr ⎠⎦
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原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/64063292

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