问在R Studio中运行散点图花费了很长时间

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这很正常，你不能期望通过在散点图上绘制超过1k或10k的点来获得良好的渲染效果(以及合理的渲染时间)。这就是所谓的“叠加”。您可以做什么:用geom_hex()或stat_density_2d()替换geom_point()

如果你特别需要散点图，我建议你试试rasterly。它将首先以一种智能的方式聚合以生成栅格，然后渲染输出。

尤其是如果要将图表导入到另一个文档中，则需要限制要显示的对象的大小和数量(对于矢量图像很重要)。

这真的取决于你使用的绘图库，但看看大小，你似乎绘制了大约100000个点，5秒对我来说并不太长。如果使用plot函数，下面是一些比较，可能会从以下来源获得帮助：Speed up plot() function for large dataset和https://www.r-bloggers.com/accelerating-ggplot2-use-a-canvas-to-speed-up-rendering-plots/。

我在我的笔记本电脑上运行了下面的代码，这是我得到的781.3 Kb的代码：

x <- seq(1, 1000, length.out = 100000)

system.time(plot(x))
    user  system elapsed 
    0.28    3.00    3.42 
system.time(plot(x,pch=20))
    user  system elapsed 
    0.45    5.81    6.31 
system.time(plot(x,pch='.'))
    user  system elapsed 
    0.13    0.92    1.09 

您可以看到，使用pch可以显著提高性能。