在ec2 (亚马逊)上使用RStudio进行群集时意外崩溃
在ec2 (亚马逊)上使用RStudio进行群集时意外崩溃
提问于 2019-05-02 17:30:14
我在ec2上使用RStudio时遇到崩溃，同时使用doSNOW包对当前32个内核进行集群。问题不断发生，RStudio和awslog中的日志显示以下问题：
The previous R session was abnormally terminated due to an unexpected crash. You may have lost workspace data as a result of this crash我尝试了在RStudio社区页面上找到的一种解决方法，如下所示：
rm -rf ~/.rstudio我重启了它，终止了RStudio很多次，但都没有用。我更改为一个更大的实例: r4.8xlarge，但也无法进行计算。
Apr 30 14:14:23 ip-172-31-46-102 rsession-rstudio[12984]: ERROR session hadabend; LOGGED FROM: rstudio::core::Error {anonymous}::rInit(const rstudio::r::session::RInitInfo&) /home/ubuntu/rstudio/src/cpp/session/SessionMain.cpp:563这是RStudio崩溃时的以下代码：
# Clustering using gower distance and hclust()
d <- sapply(1:nrow(data), function(i) gower_dist(data[i,], data))
d <- as.dist(d)
h <- hclust(d) # this causes error回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2019-05-02 18:13:23
问题解决了- hclust并不真正适合大数据。将其替换为flashClust不会再导致RStudio崩溃，并且计算成功。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/55949451
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