在向map
函数传递大参数时,我得到了一个IOError: bad message length
。我怎样才能避免这种情况?当我设置N=1500
或更大时出现错误。
代码是:
import numpy as np
import multiprocessing
def func(args):
i=args[0]
images=args[1]
print i
return 0
N=1500 #N=1000 works fine
images=[]
for i in np.arange(N):
images.append(np.random.random_integers(1,100,size=(500,500)))
iter_args=[]
for i in range(0,1):
iter_args.append([i,images])
pool=multiprocessing.Pool()
print pool
pool.map(func,iter_args)
在multiprocessing
的文档中,有一个引发IOError的函数recv_bytes
。会不会是因为这个原因?(https://python.readthedocs.org/en/v2.7.2/library/multiprocessing.html)
编辑如果我使用images
作为数值数组而不是列表,我会得到一个不同的错误:SystemError: NULL result without error in PyObject_Call
。稍有不同的代码:
import numpy as np
import multiprocessing
def func(args):
i=args[0]
images=args[1]
print i
return 0
N=1500 #N=1000 works fine
images=[]
for i in np.arange(N):
images.append(np.random.random_integers(1,100,size=(500,500)))
images=np.array(images) #new
iter_args=[]
for i in range(0,1):
iter_args.append([i,images])
pool=multiprocessing.Pool()
print pool
pool.map(func,iter_args)
EDIT2我实际使用的函数是:
def func(args):
i=args[0]
images=args[1]
image=np.mean(images,axis=0)
np.savetxt("image%d.txt"%(i),image)
return 0
此外,iter_args
不包含相同的图像集:
iter_args=[]
for i in range(0,1):
rand_ind=np.random.random_integers(0,N-1,N)
iter_args.append([i,images[rand_ind]])
发布于 2015-08-13 05:58:29
这就是解决问题的方法:声明图像是全局的。
import numpy as np
import multiprocessing
N=1500 #N=1000 works fine
images=[]
for i in np.arange(N):
images.append(np.random.random_integers(1,100,size=(500,500)))
def func(args):
i=args[0]
images=images
print i
return 0
iter_args=[]
for i in range(0,1):
iter_args.append([i])
pool=multiprocessing.Pool()
print pool
pool.map(func,iter_args)
发布于 2015-08-04 02:33:09
您正在创建一个池,并将所有图像一次发送到func()。如果您可以一次处理单个图像,可以尝试类似这样的操作,它将在35秒内运行到N=10000,并为我提供Python2.7.10:
import numpy as np
import multiprocessing
def func(args):
i = args[0]
img = args[1]
print "{}: {} {}".format(i, img.shape, img.sum())
return 0
N=10000
images = ((i, np.random.random_integers(1,100,size=(500,500))) for i in xrange(N))
pool=multiprocessing.Pool(4)
pool.imap(func, images)
pool.close()
pool.join()
这里的关键是使用迭代器,这样你就不必一次在内存中保存所有的数据。例如,我将保存所有数据的数组中的图像转换为生成器表达式,以便仅在需要时创建图像。你可以修改它,从磁盘或其他任何地方加载你的图像。我也使用了pool.imap而不是pool.map。
如果可以,请尝试在worker函数中加载图像数据。现在,您必须序列化所有数据并将其传送到另一个进程。如果您的图像数据较大,这可能是一个瓶颈。
现在更新,我们知道func必须一次处理所有图像
你可以对你的图像做一个迭代均值。这里有一个不使用多进程的解决方案。要使用多处理,您可以将图像分成块,然后将这些块分配到池中。
import numpy as np
N=10000
shape = (500,500)
def func(images):
average = np.full(shape, 0)
for i, img in images:
average += img / N
return average
images = ((i, np.full(shape,i)) for i in range(N))
print func(images)
发布于 2015-08-01 19:34:41
Python可能会将数据加载到RAM内存中,而您需要此内存可用。你检查过你的电脑内存使用情况了吗?
此外,正如Patrick提到的,您正在加载3 3GB的数据,请确保您使用的是64位版本的Python,因为您将达到32位内存限制。这可能会导致进程崩溃:32 vs 64 bits Python
另一个改进是使用python 3.4而不是2.7。Python3实现似乎针对非常大的范围进行了优化,请参阅Python3 vs Python2 list/generator range performance
https://stackoverflow.com/questions/30834132
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