腾讯云开发者社区-腾讯云

开发者社区

文档建议反馈控制台

最新优惠活动

文章/答案/技术大牛

发布

生信马拉松

专栏作者

26

文章

3802

阅读量

18

订阅数

生信马拉松 Day1

除了数据处理外，R的作用还体现在统计分析+可视化，这些功能都是通过现成的函数或者修改现成函数来完成

阿呆的月历

2024-01-08

2810

生信马拉松 Day2

（1）用函数 c() （注意是小写的c()，大写的C()是另外的函数）逐一放到一起，例：

阿呆的月历

2024-01-09

2840

生信马拉松 Day3

今天延续Day2讲完了全部的几个重要数据类型，都是后续生信分析非常重要的知识点以及小Tips，同时深深感受到代码思维的重要性。要写能换个环境和场景依然可运行的代码，而不是一次性的玩意儿

阿呆的月历

2024-01-11

2760

生信马拉松 Day4

function()是创造函数的函数，括号里是形式参数，有默认值就写上，例如这里的m=2

阿呆的月历

2024-01-12

1420

生信马拉松 Day5

r 语言生物基因

比较能正确运行的数据和出错的数据，可能出现的情况有：异常值INF，重复值、非法输入、数据类型、数据结构

阿呆的月历

2024-01-13

1560

生信马拉松 Day6

r 语言生物基因 ggplot2

开头一个小tips：在运行R project时，界面上最好每次只有一个脚本，否则不同脚本之间流程、变量容易混乱

阿呆的月历

2024-01-15

1500

生信马拉松 Day7

r 语言生物基因

碎碎念：这个没啥好仔细展示的，含义也很直观，主要是要记住有这个函数，等需要用的时候回来找

阿呆的月历

2024-01-16

2160

生信马拉松 Day8 GEO数据分析课程笔记

生物基因 geo

广义的基因有6w+个，包括lncRNA、miRNA等等，每年可能都有个别基因增增减减的情况，累计在一起，就存在基因库版本的差异，10年前查到的和今年的可能不一样，所以旧的数据仍然可以有新的解释，同一个数据集也可以在和其他数据集用不同的思路分析

阿呆的月历

2024-01-25

1870

生信马拉松 Day9-10 GEO数据分析笔记

生物基因 geo

今天正式开始教画图了，具体的代码其实挺多地方讲到了，上课的好处就是可以听到很多细节和经验，是自己零散地找资料不能相比的，收获很多，感觉要全部吞下来还要再复习几遍

阿呆的月历

2024-01-26

1101

生信马拉松 Day11 Linux纯新入门

linux 生物基因

今天的内容主要是Linux入门，比R确实复杂枯燥很多╮(╯﹏╰）╭，使用的软件是Terminus，优点是可以同时完成登录服务器和ftp上传

阿呆的月历

2024-01-27

890

生信马拉松 Day12 Linux-2笔记

生物基因 linux编程

碎碎念：今天马拉松入门课程已经结课了，而我才补课到12天，呜呼！原本觉得自己R学的很好想直接跳到转录组，没有linux的基础根本听不懂，还得一步一步慢慢来。直播课连上3小时已经很难坚持了，补课的时候没有互动更加难熬，唯一的好处是听不懂的地方可以反复拖回来看，只能用这个勉强安慰一下自己了(；′⌒`)

阿呆的月历

2024-02-04

970

生信马拉松 Day13 Linux-3笔记

linux 生物基因

实际容忍度很高，pattern写在左后，或者options写在pattern后面都可以

阿呆的月历

2024-02-04

1210

生信马拉松 Day14 conda！

linux 生物基因 conda

anaconda：所有语言的包、依赖和环境管理器，几乎全平台（Windows、macOS、Linux）

阿呆的月历

2024-02-04

920

生信马拉松 Day15 Linux-shell笔记

linux 生物基因 shell

碎碎念：完蛋了，虽然补完了linux的课程但是感觉linux对我来说还像新的一样，完全不知道怎么用以及有什么用，唯一能记住的东西只有自己以前在书上学过的部分，现在回想起来觉得前面R的内容学的好，不会只是因为我本来就会吧!!!∑(ﾟДﾟノ)ノ，突然就明白了曾老师在群里说完成Linux的题目需要至少1个月才能完成，简直保守了----

阿呆的月历

2024-02-05

1120

生信马拉松 Day16 转录组RNA-seq-1

linux 生物基因

今天开始学习转录组测序的上下游分析了，艰苦地学完Linux之后感觉生活又光明了！虽然Linux的命令还不太熟悉，只能先想要做什么再从笔记里搜搜关键词，但基本上能跟得上，不用像学Linux一样漏一分钟就要反复回放好多遍才听懂

阿呆的月历

2024-02-06

2100

生信马拉松 Day17 转录组RNA-seq-2

今天的主要内容是转录组上游的质控，设计到4个包：fastqc、multiqc、trim_galore、fastp

阿呆的月历

2024-02-13

1650

生信马拉松 Day18 转录组RNA-seq-3

linux 生物基因

转录组上游的内容终于上完了，今天的内容太抽象了，每一步处理的内容都不是很好理解，现在上完课也还是摸不着头脑，最大的收获似乎是多按tab键？

阿呆的月历

2024-02-29

1940

生信马拉松 Day19 转录组 RNA-Seq-4

今天的内容终于到转录组下游啦，R比起Linux易懂很多，基本上改改分组信息无脑run就好

阿呆的月历

2024-03-01

640

生信马拉松 Day20 转录组 RNA-Seq-5

GSEA & GSVA：以一组基因为单位，来描述是否参与某种功能，直接注释的结果是得到大量的功能节点

阿呆的月历

2024-03-04

1300

生信马拉松 Day21 转录组的分析实战

啊啊啊，太伤心了，这一天的课小洁老师抽了我的数据集做师范，我竟然上一半跑路么有上和甜甜的小洁连麦的机会o(╥﹏╥)o

阿呆的月历

2024-02-07

1410

点击加载更多

社区活动

腾讯技术创作狂欢月

“码”上创作 21 天，分 10000 元奖品池！

Python精品学习库

代码在线跑，知识轻松学

博客搬家 | 分享价值百万资源包

自行/邀约他人一键搬运博客，速成社区影响力并领取好礼

技术创作特训营·精选知识专栏

往期视频·千货材料·成员作品最新动态