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InstaPrism是否能平替BayesPrism(贝叶斯棱镜)？

上一期内容提到了BayesPrism算法用于单细胞数据的反卷积，BayesPrism算法在实际应用中非常占用计算资源以及消耗使用者的时间。那么是否有较好的替代包呢？

凑齐六个字吧

2024-07-18

460

BayesPrism(贝叶斯棱镜法)可提取单细胞数据去卷积后将信息映射至bulkRNA数据

贝叶斯棱镜法作为一种工具可以根据scRNA数据(作为先验模型)去推断bulkRNA数据中肿瘤微环境组成(不同免疫细胞组分/不同细胞群)和基因表达情况。

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2024-07-15

900

Count数据转换为TPM数据方法整理-常规方法、DGEobj.utils和IOBR包

在正式分析之前，对于数据的处理是至关重要的，这种重要性是体现在很多方面，其中有一点是要求分析者采用正确的数据类型。

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2024-07-13

1240

Scissor算法-从含有表型的bulkRNA数据中提取信息进而鉴别单细胞亚群

在做基础实验的时候，研究者都希望能够改变各种条件来进行对比分析，从而探索自己所感兴趣的方向。

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2024-07-09

1090

R语言绘制临床基线表(Table1三线表)-compareGroups包

开发者对它的功能定义主要侧重于绘制描述性表格，可以显示多个变量的平均值、标准差、分位数或频率，以及运用统计学方法计算各组之间的P值。

凑齐六个字吧

2024-07-05

930

如果在使用CIBERSORT时出现报错

在进行CIBERSORT分析的时候，关键的一步是根据内置的22种免疫细胞基因表达特征数据结合自己的表达矩阵文件计算每一个样本中的免疫细胞浸润情况。

凑齐六个字吧

2024-07-03

1040

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