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R基础

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分子对接—蛋白分子和小分子配体

将前两步获得的rep.pdb，lig.mol2文件复制到AutoDock的工作目录中

sheldor没耳朵

2024-11-30

4890

两蛋白间的分子对接—2

Uniprot数据库中检索SFN与HDAC6蛋白质，挑选分别率最佳的构象。SFN对应PDB数据库中3IQU，HDAC6对应PDB数据库中5B8D。使用HDOCK进行分子对接，挑选最佳对接结果导入PYMOL进行可视化。

sheldor没耳朵

2024-11-19

650

group_by()和split()函数的运用

考虑下面一种情形，要根据 "drug" 列中的相同值提取出对应的 "molecules"，并将 "molecules" 对应的值按每个 "drug" 分组，可以使用 dplyr包中的 group_by()和 summarize()函数，或者直接使用 split()函数来达到目的

sheldor没耳朵

2024-11-15

910

蛋白组学—两个蛋白质之间的分子对接

首先在https://www.uniprot.org/中搜索相关基因，如VTN,选择对应的种属，点击Entry编号，uniprot中可以直接跳转PDB数据库https://www.rcsb.org/（也可以复制编号，直接去PDB数据库中去检索），同理下载SLPI的最佳蛋白质结构。

sheldor没耳朵

2024-11-06

8453

使用read.table读取数据时候不完全？

怎么找原因，试了是否NA、空值影响，结果都不是。交流群里问了其他人，也遇到过data.table吞数据的情况。原因竟然是数据中存在引号的原因。

sheldor没耳朵

2024-11-01

1540

技能树Day03_直播课05-06_R作图与综合利用

属性设置：映射：根据数据的某一列的内容分配颜色；统一设置：把图形设置为一个颜色，与数据无关

sheldor没耳朵

2024-07-19

1150

技能树Day02_直播课02-04_数据结构、R包、数据读取

sheldor没耳朵

2024-07-18

1900

技能树Day01_R环境配置_直播课day01

（原网址http://www.bio-info-trainee.com/3727.html）

sheldor没耳朵

2024-07-17

1020

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