生信宝典

159 篇文章
62 人订阅

全部文章

生信宝典

引起相变的无序结构域(IDRs)怎么预测?跟踪热点,提升文章档次!

蛋白研究过程中,一般认为氨基酸的序列决定了蛋白的结构,结构决定功能(一般指蛋白的三维结构)。然而,近50年的研究中,有一种没有特定三维结构的蛋白不断被研究人员发...

762
生信宝典

饿死癌细胞?还是先看看肿瘤中的异常代谢的特征分析和背后的遗传与环境互作吧!

本文授权转载自 “生物狗窝,很有深度的公众号”,讲述了肿瘤中异常的代谢类型,代谢重编程与基因突变和肿瘤微环境的关系,以及如何靶向这些突变来实现癌症治疗的研究。原...

803
生信宝典

肿瘤化疗无效是对预先存在的突变的选择还是诱发新突变,Cell给你答案

三阴乳腺癌(TNBC)是乳腺癌的一种侵袭性亚型,是指雌激素受体(ER),孕激素受体(PR)和原癌基因(HER-2)均为阴性的乳腺癌,常对化疗产生耐药性。而耐药性...

952
生信宝典

UCSC XENA - 集大成者(TCGA, ICGC)

TCGA有自己的一批工具,ICGC也有自己的网站,但好的资源都是要整合起来,整合越多越好(虽然事实不一定如此,但有这个想法的人不少),用着才更方便。这就靠今天介...

1423
生信宝典

免费Linux系统和生信宝典原创学习教程

生物信息的学习离不开Linux系统,不管自己写命令处理数据,还是使用现有的工具。Linux对我们来讲最重要的是它强大的命令行功能,可以快速、批量、灵活的处理数据...

733
生信宝典

如何获取目标基因的转录因子(下)——Linux命令获取目标基因TF

如何获取目标基因的转录因子(上)一文中我们以人类基因组为例,从ensemble网站下载了基因组中基因位置信息矩阵GRCh38.gene.bed和基因组中转录因子...

1093
生信宝典

2018 Cell系列相变最强综述,未来已来,你在哪?

Trends in Cell Biology (Cell系列综述, 2018 IF: 18.564)于2018年6月1日在线发表了Steven Boeynaem...

401
生信宝典

如何获取目标基因的转录因子(上)——Biomart下载基因和motif位置信息

科研过程中我们经常会使用Ensembl(http://asia.ensembl.org/index.html) 网站来获取物种的参考基因组,其中BioMart工...

933
生信宝典

18式优雅你的Python

文章授权转载自 Python与算法之美,粗体文字为生信宝典的修改和补充。文后有生信宝典原创的系列Python学习教程(Python2和Python3)。

872
生信宝典

生信宝典文章集锦,众多干货,有趣有料 (20180825版)

生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的...

753
生信宝典

癌症组织特异性基因怎么找?这是个不错的开始

组织特异性基因(Tissue-specific Genes)是指在不同类型的细胞中特异性表达的基因,其调节细胞特异的形态结构或生理功能。组织特异性基因的表达是理...

782
生信宝典

WB图片处理-教你利用PPT做出漂亮的WB图片!

WB是很科研多小伙伴都会用到的实验技术,而对于最终WB图片的处理也是各自有各自的手段,不过主流主要分为两大派:PPT或者Adobe Photoshop/Illu...

922
生信宝典

父爱无言!科学家首次发现来自爸爸的基因,可以通过胎儿来控制妈妈对宝宝的爱

近期,卡迪夫大学研究者发表在PLOS Biology上的一项研究发现,宝宝体内一个名为Phlda2的基因竟然能够影响妈妈是否关爱宝宝[1]!当这个来自鼠爸的印记...

822
生信宝典

SOM基因表达聚类分析初探

上周的暑期生信黑马培训有老师提出要做SOM分析,最后卡在code plot只能出segment plot却出不来line plot。查了下,没看到解决方案。今天...

712
生信宝典

图像处理R包magick学习笔记

作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源

602
生信宝典

易生信-扩增子教程01-基本概念

距离上次《生信宝典》联合《宏基因组》组织的扩增子分析线下培训结束己经有三个多月了。

581
生信宝典

一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点

本文授权转载自科研小助手(ID:SciRes)斜体小一号字体为生信宝典的备注或校正。

3331
生信宝典

2018 升级版Jaspar数据库

R包ggseqlogo 绘制seq logo图和Seq logo 在线绘制工具—Weblogo介绍了如何用R脚本和在线工具绘制seq logo图,用于展现转录因...

982
生信宝典

在线浏览器,在线PS,在线AI,在线编程 ...

现在越来越习惯使用在线工具,拿来即用,用完即走。只要有网,在哪都可以用。比如我们推出的在线绘图 (http://www.ehbio.com/ImageGP)已经...

813
生信宝典

Seq logo 在线绘制工具——Weblogo

seqlogo图可以直观清晰的反应序列偏好特征,每个位置出现的碱基或氨基酸类型反映了该位置序列的偏好性,每个字母的大小与该碱基在该位置上的出现频率成正相关。

652

扫码关注云+社区