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Science述评|大规模单细胞组学解析人类基因遗传学互作

评述论文:Exploring genetic interaction manifolds constructed from rich single-cell p...

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NCB|心咽发育多样化的单细胞转录轨迹分析

In vertebrates, multipotent progenitors located in the pharyngeal mesoderm form ...

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CNS常客——单细胞转录组:不愧是我

动物单细胞的研究有将近10年了,每年都是CNS的常客。在国内形成了北汤南郭的局面,一个是单细胞转录组的世界第一人,一个促成了单细胞从追求深度到追求数量的转变。具...

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Science组合图表解读

关于此图的讨论已经有一段时间了。我发现一个事实,对此图教程表现出强烈渴望的小伙伴名字后面都有“生态”二字。不管是土壤生态、草地生态还是水生态。非生态的大佬及吃瓜...

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ggplot2的作者Hadley Wickham拿了"统计学界的诺贝尔奖"

|| 原文来源:统计之都 (https://mp.weixin.qq.com/s/dbVJoUtHk3ORrQbNp7IypQ)

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道友,来Rstudio里面看动画了

这是ggplot中十分可爱的一个扩增包,目的只有一个,就是让你的图动起来!就是酱紫!!

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是Excel的图,不!是R的图

excel作为一个强大的统计工具,自身包含着一部分数据可视化的功能。R作为可视化的大势,自然也可以画出这些图,有一篇就通过ggplot2包进行了部分总结,甚是有...

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最能装的硬盘,其实是你的遗传物质

大家应该对记忆面包都不陌生,只要吃下印了课文内容的记忆面包,课文就记牢了,不仅能省下时间去玩,还能得到老师夸奖。

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在程序中变量名这样写,就是给自己挖坑

这并不是一段好的的代码,为了图省事,使用了简单而无实际含义的变量及数值,看起来在任何程序中都可以用,对于看的人来说就是灾难,因为要想半天或者查看上下文才知道你写...

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赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说,该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析,只能把分析结果进行可视化。在...

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一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D

虽然3D的plot见得比较多了,但是看见这样的R包,我的心还是砰了一下,这个简直不能再好看了!

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从一段挖矿病毒代码看Linux命令的实际应用

最近做易生信培训时新购了一块阿里云,用于演示分析流程搭建和配置。短期使用,上面没有数据,也没做什么防范,结果不曾想,被挖矿病毒盯上了,给了一个近距离接触病毒的机...

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这些数据库很不错,要不要看看?

生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。

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单基因GSEA怎么做?

今天在讨论群看到有群友提问 单基因GSEA怎么做?。之前也看到过这个概念,但一直不清楚这个单是什么含义,一直以为是用单个基因做GSEA。如果之前看过生信宝典的一...

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增强火山图,要不要试一下?

包作者:Kevin Blighe撰文:协和医学院 苑晓梅编辑:生信宝典 时间:2019-06-03

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给你的数据一个家,一个有DOI的地方 | 生物数据库承建

现在数据库升级第二版,更多功能,更多展示 (网络图比下面这个更漂亮,更有生物意义,更有交互性,只是暂时还不能释放 o(╥﹏╥)o)。

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获取pheatmap聚类后和标准化后的结果

pheatmap是简单常用的热图绘制包,可以快速、简单、可定制的绘制漂亮热图。具体见R语言学习-热图简化和免费高颜值可定制在线绘图工具 ImageGP。

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实验没进展?计划有变动?那是因为你不够敏捷

如果你曾写过研究计划书,很可能是把工作内容规划为一系列顺序活动,用甘特图(条状图)表现出来。

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Cell 深度| 一套普遍适用于各类单细胞测序数据集的锚定整合方案

自北京大学汤富酬教授(当时为英国剑桥大学格登研究所(Gurdon Institute) Azim Surani实验室博士后)等人于2009年在Nature Me...

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癌中之王:基质微环境塑造胰腺癌瘤内结构|Cell

单细胞技术可以描述不同组织之间的异质性,但驱动单细胞表型的空间分布和条件是不太相同的。结合单细胞转录组和蛋白组学研究间质癌相关成纤维细胞(CAFs)在调节胰腺癌...

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