连续两次求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!大家开始根据我的ngs组学视频进行...
然后就找我,以为是我们的标准代码有问题,实际上我的 run_kegg 函数仅仅是包装了 Y叔的 clusterProfiler包而已 ,实际上里面没有啥玄机,如...
差不多几个小时就可以完成全部的样品的cellranger的定量流程,但是如果初次接触这个 基于10x的单细胞转录组fastq文件的cellranger的定量流程...
确实,我们虽然有一个专注于单细胞数据处理技术分享的公众号:《单细胞天地》,但确实是一直专注于常规的单细胞转录组数据分析,无非是降维聚类分群,以及不同分组看细胞亚...
连续两次求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!有做ngs实战整理的,也有做临床数...
前面整理了100多套R代码,因为时间跨度有点长,而且公众号写作后没办法修改,所以安排实习生进行代码审查,看看是不是确实复制粘贴就可以运行。
Hiplot 项目发起于 2019 年,是由国内生物信息学开源社区 Openbiox 和多家单位和机构共同建设的一个免费、易用、部分开源的综合在线绘图系统(生物...
数字游民第三波有你吗 https://mp.weixin.qq.com/s/q864LQvsOOmd9nUyxk939w
希望所有的学徒,实习生以及马拉松授课学员都可以在咱们《生信技能树》的舞台上大放异彩。前面有粉丝自告奋勇希望可以把他自己在简书等平台的生物信息学笔记分享在我们《生...
当然了,不同公司的WGS,WES和捕获测序产品不一样,但是背后的原理是一致的,都是要找 点突变和拷贝数变异,最后根据不同分组或者队列样品的统计学检验, 去确定 ...
肉眼看起来没有啥问题,因为对方本来就是测序数据文件破损了,所以也无所谓md5校验了,本来是想把它们全部先解压再说,马上就报错:
我们需要批量下载它们并且进行最简单的表达量矩阵差异分析,并且给出来统计学显著的上下调基因。现在看来当然是非常简单了,公众号推文在:
但是有一些文章并不会给我们表达量矩阵,而是原始数据,比如sra文件或者fastq文件,就需要自己走cellranger的定量流程啦。我们在单细胞天地多次分享过c...
最近学徒在复现文献图表的时候接触到了一个难搞的单细胞转录组项目,降维聚类分群结果非常糟糕,我看了看其dotplot发现主要是部分基因无处不在导致很多单细胞亚群特...
写教程的话,我的优点仅仅是量大,坚持了七年多写了超1万篇教程。但实际上绝大部分都浮于表面,深度不够。
最近有粉丝自告奋勇希望可以把他自己在简书等平台的生物信息学笔记分享在我们生信技能树公众号,在专业的舞台上跟大家切磋!
我们的生信入门班和数据挖掘线上直播课程已经有了三年多的历史,培养了一波又一波优秀的生信人才。前面提到R语言授课时的超纲练习题,已经分享过两位优秀学员的答案。
我们的生信入门班和数据挖掘线上直播课程已经有了三年多的历史,培养了一波又一波优秀的生信人才。课堂上设置的练习题代表着以目前学到的知识所能完成实战,学员们对待练习...
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