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kongxx

设置Docker允许非root用户操作

以前写过一篇博客介绍过怎样允许非root用户来访问Docker,当时的方法是将用户加入的docker组里,这样做安全是安全了,但是实在是太麻烦了,对于我这种安全...

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kongxx

高通量测序数据质控神器Trimmomatic

高通量测序下机的原始数据中存在一些低质量数据、接头以及barcode序列等,为消除其对后续分析准确性产生的影响,在数据下机以后对原始数据进行质控处理就成了至关重...

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kongxx

使用SPAdes测序数据拼接软件拼装基因组

SPAdes 是由俄罗斯科学院 St. Petersburg Academic University 与美国科学家合作开发的主要应用于小型基因组如细菌,真菌等基...

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kongxx

三代测序组装工具Canu学习笔记

Canu是Celera的继任者,能用于组装PacBio和Nanopore两家公司得到的测序结果。

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kongxx

使用phoenix查询hbase

今天需要从的 hbase 使用 sql 来查询数据,于是想到了使用 phoenix 工具,在自己的环境里大概试了一下,一下子就通了,就这么神奇。

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kongxx

python使用phoenixdb操作hbase

然后使用下面代码来建立连接、创建/删除并查询表。代码比较简单,和我们通常查询关系型数据库比较类似,这里就不多说了哈。

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kongxx

SSH端口转发

今天碰到一个需求,在用户环境中,如果要访问机房里某个机器上,必须通过一个机器中转才可以,如果仅仅是SSH登录一下,我也就忍了,毕竟跳跳更健康嘛。但是今天要访问里...

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kongxx

环境自动加载工具direnv

最近在多个项目之间来回切换,其中不同项目需要使用同一个库的不同版本,来回切换太麻烦,于是乎,想到了曾经有同事给我建议的环境自动加载工具direnv,可以使我在命...

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kongxx

一个简单的通过浏览器共享命令行的工具ttyd

今天调研的时候看到了ttyd工具,一个可以简单的通过浏览器共享命令行工具,只需要在命令行运行一个命令,就可以通过浏览器来直接访问终端了。下面就看看怎么使用吧。

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kongxx

使用PyInstaller打包webssh

接前一篇博客,为了使webssh更容易安装部署,我在想是不是可以把webssh打包成一个独立的可执行文件,这样使用起来不是更方便呢。于是乎我想到了是不是可以使用...

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kongxx

Ubuntu Server 14.04 上安装 OpenSSL 1.0.2

在 Ubuntu Server 14.04上默认的 OpenSSL 的版本还是 OpenSSL 1.0.1f,使用 apt-get 还无法升级,因此只能通过编译...

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kongxx

使用Sqoop从Postgresql中导入数据到Hive中

这里假定已经准备好了现成的Hadoop,Hive,Hbase,Zookeeper和一个postgresql数据库。

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kongxx

通过 Serveo 将局域网服务开放到互联网上

发现一个好东西 Serveo,可以将局域网内的服务端口开放到互联网上,从而实现通过外网访问局域网。最主要这东西还不要安装,你说要命不。下面就看看怎么使用。

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kongxx

使用 Portainer 管理 Docker Swarm 集群

也可以在命令行通过 docker service 查看 portainer 服务。

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kongxx

查看Docker镜像仓库中镜像的所有标签

用 Docker 的人都知道,我们在查询远端镜像仓库中镜像的时候,在命令行只能看到镜像名,说明等信息,而看不到标签。因此,如果我想要查看镜像有哪些标签,就只能通...

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kongxx

一个好用的Python和JS实现的Web SSH工具webssh

今天找到了一个使用python和js做的基于Web的SSH工具 webssh,大概试了一下,安装使用都比较方便,分享一下。

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kongxx

使用Web Console提供一个简单的远程命令行服务

今天调研基于Web的SSH的应用程序的时候无意间看到了一个Web Console的工具,虽然没有满足我的最终需求,但还是试了一下,可以当作一个受限的基于Web远...

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kongxx

安装使用Eclipse Che

前些日子下载 Eclipse 的时候无意间看到了 “Eclipse Che”,一个高性能的基于浏览器的集成开发环境,说直白点就是浏览器版的 Eclipse,当时...

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kongxx

使用Sqoop从Postgresql中导入数据到HBase中

接前面的文章 “使用Sqoop从Postgresql中导入数据到Hive中”,今天看看怎样从 Postgresql 入数据到 HBase 中。

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kongxx

语音识别语言模型和拼音字典文件制作

访问 http://www.speech.cs.cmu.edu/tools/lmtool-new.html 页面,上传 my.txt 文件,然后使用“COMPI...

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