如果只想用gitbook制作自己的电子书，本地观看，那只需要安装gitbook即可。现在是想部署在github。
原地址 几点说明 1.非简单翻译，所有代码均可运行，为了辅助理解，基本每步代码都有结果，需要比较的进行了整合 2.原文中的软件都下载最新版本 3.原文中...
Graphical representation of allelic heterogeneity at a locus with common and low...
一共三部分 通过简单数据熟悉Linux下生物信息学各种操作1 通过简单数据熟悉Linux下生物信息学各种操作2 通过简单数据熟悉Linux下生物信息学各种...
关于trimmomatic相关内容请见https://zhuanlan.zhihu.com/p/28924793 https://www.jianshu.co...
为了加快速度先下载aspera并添加环境变量，具体看以前的内容 下载sra toolkit加环境变量 下载EDirect 用yeast的几个数据说明
Edirect是非常有用的工具 其使用要用来perl，mac都预先安装了perl 安装的时候最好按下面进行 打开终端
查看sra-tools版本是否最新版 可以重新安装最新版或建立新的环境安装最新，建议删除。
不管数值型还是字符串型，都是用一对圆括号表示，并且数组的元素之间用空格隔开，但是字符型的元素需要加引号 比如
Run和Library_Name的对应关系如下 也就是要以第二列代替第三列，所以简单的rename命令不行，因为这些名字之间㐊简单的替换
接下来用 BWA mem把fastq map到参考基因组 hg38 版本。 比对结果直接通过管道传给samtools处理，节省 I／O 时间。 因为空间问题...
下一步，需要把RNA-seq（448个样本）和WXS(279个样本)分开进行比对，所以首先要把他们分开，并重新命名 具体信息见总目录
创建好脚本，并设置好权限，就可以将这个脚本放在某个目录中，来运行 比如当前目录下
引号常用创建字面量，也就是原装的字面义。 所以操作脚本或命令行，要先知道shell是如何执行命令的
filezilla用户帐号可以登录服务器 但这不能上传文件，用root帐号的时候提示
比xmind更便捷 虽然一些美化功能在免费版不能用，也不能像xmind一样添加各种箭头和连接 但也足够 比xmind的效率更高一些 主要是可以无脑操作...
config是需要进行处理的文件列表 trim_galore命令这里用的也比较简单，总结下处理时遇到的问题
主要两个原因， 一是构建测序文库时的可用的细胞量并不充足 二是打断的步骤（一般都是超声波）会引起部分DNA降解 以上两个都会是的整体或局部DNA浓度过低，...
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