生信修炼手册

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给你的热图挑选一个合适的渐变色

一个合适的渐变色可以让我们的热图更加的美观,在matplotlib中内置了许多的渐变色,如何挑选合适的渐变色就诚成为了一个问题,这么多的渐变色,其分布有没有什么...

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matplotlib基础绘图命令之violinplot

vert参数的默认值为True,表示竖直方向的小提琴图,当取值WieFalse时,绘制水平方向的小提琴图,用法如下

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matplotlib基础绘图命令之boxplot

notch控制是否在图中显示中位数的置信区间,默认值为False, 当取值为True时,会计算中位数的置信区间,并在图中将置信区间与中位数相连,用法如下

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matplotlib基础绘图命令之imshow

imshow方法首先将二维数组的值标准化为0到1之间的值,然后根据指定的渐变色依次赋予每个单元格对应的颜色,就形成了热图。对于热图而言,通常我们还需要画出对应的...

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matplotlib基础绘图命令之hist

density参数默认值为False, 表示用每个区间的数值个数来绘图,当取值为True时,柱子的高度为每个区间的频率,用法如下

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一文搞懂matplotlib中的颜色设置

在matplotlib中,默认的颜色盘通过参数rcParams["axes.prop_cycle"]参数来指定, 初始的调色盘就是T10调色盘。

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matplotlib基础绘图命令之errorbar

在matplotlib中,errorbar方法用于绘制带误差线的折线图,基本用法如下

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matplotlib基础绘图命令之scatter

在matplotlib中,scatter方法用于绘制散点图,与plot方法不同之处在于,scatter主要用于绘制点的颜色和大小呈现梯度变化的散点图,也就是我们...

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matplotlib基础绘图命令之pie

这样的饼图并没有任何实用价值,为了有效的展示信息,至少我们还需要显示数据的标签和百分比的数值。此时就需要调整参数,pie方法常用的参数有以下几个

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matplotlib基础绘图命令之plot

第一个参数的值作为x轴坐标,第二个参数的值作为y轴坐标,从而绘制折线图。当只提供一个数值参数时,自动将其作为y轴坐标,x轴坐标为对应的数值下标,示例如下

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matplotlib基础绘图命令之bar

在matplotlib中,bar命令用于绘制柱状图,基本用法如下在matplotlib中,bar命令用于绘制柱状图,基本用法如下在matplotlib中,bar...

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matplotlib简介

丰富的第三方模块赋予了python强大的能力,matplotlib作为python最流行的可视化模块之一, 功能强大,用法简便。对于新手而言,其上手难度低,仅需...

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pands中的日期和时间操作

其中,Date Time用于表示某个具体的时间点,Time spans用于生成时间间隔相同的时间序列;Time deltas表示时间间隔,Date offset...

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使用jupyter notebook运行python和R

一个图形化的交互式运行环境,对于编程语言的学习和开发,特别是可视化方面,提供了极大的便利。比如在window上使用R语言进行绘图,在R语言自带的交互环境中,可以...

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pandas中的窗口处理函数

滑动窗口的处理方式在实际的数据分析中比较常用,在生物信息中,很多的算法也是通过滑动窗口来实现的,比如经典的质控软件Trimmomatic, 从序列5'端的第一个...

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pandas中的缺失值处理

在真实的数据中,往往会存在缺失的数据。pandas在设计之初,就考虑了这种缺失值的情况,默认情况下,大部分的计算函数都会自动忽略数据集中的缺失值,同时对于缺失值...

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pandas中的index对象详解

在pandas中,Series和DataFrame对象是介绍的最多的,Index对象作为其构成的一部分,相关的介绍内容却比较少。对于Index对象而言,有以下两...

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pandas中的字符串处理函数

在pandas中,通过DataFrame来存储文件中的内容,其中最常见的数据类型就是字符串了。针对字符串,pandas提供了一系列的函数,来提高操作效率。

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pandas中的数据处理利器-groupby

在数据分析中,常常有这样的场景,需要对不同类别的数据,分别进行处理,然后再将处理之后的内容合并,作为结果输出。对于这样的场景,就需要借助灵活的groupby功能...

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pandas中数据框的reshape操作

数据框的长宽转换对于熟悉R语言的朋友而言,应该不会陌生。使用ggplot2画图时,最常用的数据处理就是长宽转换了。在pandas中,也提供了数据框的长宽转换功能...

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