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使用tensorflow创建一个简单的神经网络
神经网络
tensorflow
keras
api
数据分析
本文是对tensorflow官方入门教程的学习和翻译，展示了创建一个基础的神经网络模型来解决图像分类问题的过程。具体步骤如下
生信修炼手册
2021-07-06
950
0
基于正则化的回归：岭回归和套索回归
编程算法
正则表达式
线性回归
api
在多元线性回归中，多个变量之间可能存在多重共线性，所谓多重，就是一个变量与多个变量之间都存在线性相关。首先来看下多重共线性对回归模型的影响，假设一下回归模型
生信修炼手册
2021-02-09
1.1K
0
使用biopython解析kegg数据库
api
python
数据库
sql
KEGG数据库称之为基因组百科全书，是一个包含gene, pathway等多个子数据库的综合性数据库。为了更好的查询kegg数据，官方提供了对应的API。
生信修炼手册
2021-01-25
1.4K
0
IP代理在网络爬虫中的应用
tcp/ip
数据分析
api
http
费用中心
通过用户代理我们可以将普通的爬虫程序伪装成浏览器，而IP代理的作用则是用于突破目标服务器对同一IP访问频率的限制。
生信修炼手册
2020-11-02
396
0
pands中的日期和时间操作
python
unix
node.js
api
其中，Date Time用于表示某个具体的时间点，Time spans用于生成时间间隔相同的时间序列；Time deltas表示时间间隔，Date offsets则表示日期间隔，这二者的作用都是用于时间运算，通过时间点+时间间隔的方式，得到新的时间点。
生信修炼手册
2020-07-16
2.1K
0
ENCODE转录因子靶基因数据库
http
数据库
sql
api
ENCODE数据库中包含了许多转录因子的chip-seq数据，通过对chip-seq数据进行分析，可以预测得到该转录因子对应的靶基因数据。
生信修炼手册
2020-05-08
1.5K
0
使用clusterProfiler进行KEGG富集分析
api
http
https
网络安全
KEGG pathway是最常用的功能注释数据库之一，可以利用KEGG 的API获取一个物种所有基因对应的pathway注释，human对应的API 链接如下
生信修炼手册
2020-05-08
4.6K
0
eggNOG:从COG延伸出来的同源蛋白数据库
数据库
sql
http
api
直系同源蛋白的预测在系统发育，比较基因组学等多个领域都占用重要地位，COG数据库开创了同源蛋白数据库的先河，后续又不断有新的数据库涌现，而eggNOG就是目前使用最广泛的数据库之一。
生信修炼手册
2020-05-08
1.6K
0
使用GDC API查看和下载TCGA的数据
api
分布式
https
php
网络安全
API是应用程序编程接口，很多的网站都有对应的API,方便程序抓取数据，比如NCBI, EBI, KEGG等等，GDC也有对应的API, 可以方便的查询和下载TCGA的数据，API的网址如下
生信修炼手册
2019-12-19
1.4K
0
使用TCGAbiolinks下载TCGA的数据
api
html
TCGAbiolinks是一个分析处理TCGA数据的R包，通过GDC API来查询和下载TCGA的数据，同时提供了差异分析，生存分析，富集分析等常见的分析功能，网址如下
生信修炼手册
2019-12-19
1.3K
0
Disease Ontology:人类疾病分类数据库
http
数据库
sql
api
go
Gene Ontology, 简称GO, 是最常用的基因功能注释数据库之一。Disease Ontolog与GO数据库类似，通过参照MeSH, ICD等疾病分类标准，对人类的常见疾病与罕见病进行了归纳整理，提供了一个统一的，标准化的疾病分类系统，对应的文章发表在Nucleic Acids Research 链接如下
生信修炼手册
2019-12-19
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