腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
登录/注册
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
返回腾讯云官网
生信修炼手册
专栏作者
举报
877
文章
1699881
阅读量
181
订阅数
订阅专栏
申请加入专栏
全部文章
数据库
sql
编程算法
网络安全
python
https
生物基因
http
数据分析
html
硬件开发
numpy
go
github
机器学习
git
神经网络
matlab
深度学习
开源
na
线性回归
ftp
对象存储
存储
linux
人工智能
java
tcp/ip
android
api
网站
data
javascript
node.js
file
plot
perl
r 语言
xml
scikit-learn
数据结构
腾讯云开发者社区
聚类算法
case
panel
文件存储
adapter
cell
ld
list
matplotlib
reference
其他
c++
php
bash
json
bash 指令
爬虫
正则表达式
count
map
model
官方文档
express
监督学习
决策树
axes
block
dot
error
input
sample
sequence
可视化
react
jquery
typescript
打包
ide
容器镜像服务
黑石物理服务器
图像处理
容器
自动化
unity
scrapy
大数据
windows
axis
bi
db
edge
merge
min
nan
overlap
pandas
path
pipeline
scale
summary
target
time
umi
window
内容分发网络 CDN
ios
actionscript
arm
批量计算
命令行工具
腾讯云测试服务
svg
serverless
koa
分布式
keras
selenium
anaconda
es
emr
flink
accessibility
add
apply
background
barcode
capture
csv
diff
dp
encode
figure
frame
ggplot2
heatmap
marker
matrix
nas
patch
pdf
profile
ref
reverse
rules
structure
tree
txt
var
view
web
技巧
软件
索引
图表
费用中心
NLP 服务
tensorflow
css
ajax
云数据库 SQL Server
sqlite
access
jar
analyzer
unix
centos
apache
spring
日志服务
访问管理
vr 视频解决方案
xslt & xpath
云联网
shell
spark
html5
卷积神经网络
hive
erp
gui
面向对象编程
grep
cdn
gcc
安全
数据处理
processing
特征工程
jupyter notebook
分类算法
迁移
验证码
absolute
alias
analysis
attributes
average
bezier
boxplot
branch
bug
cgi
channel
colors
compare
conda
config
copy
dataframe
date
dba
dbi
default
diagram
difference
display
distance
distribution
dom
double
download
duplicates
environment
exists
expression
extend
filter
filtering
find
fixed
flags
frequency
fs
geo
gpu
graph
header
histogram
identity
import
inheritance
int
intervals
label
latex
loading
mask
max
mean
metadata
mkdir
navigator
output
package
png
position
postscript
prefix
ps
range
relationship
restart
ribbon
seaborn
search
server
set
sf
sh
sort
sse
state
submit
tiles
tools
traits
transform
unique
using
variant
vector
version
表格
二进制
基础
排序
芯片
搜索文章
搜索
搜索
关闭
好看的桑基图是如何炼成的!
https
javascript
java
网络安全
编程算法
Sankey Diagram, 也叫做桑基图,是一种展示数据流的可视化方式,一张典型的桑基图示例如下
生信修炼手册
2022-06-09
1.4K
0
整理NAD+代谢相关基因
数据库
sql
https
http
网络安全
来自KEGG和Reactome两个数据库,本文主要介绍下从这两个数据库获取基因列表的方法
生信修炼手册
2022-04-20
489
0
手把手教你处理illumina beadchip芯片数据
硬件开发
https
网络安全
数据处理
在NAD+代谢相关的文献中,使用了两批illumina beadchip的芯片数据进行分析,本文以其中一篇数据为例,详细展示该平台的数据处理流程。
生信修炼手册
2022-04-18
1.2K
0
教你分析后缀为gpr的芯片数据
硬件开发
https
网络安全
分析芯片数据,我们首先需要确定芯片平台。不同的芯片平台技术不同,既有单通道,也有双通道,而且输出文件的格式也不同。
生信修炼手册
2022-04-18
607
0
原始数据不仅有GEO, 还有ArrayExpress!
硬件开发
https
网络安全
数据库
sql
和GEO数据库类似,ArrayExpress是属于EBI旗下的公共数据库,用于存放芯片和高通量测序的相关数据,网址如下
生信修炼手册
2022-04-18
935
0
解密conda channels
anaconda
https
typescript
网络安全
channels是conda下载包的镜像网站,通过如下命令可以查看已有的channels
生信修炼手册
2020-12-11
1.4K
0
conda:基于python的软件管理系统
python
anaconda
https
网络安全
python语言在发展的过程中,经历了python2到python3的迁移,对应的包也出现了多个版本。如何在一台服务器上同时安装不同版本的python,不同版本的package, 而且不互相干扰,是一个令人头痛的问题。
生信修炼手册
2020-12-11
933
0
GATK4基本概念整理
spark
java
https
ios
网络安全
GATK 是 Genome Analysis ToolKit 的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的snp calling 软件之一。GATK 设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据,随着不断发展,现在也可以用于其他的物种,还支持CNV和SV变异信息的检测。在官网上,提供了完整的分析流程,叫做GATK Best Practices。
生信修炼手册
2020-05-11
981
0
OMIM数据库简介
数据库
sql
https
网络安全
OMIM 全称叫做Online Mendelian Inheritance in Man, 是一个不断更新的人类孟德尔遗传病的数据库。这个数据库主要关注人类基因变异和表型性状之间的关系。
生信修炼手册
2020-05-11
1.6K
0
IMGT/HLA数据库简介
数据库
sql
https
ftp
网络安全
数据库中主要收录了HLA I 型和II 型基因的Allel信息,此外,还包含了一些非HLA基因的Allel
生信修炼手册
2020-05-11
1.8K
0
HLA Dictionary-Allel和抗原之间的对应关系
https
网络安全
HLA Dictionary , 中文名叫做HLA 字典,记录了HLA-A, -B, -C, -DRB1/3/4/5 和 -DQB1 等HLA基因的不同Allel 对应的血清学分析鉴定的抗原。
生信修炼手册
2020-05-11
490
0
bismark对参考基因组建立索引
数据分析
https
网络安全
分析DNA甲基化的手段有很多,除了甲基化芯片外,还有WGBS和RRBS等实验与高通量测序相结合的手段,不管是哪种策略,都需要对DNA进行亚硫酸氢盐处理。
生信修炼手册
2020-05-10
1.3K
0
COSMIC数据库简介
https
网络安全
数据库
sql
对象存储
癌症相关的体细胞位点,是整个网站的核心,收录了来自不同研究机构和数据库的体细胞突变数据,并提供了方便的浏览,检索,下载功能。
生信修炼手册
2020-05-10
3.6K
0
外显子测序简介
https
网络安全
html
外显子测序,也叫做外显子捕获测序。首先利用序列捕获技术将外显子区域的DNA捕获并富集,然后进行高通量测序。外显子测序主用用来分析基因组上的变异位点,包括SNP和INDEL。
生信修炼手册
2020-05-09
1.1K
0
minfi 分析甲基化芯片数据-数据导入篇
硬件开发
bash
bash 指令
html
https
如果要用这个包进行分析,首先需要在R中将我们的芯片数据读取进来,就是常说的import data。对于minfi 来说,其设计思路是通过读取SampleSheet.csv 文件,在事先约定好的目录结构中查找所有样本的原始数据,来自动化的读取所有样本的信息。
生信修炼手册
2020-05-09
1.3K
1
初识DNA甲基化芯片
硬件开发
https
go
网络安全
DNA 甲基化作为重要的表观遗传学的标记,能够调控基因的表达,在生长发育和疾病相关研究领域都有着重要意义。测定甲基化的手段有很多,芯片作为一种成熟的手段,其稳定性,可重复性以及性价比,使得在DNA甲基化研究领域芯片占据了半壁江山。
生信修炼手册
2020-05-09
1.3K
0
PathVisio : wiki pathway 通路图可视化工具
java
https
网络安全
PathVisio 是一款免费开源的pathway 可视化工具,通过这个软件我们不仅可以创建并编辑通路图,甚至还可以进行富集分析。
生信修炼手册
2020-05-09
1.3K
0
wikipathway : 代谢通路专用数据库
数据库
sql
https
svg
网络安全
为了预防和治疗疾病,理解细胞活动至关重要。细胞活动通常是一系列蛋白质和代谢物质的动态变化过程,叫做pathway。我们常用的pathway 数据库就是KEGG pathway,除了KEGG pathway 之外,还有很多的pathway 数据库可以使用。
生信修炼手册
2020-05-09
1.5K
0
RNAcentral:非编码RNA数据库
数据库
https
ftp
sql
网络安全
RNAcentral是由EBI开发的一个非编码RNA数据库,整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多个数据库中的非编码RNA信息,旨在为ncRNA的研究提供一个统一的参照,网址如下
生信修炼手册
2020-05-08
1.2K
0
DARNED:RNA编辑位点数据库
linux
数据库
sql
https
网络安全
DARNED数据库收录了human等多个物种的RNA编辑位点信息,除了最常见的A->I类型的RNA编辑外,还收录了部分C->U的RNA编辑位点,网址如下
生信修炼手册
2020-05-08
602
0
点击加载更多
社区活动
Python精品学习库
代码在线跑,知识轻松学
点击查看
【玩转EdgeOne】征文进行中
限时免费体验,发文即有奖~
立即参加
博客搬家 | 分享价值百万资源包
自行/邀约他人一键搬运博客,速成社区影响力并领取好礼
立即体验
技术创作特训营·精选知识专栏
往期视频·干货材料·成员作品·最新动态
立即查看
领券
问题归档
专栏文章
快讯文章归档
关键词归档
开发者手册归档
开发者手册 Section 归档