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小明的数据分析笔记本

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生物信息学入门~利用购买的云服务器学习有参转录组数据处理(fastq到差异表达)
参考基因组 拟南芥基因组 来源于 论文 The genetic and epigenetic landscape of the Arabidopsis centromeres。下载链接 https://github.com/schatzlab/Col-CEN/tree/main/v1.2
用户7010445
2024-04-30
780
使用R语言的phytools包在进化树上标记自己测序取样的样本
用户7010445
2024-04-30
560
跟着NC学作图:R语言ggplot2分组散点图和拟合曲线
https://www.nature.com/articles/s41467-024-46421-6
用户7010445
2024-04-30
1030
R语言ggplot2散点图如何使用更多的形状
如果想用其他形状,有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes/ggstar.html
用户7010445
2024-04-23
870
有趣的数据可视化:R语言ggplot2包画云雨图展示不同地质时代恐龙的体长
https://www.kaggle.com/datasets/kjanjua/jurassic-park-the-exhaustive-dinosaur-dataset?resource=download
用户7010445
2024-04-22
730
跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2画图展示基因树的拓扑结构冲突
https://doi.org/10.1038/s41588-024-01683-0
用户7010445
2024-04-15
1020
R语言ggplot2画棒棒糖图展示KEGG富集分析结果
https://www.nature.com/articles/s41588-024-01683-0
用户7010445
2024-04-15
640
R语言ggplot2折线图/散点图/作图添加水印
在小红书看到有的人直接截我公众号的图发,所以想看看能不能在图上添加水印,我搜索了一下看有没有现成的R包可以直接做这个事情。找到了一个R包 tracee
用户7010445
2024-04-15
1010
跟着Nature Plants学作图:R语言ggplot2甜甜圈图包裹饼图
https://www.nature.com/articles/s41477-024-01654-7
用户7010445
2024-04-03
1080
4种方法实现ggplot2的aes()中的变量替换
ggplot2里aes()可以用tidyselect风格去选择变量做映射绘图,那么这种情况下如何实现「变量替换」呢?
用户7010445
2024-04-03
790
跟着Nature Plants学作图:R语言ggplot2分组散点图添加置信区间/图片上插入表格
https://www.nature.com/articles/s41477-024-01654-7
用户7010445
2024-04-03
1220
Centromics 软件鉴定可能的着丝粒区域
Centromics software (https://github.com/ShuaiNIEgithub/Centromics) was used to identify centromeres
用户7010445
2024-03-22
1190
跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2堆积柱形图组合饼状图
https://www.nature.com/articles/s41467-024-45739-5
用户7010445
2024-03-22
1030
R语言利用cds序列计算kaks值
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.27.582236v1.abstract
用户7010445
2024-03-12
1510
使用StainedGlass的输出结果用R语言自己画三角形热图展示着丝粒的位置
代码链接 https://mrvollger.github.io/StainedGlass/ https://github.com/mrvollger/StainedGlass
用户7010445
2024-03-04
1181
答读者问:R语言ggplot2做折线图的几个细节
ggplot2里画折线图的函数是geom_line(),这个函数是按照y值的大小从左往右,如果要实现上图所示折线的方向可以向左拐,可以使用geom_path()函数,比如
用户7010445
2024-03-04
1450
跟着Plos Genetics学数据分析:LTRpred流程注释完整的LTR(1)安装篇
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008370
用户7010445
2024-03-01
1190
跟着Plos Genetics学数据分析:LTRpred流程注释完整的LTR(2)运行示例数据
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008370
用户7010445
2024-02-23
650
结合深度学习和隐马尔可夫模型的真核生物基因组基因注释工具Helixer
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.02.06.527280v2
用户7010445
2024-02-23
890
R语言packcircles包画圆堆图(circle packing chart)展示美国不同年龄段在情人节送的礼物的不同
这个圆堆图(circle packing chart)之前有人问过,但是当时也不知道是如何实现的。今天看到一个很有意思的数据可视化案例:画圆堆图展示美国不同年龄段在情人节送的礼物的不同
用户7010445
2024-02-23
950
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