医学数据库百科

104 篇文章
23K 次阅读
38 人订阅

全部文章

医学数据库百科

我研究的疾病研究过哪些基因呢?

我们在研究一个疾病或者某一个方向的时候,经常需要首先了解一下这个了解一下这个领域都研究了哪些基因。这个方面的的数据库还是挺多的,之前我们介绍过geneshot ...

6620
医学数据库百科

2021.04在线数据库汇总

在4月期间,总共发表了医学相关在线数据库34个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据库。如果想要所有相关数据库信息的,后台回复:21...

10150
医学数据库百科

CellMarker:细胞标志物数据库

我们都知道,细胞标志物是我们用来对细胞定义和分选的重要标志。当我们想查看某细胞的标志物时,不可能对所有细胞都进行测序分析,首先,经费就烧不起。。。...

13640
医学数据库百科

多组学与药物敏感分析的数据库

---------------------------------分割线------------------------------------

10840
医学数据库百科

在线聚类分析网站

对于高维度的数据分析而言,例如RNA-seq的数据。我们在得到数据想要解释不同分组之间的差异的基因。往往都需要逐渐的降维来进行解释。最普遍的方法通过差异分析—富...

20720
医学数据库百科

预后分析最佳cutoff值计算工具

在大家进行科研工作的过程中,拿到一个基因,获取表达量后,总要先与预后来一波分析。分析过程中势必会涉及到分组,说到分组,肯定是老生常谈的以中位值,平均值,抑或是3...

18340
医学数据库百科

人类lncRNA的表达数据库

LncRNA一直是近些年来非编码RNA领域的研究热点,所以,许多各式各样的LncRNA数据库应运而生。今天,小编就来给大家介绍一个通过整合lncRNA在广泛的生...

8330
医学数据库百科

如何使用TCGA数据分析肠道菌群

我们知道TCGA数据库包括很多患者的二代测序的数据。关于二代测序。之前我们就介绍过,其实二代测序的数据是是一部分所有细胞的核苷酸序列。对于这一部分的序列,只是看...

21640
医学数据库百科

PCR引物如何设计

说起Real-Time PCR,大家都不陌生,毕竟是检测基因转录水平表达情况最基本的实验了。但是对于没有接触过的小伙伴来说,还是挺陌生的,所需试剂仪器就先不聊了...

27320
医学数据库百科

一站式 lncRNA 查询数据库

在研究一个lncRNA之前,我们都要先去查看这个lncRNA可能的相关功能,比如要查看这个lncRNA的表达、查看其相互作用的miRNA或者需要去查看调控这个l...

13810
医学数据库百科

GEO二代测序表达数据下载数据库

在GEO公共数据检索的时候,发现有一个数据集想要分析,但是发现是二代测序的数据,没有相关的原始数据处理经验,要怎么办呢?

18320
医学数据库百科

ROC绘制工具介绍

PS: B站之前是有关于这个STATQUEST所有视频的搬运的。但是不清楚后来作者都删除了。所以以下是简单的搬运,感兴趣的可以去想办法去看所有的视频。作者讲的很...

8120
医学数据库百科

《数据可视化基础》:使用颜色的常见陷阱

颜色是增强数据可视化的一种非常有效的工具。与此同时,糟糕的颜色选择也会破坏原本优秀的视觉效果。颜色的使用必须是基于某一个目的的,而不是用来分散注意力的。

11210
医学数据库百科

疾病相关单细胞数据库

对于对于测序而言,单细胞测序算是很火的一个测序技术了。简单来说单细胞测序技术的,就是对每一个细胞来进行测序。相较于之前的RNA-seq而言,我们其实是对某一块组...

15020
医学数据库百科

只聚焦一个基因如何进行下一步研究?

之前有小伙伴提问说,老板只给了一个基因让在胃癌当中研究。组内的测序数据也不让用,想要往下做一些和这个基因有关的基础实验,这个该怎么弄呢?

12520
医学数据库百科

非肿瘤研究如何利用公共数据库发表文章

目前很多对于公共测序数据的分析,很多都是集中在肿瘤数据当中,主要原因还是在于,肿瘤有一个TCGA的数据库。倒不是说TCGA数据库有多大的样本,而是在于TCGA数...

22030
医学数据库百科

10月数据库汇总

截止9.21-10.21之间总共 发表了在线医学相关数据库49个。由于微生物和病毒方面的数据库比较多。所以相较于之前的汇总,我们增加了微生物和病毒相关数据库的模...

12520
医学数据库百科

ncRNA-疾病相关数据库

多项研究表明,非编码RNA(ncRNA)在基因表达调控过程中起着至关重要的作用,其功能障碍与多种疾病密切相关。既然这么重要,那么今天我们就来给大家介绍一个存储疾...

15030
医学数据库百科

转录调控必知数据库:ENCODE

之前我们在介绍很多转录调控相关的数据库的时候,都会提到这些数据库包含了ENCODE数据库。那么ENCODE数据库是什么样的数据库呢?

14710
医学数据库百科

基于实验的 ncRNA 靶点查询

在昨天LnCeVar数据库介绍当中,我们提到了两个基于实验方法查询 miRNA 功能的数据库,正好今天介绍的这个是基于实验收集的 lncRNA 功能的数据库,所...

17120

扫码关注云+社区

领取腾讯云代金券