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生信喵实验柴

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1分钟教你国内使用gpt4
前面我们一直推荐的网站,本身有多个模型可以调用,但是大家不知道有什么区别,以及不知道如何使用。这篇推文介绍的就是让大家更好地使用工具,拥抱AI。
生信喵实验柴
2024-04-17
2470
LSF作业系统无法启动
最近使用linux系统module模块安装中,使用root用户,执行以下高危命令后
生信喵实验柴
2024-03-06
1160
Linux环境安装R包Rglpk报错
搜了很多教程,有需要root管理员权限使用yum安装glpk的,秉承不随意使用root的原则, 接下来,我们以普通用户解决该问题。
生信喵实验柴
2024-02-28
3260
Sora来了:Chatgpt+Midjourney还不试试?
当今的社交网络已经成为人们生活中不可或缺的一部分,人们在这里分享生活、交流思想、寻找信息和娱乐等等。在日常的科研学习中,我们会遇到各种难题,我们会寻求某歌等搜索引擎,某瓣某虫等专业的社区,但是这样的速度实在是太慢了。
生信喵实验柴
2024-02-28
1890
Linux修改用户名
注意:你需要从要改名的帐号中登出并杀掉该用户的所有进程,要杀掉该用户的所有进程可以执行下面命令
生信喵实验柴
2023-11-03
1.5K0
模块和包
Python 模块(Module),是一个 Python 文件,以 .py 结尾,包含了 Python 对象定义和Python语句。
生信喵实验柴
2023-09-18
1210
面向对象多态
多态指的是一类事物有多种形态,(一个抽象类有多个子类,因而多态的概念依赖于继承)。
生信喵实验柴
2023-09-18
1530
集合
创建集合使用{}或set(), 但是如果要创建空集合只能使用set(),因为{}用来创建空字典。
生信喵实验柴
2023-09-18
1450
字典
思考3:如果将来数据顺序发生变化,如下所示,还能用list1[0]访问到数据'Tom'吗?。
生信喵实验柴
2023-09-18
1400
元组
元组特点:定义元组使用==小括号==,且==逗号==隔开各个数据,数据可以是不同的数据类型。
生信喵实验柴
2023-09-18
1160
列表
思考:如果一个班级100位学生,每个人的姓名都要存储,应该如何书写程序?声明100个变量吗?
生信喵实验柴
2023-09-18
1050
循环
需求:复现重复执行100次print('媳妇儿,我错了')(输出更简洁一些,我们这里设置5次)。
生信喵实验柴
2023-09-18
1460
输入
当程序执⾏到 input ,等待用户输入,输入完成之后才继续向下执行。
生信喵实验柴
2023-09-18
830
输出
%06d,表示输出的整数显示位数,不⾜以0补全,超出当前位数则原样输出
生信喵实验柴
2023-09-18
1340
变量
举例体验:我们去图书馆读书,怎么样快速找到⾃⼰想要的书籍呢?是不是管理员提前将书放到固定位置,并把这个位置进⾏了编号,我们只需要在图书馆中按照这个编号查找指定的位置就能找到想要的书籍。
生信喵实验柴
2023-09-18
1250
注释
通过⽤⾃⼰熟悉的语⾔,在程序中对某些代码进⾏标注说明,这就是注释的作⽤,能够⼤⼤增强程序的可读性。
生信喵实验柴
2023-09-18
1250
画出优雅的气泡图
第一种: 把自己的数据整理成easy_input.txt的格式,就可以跳过“输入数据的格式化”,直接进入“开始画图”。第一列是基因名,后面几列依次是各个sample里motif的pvalue,然后是motif的名字,后面是FPKM值。
生信喵实验柴
2023-09-06
3480
画出最佳分组的生存曲线
做生存分析,Best separation和Median separation,后者很简单,很想学前者,这次带来的是最佳分组的曲线代码。
生信喵实验柴
2023-09-06
1980
vcf文件
VCF 是生物信息分析中非常重要的一种格式。主要用来描述基因组突变的信息,无论是检测出来的 SNP,indel,cnv,还是 SV,都可以存储格式都为 vcf 格式。从比对生成的 bam 文件中,将潜在变异信息筛选出来,就是 vcf 格式。vcf 是一种列表格式,里面包含很多的内容。需要掌握每一列的信息,并能使用相对应的软件对 vcf 进行处理。处理 VCF 格式软件主要包括 bcftools,vcftools,gatk,python pyvcf,plink 等。
生信喵实验柴
2023-09-04
7640
GATK变异检测
准备的已知变异集作为训练集,可以是 Hapmap、OMNI,1000G,dbsnp,瓶中基因组计划等这些国际性项目的数据,然后利用训练集对每一个位点进行过滤。利用 VariantRecalibrator工具进行机器学习,ApplyVQSR 工具进行处理。VQSR 过滤 SNP 和 InDel 分别进行,首先处理 SNP,得到结果后,再进行 InDel 处理。
生信喵实验柴
2023-09-04
3340
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