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空间转录组揭示玉米胚乳发育过程中细胞异质性的研究
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这篇文章是2023年11月8日发表在Nature Communications上一篇文章，主要讲的是利用单细胞空间组学的方式对玉米胚乳发育过程中细胞异质性的研究[1]。
小胡子刺猬的生信学习123
2024-03-30
122
0
单细胞转录组学轨迹分析解析3-Slingshot代码解析
数据分析
前面一节对单细胞轨迹的数据过滤和降维已经做了解析，而其实主要用这个软件的是用后面的拟时序分析的内容。因此下面对拟时序的内容进行解析。
小胡子刺猬的生信学习123
2023-12-05
940
0
单细胞转录组学轨迹分析解析2-Slingshot代码解析
数据分析
通过上节对Slingshot文献的基本讲解，对这个拟时序的分析方法有了基本的了解，作者也公布了流程的代码，并分享在https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/slingshot/inst/doc/vignette.html上。
小胡子刺猬的生信学习123
2023-11-07
508
0
单细胞转录组学轨迹分析解析1-Slingshot
数据分析
在单细胞转录组中，比较经典的分析内容：单细胞拟时序分析（轨迹分析），主要为了对复杂的细胞亚群进行异质研究，主要应用于干细胞及其后代，来绘制从多种祖细胞到完全分化细胞的进展情况。目前已经有了多种方法进行研究，今天主要介绍的Slingshot分析软件。
小胡子刺猬的生信学习123
2023-11-06
631
0
单细胞韧皮部研究代码解析4-Fig01-umap_cell_types.R
命令行工具
r 语言
单细胞韧皮部研究代码解析1-QC_filtering.R:https://cloud.tencent.com/developer/article/2256814?areaSource=&traceId
小胡子刺猬的生信学习123
2023-05-06
243
0
单细胞韧皮部研究代码解析3-comparison_brady.R
r 语言
命令行工具
单细胞韧皮部研究代码解析1-QC_filtering.R:https://cloud.tencent.com/developer/article/2256814?areaSource=&traceId
小胡子刺猬的生信学习123
2023-05-05
180
0
单细胞韧皮部研究代码解析2--comparison_denyer2019.R
命令行工具
r 语言
单细胞韧皮部研究代码解析1-QC_filtering.R:https://cloud.tencent.com/developer/article/2256814?areaSource=&traceId
小胡子刺猬的生信学习123
2023-04-08
237
0
单细胞韧皮部研究代码解析1-QC_filtering.R
命令行工具
r 语言
由于最近一直需要加班和做试验，我把更文的时间变成一周一次啦，有问题的小伙伴可以留言，我们做生信的小可爱们一起学习进步。
小胡子刺猬的生信学习123
2023-04-02
519
0
Seurat软件学习11-细胞周期内容的分析
r 语言
命令行工具
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2023-03-25
713
0
Seurat软件学习10-SCTransformV2版本的运行方式
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2023-01-31
1K
0
Seurat软件学习9-sctransform的使用
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2023-01-10
709
0
Seurat软件学习8-不同细胞类型样本的分析流程
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-12-12
646
0
Seurat软件学习7-同胞多组学结合方法-WNN
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-11-04
876
0
Seurat软件学习6-多模型参考映射的方法
编程算法
数据分析
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-10-29
569
0
Seurat软件学习5-scRNA-Seq和scATAC-Seq数据整合
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-10-15
623
0
Seurat软件学习4-使用RPCA进行快速整合数据集
rpc
https
数据分析
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-10-05
861
0
Seurat软件学习3-scrna数据整合分析注释数据集
https
网络安全
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-10-04
912
0
Seurat软件学习2-scrna数据整合分析
css
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合：https://cloud.tencent.com/developer/article/2130078
小胡子刺猬的生信学习123
2022-09-30
1.1K
0
Seurat软件学习1-多个模型得数据进行整合
数据分析
https
网络安全
html
单细胞数据分析中比较重要得软件seurat应该能排在前几名，我一直没有系统得学习过seurat，所以把官网上得内容进行翻译及学习。
小胡子刺猬的生信学习123
2022-09-29
581
0
单细胞代码解析-妇科癌症单细胞转录组及染色质可及性分析19
https
网络安全
单细胞代码解析-妇科癌症单细胞转录组及染色质可及性分析1：https://cloud.tencent.com/developer/article/2055573
小胡子刺猬的生信学习123
2022-09-25
358
0
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