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分子动力学模拟
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分子动力学模拟软件GROMACS的安装
云服务器
在作者进行的不严谨的速度测试中,模拟的包含水分子在内的约6万个原子的蛋白质体系,24核CPU上速度约20 ns/day,利用-pme gpu -nb gpu -bonded gpu -update gpu 将主要任务均加载中GPU上时,利用T4速度约80 ns/day,利用V100速度约150 ns/day,A100速度约250 ns/day (CPU为常见服务器CPU)。可见利用GPU加速可较大促进模拟速度。
用户9732374
2022-05-25
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