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🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（五）（相关性分析）
可视化
排序
数据
变量
函数
今天继续之前的hdWGCNA教程，做完了前面的模块分割、鉴定，该和各种traits相关起来啦。😂
生信漫卷
2024-07-31
146
0
🤩 Mime1 | 终极机器学习算法大组合筛选你的最佳模型（二）（二分类结局篇）
可视化
模型
数据
机器学习算法
list
生信漫卷
2024-07-12
259
0
🤩 Mime1 | 终极机器学习算法大组合筛选你的最佳模型（一）（预后模型篇）
可视化
模型
数据
机器学习算法
list
今天讲一下机器学习的神包，Mime1，之所以写这个名字，是怕大家和Mime包混淆，影响安装。😂
生信漫卷
2024-07-12
555
1
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（四）（差异分析）
可视化
数据
cell
plot
函数
在这里，我们将group.by对每种细胞类型进行One-versus-all分析。🦀
生信漫卷
2024-07-12
156
0
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（三）（pseudobulk data）
data
meta
可视化
数据
网络
今天没什么废话，主要讲讲如何用pseudobulk data做hdWGCNA。🙃
生信漫卷
2024-05-27
197
1
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（二）（基础可视化）
函数
基础
可视化
数据
工作
明明是认真的完成了自己的工作，不过总有人觉得你过的太舒服，非要让你过上牛马一样的生活，他才觉得是正常的，真是不能理解。🙃
生信漫卷
2024-05-27
319
0
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（一）（小试牛刀）
可视化
数据
存储
对象
函数
好久没更了，今天写一下hdWGCNA吧，单细胞和空间转录组都能用到的高级分析。🧐
生信漫卷
2024-05-27
378
0
🤩 CellMarker | 人骨骼肌组织细胞Marker大全！~（强烈建议火速收藏！）
min
raster
marker
分享一下最近看到的2篇paper关于骨骼肌组织的细胞Marker，绝对的Atlas级好东西。👍
生信漫卷
2024-05-08
351
0
🤩 GeneSelectR | 用多种机器学习方法筛选重要基因！~
机器学习
selection
工作
基础
可视化
GeneSelect是基于使用Python进行特征选择的。所以第一次用的时候需要安装相应的Python模块，需要为包创建工作环境。
生信漫卷
2024-04-23
365
1
🤩 catboost | 分量变量的梯度提升机器学习算法怎么用！?~（附shap解析！~）
变量
可视化
模型
算法
机器学习算法
CatBoost和XGBoost、LightGBM并称为GBDT的三大主流神器，都是在GBDT算法框架下的一种改进实现。
生信漫卷
2024-04-10
163
0
🤩 shapviz | 如何利用SHAP解释Xgboost模型！?~
xgboost
可视化
模型
机器学习
游戏
今天讲一下机器学习的经典方法，SHAP（Shapley Additive exPlanations）。🤒
生信漫卷
2024-02-01
1.2K
0
🤩 scMetabolism | 哎哟！单细胞代谢怎么评估嘞！？
数据
input
signature
变量
可视化
这里说一下，这个包的依赖包还是很多的，装起来有些麻烦，还是希望作者可以抽时间完善一下。🤓
生信漫卷
2024-02-01
447
0
🤩 xgboost | 经典机器学习大杀器之XGBoost！~
机器学习
xgboost
变量
模型
数据
XGBoost是一种提升树模型，所以是将许多树模型集成在一起，形成一个很强的分类器，叫CART回归树模型。🌲
生信漫卷
2024-01-22
258
0
🧐 MendelianRandomization | 孟德尔随机化神包更新啦！~（二）（一行代码拿捏所有方法）
变量
服务器
工作
函数
网络
今天继续接上次的MendelianRandomization包吧，示例数据就不再重复了。🧐
生信漫卷
2024-01-15
1.3K
0
🧐 MendelianRandomization | 孟德尔随机化神包更新啦！~（一）（小试牛刀）
alpha
input
函数
可视化
数据
betaX是来自每个SNP的暴露因素的回归分析的β系数，betaXse是标准误。😘
生信漫卷
2024-01-02
581
0
🤩 Monocle 3 | 太牛了！单细胞必学R包！~（八）（数据映射比较）
cell
models
ref
可视化
数据
共嵌入（Co-embedding）用于比较相似的数据集，以识别相似性和差异性，并在细胞间传输注释。🤓
生信漫卷
2023-12-26
256
1
🤩 Monocle 3 | 太牛了！单细胞必学R包！~（七）（分析单细胞轨迹中的分支）
graph
loading
module
subset
数据
然后调用graph_test()子集，识别出具有制定表达模式的基因，这些基因只落在你选择的轨迹区域内哦。😲
生信漫卷
2023-12-19
682
0
🤩 Monocle 3 | 太牛了！单细胞必学R包！~（六）（寻找随伪时变化的基因）
cell
graph
函数
可视化
数据
这次，我们用一下啊graph_test()函数，设置neighbor_graph="principal_graph"测试轨迹上相似位置的细胞是否具有相关的表达。🤒
生信漫卷
2023-12-19
868
1
🤨 Mfuzz | 新瓶装旧酒，也是不一样的味道！~（经典的时间趋势分析包！~）
线性回归
教程
解决方案
可视化
数据
前面写了个TCseq，还有小伙伴想问经典的Mfuzz，其实这个包一开始是为microarray开发 。🤣
生信漫卷
2023-12-13
340
0
🤨 TCseq | 它可以做的不仅仅是RNA-seq的时间趋势分析！~（一文拿捏！~）
安全
filter
可视化
设计
数据
最近也是真的很忙，根本没有时间好好地整理一下这些东西，翻一下以前写的东西分享给大家吧。🥸
生信漫卷
2023-12-13
401
0
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