R语言&linux

代码在线跑，知识轻松学

Python精品学习库

自行/邀约他人一键搬运博客，速成社区影响力并领取好礼

博客搬家 | 分享价值百万资源包

往期视频·干货材料·成员作品 最新动态

技术创作特训营·精选知识专栏

新邀入驻腾讯云开发者社区，福利多多！

如何运用「云、端融合的数智化安全体系」高效护航数据安全

左手AI，右手安全 —— 一汽丰田数字化转型之路

转录组测序分析——差异表达分析2

pearson:对离异值非常敏感，如果有一个值与正常值差很远会导致数据相关性很低，所以通常进行log处理之后再进行pearson分析。 pearson计算出的相关性比spearman计算出的相关性要高。

下游表达分析——差异表达分析

NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/gu ide/human/index.shtml

转录组测序分析专题——比对/定量

jobs具有当前窗口时效性，只能看见当前窗口进行的任务，但ps可以看到其他窗口进行的任务

转录组测序分析专题——质控

FASTQ数据格式介绍

转录组——背景介绍

https://wizardforcel.gitbooks.io/vbird-linux-basic-4e/content/104.html

linux 环境变量&脚本编程之系统环境与变量

linux 软件安装

特征: 两部分, id行和序列行.
- id行:以“>”开头, 有时候会包含注释信息，如 chr1、chr2 ...
- 序列行:一个字母表示一个碱基/氨基酸，ATCGN 或 20种氨基酸

linux 进阶

一、linux系统简介
》



图片
命令格式：命令+参数+文件
图片
举例
tar -zxvf  Data.tar.gz

二、文件夹与文件管理命令
1.pwd：printworking dire

linux基础

1.GO富集分析
rm(list = ls())  
load(file = 'step4output.Rdata')
library(clusterProfiler)
library(ggthemes)
library(org.Hs.eg.db)
library(dplyr)
library(ggplot2)
library(stringr)
library(enrichplot)

1）输入数据
gene_up = deg$ENTREZID[deg$change == 'up'] 
gene_down

geo（三）

1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表，但是列表不能进行计算，对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st

R语言-专题

dev.off() #关闭画板，报错也没问题，如果多次运行也不出图就dev.new()

R语言-画图

ex2 <- read.csv("ex2.csv",row.names = 1,check.names = F) #check.name=F不允许检查行名，可以保留其特殊字符

R语言-文件读写

3）是否更新：建议选n，除非一直报错；不想回答安装命令参数：update=F, ask=F

3-R包

---title: "2-R语言数据结构"output: html_documentdate: "2023-02-02"---矩阵：只允许一种数据类型的二维结构数据框：每一列只允许一种数据类型列表：可以装各种数据类型#重点：数据框#1.数据框来源# （1）用代码新建# （2）由已有数据转换或处理得到# （3）读取表格文件# （4）R语言内置数据#2.新建和读取数据框df1 <- data.frame(gene   = paste0("gene",1:4),                 change  =

2-R语言数据结构

数据类型：数值型（numeric)，字符型（character，必须加" "or' '），逻辑型（TRUE FALSE NA存在但未知）

R语言-基础+向量

文章

问答

视频

学习中心

腾讯云实验室

直播

竞赛

腾讯云代码分析专区

腾讯iOA零信任安全管理系统专区

腾讯云架构师技术同盟交流圈

腾讯云数据库专区

腾讯云顾问专区

腾讯云原生专区

腾讯混元专区

腾讯云TCE专区

腾讯云Lighthouse专区

腾讯云HAI专区

腾讯云Edgeone专区

腾讯云存储专区

腾讯云智能专区

腾讯轻联专区 

腾讯云开发专区

TAPD专区

腾讯轻量云游戏服专区

腾讯云最具价值专家

腾讯云架构师技术同盟

腾讯云创作之星

腾讯云开发者先锋 

腾讯云代码助手

CODING DevOps

Cloud Studio

SDK中心

API中心

命令行工具

腾讯云开发者社区推出了R语言&linux专栏，为你提供了R语言&linux的相关文章，致力于帮助开发者快速成长与发展。

R语言&linux-腾讯云开发者社区

R语言&linux

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐