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生信技能树学习笔记

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Linux 三大马车——grep sed awk

unix linux 正则表达式

[] eg: TATA-box 则可表示为：TATAATAAT. (这里的塔塔盒是指TATAWAWN 其中W=A/T N=ATC/G)

Labetaloliiixxx

2023-03-09

1.1K0

Linux文本编辑器vim的使用2-14

Vim的三种模式：命令模式编辑模式末行模式 vim [file] 进入命令模式后，使用”i“，进入编辑模式，按ese退出，返回命令模式进入命令模式后，使用”:“，进入末行模式，按ese退出，返回命令模式命令模式可以干什么？编辑模式可以干什么？末行模式可以干什么？ 1.保存并退出 :q! :wq :q :wq! 2.查询 :/关键词，n向下翻 N向上翻 3.set :set nu #显示行号 :set nonu #不显示行号 :set list #显示不可见的字符 :set ff=unix

Labetaloliiixxx

2023-03-03

2930

Linux文本查看、操作、统计2-14

eg：当某些文件以多个空格开头，想要取里面某列的字符串可以先缩减空格，使得每列的分隔只有一个空格，再以空格为分隔符，取第n列

Labetaloliiixxx

2023-03-02

1.1K0

2-13 Linux基础

* 服务器：可以理解为一个配置强大的电脑，可以供用户远程连接，并用其进行操作。连接上服务器后，所有的操作都是在服务器上，与自己的电脑无关。连接服务器： ssh vip28@94.191.82

Labetaloliiixxx

2023-02-25

7090

GEO数据挖掘富集分析

富集分析需要很长的时间跑代码，以下代码可以“存在即跳过，不存在即运行”，可以节省时间，不重复运行

Labetaloliiixxx

2023-02-22

4750

GEO数据挖掘2（分组+探针注释的获取）

#https://mp.weixin.qq.com/s/mrtjpN8yDKUdCSvSUuUwcA

Labetaloliiixxx

2023-02-18

1.5K0

GEO数据挖掘代码1（从geo下载数据）

在GEO上搜索数据，下载其表达矩阵（如果以M为单位，说明文件可用；如果大小只有K，说明文件不可用）

Labetaloliiixxx

2023-02-17

1.2K0

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