术语 cis 源自拉丁语词根“cis”，意思是“同一侧”。相比之下，“trans”一词来自拉丁语词根“trans”，意思是“对面”。在分子生物学中，顺式调控元件是指染色体 DNA 中调节同一染色体上基因转录或表达的区域。反式作用因子是指与基因的顺式作用元件结合以控制其表达的可溶性蛋白质。然而，可溶性反式作用蛋白可以驻留在任何染色体上，通常位于与其调节位置不同的染色体上。
终于结束了接口调试层的前端编写。来到了后台代码处理。其实就是点击Send按钮，我们调用requests来发送请求，并把返回值显示到调试层的返回体中即可,注意实际中这部分会越来越复杂，内容也会越来越多，本教程目前章节只会实现初始的各种请求难度，后续章节可能会不断完善这块。
近日在鼓捣课题的过程中，遇到了一些数据整理需求。需要快速统计物种的序列特征情况，比如基因，转录本，外显子，内含子，CDS，UTR等。但我们其实都清楚，很多物种的基因结构注释信息比较粗糙，所以前面我写了一个功能GXF Fix，详细见《GXF Fix 修复 / 优化基因结构注释信息文件 - GTF/GFF3》。说实话，我觉得这个功能还是比较有用的。
冷菠 冷菠，网名悠然（个人主页http://www.orasky.net），资深DBA，著有《Oracle高性能自动化运维》，有近10年的数据库运维、团队管理以及培训经验。曾担任美资企业Senior
细菌中的转录和翻译以偶联的转录/翻译形式同时进行，因为在mRNA的合成尚未结束时，核糖体就已经开始翻译了。
亚基大小不同的rRNA都通过从共同的前RNA切割下来而释放，而5S rRNA是分开转录的。
转录组，也叫做 RNAseq，是指特定类型细胞中全体转录本的集合。在转录组中，既包括编码蛋白的信使 RNA(mRNA),也包括不编码蛋白的 rRNA，tRNA，小RNA，lncRNA 等非编码 RNA。这些 RNA 转录本彼此协同作用，共同来调控细胞的生长，发育，凋亡等一系列重要的生理过程。对于转录本的研究通常包括定性和定量两个方面。
文章：STD: Stable Triangle Descriptor for 3D place recognition
给你 n 个长方体 cuboids ，其中第 i 个长方体的长宽高表示为 cuboids[i] = [widthi, lengthi, heighti]（下标从 0 开始）。请你从 cuboids 选出一个 子集 ，并将它们堆叠起来。
1、基因、DNA、染色体之间的关系：染色体由DNA和蛋白质构成，基因是DNA上具有遗传效应的片段。
疟疾是一种蚊媒疾病，感染者通常会出现发烧、发冷和流感样疾病。如果不及时治疗，严重者甚至会危及生命。世卫组织新近发布的数据表明，2019 年全球估计发生 2.29 亿疟疾病例，死于该病的人数超过 40 万例。
AI科技评论按：强化学习是学到一个策略解决智能体与环境间互动问题的重要学习范式。不过以往的强化学习过程都常常很低效，在复杂环境中往往难以收敛。这一方面由于简单的策略难以完善、细致地描述各种不同环境状态下的不同行为，另一方面也有由于可能的行为的组合太多所以要探索的空间太大了。 OpenAI的研究人员们这次就开发了一个层次化的强化学习算法，它可以学习到高阶的行动，用来解决一系列不同的任务，同时也可以快速学会解决总共需要上千个步骤的任务。当这个算法用来解决导航问题时，它能够为不同方向的走或者爬行学到一系列高级别的
强化学习是学到一个策略解决智能体与环境间互动问题的重要学习范式。不过以往的强化学习过程都常常很低效，在复杂环境中往往难以收敛。这一方面由于简单的策略难以完善、细致地描述各种不同环境状态下的不同行为，另一方面也有由于可能的行为的组合太多所以要探索的空间太大了。 OpenAI 的研究人员们这次就开发了一个层次化的强化学习算法，它可以学习到高阶的行动，用来解决一系列不同的任务，同时也可以快速学会解决总共需要上千个步骤的任务。当这个算法用来解决导航问题时，它能够为不同方向的走或者爬行学到一系列高级别的动作，这也让智
标题：Augmenting Visual Place Recognition with Structural Cues
我们知道，一个N维的Cube，是由1个N维子立方体、N个(N-1)维子立方体、N*(N-1)/2个(N-2)维子立方体、…、N个1维子立方体和1个0维子立方体构成，总共有2^N个子立方体组成，在逐层算法中，按维度数逐层减少来计算，每个层级的计算（除了第一层，它是从原始数据聚合而来），是基于它上一层级的结果来计算的。比如，[Group by A, B]的结果，可以基于[Group by A, B, C]的结果，通过去掉C后聚合得来的；这样可以减少重复计算；当 0维度Cuboid计算出来的时候，整个Cube的计算也就完成了。 每一轮的计算都是一个MapReduce任务，且串行执行；一个N维的Cube，至少需要N次MapReduce Job。 过程如下：
文章：VoxelMap++: Mergeable Voxel Mapping Method for Online LiDAR(-inertial) Odometry
食管鳞状细胞癌 (esophageal squamous-cell carcinoma, ESCC) 占全球食管癌病例的 80%，5 年生存率低于 30%。 早期阶段通常比晚期阶段有更好的预后，但目前缺乏有助于早期诊断和准确预测预后的有效生物标志物。
2019 年 8 月 8 日，来自美国 NIH 的 Rafael Casellas 与科罗拉多大学 Francisco J. Asturias 在 Cell 杂志上发表文章 《A Pliable Mediator Acts as a Functional Rather Than an ArchitecturalBridge between Promoters and Enhancers》，综合运用 CRISPR-Cas9 筛选系统、降解子实验、Hi-C 和冷冻电镜等技术研究了哺乳动物 Mediator（mammalian Mediator，mMED）的功能和结构，揭示了 mMED 尾部模块与核心模块的构象影响 mMED-Pol II 相互作用。该研究的另一亮点是揭示了虽然Mediator 在功能上联系着启动子和增强子，但与传统的认识不同的是，启动子与增强子空间上的联系主要是由 cohesin 发挥的。
此次为大家分享的是来自Nature Communiations 上的一篇题为”Predicting the structure of large protein complexes using AlphaFold and Monte Carlo tree search” 的文章，来自斯德哥尔摩大学生物化学和生物物理系的Patrick Bryant团队。
癌变的特征是多种细胞过程的失调，这些过程一直是详细的遗传学、生物化学和结构学研究的主题，但直到最近，才有证据显示许多这些过程发生在生物分子凝结体的背景下。凝结体是无膜的团体，通常由液液相分离形成，将具有相关功能的蛋白质和RNA分子隔离开来。来自凝结体研究的新见解预示着我们对癌症细胞失调机制的理解将发生深刻的变化。在这里，我们总结生物分子凝结体的关键特征，指出它们已经被暗示（或很可能被暗示）在致癌发生中的作用，描述癌症治疗药物的药动学可能会受到凝结体的极大影响，并讨论一些必须解决的问题，以进一步提高我们对癌症的理解和治疗。
我们已经开发了一种分层强化学习算法，它学习用于解决一组任务的高级操作，可以快速解决需要数千个时间步长的任务。我们的算法应用于一组导航问题时，会发现一组用于在不同方向上进行走路和爬行的高级动作，这使智能
声明：非常感谢Carina投稿，全文由Carina撰写，主要对生信的可变剪切相关内容作了一定的梳理。
四、拓扑结构域 Topologically associating Domains，TAD
ngx_http_addition_module模块是一个在响应之前和之后添加文本的过滤器。默认情况下未构建此模块，应使用--with-http_addition_module配置参数启用它。
每个人体内都有着两米长的DNA，它是如何紧密折叠在直径 10 微米小的细胞核内。
这篇文章是我个人对协程的理解，在探索的过程当中写下的体会，这篇博客会一直有改动（对协程的理解更加深入，排版比较丑，后期博客更新完会调整排版），有不对的地方或者不清晰的地方希望大佬们指出，我会进行解释和优化本篇文章。
2018-11-02 by Liuqingwen | Tags: Godot | Hits
前面一篇文章《learning：vpp实现dot1q终结功能配置》介绍了vlan dot1q终结子接口功能配置，下面参考vpp官方文档介绍一下创建vlan子接口的命令行。我们都知道vpp默认都是从物理或虚拟主接口收包，那么vpp如何识别vlan报文并将报文转发至vlan子接口上进行业务处理,本文将逐步展开学习。
Somatic point mutations are detectable in spatial transcriptomics data
KMD框架通过V4L2标准方法在系统中创建设备节点，将控制接口直接暴露给UMD CSL进行访问，而其内部主要定义了一系列核心模块，包括CRM(Camera Request Manager)：
轴心 一般是 3D 物体的几何中心 , 下面通过示例说明 3D 物体的 轴心 概念 ;
过滤模块简介 执行时间和内容 过滤（filter）模块是过滤响应头和内容的模块，可以对回复的头和内容进行处理。它的处理时间在获取回复内容之后，向用户发送响应之前。它的处理过程分为两个阶段，过滤HTTP回复的头部和主体，在这两个阶段可以分别对头部和主体进行修改。 在代码中有类似的函数： ngx_http_top_header_filter(r); ngx_http_top_body_filter(r, in); 就是分别对头部和主体进行过滤的函数。所有模块的响应内容要返回给客户端，都必须调用这两个接口。
通过标签查找(FindObjectsOfType)使用GameObject的FindObjectsOfType方法可以根据类型查找场景中所有匹配的对象。
机器之心编译 参与：路、晓坤 CMU 冷扑大师团队在读博士 Noam Brown、Tuomas Sandholm 教授和研究助理 Brandon Amos 近日提交了一个新研究：德州扑克人工智能 Modicum，它仅用一台笔记本电脑的算力就打败了业内顶尖的 Baby Tartanian8（2016 计算机扑克冠军）和 Slumbot（2018 年计算机扑克冠军）。此前，冷扑大师的论文《Safe and Nested Subgame Solving for Imperfect-Information Ga
作者介绍 qiannzhang（张倩），腾讯云数据库专家工程师，具备多年数据库内核研发经验，在大数据分析领域深耕多年。加入腾讯后，主要负责CDW PG数据库SQL引擎相关特性的研发工作。 背景介绍 CDW PG是腾讯自主研发的新一代分布式数据库，采用无共享的MPP集群架构，具备业界领先的数据分析查询处理能力，适用于PB级海量数据的OLAP应用场景。 在OLAP场景中，多表连接查询是最主要的查询类型之一。CDW PG支持多种连接类型，包括left join、right join、inner join和fu
为什么要分享它们两个呢？最近在 100dayscss 上做 CSS 题的时候，被下面这个效果给难住了。
今天为大家介绍的是来自Jian Zhou的一篇的论文。为了了解基因组序列对多尺度三维基因组结构的影响，本文介绍了一种基于序列的深度学习方法，名为Orca，可以直接从序列中预测从千碱基到整个染色体尺度的三维基因组结构。Orca捕捉了包括染色质区块和拓扑联合域在内的结构的序列依赖性，以及与细胞类型特异性相关的各种类型的相互作用，包括CTCF介导的相互作用、增强子-启动子相互作用和Polycomb介导的相互作用。
这篇文字是之前解答知乎上网友的问题， 累积了一些朋友的认同，现在看来还是觉得适用解释这个问题。
固体金属中，通常情况下具有质量和电荷的电子，可以结合形成的一种无质量、电中性，且不与光发生相互作用的复合粒子。
【新智元导读】Hinton 上周发表的一篇论文 Dynamic Routing Between Capsules 提出用 Capsule 这个概念代替反向传播，引起广泛关注，大数医达创始人，CMU计算机学院暨机器人研究所博士邓侃用浅显的语言梳理解读了论文。邓侃认为，capsule 作为视觉数学表征，很可能是为了把视觉，听觉、阅读的原本相互独立的数学向量，统一起来，完成多模态机器学习的终极目标。 邓侃也是 AI WORLD 2017 世界人工智能大会智能医疗论坛的讲者，届时他将以《多模态智能疾病诊断系统的四
１:数据成员对齐规则：结构(struct)(或联合(union))的数据成员，第一个数据成员放在offset为0的地方，以后每个数据成员存储的起始位置要从该成员大小或者成员的子成员大小（只要该成员有子成员，比如说是数组，结构体等）的整数倍开始(比如int在３２位机为４字节,则要从４的整数倍地址开始存储。 ２:结构体作为成员:如果一个结构里有某些结构体成员,则结构体成员要从其内部最大元素大小的整数倍地址开始存储.(struct a里存有struct b,b里有char,int ,double等元素,那b应该从
src: https://github.com/blyxxyz/lexopt#see-also
指标签和标签之间有 包含 关系（父子、爷孙都是包含），例如： <html> 标签包含了 <body> 标签。
Geant4，是模拟辐射粒子与物质相互作用的可靠软件工具，有着丰富的物理过程截面库，涉及中子、伽玛（X）、电子、质子、各种重离子乃至可衰变核素等各种辐射粒子。
早年的全基因组范围的微缺失微重复检测是采用aCGH技术，后来逐渐转为带SNP探针的array或者全部为SNP探针的SNParray技术。
在STM32中执行中断主要分三部分： ==1.配置NVIC_Config()函数 2.配置EXTI_Config()函数 3.编写中断服务函数== （注：本文章所用代码为中断按键代码，实现了按键进入中断从而控制LED亮灭）了解10904更多92304加
建立空间索引在点云数据处理中已被广泛的应用，常见的空间索引一般是自顶向下逐级划分空间的各种空间索引结构，比较有代表性的包括BSP树，KD树，R树，CELL树，八叉树等索引结构，其中就属KD树和八叉树在3D点云中的应用最为广泛，KD树的理论基础在上一篇推文中已经讲解，那么我们知道PCL库中已经对KD树和八叉树的数据结构的建立和索引的方法进行的实现，以方便在此基础上的其他点云的处理操作。
孟德尔定律很数学化，当基因区分显隐性时，分离定律（AaAa呈现3:1），自由组合定律（AaBbAaBb呈现9:3:3:1）。同父同母生育的孩子，应该是遗传父母各一半的遗传物质，因此全同胞的个体应该是一样的。之所以九子各不同，是因为存在抽样误差，而这种误差在遗传学中，又称为孟德尔抽样误差。
https://leetcode-cn.com/contest/weekly-contest-219/
可变剪切differential splicing，也叫做选择性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前体到成熟mRNA的过程当中，不同的剪切方式使得同一个基因可以产生多个不同的成熟mRNA, 最终产生不同的蛋白质，示意图如下
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