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基因集合数据框,列表对象形式

通常拿到了上下调差异基因列表,然后说GO/KEGG数据库注释,指的是超几何分布检验。...可以看到,GO/KEGG是最出名,但不是唯一,起码kegg数据库并列就有Reactome数据库。...这些来源于参考文献基因列表往往是千奇百怪格式,它们并不会遵循MSigDBgmt文件标准(其实绝大部分人应该是都没有听说过这个标准),绝大部分都是Excel里面的列表格式。...这种数据格式基因列表适合于 clusterProfiler::GSEA( 函数: names(all_gene_sets) egmt <- GSEA(geneList, TERM2GENE= all_gene_sets...x){ data.frame(gs_name=x,gene_symbol=glist[[x]]) })) 对象(遵循MSigDBgmt文件标准) 前面的数据框或者列表,要弄成对象就比较麻烦了,需要做一些转换

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【FFmpeg】视频裁剪与拼接命令 ( 裁剪视频命令 | h264 编码 SPS PPS 数据 | 拼接视频 - 相同编码相同容器格式拼接 | 拼接视频 - 不同编码容器格式拼接测试 )

; 这两种数据 是非常重要 视频信息单元 , PPS 数据 通常 在 SPS 数据 之后 , 并在 H.264 码流中作为 元数据 传输 ; 裁剪分离 视频 时 , 如果视频格式是 H.264 编码格式..., 该视频格式中需要写入 SPS PPS 信息 , 如果裁剪出来视频 没有上述 SPS PPS 数据 , 这个视频就无法播放 ; 将 mp4 格式视频转为 其它格式时 , 建议添加 -vbsf...3 个 mp4 格式 视频 , 转为 flv 格式视频 ; 执行 ffprobe 1.flv 命令 , 查看 转换后 1.flv 输出文件 ; 二、拼接视频 - 相同编码相同容器格式拼接测试...视频拼接 , 使用 list 列表 , 设置输入文件 , 不要使用 concat 字符串设置要拼接视频文件 , 否则部分封装格式会拼接失败 ; 使用 ts 格式进行视频拼接 , 不要使用 mp4 ...视频拼接 , 视频画面 分辨率 可以是不同 , 但是 视频 编码格式 必须相同 , 否则会出现问题 ; 音频 拼接时 , 音频编码格式需要相同 , 并且 音频 采样率 / 通道数 / 采样位数

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详细解析以太网、ARP数据报、IP数据报、UDP数据TCP数据协议格式

本文将详细解析以太网、ARP数据报、IP数据报、UDP数据TCP数据协议格式,帮助你更好地理解网络通信中数据格式结构。图片2....以太网格式如下: 目的MAC地址(6字节) 源MAC地址(6字节) 类型(2字节) 数据(46-1500字节) CRC(4字节)目的MAC地址:指示数据接收方物理地址。...TCP数据格式如下: 源端口号(16位) 目的端口号(16位) 序列号(32位) 确认号(32位) 首部长度(4位) 保留(6位) 控制位(6位) 窗口大小(16位) 校验(16...控制位:用于指示TCP连接不同状态控制信息。窗口大小:用于进行流量控制,限制发送方发送数据量。校验:用于校验TCP数据完整性。紧急指针:用于指示紧急数据位置。...选项:用于扩展TCP首部功能。数据:传输有效数据。7. 总结本文深入解析了常见网络协议格式,包括以太网、ARP数据报、IP数据报、UDP数据TCP数据报。

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深入理解列表元组

接下来让可莉来给大家讲解列表元组这两个强力工具吧~ 在 Python 中,列表元组是两种常用序列数据类型,用于存储操作一组数据。虽然它们用 途相似,但它们在一些方面有很大不同。...通过下标不仅能访问数据,也能修改数据: alist = [1, 2, 3, 4] alist[2] = 100 print(alist) 当访问元素时下标超出有效范围时,程序会抛出异常: alist =...只会尽可能把满足条件元素都取到 但如果两个界限超出了范围的话就会取不到元素,但也没有报错: alist = [1, 2, 3, 4] print(alist[100:200]) 遍历列表元素 下面将进行讲解如何进行遍历数列元素...是搭配列表对象alist来使用,而不是作为一个独立函数,是一种搭配对象函数。...希望大家通过可莉一起学习这篇博客能可以你更好地理解列表元组,并选择适当数据类型来处理你数据,加油~

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Java中常见异常类型

IllegalThreadStateException 请求操作与当前线程状态不兼容。 IndexOutOfBoundsException 一些类型索引是超出界限。...IllegalThreadStateException 请求操作与当前线程状态不兼容。 IndexOutOfBoundsException 一些类型索引是超出界限。...IllegalThreadStateException 请求操作与当前线程状态不兼容。 IndexOutOfBoundsException 一些类型索引是超出界限。...当对数组索引值为负数或大于等于数组大小时抛出。 java.lang.ArrayStoreException 数组存储异常。当向数组中存放非数组声明类型对象时抛出。...当应用试图通过名称枚举类型访问一个枚举对象,但该枚举对象并不包含常量时,抛出该异常。 java.lang.Exception 根异常。用以描述应用程序希望捕获情况。

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操作系统笔记:内存虚拟化

具体说,操作系统必须将当前基址界限寄存器中内容保存在内存中,放在某种每个进程都有的结构中,如进程结构或进程控制块中;当操作系统恢复执行某个进程时,也必须给基址界限寄存器设置正确值。...空闲空间被分割成不同大小小块,成为碎片,后续请求可能会失败,因为没有一块足够大连续空闲空间,即使这时总空闲空间超出了请求大小。...目前已经有数百种方法,包括经典算法: 最优匹配 (best fit):首先遍历整个空闲列表,找到请求大小一样或更大空闲块,然后返回这组候选者中最小一块。...还有一些改进策略: 分离空闲列表:如果某个应用程序经常申请一种(或几种)大小内存空间,那就用一个独立列表,只管理这样大小对象。其他大小请求都交给更通用内存分配程序。...如下图所示: 简言之,页表就是一种数据结构,用于将虚拟地址 (或者实际上,是虚拟页号) 映射到物理地址 (物理号)。因此任何数据结构都可以采用,最简单形式成为线性页表,就是一个数组。

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数组

数组初始化 定义数组语法格式 定义数组有两种方式,如下两种格式是等价: int[] a1; int a1[];  注:在C/C++中,不支持第一种格式。...对象数组 基本类型数组就是指保存数据类型为基本类型数组,如int、long、double等。 对象数组是指保存数据类型为非基本类型数组,如一些内置类或自定义类等。...对象数组基本类型数组在使用上几乎是相同;唯一区别就是对象数组保存是引用,而基本类型数组直接保存是基本类型值。 如下代码中,声明一个自定义类apple类型数组。...注:C/C++一样,JAVA数组计数也是从第0个元素开始,所以下标最大值为length-1。如果超出边界,编译器会提示错误。 数组特点 数组是一种效率最高存储随机访问对象引用序列方式。...如果现在广泛使用容器相比较,它优点在于访问效率比较高,缺点在于大小固定,没有容器大小伸缩性。

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【愚公系列】2021年11月 C#版 数据结构与算法解析(数组)

线性表每个元素必须有相同结构(元素可以是简单数据,也可以是复杂数据,但复杂数据内部结构要相同)。...缺点:1、定义数组时候需要指定数组长度(过长会造成内存浪费、过短会导致程序异常System.IndexOutOfRangeException:“索引超出数组界限”) 2、插入删除元素效率低、也比较麻烦...缺点:1、ArrayList会把插入数据都当做object类型来存储、在操作数据时候可能会因为类型不匹配而出现异常、它是非类型安全对象。...NET Framework 2.0 推出了List List 表示可通过索引访问对象强类型列表。 提供用于对列表进行搜索、排序操作方法。...这样就避免了类型不安全、以及数据强制转换导致装箱拆箱损耗性能。 备注:哈希表(散列),就是数组升级版通过hash运算快速查找到值,数组下标就是哈希值。(前512是int,后才是哈希)

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R语言函数含义与用法,实现过程解读

解线性方程求矩阵逆,奇异值分解与行列式见; 六  列表数据 6.1 列表 列表是由称作组件有序对象集合构成对象。组件模式或类型不一定相同。...> list.ABC <- c(list.A, list.B, list.C) 6.2 数据 数据是类别为"data.frame"列表数据会被当作各列具有不同模式属性矩阵。...数据列表限制 1 组件必须是向量(数值型,字符形,逻辑型),因子,数值矩阵,列表,或其他数据; 2 矩阵,列表数据向新数据提供变量数分别等于它们列数,元素数变量数; 3 数值向量,...逻辑值因子在数据中保持不变,字符向量将被强制转化为因子,其水平是字符向量中所出现值; 4 数据中作为变量向量结构必须具有相同长度,而矩阵结构应当具有相同大小。...此时文件要符合特定格式: 1 第一行应当提供数据中每个变量名称; 2 每一行(除变量名称行)应包含一个行标号各变量值。

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R语言函数含义与用法,实现过程解读

解线性方程求矩阵逆,奇异值分解与行列式见; 六  列表数据 6.1 列表 列表是由称作组件有序对象集合构成对象。组件模式或类型不一定相同。...> list.ABC <- c(list.A, list.B, list.C) 6.2 数据 数据是类别为"data.frame"列表数据会被当作各列具有不同模式属性矩阵。...数据列表限制 1 组件必须是向量(数值型,字符形,逻辑型),因子,数值矩阵,列表,或其他数据; 2 矩阵,列表数据向新数据提供变量数分别等于它们列数,元素数变量数; 3 数值向量,...逻辑值因子在数据中保持不变,字符向量将被强制转化为因子,其水平是字符向量中所出现值; 4 数据中作为变量向量结构必须具有相同长度,而矩阵结构应当具有相同大小。...此时文件要符合特定格式: 1 第一行应当提供数据中每个变量名称; 2 每一行(除变量名称行)应包含一个行标号各变量值。

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python列表及函数

列表是python中最基本数据结构,[,,,,]由一个方括号以逗号分隔醉成数据集合。...序列中每个元素会自动分配一个位置(这个位置就是索引,也称为下标列表特点: ①.列表中可以包含不同类型对象 ②.支持嵌套 ③.可变即可修改,通过下标切片改变列表元素 6.如何定义列表?...这里lists[1:5]中1是指下标的位置,即第几个下标下标的编号是从0开始),5是正常数字5,即第五个位置. 所以意思就是:截取下标为0第五个元素位置之间值。...8.如何修改列表元素? eg: ? 9.列表索引切片 eg: ?...insert(2,5):2:在第几个索引前面插入数,如果超出下标范围,不会报错并且将新值插入到末尾。 PS:如果超出取值范围会报错 ?

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Python科学运算之存取元素

打印所有的数据 范围中第三个参数表示步长,2表示隔一个元素取一个元素 省略范围开始下标结束下标,步长为-1,整个数组头尾颠倒 步长为负数时,开始下标必须大于结束下标 Python列表序列不同,...使用整数序列作为下标获得数组不和原始数组共享数据空间 获取x中下标为3, 3, 1, 84个元素,组成一个新数组 下标可以是负数 由于bx不共享数据空间,因此x中值并没有改变 整数序列下标也可以用来修改元素值...在现在版本里面,对超出index部分之间报错 我觉得是个好做法,因为一切都是可控 布尔数组 产生一个长度为10,元素值为0-1随机数数组 数组x中每个元素0.5进行大小比较,得到一个布尔数组...多维数组创建方式 结构数组创建 在C语言中我们可以通过struct关键字定义结构类型,结构中字段占据连续内存空间,每个结构体占用内存大小相同,因此可以很容易地定义结构数组。...C语言一样,在NumPy中也很容易对这 种结构数组进行操作。只要NumPy中结构定义C语言中定义相同,NumPy就可以很方便地读取 C语言结构数组二进制数据,转换为NumPy结构数组。

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HashMap、LRU、散列表

发生碰撞后会把相同hashcode对象放到同一个链表里,但是在数组大小不变情况下,存放键值对越多,查找时间效率也会降低 扩容可以解决该问题,而负载因子决定了什么时候扩容,负载因子是已存键值对数量数组长度比值...get对key hash,找到数组角标(indexfor()) 如果hash相同key相同就找到了 如果hash相同key不相同,找链表下一个(通过值找) 其他问题 1.7 1.8 数据结构有什么不同...,一个int数组是存储对象数据对应下标,一个对象数组保存keyvalue,内部使用二分法对key进行排序,所以在添加、删除、查找数据时候,都会使用二分法查找,只适合于小数据量操作, 通常情况下要比传统...为了减少频繁地创建和回收Map对象,ArrayMap采用了两个大小为10缓存队列来分别保存大小为48Map对象。...least recentlly use 最少最近使用算法,就是使用LinkedHashMap 会将内存控制在一定大小内, 这个最大值可以自己定,超出最大值时会自动回收。

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【C语言总集篇】指针篇——从不会到会过程

没错,不同类型指针在进行加1减1操作后,指针变化字节大小与对应数据类型所占空间大小相同; 那如果是+2,就相当于是+1之后再+1,那指针变化字节大小应该是对应数据类型所占空间大小2倍; 同理...在通过解引用将地址中存储值改为0时,p4改变了8个字节内容; 可以看到这个改变内容字节大小与指针对应数据类型所占空间大小也是相同,也就是说,不同类型指针在进行解引用操作是可以操作字节大小与对应类型所占空间大小相同...我们根据这里创建格式可以看到,所谓数组数据类型,实质上就是数组元素数据类型+数组大小。...数组与指针区别主要由以下几点: 数组指针在内存中空间不相同 数组在内存中申请空间时,申请是一片连续空间; 指针指向空间是内存空间中一块空间; 数组指针存储数据个数不同 数组在内存中会根据自己大小申请对应空间个数...,每个空间中都能存放一个数据,所以数组能存放与数组大小数量相同数据; 指针在内存空间中只申请了一块空间,所以指针也只能存储一个数据; 数组指针工作原理不同 数组是先通过数组名找到数组空间起始位置

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Unity可编程渲染管线系列(三)光照(单通道 正向渲染)

Unity当前为light索引支持两种格式。第一种方法是在每个对象设置两个float4变量中最多存储八个索引。第二种方法是将所有对象光照索引列表放在单个缓冲区中,类似于存储GPU实例化数据方式。...现在,Unity必须为每个对象设置其他GPU数据,这会影响GPU实例化。Unity尝试对受相同灯光影响对象进行分组,但更喜欢根据距离进行分组。...让我们将限制增加到16,这与轻量级管线使用限制相同。这就要求我们每向GPU发送更多数据,但是大多数对象只会受到少量灯光影响。在着色器中调整MAX_VISIBLE_LIGHTS。 ?...以及MyPipeline中maxVisibleLights。 ? 重新编译后,Unity将警告我们我们已经超出了先前数组大小。不幸是,不可能仅在着色器中更改固定数组大小。...但是,这仅仅是因为我们没有将其数据复制到着色器。Unity对此一无所知,也没有从每个对象灯光索引列表中消除这些灯光。因此,我们最终可能会遇到超出范围光索引。

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数据必学Java基础(二十四):数组引入学习

,数组用来将相同类型若干数据组织起来。...这个若干数据集合我们称之为数组。二、数组学习1、数组定义数组是相同类型数据有序集合。数组描述相同类型若干个数据,按照一定先后次序排列组合而成。...其中,每一个数据称作一个元素,每个元素可以通过一个索引(下标)来访问它们。数组五个基本特点:1.长度是确定。数组一旦被创建,它大小就是不可以改变。...2.其元素类型必须是相同类型,不允许出现混合类型。3.数组类型可以是任何数据类型,包括基本类型引用类型。...数组本身就是对象,Java中对象是在堆中,因此数组无论保存原始类型还是其他对象类型,数组对象本身是在堆中存储

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python数据分析——数据选择运算

在NumPy中数组索引可以分为两大类: 一是一维数组索引; 二是二维数组索引。 一维数组索引列表索引几乎是相同,二维数组索引则有很大不同。...一维数组元素提取 沿着单个轴,整数做下标用于选择单个元素,切片做下标用于选择元素范围序列。...而在选择行时候可以传入列表,或者使用冒号来进行切片索引。...关键技术:这里介绍一下.iloc[函数]中函数使用方法: ①函数 =自定义函数(函数返回值需要是合法对象(= 整数、整数列表、整数切片、布 列表)) ②匿名函数lambda :使用方法 语法...标准格式及参数解释如下: pd.concat(objs,axis=0,join='outer',join_axes=None,ignore_index=False) objs-这是序列、数据或面板对象序列或映射

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Python笔记之基本数据类型

字符串截取语法格式如下: 变量[头下标:尾下标] 索引值以 0 为开始值,-1 为从末尾开始位置。 string使用测试: #!...字符串一样,列表同样可以被索引截取,列表被截取后返回一个包含所需元素列表。...列表截取语法格式如下: 变量[头下标:尾下标] list使用测试 Tuple(元组) 元组(tuple)与列表类似,不同之处在于元组元素不能修改。...元组中元素类型也可以不相同 Set(集合) 集合(set)是由一个或数个形态各异大小整体组成,构成集合事物或对象称作元素或是成员。 基本功能是进行成员关系测试删除重复元素。...创建格式: parame = {value01,value02,...} #或者 set(value) Dictionary(字典) 列表是有序对象集合,字典是无序对象集合。

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python模块之sys

到调用代码检查时,非死锁线程返回可能与该线程的当前活动没有关系。 此函数应仅用于内部专用用途 sys.breakpointhook() sys....sys.getsizeof(object[, default]) 返回任意对象字节大小。所有的内置对象都能返回正确结果,但对于第三方扩展不一定适用。...对于未提供获取大小方式对象,返回default。如果未提供default,抛出TypeError异常。...下列属性在不同python实现上都存在: name:实现标识符,比如"cpython"。 version:具有同sys.version_info相同格式,表示python实现版本。...可以通过命令行参数"-u"重写 Note:要从标准流中读取二进制数据或写入二进制数据到标准流,使用底层二进制buffer对象

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视频压缩原理入门

图像大小如何计算? 图像大小:像素数量 * 像素大小 = 图片大小,而 像素大小 像素深度1有关系。...码率(Bit Rate):视频文件在单位时间内使用数据流量,决定视频质量大小,单位是 kb/s 或者 Mb/s。 一般来说同样分辨率下,视频文件码流越大,压缩比就越小,画面质量就越高。...视频压缩原理 主要是将视频像素数据(RGB,YUV 等)压缩成为视频码流,从而降低视频数据量,也就是处理像素。 YUV: RGB一样是一种颜色编码格式,相比RGB更利于压缩。...帧内压缩 也叫空间压缩,类似于图像压缩,属于有损压缩算法,达不到很高压缩比。 2. 间压缩 主要是通过记录关键,通过压缩关键之间连续冗余信息(连续相同像素区域)过程。...视频编码格式主要是对视频大小进行压缩,分为帧内压缩间压缩,间压缩主要是通过记录关键形式来进行压缩。

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