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R : Shiny|搭建单细胞数据分析云平台

前言 shiny官网(https://shiny.rstudio.com/) 在R for data science这本书中，作者提出数据分析的一个流程，在数据转换、可视化以及建模之后，来到数据分析的新阶段...之前我们分享了许多单细胞数据分析的教程cellranger拆库定量、seurat质控分析，monocle轨迹推断，R语言给单细胞数据分析带来更多可能。...R for data science 有不少文章在发表的最后也会附上数据探索的一个Shiny程序，方便读者再利用文章的数据。...建立Shiny程序 在Rstudio中像新建文件一样，建立Shiny文件： ?...编写 server.R 以及ui.R 然后就可以开始写我们自己的shiny程序了，先来看一下我的server.R： # # This is the server logic of a Shiny web

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R In Action|创建数据集

5)因子(factor)：类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子（factor），绘图时候重要。 6)列表(list)是R的数据类型中最为复杂的一种。...3)数组：从数组中选取元素的方式与矩阵相同 4)数据框：可以使用前述（如矩阵中的）下标记号，亦可直接指定列名。...联合使用函数attach()和detach()或单独使用函数with()来简化代码； 示例如下： attach(mtcars) #函数attach()可将数据框添加到R的搜索路径中summary(mpg...) #检查搜索路径中的数据框，以定位到这个变量plot(mpg, disp)detach(mtcars) #函数detach()将数据框从搜索路径中移除 with(mtcars, {nokeepstats...2)使用read.csv()导入csv(excel)数据。 3)write.table , write.csv 输出R结果到文件中.

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下载kaggle数据集的小妙招

kaggle是很多数据分析和机器学习初学者非常喜爱的数据科学竞赛平台。 这个平台上有很多接近现实业务场景的数据集，非常适合练手。...今天向大家推荐一个下载kaggle数据集的小工具——kaggleAPI 配置好之后，可以写个脚本，以后下载数据就方便多了。...然后就会自动下载一个kaggle.json文件，另存到第一步那个.kaggle文件夹 下载数据集 再执行以下 kaggle compeitions list 可以看到近期的一些竞赛，重点关注以下奖金?...kaggle competitions {list, files, download, submit, submissions, leaderboard} 大家最关心的数据集下载 kaggle datasets...{list,files,download,create,version,init,metadata,status} 比较常用的是：list（可用数据集列表）、files（数据文件）、download（下载

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kitti数据集介绍_cifar10数据集下载

KITTI数据集下载及解析 W.P....KITTI数据集下载官网 （不想爬梯子的朋友可移步我的CSDN博客：KITTI数据集下载（百度云）） 3D Object Detection经典论文整理【分类/下载/代码/笔记】 基于OpenPCDet...框架的基线模型下载及性能评估 1.1 数据采集平台 图1.1 3D物体的观察角和方位角 ​ 如图1.1所示，KITTI数据集的数据采集平台装配有2个灰度摄像机，2个彩色摄像机，一个Velodyne...* 如果要将激光雷达坐标系中的点x投影到左侧的彩色图像（P2）y中，可使用如下公式： y = P 2 ∗ R 0 _ r e c t ∗ T r _ v e l o _ t o _ c a m ∗...第16列（浮点数）：检测的置信度（score） 要特别注意的是，这个数据只在测试集的数据中有（待确认）。

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【数据集】机器学习数据集汇总（附下载地址）

/ 大型众包关系数据库自然语言查询语义解析数据集(8万+查询样本) http://t.cn/RNMr09n 赛马赔率数据集 http://t.cn/RNf0tXN 新的YELP数据集：包含470万评论和...多模态二元行为数据集 http://t.cn/RCzFn1g 机器学习论文/数据集/工具集锦(日文) http://t.cn/RKV7x2A 机器学习公司的十大数据搜集策略 http://t.cn/R54rtvd...高质量免费数据集列表 http://t.cn/R6B1aqa 《数据之美》自然语言数据集/代码 http://t.cn/hBOTM4 微软数据集MS MARCO，阅读理解领域的「ImageNet」 http.../labs/dl/p.html 互联网图片库来自sogou图片搜索所索引的部分数据。...对于每张图片，数据集中给出了图片的原图、缩略图、所在网页以及所在网页中的相关文本。

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将Shiny APP搭建为独立的桌面可执行程序 - Deploying R shiny app as a standalone application

0 准备工作 1 下载安装R-portable 2 配置 Rstudio 3 搭建Shiny App 3.1 添加模块 3.2 写AppUI和AppServer 3.3 测试App 3.4 打包Shiny...为了达到这个目的，最好的结果是将R中的Shiny App转换为一个独立运行的exe文件，也就是一个这样的桌面应用： image.png 10065741-1d8037cb4acec453.png 对，我实现了...0 准备工作 熟悉R及Rstudio 熟悉命令行操作 了解Shiny App及其基本结构 确定了解我们的目的 新建一个工作目录C:\myShinyApp 1 下载安装R-portable 链接：https.../dev中的三个脚本01_start.R，02_dev.R，03_deploy.R以及./R中的三个脚本app_ui.R，app_server.R，run_app.R。.../dev/run_dev.R脚本中测试一下我们的Shiny App： > # Detach all loaded packages and clean your environment > golem:

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数据集 | 如何方便的下载GLASS数据

上图就是以GLASS LAI产品为例，显示的三种GLASS数据。 介绍完GLASS数据以后，我们就要说一下如何下载使用它了。...国内可提供下载的网站是，国家地球系统科学数据中心，网址为：http://www.geodata.cn。 但是我们今天不推荐使用它进行下载GLASS数据，因为还要申请账号，挺麻烦的。...美国马里兰大学的官网也提供GLASS数据的下载，并且不需要申请账号，十分的方便。关键这个网站国内也可以直接访问，不需要设置访问国外网站。...网址为： http://www.glass.umd.edu/Download.html 我们打开网页，就可以选择自己需要的数据进行下载。 下面，我们就选择其中一些数据进行展示一下。...如果进行数据处理可以使用python中的pyHDF库，用起来还是蛮方便的。 需要注意的是，GLASS数据会把数据存储为整数，所以一般需要乘以一个尺度因子。这些信息也都存贮在HDF文件中。

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keras中的数据集

数据在深度学习中的重要性怎么说都不为过，无论是训练模型，还是性能调优，都离不开大量的数据。有人曾经断言中美在人工智能领域的竞赛，中国将胜出，其依据就是中国拥有更多的数据。...除了自行搜集数据，还有一条捷径就是获得公开的数据集，这些数据集往往是研究机构或大公司出于研究的目的而创建的，提供免费下载，可以很好的弥补个人开发者和小型创业公司数据不足的问题。...注意 keras.datasets模块包含了从网络下载数据的功能，下载后的数据集保存于 ~/.keras/datasets/ 目录。因为这些数据集来源各有不同，有些需要访问外国网站才能访问。...出于方便起见，单词根据数据集中的总体词频进行索引，这样整数“3”就是数据中第3个最频繁的单词的编码。...总结 从上面的代码可以看到，keras提供的接口非常简洁，仅仅调用各数据集的load_data()方法，开发者无需处理数据下载、数据保存、数据解析等等细节，可以极大的方便开发者将精力集中于业务开发。

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-07

分别是runUrl, runGitHub, runGist runUrl runUrl 会直接从网页连接下载和启动一个shiny app 使用方法 直接保存shiny app 的目录为一个zip文件...托管这个zip文件到网页连接，任何获取这个连接的人都可以从R中启动这app library(shiny) runUrl( "") runGitHub 如果没有自己的网站，免费的代码托管网站...然后将您的app.R文件以及该应用程序使用的所有补充文件存储在存储库中。...Connect，这是您的团队在R中创建的工作的发布平台。...恭喜你 您已经完成了整个Shiny开发过程。您可以构建复杂的反应式应用程序，进行部署并与他人共享。用户可以与您的数据进行交互，并以新的方式关注您的故事。 下一步是练习，然后探索Shiny的高级功能。

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使用R和Shiny创建数据可视化仪表盘的详细教程

数据可视化仪表盘是将数据直观呈现并提供交互性的强大工具。R语言与Shiny框架的结合，使得创建交互式数据可视化仪表盘变得轻松而灵活。...在这篇博客中，我们将深入介绍如何使用R和Shiny创建一个简单而实用的数据可视化仪表盘。步骤1：安装和加载必要的包首先，确保你已经安装了以下R包：shiny、ggplot2、dplyr。...应用在R中运行Shiny应用：RCopy codeshinyApp(ui, server)这将启动Shiny应用，你可以在浏览器中访问http://127.0.0.1:XXXX（XXXX为端口号），查看创建的数据可视化仪表盘...Shiny创建一个简单的数据可视化仪表盘。...随着你的深入学习，你可以探索更多的Shiny功能和图形库，创造出更加复杂和功能丰富的仪表盘。祝你在数据可视化的旅程中取得成功！我正在参与2023腾讯技术创作特训营第四期有奖征文，快来和我瓜分大奖！

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-01

上面是shiny团队的稿件 shiny是一个直接用R来制作交互式网页应用 (interactive web applications (apps)) 的R包 一、欢迎使用shiny 如下就是一个简单朴素的...，做一些计算然后画成对应柱子数量的直方图 其中renderPlot 包含了大部分脚本，之后会详细解释，目前看不懂也没关系 试试把上面两块拼进一个shiny app的app.R脚本,记住要以library...runApp和其他R中的许多函数(read.csv, read.table)一样，第一个参数的是从工作目录到app的目录的文件路径，以上代码假设my_app文件夹包含在你的工作路径，因此，只需要输入文件夹的名字...当shiny app启动后，R的会话框会变成忙碌状态，不能运行任何其他代码，R会监控app并处理app的反应。...Shift+Enter) 点击灰色的向下展开小箭头还有更多惊喜哦 一个个点点看 5.回顾一下怎么创建一个app 创建一个以myapp为名的路径（文件夹） 保存app.R到myapp文件夹中 使用runApp

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-02

app代码中 网页面板的对应位置就会显示设置的文本，通过逗号分隔，同一个面板能插入多个元素 ui <- fluidPage( titlePanel("My Shiny App"), sidebarLayout...格式化文本 shiny 提供了许多标签函数格式化文本，跑例子是最简单的了解他们的fangfa 试试把下面的代码粘贴到app中的合适位置 ui <- fluidPage( titlePanel("My...shiny 用 img 函数将图片放入app中 src参数用于指定图片的来源，比如，img(src = "my_image.png"，这是必要的参数，不然不知道传递哪张图片到app呢 也有其他参数能够定义图片的属性...www的文件夹中，shiny会通过特殊的处理，将这个文件夹中的文件与浏览器共享，www就是存放图片，样式表等东西的大本营，里面的文件用于浏览器构建app的网页部分。...比如放入一个图片rstudio.png下载连接 目录结构看起来像这样 应用到app的代码中就是 library(shiny) # Define UI ---- ui <- fluidPage( titlePanel

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-03

，每个都可以用直白命名的R函数创建，例如函数actionButton 用来创建 动作按钮 （Action Button），函数 sliderInput 创建 一个 滑块 （slider bar） 下表是常见的小部件...一个label：这个标签将和app中的小部件一起出现，应该是字符串，但是也可以是空的"" 此例中，name参数是"action", 标签是 "Action" actionButton("action"...app中 访问这个网站，图库中展示了每个小部件，并演示了每个小部件的值根据你的输入而变化 选择一个小工具，并点击See Code。...图库会跳转到一个描述这个小工具的示例app，只需要复制其中代码到自己的app中即可。...from your R console:"), code('install.packages("shiny")'), br(), br(), br(),

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-06

上面是shiny团队的稿件 L6-反应表达式 用反应表达式，快速构建，模块化app ⚠️此篇的线上数据可能有时无法顺利抓取，要多试几次 使用反应表达式 用户会赞叹快速的app，但是你的app有大量运算影响速度了该怎么办呢...stockVis主要依赖两个来自quantmod包的函数 1.使用getSymbols 直接从网站下载数据到R，比如Yahoo finance，Federal Reserve Bank of St....shiny会重建对象，一旦： 对象的render*函数中，input值改变了 对象的render*函数中，反应表达式过期了 将反应表达式作为一条链中的连接，把input值和output对象连了起来。...output中的对象会响应链中任何下游的更改(你可能会塑造一个长链，因为反应表达式可能包含其他反应表达式) 为何仅仅从reactive或者render*调用反应表达式，只有这些R函数能处理反应输出，没有警告的改变...，让用户能切换价格是否适应通货膨胀 helper.R 中的adjust函数使用由圣路易斯联邦储备银行提供的Consumer Price Index 数据，将历史价格转为当前价格，是如何用代码实现呢？

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-05

上面是shiny团队的稿件 l5-更复杂的反应app 创建一个更复杂的依赖R脚本和额外数据的有灵魂的（能反应的）app 使用R脚本和数据 此篇旨在展示如何载入数据，R脚本，包，用来构建app。...构建一个复杂的数据，可视化美国的人口普查数据 看起来像下图 counties.rds counties.rds是一个包含美国每个县人口统计数据的数据集，使用R包UScensus2010收集，也可从这下载...下载文件后 新建一个data文件夹于census-app文件夹中 将counties.rds放入data文件夹 目录结构看起来像这样 这个叫counties.rds的数据集包含以下内容 美国每个县的名字...地区分布图使用颜色展示变量的地区差异 此例中，helpers.R 将会创建一个percent_map ，一个设计用于匹配counties.rds数据的函数，下载 脚本将会使用maps和mapproj包，...构建参数值 如何放置这些设置参数的代码 赶紧先自己做做吧 回顾 如今，你已经可以使用R脚本，数据集，包创建复杂的app了 有几个要点 对于shiny app 来说，app.R脚本所在的路径就是工作目录

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