最近工作中遇到一个需求，就是需要更新 yaml 配置文件，但是在实际读取和写入的过程中，发现 yaml 默认会按照字母顺序对数据进行排列，于是就导致了 yaml 文件无法保留原有的格式和顺序，这既不便于对比前后变化...，也容易有潜在问题遗留，于是，进过一番搜索查询，我收集到了可以最接近地保留源文件格式的方案。...问题复盘 首先来看一下这个问题的背景，有如下一份 yaml 配置文件（如下只是示例，实际的配置大概一千多行），现在需要结合另一个配置文件，来更新此文件，这里我直接省略更新的过程，只说读取和写入遇到的问题...规避格式问题 首先我们来解决格式跟源文件不一致的问题（其实就是 yaml 语法形式），在写入的时候，safe_dump 方法其实可以传入一些参数，其中有一个参数就可以决定 yaml 写入格式的风格。...规避排序问题 虽然通过参数改变了 yaml 写入风格，格式总算和源文件一致了，但是 yaml 重新写入的是默认按照字母排序这种逻辑我反正没搞懂，为什么默认不是按照读取的文件顺序排列的？
/pyyaml.html 12 默认支持Yaml1.2 PyYAML支持YAML 1.1标准，ruamel.YAML支持2009年发布的YAML 1.2； YAML 1.2放弃了对几个未提及的功能的支持...，包括Yes、No、On、Off； YAML 1.2不再接受以0开头且仅由数字字符组成的字符串作为八进制，需要使用0o[0-7]+（对于八进制，零+小写o+一个或多个八进制字符）指定此类字符串； YAML...14 修复 转储时，ruamel.yaml跟随标量上的indent关键字参数； ruamel.yaml允许：在纯标量中，只要它们后面没有空格（根据规范）。...除了新的测试之外，原始的PyYAML测试框架也在tox运行中调用； 在将版本推送到PyPI之前，将在所有支持的Python版本上调用tox，并且必须在PyPI以及flake8/pep8上传递。...16 API 从0.15开始，使用ruamel.yaml的API出现了分歧，可以更容易地添加新功能。
达到相同目的,可以有多种写法,每种写法有性能、可读性方面的区别,本文旨在探讨不同写法之间的性能差异 len(str) vs str == "" 本部分参考自: [问个 Go 问题，字符串 len...-benchmem (添加 -benchmem 参数,可以提供每次操作分配内存的次数，以及每次操作分配的字节数。...= minimum 执行 go tool pprof -web xxx.test cpu.profile ----- EOF ----- ---- 几种 int转string 方法的性能差异...中整数转字符串[2] ---- 几种 字符串拼接 写法的性能差异 将两个字符串 "hello"和"world",拼接为"hello,world" package shuang import ( "...大小的内存空间 第7行显示了BenchmarkAddStringWithBuffer-8 执行了1000000000次，每次的平均执行时间是 0.000104纳秒, 无内存分配 最后一行显示总共的执行时间为
其中，yaml文件是一种配置文件类型，相比较ini，conf配置文件来说，更加的简洁，操作也更加简单，同时可以存放不同类型的数据。...以下主要介绍yaml语法、yaml存储数据，封装类读写yaml配置文件。 一 yaml介绍及使用 01 yaml简介 YAML 语言（ /ˈjæməl/ ）的设计目标，就是方便人类读写。...02 yaml语法规则 基本语法规则： 大小写敏感； 使用缩进表示层级关系； 缩进时不允许使用Tab键，只允许使用空格； 缩进的空格数目不重要，只要相同层级的元素左侧对齐即可； # 表示注释，从这个字符一直到行尾...配置文件格式校验 刚了解yaml的同学，可能对yaml格式掌握不熟练，出现格式错误，这里推荐一个在线网站，用于校验我们写的yaml文件格式是否正确。...01 安装pyYaml 在python中读取yaml文件，需要用到第三方模块PyYaml。
，在Python2和Python3上使用方式略有差异 是否是标准库 标准库，Python2上和Python3上包名称有差异 不需要额外安装模块算是优点之一 python2中包名称首字母大写 python2...随着yaml文件的普及，不少项目开始把自己的配置文件换成了yaml文件格式 是否是标准库 非标准库，需要单独安装，另外需要注意的是，yaml编写格式对齐有要求，一定要特别注意，常见的使用的有gitlab-ci...pyyaml[3] 安装 pip install pyyaml 演示 python2 >>> import yaml >>> >>> >>> config = yaml.safe_load(open(...，避免语法错误 大家在看别人的代码的时候，可能会看到simplejson这个库，原因有几个： •json是在python2.6的时候引入的，simplejson可以兼容更低版本的Python•simplejson...，是需要区分环境的，不同的环境连接DB和中间件的地址或部分常量是有所差异的，这个时候就需要以环境区分来进行加载操作，一般是在入口文件里定义一个变量，启动时去读取这个变量，如果存在就按照指定环境的配置启动
全称为：YAML Ain’t Markup Language，它不是标记语言，是一种轻量级数据交换格式；是一个易读易理解的数据序列化格式；面向文本，不同的语言中有相应的解析器和生成器，比如Python中的...PyYAML；可常用于各种语言的配置文件。...2 YMAL语法了解使用空白符、缩进和一些符号表示数据结构；使用缩进表示数据结构的层次；YMAL中字符串使用单引号、双引号均可；注释或备注使用#号；2.1 数据类型# 基本数据类型str: "Hello...4 不同语言的解析和生成Python：pyyaml库；Ruby：psych 库；Java：snakeyaml 库；JavaScript：js-yaml 库。...5 使用pyyaml库解析安装：pip install pyyaml新建一个config.yaml文件，如下：# test# 基本数据类型str: "Hello World"
周五下班的时候想在 windows 电脑上跑一下 FixIt 看看有没有什么 bug, 然后就发现了 typyit shortcode 开头多出一行空行，mermaid shortcode 则直接语法报错了...debug 了一下才发现 Windows 系统上的换行是 \r\n, 而 Mac 系统上的换行是 \n。于是查了一下不同系统的换行符的差异问题。...历史 简单来说，回车换行这些说法是从打字机那个时代开始叫的，然后在不同的标准下换行符有不同的表现符号。...Windows 系统设计遵循了 CR + LF 的约定，而 Unix 系统则遵循了 LF 的约定, 之后的 类 Unix (Linux, macOS) 系统也遵循了 LF 的约定。...表示 CR 回车: \r LF 换行: \n 操作系统 换行符号 Windows \r\n Unix、Linux、MacOS \n classic Mac OS \r 问题 由于这个差异，会导致文本类的文件在跨系统浏览时会产生一些差异
，常用的配置文件格式有ini、json、yaml等，下面简单给大家介绍下，Python如何读写这几种格式的文件。...ini格式 ini 即 Initialize ，是Windows中常用的配置文件格式，结构比较简单，主要由节（Section）、键（key）和值（value）组成。...格式 yaml全称Yet Another Markup Language（另一种标记语言），它是一种简洁的非标记语言，以数据为中心，使用空白，缩进，分行组织数据，解析成本很低，是非常流行的配置文件语言...yaml的语法特点： 大小写敏感 使用缩进表示层级关系，缩进的空格数目不重要，只要相同层级的元素左侧对齐即可 缩进时不允许使用Tab键，只允许使用空格。...字符串、布尔值、整数、浮点数、Null、时间、日期 Python中使用pyyaml处理yaml格式数据 使用前，需要进行安装 pip install pyyaml yaml文件读取 用python读取yaml
yaml作为配置文件格式，比json和properties更加优化和结构化，而且还支持注释。...python中一般使用PyYaml模块来解析yaml 安装 pip install pyyaml 配置文件 config.yaml # 用户信息（映射为dict） user: name: tenmao...# 打开文件 with open("config.yaml", encoding='utf8') as a_yaml_file: # 解析yaml parsed_yaml_file...= yaml.load(a_yaml_file, Loader=yaml.FullLoader) print(parsed_yaml_file["user"]) print(parsed_yaml_file.get...解析结果 参考 Reading and Writing YAML to a File in Python https://pyyaml.org/wiki/PyYAMLDocumentation
1 Monocle找不同谱系之间的高变化基因 加载数据 rm(list = ls()) options(warn=-1) options(stringsAsFactors = F) source("...lineageNb=1, female_clustering ) > dim(female_lineage1_sig_gene_pseudoT) [1] 12612 6 # 从中找到差异显著的基因...female_lineage2_sig_gene_pseudoT[female_lineage2_sig_gene_pseudoT$qval<0.05,] # 从11937个基因里面挑选出2182个差异显著的基因..._sig_gene_pseudoT, female_lineage2_sig_gene_pseudoT, file = 'lineage_sig_gene.Rdata') 2 将不同谱系中的高变化基因进行分类...找到了变化显著的基因，就相当于缩小了操作对象，下面聚类的操作就会得到这些基因并基于它们进行后续分析 2.1 取两个谱系全部的HVGs，并进行去重复 首先各自提取两个谱系中差异显著的基因 female_lineage1
这也意味着用户需要了解这两种工具的发现规则，因为每个工具可能支持不同的软件包格式或以不同方式确定最新版本。...经过distutils-sig邮件列表上发起的投票，当前的名称胜出。 其他文件格式 提出了其他几种文件格式供考虑，都因各种原因而被拒绝。 关键要求是该格式可以由人进行编辑，且可以通过项目落地。...YAML YAML格式[8]被设计为JSON的超集[7]，同时更易于手工操作。 YAML有三个主要问题。 一个是规范太多：如果打印在letter尺寸的纸上，则为86页。...最后，最流行的YAML的Python实现是PyYAML [10]，它是一个包含几千行代码的大型项目，也是一个可选的C扩展模块。...PyYAML的一个概念验证已经完成，看看供应一个简单版本的库是多么地简单，这一切表明了一种可能性。 一个YAML示例文件: ?
apiVersion版本 ---- 当编写一个yml文件时，第一行必须先写入apiVersion的版本 不同的apiVersion可以实现不同的功能，或者配合不同的组件去使用 官方文档也没有给出一个充分的解释...这是k8s准备出的一些新功能会包含在这个版本中，很有可能会出现未知无法解决的错误，仅用于测试的版本。...k8s的yaml文件语法 大小写敏感 使用缩进表示层级关系 缩进时不允许使用Tab键，只允许使用空格。...containers: - name: nginx image: nginx:1.7.9 ports: - containerPort: 80 yaml...，在后面的使用过程中会提到，也回去解释 大致结构是这样的 Labels的重要性 ---- 在新版的k8s中labels是非常重要的 注意： 必须在 Deployment 中指定适当的选择器和 Pod
杂乱带来的最大坏处：管理困难 —— 各种配置的文件类型、配置语法并不统一，对任何刚接入项目的人都有较高学习成本。...一个比较大的疑问，为什么要选择用 toml 这种使用面并不算广泛的文件格式？ 由于长期浸淫在 k8s 里，我第一反应觉得是 yaml 更合适，毕竟表达能力更强。...但待我仔细阅读了 PEP 里的相关比较，发现 toml 的选型反而是正确的。...首先，要搞清楚 pyproject.toml 的使用场景，它是配置的集合，而不是业务逻辑对象，过于复杂的配置反而不利于其发展，毕竟工具配置都是开发的“边角料时间”处理的，不能有太复杂的理解门槛。...PEP 里阐述的 yaml 作为项目配置文件的缺点： 过于复杂灵活，可能会导致不同解析器不能互相解析 本身不够安全，而能解决该问题的 PyYAML 依赖过重 主流工具支持 好孩子 详见： carlosperate
YAML 是什么? 具体是什么我也说不上来! 就拿它当一个配置文件来学习就好了!...以下是它注意的地方 大小写敏感 使用缩进表示层级关系 缩进不允许使用tab，只允许空格 缩进的空格数不重要，只要相同层级的元素左对齐即可 对空格及其严格 语法 # 为注释 # 这个是注释内容 普通写法
apiVersion版本 当编写一个yml文件时，第一行必须先写入apiVersion的版本 不同的apiVersion可以实现不同的功能，或者配合不同的组件去使用 官方文档也没有给出一个充分的解释...这是k8s准备出的一些新功能会包含在这个版本中，很有可能会出现未知无法解决的错误，仅用于测试的版本。...k8s的yaml文件语法 大小写敏感 使用缩进表示层级关系 缩进时不允许使用Tab键，只允许使用空格。...containers: - name: nginx image: nginx:1.7.9 ports: - containerPort: 80 yaml...，在后面的使用过程中会提到，也回去解释 大致结构是这样的 Labels的重要性 在新版的k8s中labels是非常重要的 注意： 必须在 Deployment 中指定适当的选择器和 Pod 模板标签
高通量测序在这几年火速发展，常规的RNA-seq分析是我们先找到合适的相关基因，然后进行下游靶基因的验证。其实，研究调控基因上游的转录因子更能加深后期机制研究的深度。...不仅可以查看转录因子调控的基因，详细的数据注释、分析结果和单个数据集的详细信息（数据的QC情况、motif分析结果、潜在的靶基因预测）、同时还可以在基因组浏览器中查看数据的分布及下载分析的结果文件。...不同数据库中收集的转录因子的信息有所不同，接下来，我们以下列三个数据库：AnimalTFDB 3.0、The Human Transcription Factors 和RcisTarget包自带的motifAnnotations_hgnc_v9...数据库为例，为大家展示一下这三个数据集所含转录因子的信息差异： ****读取不同数据库下载得到的TFs列表 #1_来源于AnimalTFDB3，下载链接：http://bioinfo.life.hust.edu.cn...，但还是存在一些差异。
，如变量number与变量Number表示不同的变量… 相关推荐 2019-09-28 21:13 − Python python是一种跨平台的计算机程序设计语言，是一种面向对象的动态类型语言。...最初被设计用于编写自动化脚本(shell)，随着版本的不断更新和语言新功能的添加，越来越多被用于独立的、大型项目的开发。...原因： 1.Python不用打头文件（咳咳，纯属个… 2019-12-06 14:02 − 学习提纲 生成指定范围的数值列表，语法格式如下： 生成一个包括10哥随机数的列表，要求数的范围在10-100之间...redis 1、操作模式r… 2019-11-27 16:55 − 1.安装 需要安装得模块名为pyyaml，直接pip install pyyaml 导入，直接import yaml 2.yaml文件的格式...文件格式输出可以是列表，可以是字典，可以嵌套。
通常 Python 使用的 Yaml 文件处理的包有 2 个。...PyYAML ruamel.yaml 可以理解为 PyYAML 是 Python 自带的 Yaml 数据处理库，ruamel.yaml 是 PyYAML 的增强版。...因此使用 ruamel.yaml 的会比较多，而且很多语法和函数都是通用的。 安装 PyYAML 和 ruamel.yaml 都需要安装。 使用 pip install 进行安装就可以了。...pip install pyyaml pip install ruamel.yaml 输出 对比了下 2 个包的输出格式，ruamel.yaml 输出格式更好，更加标准。...这也许就是很多人使用 ruamel.yaml 的原因吧。 对比下使用 PyYAML 的输出来看，确实 PyYAML 的输出文件更加不好阅读。
根据平台不同，命名不同，python中的后缀名是.yaml 02 语法格式 yaml语法格式： 区分大小写 使用空格缩进表示层级关系。切记不要使用tab缩进。缩进空格数没有规定，按照个人喜好。...（与python单行注释一样） 数据类型：yaml支持的数据格式如下 字符串 整形 浮点 布尔 日期 空（null） 数组 上述类型除数组外。其他数据类型无特殊语法格式。...yaml中可以灵活运用嵌套规则，形成不同的数据格式：字典嵌套列表，列表嵌套字典等等 锚点 锚点主要作用就是引用公共变量。 语法： 设置锚点 使用&锚点名称。...03 读、写 yaml的读与写依赖python中的第三方包---pyyaml 使用pip install pyyaml下载yaml工具包 导入yaml模块。...在yaml中，使用空格来表示缩进。注意不能使用tab进行缩进。 最后，结合pyyaml进行读、写操作。 以上就是本期内容。各位大佬。我们下期见。拜拜~
Step1：分享背景 在工作中，我们用到的环境经常会有很多套，由于不同的环境使用的配置是不一样的，那么怎么能够对比所有不同环境的相同配置项各是什么内容呢？...指定java工程目录 dirpath="D:\java_project\entitystorage" emails='loadkernel@126.com' alldict={} #获取所有文件里的key...#将获取的key and value 内容放入字典 def get_all_properties(env,k,v): if(env not in alldict.keys()):...alldict[env] = {} alldict[env][k]=v else: alldict[env][k]=v #在页面上展示不同环境的key 对应的值...图中蓝色表示非live环境与live配置相同的。 end
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