WebSocket 是 HTML5 开始提供的⼀种在单个 TCP 连接上进⾏全双⼯通讯的协议,可以实现跨域访问。 websocket安装命令 npm i ws -S 服务器端：
OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/) 是现在用的最多的一款来找直系同源基因（Orthologs）以及旁系同源基因 (Paralog) 的软件。同源基因 (homolog) 的区别见下图，这里就不细说了。
银河麒麟高级服务器操作系统V10是针对企业级关键业务，适应虚拟化、云计算、大数据、工业互联网时代对主机系统可靠性、安全性、性能、扩展性和实时性的需求，依据CMMI 5级标准研制的提供内生安全、云原生支持、国产平台深入优化、高性能、易管理的新一代自主服务器操作系统；同源支持飞腾、龙芯、申威、兆芯、海光、鲲鹏等自主CPU及x86平台；可支撑构建大型数据中心服务器高可用集群、负载均衡集群、分布式集群文件系统、虚拟化应用和容器云平台等，可部署在物理服务器和虚拟化环境、私有云、公有云和混合云环境；应用于政府、国防、金融、教育、财税、公安、审计、交通、医疗、制造等领域。
整理一下最近开发中遇到的小问题，解决了Mysql同步数据、跨域解决办法、Sftp传输文件在这里做一个节点，进行整理和总结。
分享一个超简单搭建WEB服务器的小方法，可以一键将你的普通电脑变身为网站服务器哟！ 1、为了实现快速架设PHP(网站程序)+MySQL(数据库)Web运行环境，这里提供一款超级棒的免费工具 - USBWebserver，是国外汉化版的，绿色无需安装，解压即可使用 2、下载上面的工具包，将里面全部的文件(夹)完整的解压出来，双击运行主程序“usbwebservercncn.exe”，这时一个完美的Web运行环境就搞定了 3、由于该工具包默认开启的网站端口为 8080 ，所以我们需要进入“
Secure by default, in software, means that the default configuration settings are the most secure settings possible……
昨天完成了将STM32采集到的温湿度数据传到服务端，存入Mysql数据库的操作。今天做的是通过express连接数据库，提供接口，让前端页面通过fetch获取数据。其中遇到了跨域问题，在express中解决了。 代码地址：https://github.com/klren0312/stm32_wifi 2017.3.21 搭建简易的物联网服务端和客户端目录 Express服务端与前端获取 1.Express服务端代码 1)连接数据库（前面已经有介绍了） var mysql = require('my
Ensembl 对于学习生物信息学的我们来说应该是如数家珍了，但是我们平时常用到的操作一般是去查基因，下载基因组，这些都是通过网页端来完成：http://uswest.ensembl.org/index.html
我们经常会使用KEGG数据库来研究基因的功能，而在KEGG 数据库中，直接存储分子功能的就是KEGG Orthology 数据库。
廖雪峰：https://www.liaoxuefeng.com/wiki/0014316089557264a6b348958f449949df42a6d3a2e542c000/001431611988455689d4c116b2c4ed6aec000776c00ed52000
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。 本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42528266/article/details/102854828 简介：带你剖析elastic search分布式⼯作原理 前言 Elasticsearch 是分布式的，但是对于我们开发者来说并未过多的参与其中，我们只需启动对应数量的节点，并给它们分配相同的 cluster.name 让它们归属于同⼀个
大家好！针对选手提及的问题技术团进行了倾情解答，内容整理如下。当前的解疑答惑已非常全面，如有疑问请仔细查阅以下Q&A，且文档内容也会实时更新给到大家。
在接口测试中把 Case存储至数据库中，是比较常见的“数据驱动”做法。而在实际的接口测试用例开发中，对数据库的操作无非就是“增删改查”。就为最普遍的单表操作而言，除了表和字段不同外，语句都是类似的，测试人员需要写大量类似而枯燥的语句来完成业务逻辑。
，约80%的小鼠蛋白质在人类基因组中具有严格的1:1种间同源体，其序列同一性通常介于70%~100%。当然跟人类亲缘关系最近的物种是黑猩猩。
大家好，我是Leon-pi，可以叫我pipi，新人报道，是个菜鸟，由于个人也是在学习过程中，文章写的也不是面面俱到，尽善尽美，请见谅。
直系同源蛋白的预测在系统发育，比较基因组学等多个领域都占用重要地位，COG数据库开创了同源蛋白数据库的先河，后续又不断有新的数据库涌现，而eggNOG就是目前使用最广泛的数据库之一。
最近参加了一场面试，平时感觉自己学的还挺不错的，但是在面试的时候才意识到到原来自己还有那么多东西不够了解。
在进行生物学实验或者生物信息的学习中，都会听说KEGG富集分析，而且该方法在高通量测序分析中已然成为数据分析中必不可少的一环。
DRF，全称Django Restful Framework，是一个基于Django的Restful接口框架，是主要用来做API接口的，为前端提供数据的接口。在前面一片博客中，我们构建了一个vue的项目，vue项目是一个前端项目，这个前端项目中的数据就是接口获取的，而今天要完成的drf项目，就是为vue项目提供数据做接口的，我们把前端vue项目和后端drf项目加在一起，就可以完成一个前后端分离的web项目。
在过去的十年中，宏基因组测序技术以惊人的速度提供了越来越多的蛋白序列数据，这些数据已被用于各研究领域，如研究肠道微生物群在人类疾病和衰老中的作用。然而，在收集的所有宏基因组序列中，只有一小部分在功能或结构上进行了表征，其中大部分尚未被探索。近日《Computational and Structural Biotechnology Journal》发表了一篇Mini review，回顾了宏基因组数据如何被用于蛋白质结构预测和蛋白质发现。
今天为大家介绍的是来自Kyunghyun Cho和Richard Bonneau团队的一篇论文。在生物技术领域，挖掘序列（sequence）、结构（structure）和功能（function）之间的关系，需要更好的方法来比对那些与已经标注的蛋白质序列相似度较低的蛋白质。作者开发了两种深度学习方法来解决这一难题，即TM-Vec和DeepBLAST。TM-Vec允许在大型序列数据库中搜索结构-结构的相似性。它经过训练，能够直接从序列对预测TM分数，作为结构相似性的度量，无需中间计算或解析结构。一旦识别出结构相似的蛋白质，DeepBLAST就可以仅使用序列信息来结构性地比对蛋白质，识别蛋白质之间的结构同源区域。
来源于2019的文章：《Oncogenes, tumor suppressor and differentiation genes represent the oldest human gene classes and evolve concurrently》，链接是：https://www.nature.com/articles/s41598-019-52835-w
使用spring data jpa 开发时，发现国内对spring boot jpa全面介绍的文章比较少案例也比较零碎，因此写文章总结一下。
富集分析的结果可以通过一个瀑布图和分布热图来进行可视化。同时也提供了数据结果下载的界面。其结果包括11个部分：
背景 预测得到一个物种的全部基因之后，接下来自然而然的问题就出现了。这些基因都有哪些功能呢?这就需要进行基因功能注释。基因功能注释就是将待查基因与已知数据库进行比对，如果比对上则认为二者
BUSCO能利用单拷贝同源基因数据库对基因组序列的完整性进行分析。BUSCO的核心原理是调用hmmsearch将待分析的基因组（转录组序列或蛋白序列）和单拷贝同源基因数据库进行比较，最终得到全基因组（转录组或蛋白序列）对数据库中单拷贝同源基因覆盖的比率。不同物种分类具有不同的单拷贝同源基因数据库，本期以细菌的单拷贝同源基因数据库为例，评估三个株系的沃尔巴克氏菌(Wolbachia)的基因组完整性。
点击来源基因的名称，可以跳转到对应的数据库。点击右上角的Download按钮，可以下载所有结果，点击Datails可以查看环状RNA的详细信息，示意如下
跨域资源共享(CORS)是一种放宽同源策略的机制，它允许浏览器向跨源服务器，发出 XMLHttpRequest 请求，从而克服了 AJAX 只能同源使用的限制，以使不同的网站可以跨域获取数据，目前已经被绝大多数浏览器支持，并被主流网站广泛部署使用。跨域资源共享 CORS 漏洞主要是由于程序员配置不当，对于 Origin 源校验不严格，从而造成跨域问题，攻击者可以利用 CORS 错误配置漏洞，从恶意网站跨域读取受害网站的敏感信息。
微生物由于形态微小，数目众多，分类鉴定一直都是一大难题，传统的微生物鉴定方法，主要是根据微生物的表型特征，例如形态学、生理生化学，生态学等特征来推断微生物的系统发育。但是由于微生物形体微小、结构简单等特点，微生物的分类鉴定除了传统的分类方法之外，还必须寻找新的特征作为分类鉴定的依据。分子生物学的发展，使我们不仅可以根据表型特征，而且可以从分子水平上，通过研究和比较微生物乃至整个生物界的遗传型特征，甚至生物的基因组特征来研究生物的进化、发育和分类鉴定。
序列比对是整个生物信息的核心，因为几乎每个生物信息分析过程都需要用到序列比对。判断两个基因或两段基因组片段是否相似是序列分析的基本工作。从序列数据库搜索，序列拼接到基因蛋白质功能注释，以及进化树构建等，都依赖于分子序列相似性的比较，也就是序列比对。
HTTPS和HTTP的区别主要如下：1、https协议需要到ca申请证书，一般免费证书较少，因而需要一定费用。2、...
eggnog-mapper 是一种用于对未知序列进行快速功能注释的工具。它使用 eggNOG 数据库中预先计算好的直系同源基因组和系统发育树，根据其进化关系推断他们的功能信息。eggnog-mapper 一般用于注释新的基因组，转录组亦或是宏基因组数据。
仅凭嘴皮子，很难让初学者有个直观的印象，那么我就用非常受欢迎的漫威人物钢铁侠来解释下：
在之前 [[Gene Id二三事]] 中介绍过，每一个基因都在不同的数据库当中都有不同的 ID ，但是每一个基因又都有同样的一个基因名。这个基因名是哪里命名的呢？今天来介绍一下基因命名数据库: HUGO Gene Nomenclature Committee: https://www.genenames.org/
作为一名科研狗，重来，是研究生，想来最重要的就是课题能否顺利的进行，当满心欢喜的搞好了实验设计发给老板，一天不到就被打回来，内心那是满满的崩溃
前言：同步一篇2017年1月在QQ空间写的随笔，2017年，我还在实习，现在回首，已经好几年过去，现在看起来，还挺有意思的。
从微博上看到有人提及Mariadb，搜索了一下。找到地址https://mariadb.org/，这是mysql的一个分支，由原作者维护。意在与oracle分庭抗礼，避免oracle将来毕源。
KEGG（Kyoto encyclopedia of genes and genomes, ）（https://www.kegg.jp/）是系统分析基因功能、 基因组信息的数据库，它整合了基因组学、生物化学以及系统功能组学的信息，有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究。
在 HTML5 规范之前，存储主要是用 cookies 。 cookies 的缺点有：
8月16日-18日，2023第十四届中国数据库技术大会（DTCC）在北京隆重召开，会上，腾讯云数据库多位顶级技术大咖就当前热门数据库技术主题、发展趋势和行业实践应用进行了深入探讨和分享。
indexedDB是一种使用浏览器存储大量数据的方法.它创造的数据可以被查询，并且可以离线使用. IndexedDB对于那些需要存储大量数据，或者是需要离线使用的程序是非常有效的解决方法. indexedDB也遵从同源协议(same-origin policy). 所以你只能访问同域中存储的数据，而不能访问其他域的。
前言 此部分内容，均为《基因学苑》公众号付费资源的学习笔记。 一、eggnog-mapper简介 拼接完的宏基因组序列，进行基因预测，去冗余，最终得到宏基因组测序的基因组。那么这些基因都
运行在http://localhost:8082端口的前端服务器express和运行在http://localhost:8080端口的后端服务器golang net/http。前端的javaScript代码使用fetch()函数发起一个到http://localhost:8080/api/students的请求。
SCycDB数据库包含细菌/古细菌52个门2684个属的207个基因家族，共585,055条代表序列，并包含20,761个同源序列。
在上篇文章《Spring Boot(二)：Web 综合开发》中简单介绍了一下 Spring Boot Jpa 的基础性使用，这篇文章将更加全面的介绍 Spring Boot Jpa 常见用法以及注意事项。
在上篇文章springboot(二)：web综合开发中简单介绍了一下spring data jpa的基础性使用，这篇文章将更加全面的介绍spring data jpa 常见用法以及注意事项 使用spring data jpa 开发时，发现国内对spring boot jpa全面介绍的文章比较少案例也比较零碎，因此写文章总结一下。 spring data jpa介绍 首先了解JPA是什么？ JPA(Java Persistence API)是Sun官方提出的Java持久化规范。它为Java开发人员提供了一种对
使用HTML5中的Web Storage API， 可以在客户端存储更多的数据，，可以实现数据在多个页面中共享甚至是同步，对于复杂的数据，可以使用 Web SQL Database API 来实现。
Journal: Database: The Journal of Biological Databases and Curation
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