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计算能够改变科学计算吗?

日前,计算专家汤姆·威尔基提供了两个例证,科学数据集的增长推动向计算进军,另外,这将深刻地改变科学计算。...而几个月前在大西洋的另一边,美国国家科学基金会(NSF)宣布将为Aristotle联盟中的三个大学的私人学术连续5年赠予500万美元的研究资金。...私有云和联合都试图解决同样的两个科学问题:如何利用学术机构有限的预算,为分析现代科学所产生的巨大的数据集提供必要的计算能力?以及如何能够有效地共享这些数据集,而不必重复这些数据集?...这两个项目举例说明行业人士近期对高性能计算的兴趣大增,而在《科学计算世界》的二月和三月号的专题文章中描述:“HPC终于登上云端”。...英国eMedLab项目和美国国家科学基金会资助Aristotle的重点是其数据密集型应用,利夫卡相信针对计算密集型的工作也将有很多机会。

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在腾讯上部署科学计算软件Amber

[amber_mol_fitted.jpg] 缘起 自己的一个朋友是做科研工作的,不久前他找到我向我咨询一个关于科学计算的需求: 他在做蛋白和药物对接相关的研究,希望使用分子动力学模拟软件Amber (...https://ambermd.org/),这款科学计算软件也在材料科学中有着广泛的应用。...部署GPU服务器环境 这里我参考了【玩转腾讯】GPU服务器(驱动篇) 这篇文章,成功部署好GPU服务器环境。但因为我对CentOS更为熟悉,所以操作系统使用的CentOS 7.6版本。...后续工作 做好环境后,我们可以利用服务器的镜像制作功能为部署好的软件环境制作自定义镜像,这样做有如下好处: 可随时使用该镜像创建新的计算实例。 之后机器上的软件环境有问题随时可用该镜像恢复。...可以使用腾讯提供的 批量计算 及 弹性伸缩 服务解决算力不足问题。 可使用镜像的分享功能分享给其他需要的人。

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如何抓住一片计算科学家宠儿

2013年,美国国家科学基金会(NSF)资助的一项调查显示,为实验室提供了接触到它们难以从其他地方获得的计算能力。需要强大计算能力的科学家只需要租借额外的计算能力,而非购买永久硬件。...科学家能配置环境,以适应自己的需求。尽管计算不能处理需要最先进超级计算机进行的分析工作,或机器间的互联,它可能只适合太大而无法在台式机上完成或太小而不值得使用高性能超级计算机的项目。...而且,在线工作让研究团队可以更容易地展开合作,分享数据的虚拟快照、软件和计算配置。 但将科学转移到上,并不是一个轻松的任务。“你需要一个技术背景。...对于一些研究人员而言,选择一个平台是简单的。自2013年起,欧洲核子研究委员会的科学家就开始使用一个大型的内部平台,康奈尔大学和圣母大学等机构也在开发计算。...尽管所有服务者都提供培训和教程,但专门的技术服务人员在拥有校园的大学中更为常见。 尽管存在挑战,但计算正吸引着越来越多的科学家投身其中。

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【玩转Lighthouse】轻松部署个人笔记

前言 市面上笔记类软件很多,但是基本都需要收费,免费的也存在诸多限制。 我们可以用自己的服务器,在服务器上搭建一个私有笔记系统。在自己的服务器上部署也无需担心隐私泄露方面的风险。...为知笔记是一款支持跨平台(Windows、Android、IOS、Mac、Linux)使用的笔记软件:为知笔记。 它支持私有化部署,支持部署到服务器/本地主机。...,2H2G的腾讯轻量服务器即可。...SSH连接软件,如xshell,其实腾讯自带的一键登录也可以。 开始 首先购买服务器,购买过程不在赘述。...购买时推荐选择宝塔Linux面板7.8.0腾讯享版这个镜像,已经购买了服务器的建议也切换到这个镜像。为了简化操作提升效率,docke的部署和管理会用到到宝塔面板。

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数据科学家眼中的大数据和计算

本次分享第【1】部分:什么是数据科学。 本次分享第【2】部分:如何从小白成长为数据科学家。 本次分享第【3】部分:如何以Python为工具走入数据科学之门。...这一部分主要是讲大规模数据处理平台和计算平台。 ? 由于现在数据量在不断增加,单独的机器很难完成大规模的数据处理。...最后要就是计算服务了。 ? 计算服务有三种模式,SaaS,PaaS,和IaaS。...IaaS:基础设施即服务, 用户无需购买硬件, 而是租赁计算提供商的基础设施, 部署自己的OS, 进行自己的计算, 这里的用户一般是商业机构而不是终端消费者。...PaaS:与IaaS类似, 只是用户不再控制OS, 而是利用计算提供商提供的OS和开发环境做开发。 这张图就是解释不同服务所控制的范围的差别: ? 打个比方,公路就是IaaS。

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科学计算工具Numpy

mp.weixin.qq.com/s/2GxvBC5WWRt8eT1JnVqx1w 1.ndarray的创建与数据类型 1.Numpy(Numerical Python) Numpy:提供了一个在Python中做科学计算的基础库...,重在数值计算,主要用于多维数组(矩阵)处理的库。...本身是由C语言开发,是个很基础的扩展,Python其余的科学计算扩展大部分都是以此为基础。...高性能科学计算和数据分析的基础包 ndarray,多维数组(矩阵),具有矢量运算能力,快速、节省空间 矩阵运算,无需循环,可完成类似Matlab中的矢量运算 线性代数、随机数生成 import numpy...SciPy 以此为基础,提供了大量在numpy数组上运行的函数,可用于不同类型的科学和工程应用程序。 图像操作 SciPy提供了一些处理图像的基本功能。

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林帅康:上构建容器化的科学计算平台

演讲嘉宾: 林帅康 | 晶泰科技计算平台技术总监,2015年加入晶泰科技,主要负责晶泰科技高性能计算平台(majorana)的研发工作,专注于在公有上通过mesos/k8s构建大规模的容器化高性能科学计算平台...我们就会想到,现在计算发展得非常快,很多企业已经从传统企业转换成上企业,已经成功落地。能否把传统的科学计算移到上面?当然,现在很多公有平台已经在做,比较典型的产品可能是批量计算、高性能计算。...核实在科学计算里面是一个通用的概念,主要衡量计算池的标准,和超算用浮点的计算能力是一样的,100万核实怎么换算?...在药物计算里面中会有精度要求,从右边图来说,不同的科学计算软件对于输出进行不同的算法计算,会有一个精度的差别,也会反映在时间上面。...我们会用到一些外部挂载,例如腾讯的CFS这种情况,还会用到一些Docker或者K8s默认的内存共享会比较小,比如说几十兆、上百兆,其实有的科学计算软件可能需要几百兆共享内存,如果运行池比较小,就会导致宕机

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【实验楼-Python 科学计算】为什么Python适合科学计算?

计算科学中所扮演的角色 传统意义上科学被分为两类:经验科学与理论科学,但在过去的几十年中计算渐渐成为了科学重要的一部分。...科学计算在接近理论的同时又包含很多实验工作的特性,因此常常被看作是科学的第三分支。在大多数领域中,计算工作是对经验与理论的一个重要补充,现今大量的论文都包含了数值计算计算机模拟和建模。 ?...科学计算的要求 可复制 与 可重现 是科学方法的两块基石。...良好的支持 多进程多线程平行计算 进程间通信 (MPI) GPU 计算 (OpenCL 与 CUDA) 容易获取,适合高性能计算机集群。 不需要许可证费用。 科学 Python 软件栈 ?...IPython 的特性包括: 命令历史记录 Tab 自动补全 对象自省,自动提取对象的文档内容 与操作系统 shell 有良好的交互 支持后端多平行线程,可以运行在计算集群或者服务上 IPython

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Python 科学计算基础 (整理)

随着NumPy、SciPy、matplotlib、ETS等众多程序库的开发,Python越来越适合于做科学计算。...与科学计算领域最流行的商业软件MATLAB相比,Python是一门真正的通用程序设计语言,比MATLAB所采用的脚本语言的应用范围更广泛,有更多程序库的支持,适用于Windows和Linux等多种平台,...* 随着Python3逐渐成为主流,IPython, NumPy, SciPy, matplotlib, Pandas, Cython等主要的科学计算扩展库也已经开始支持Python3了。...Python用于科学计算的一些常用工具和库 ---- IPython-增强的交互环境:支持变量自动补全,自动缩进,支持 bash shell命令,内置了许多很有用的功能和函数 Spyder、Wing IDE...-生物科学 Python科学计算发行版 ---- Python(x,y) 当前最新版本:2.7.6.1 (05/30/2014),支持Windows和Python2.7.6。

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