正文共 2440 字 11 图；预计阅读时间 7 分钟 5月20日，谷歌正式宣布将暂停与华为的相关业务合作，其中包括需要转移硬件、软件和技术服务的相关业务，开源业务则不受影响。 华为创始人任正非之女-孟晚舟女士 2019年5月15日，美国总统特朗普签署《保障信息与通讯技术及服务供应链安全》行政令，要求美国企业不得使用对国家安全构成风险的企业所生产的电信设备。 而在谷歌宣布将暂停与华为方面相关业务合作之前，华为消费者业务CEO余承东就曾表示：“我们已经准备好了自己的操作系统，一旦发生了不能够再使用这些（来自Google和微软的）操作系统的情况，我们就会做好启动 华为自研操作系统突破谷歌安卓系统设下的层层壁垒将是一件相当困难的事情，但一旦突破获得的回报也将是巨大的。 ? 目前智能手机市场上，除去苹果自己的iOS系统，谷歌的安卓系统便占据了剩余的江山。 假如华为能够成功推出自研的手机操作系统，或许会改变当前的局势。 本文属VRPinea原创稿件，转载请洽：brand@vrpinea.com
【编者按】本文作者为日志分析软件公司 Logz.io 的联合创始人 Tomer Levy，主要介绍 ChatOps 的特点与发展历程，以及将来可能带来的业务变革。 你可以查询它们的状态，错误情况，改变设置，甚至创建新的资源。 ChatOps功能提供的服务中已经包含机器人，可以连接多个应用，支持诸如 AWS 之类的基础设施平台。 如今，先进的研发和IT运营团队使用全面的在线聊天室和机器人，推动企业活动，而无需寻求他人协助，甚至不需要开会协商。这些企业把聊天移至团队中心，几乎打造了一个实时运营中心。 ChatOps系统从一个很酷的个人项目转变为一项关键任务型服务，在任何devops环境中都应该被视为一项重要发展。 虽然机器人的开发需要一些时间，但这势必会给网上交流带来巨大转变。 对于初创公司而言，这是一个潜在的机遇，进一步改进和商业化ChatOps，使其更安全，更可靠，功能更丰富。
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在“互联网+”热潮下，传统企业业务创新加速，企业IT基础架构面临诸多变化和挑战，关键应用需要核心系统的持续升级，新兴应用需要创新架构来支撑。 此外，云计算堪称当今IT行业最火热的话题之一，已经有越来越多的厂商开始大力发展自身的云计算业务，用以支撑企业自身的各项业务。 信息技术的每一次进步都会引起经济金融的改变，大数据技术和云计算技术的发展给金融创新带来了迫切的需求和大量机会。 服务于金融行业的技术应该具备相当高的可靠性，以及针对业务和数据的安全性。 有人认为，一个好的云架构在满足可靠性和安全性的需求外，同时也要满足金融行业的一些特定的要求。 从本质上来讲，互联网和金融都是为用户提供服务的一种形式。 云计算最大的特点就是轻松实现弹性扩展，可以随时扩容以应对互联网流量的变化。渐渐地，云计算技术已经从神秘的技术管理模式转变成为能够改变企业业务模式、支撑金融市场业务增长的主导力量。
面对大量的SNV突变数据你是否还觉得无从下手，不知道怎么分析合适？今天给大家介绍一个R包-deconstructSigs。这款R包是基于大样本量预测的signature解析突变特征。 sample.id # 突变文件中的样品列名 chr # 突变文件中的染色体列名 pos # 突变文件中的突变位置列名 ref # 突变文件中的参考基因组碱基列名 alt # 突变文件中的突变碱基列名 TRUE, tri.counts.method = 'default') whichSignatures参数释义 tumor.ref # 上一步生成突变文件 ，数据为数据框或文本，横行是样本，纵行是突变碱基上下文序列 sample.id # 样品名称，tumor.ref文件的行名 signatures.ref # 预测的已知signatures参考文件 signatures.limit # 关联的signature上限，默认无限制 signature.cutoff # 舍弃小于此阈值的关联signature contexts.needed # 是否需要突变上下文
本周，我将继续就前端之变阐述自己的思考，这一次讲到前端之变的重点：变革与突破 这是前端之变系列的第三篇文章，前两篇分别是： 前端之变（一）：技术的变与不变 前端之变（二）: "不变"的前端 同样，在具体说到前端究竟发生了哪个改变前 JavaScript最初的设想非常简单，提供一些浏览器客户行为支持，以避免昂贵的服务端渲染，比如提交数据前验证数据是否完整，准确等。 ，就是 突然有一天，前端发现自己的技术不再受到浏览器的限制 突破，与浏览器说拜拜 终于，在越过一条明显的分界线后，前端技术的发展出现了突破： 虽然在最终产物阶段，仍受限于浏览器，但在编码阶段，技术的发展与能力与浏览器再无关联 CSS 在『后』前端时代，由于突破了浏览器的限制，自然出现了更好的css的替代者。 那就是依赖--转换技术 由于突破了浏览器的限制，使得一切皆有可能，那当然也可以添加翻译这个能力。
这是一个R包，名字叫做“G3viz”，是一个专门绘制基因突变的棒棒糖图的。先来看一下颜值，你觉得OK呢再接着往下看。 是不是很OK？ 怎么样才能画出这么高颜值的棒棒糖图呢？小编这就进入正题。
背景介绍 单个癌症基因组的突变可能是由多个突变过程产生的，因此包含了多个叠加的突变特征。 因此，为了系统地描述导致癌症的突变过程，曾使用数学方法从体细胞突变目录中解释突变特征，并用每个特征产生的概率注释每个肿瘤中的每个突变类。 随后，包含聚类突变的SBS突变目录集进行了突变特征的从头提取。任何新的突变特征(以前在完整的SBS目录中没有看到的)都认为识聚集突变特征。 5. ；SBS42，卤代烷的职业性暴露；SBS44，DNA错配修复缺陷。 结果表明，多个突变过程在正常细胞中运行。 小编总结 癌症基因组中的体细胞突变是由多个突变过程引起的，每一个突变过程都产生一种特征性的突变特征。
mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）水平总结（热图） 6、探索各类肿瘤中单个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）与所有其它分子相关性并且排序 7、探索各类肿瘤中单个基因突变或者单个分子 如果大家感兴趣秀本科生活动， 已经带领了近100名优秀本科生了解生物信息学相关毕业设计：这120万我就不要了，送给500名优秀本科生，符合条件的继续报名哈！ 不知不觉一个月都过去了，优秀本科生已经学完了R语言和Linux，虽然说他们还很稚嫩，也不可能这么快就有自己的服务器，但是已经都购买了最低配云服务器，见：还说啥呢，继续免费啊，里面的：购买入门级服务器免费送 我把它拆解一下： 首先下载TCGA某个癌症的maf文件，里面记录的是肿瘤病人的somatic突变信息 然后下载该癌症全部病人的临床信息 然后根据指定基因，比如上图的BAP1和SETD2在maf文件里面查询是否突变把病人分组 2个基因突变与否是可以分成4组，上图比较的是两个基因都没有突变的1个组，与剩余的3个组来看生存差异 生存曲线当然是R语言啦
时代在发展，数字化时代需要劳动者技能发生改变，结构化思维是数字化时代很重要的业务思维方式，而数字化产品也是数字化时代最主流的产品，软件将是最主要的生产工具，无论从以上那个角度讲，技术人员都有义务帮助业务人员更好地理解软件开发 ，以提升沟通效率，业务人员也应当更加积极主动地了解这些知识，从而推动业务思维的转变。 清晰架构的目的一是为了更好地复现，目前大部分软件开发的需求还是来自业务，是对业务需求的复现，无论你写没写需求文档，这个本质是不变的。 这个问题对业务人员和技术人员的困扰是一样的，并非是一个有着极大专业界限的问题。 “乐高积木”最终是要支持业务人员的需求变化，那服务的切分到底是技术人员自己的事情，还是也需要业务人员的参与呢？ 二、软件过程是业务人员学习技术知识的基础 现在科技发展速度越来越快、应用越来越普及，用技术改变业务模式的呼吁也越来越强烈，所以很多业务人员也对技术发生了浓厚的兴趣，人工智能、区块链、大数据、云计算也都成了业务人员的案前书
利用数学方法从人类癌症成千上万的体细胞突变中已确定超过40个碱基替换和10个基因组重排突变特征。目前研究人员对某些特征的突变过程有了深入的了解，突变过程与许多疾病潜在的生物学机制有关。 在慢性炎症条件下，APOBEC家族表达异常，误伤人类基因组引发APOBEC突变特征。 背景介绍 癌基因组的体细胞突变目录是多种突变过程所产生的突变总和。 目前已发现50多种不同的突变特征，许多突变特征是外部因素引起的，其他是细胞内部因素。 随后使用癌细胞系的一个子集进行实验，评估突变特征的突变过程在体外培养过程中是否持续活跃，并记录其活动的时间变化。不断获得突变特征的细胞系是未来研究突变特征潜在机制的信息模型。 因此，在单细胞中检测到的突变特征表明APOBEC还在继续突变。 Figure 6：单细胞的突变特征表明了APOBEC相关的持续突变。
作者 | 曾响铃 文 | 响铃说（xiangling0815） 一边，是全球数字化浪潮如火如荼，用数字化对旧有工作模式、生活方式进行变革升级已经成为普遍共识，行业数字化转型全面推进，只是快慢不同； 另一边 既完成数字化变革的使命，又实现更好的绿色节能帮助落地碳中和政策，成为政企组织必须同时完成的任务。 而如何做到兼顾？ 2、快：行业大趋势下数字化业务稳健增长 一般认为在基础业务庞大时，一条业务线想要再继续增长会变得比较困难，但数字化的火热加上企业个体的创新与努力改变了这个固有现象。 在金融行业，传统的金融数据中心采用非云架构，业务规模受限，内部紧耦合，难以支撑创新业务快速上线和发放海量服务。 华为GIV预测，到2030年，全球每年产生的数据总量将提升23倍，通用计算总量将提升10倍，AI计算总量将提升500倍，联接数也将突破2000亿…… 这就造成了另外一个问题：ICT基础设施在帮助全社会数字化转型的同时
特别是在后疫情时代，复工复产、从当年的困境中突围，将是中小企业跨代转型的新机遇。 01 活动背景 4月17日，腾讯云·数智驱动中小企业转型升级深圳站即将揭幕。 基于消费习惯的线上迁移，企业全链条数字化、及数字资产成为企业业务发展的内核，在这个数字经济时代，新消费模式高速发展的过程，如何把握致胜原理，实现企业业务升级突围，腾讯云邀请行业智创明星带实操经验、鲜活案例 原幸福西饼COO&副总裁王赟，以庖丁解牛般的讲述，为您复盘幸福西饼的发展历程及商业模式，以点带面，从幸福西饼溯源产业，精准解析行业痛点及机会，聚焦当前如何用数字化解决问题的突围之法，在积累的多个实操案例中 腾讯云数智驱动中小企业转型升级主题活动，目前正在全国多个城市，该活动系针对中小企业，面临“两化”发展的时代机遇，借助腾讯云及战略生态资源，近距离为企业实现跨代转型提供一站式服务，为数字经济时代到来开展的大型主题活动 云+创业计划是腾讯云企业中心下，为创业者定制的创业扶持计划，在提供免费云资源的基础上，将整合资源为创业者享受到融资对接、园区入驻、技术咨询服务、创业大赛、初创企业产品解决方案等权益和服务。
标准结果文本为 14 列，由 TAB 分割： 1.Uploaded variation ：突变 ID2.Location ：位置3.Allele4.Gene ：基因 Ensembl ID5.Feature .Codon change ：the alternative codons with the variant base in upper case13.Co-located variation ：注释突变 （包括 dbSNP）注释突变名称。 默认情况下，VEP 用基于归一化的等位基因来匹配数据库以识别与输入突变相匹配的已知突变。 ? VEP 等位基因匹配算法示意图，该算法会将一条带有多个 ALT 的 VCF 记录解析为三种不同的突变类型和坐标。 ----
好奇怪，最近大家完成学徒作业的积极性很差，是习题太难了吗？一个简单突变位点做生存分析居然拖了一两个月才有人提交笔记！ 前面的题目见：学徒作业-两个基因突变联合看生存效应 （2020-04-26出题），下面看其中一个学徒的答案哦，同时也欢迎大家继续提交笔记给我哈，有机会认识我！ 加油哈，广大粉丝们 1 主要流程 1.本次选用BRCA的maf数据和临床数据，主要使用其中的varscan数据 2.使用R包maftools读取maf文件，并可视化top10突变基因 3.选取两基因对BRCA 临床样本进行分组 所选取两基因都未发生突变的样本为一组 剩余样本为一组 4.使用logrank进行生存分析 2 代码及结果图 1.读取maf文件并对数据进行可视化 options(download.file.method group_list<-ifelse(group_list=="TP53/KMT2C+","TP53/KMT2C+","TP53/KMT2C-") table(group_list) 4.针对基因突变与否
导语 GUIDE ╲ 由于基因组改变引起的分子损伤的特异性，我们可以生成特征改变谱，称为“signature”。 背景介绍 癌症基因组在其生命周期中由各种突变过程形成，这些过程源于外源性和细胞固有的DNA损伤，以及容易出错的DNA复制，产生了特征突变谱，称为突变特征。 sigminer包，帮助用户从基因组改变记录中提取、分析和可视化签名，从而为癌症研究提供新的见解。 obj, sig_db = "SBS") if (require(pheatmap)) { pheatmap::pheatmap(sim$similarity) } 小编总结 作为最新发布的突变特征提取和可视化
延续PC端最基本的盈利策略：广告变现和增值服务 在PC互联网，广告变现看上去很美，然而在工具类APP上却充满艰辛。“只要我有了海量用户，就不愁没有变现方式”，很多从业者认为有流量再不济可卖广告。 对于想兼顾用户规模和商业化收益的产品来说，基础功能免费+增值服务收费的商业模式就很适合，而此处的关键在于该服务是否真值得付费。 ? 在挖掘潜在需求的基础上，连同外界企业，共同打造服务生态圈，让整个工具类APP的价值放大，用户对工具类APP的依赖性便会大大增加，商业价值自然水到渠成。 变现的基础是规模，而规模的根本是打磨好产品 ? 前面分析了这么多的变现策略，但是工具型产品变现的前提基础是规模，不管是工具增值服务收费，还是靠硬件变现，打磨好产品本身最重要。 核心竞争力强：突破性的产品形态和先进智能的定价模型体系 核心竞争力，可以为自己的产品提供技术壁垒，在技术上，气象大数据的分析能力是天气通的专长。
B2B业务介绍和业务发展 01 业务介绍 京东 B2B 业务的定位是让各类型的企业都可以在京东的 B 平台上进行采购、建立采购关系。 B2B技术架构演变 01 业务架构1.0 1）架构 ? 在2014年初期，为了响应业务的发展，我们需要快速上线业务系统，采取的是纵向按业务线进行划分，每一条业务线都有自己的业务层、服务层、存储层，当有新的业务线接入的时候，还是以同样的模式进行开发。 配置（人工） 采集数据（自动） 分发请求（自动） 数据对比（自动） 核对（人工） 条件：新老服务的对外接口参数不变 5）系统耦合改进 系统耦合的问题，通过引入 jmq 消息中间件进行解决。 03 业务架构3.0 ? 3.0的版本主要是修改，包含服务层的抽取、业务和 SOA 分离，同时引入业务和工具组件。 总 结 B2B业务架构经过3次变迁与升级，我们总结到以下经验： ?
本文将告诉你如何将你的思想转变过来，给你一个将业务、将系统、甚至将自己升华的机会。 所以，需要将业务系统抽象为业务平台，支持通用的业务流程，让业务平台为日后的类似的业务系统提供灵活多变的基础业务实现方案，至于特殊的业务流程就单独开发一个特殊的业务系统，两者共同结合提供完整的服务。 如图所示，业务系统与业务平台共同为用户服务。业务平台包含某个业务的通用流程，可能刚好能满足业务的所有需求，那么此时就不需要另外开发一个业务系统。 但如果有一些比较特殊的业务流程或者必须单独创建一个业务方便管理控制的流程的话，那么可以将该业务系统与业务平台结合到一起使用，业务系统提供定制接口，业务平台提供通用接口，业务系统也能通过授权的调用接口来调用业务平台获取 通用业务 首先我们需要想清楚，如何从平台的角度考虑，将设计业务逻辑才能比较通用？如何区分是否为通用的业务逻辑，从而进行业务拆分？ 通用性 目的：解决业务实现的N种可能。
在基因组层面，包括了以体细胞突变为主体的多种基因组变异研究，在转录组层面，包括以ceRNA调控网络为制高点的多项分析内容。 以直接位于miRNA基因区域的体细胞突变位点为例，检索框如下 ? 可以选择对应的肿瘤类型，检索结果示意如下 ? 会给出CLASH数据分析得到的miRNA结合位点，和位于该区域内的体细胞突变的详细信息。 除了直接提供肿瘤相关的体细胞突变位点外，为了更好的研究其功能，还提供了对应的这些突变位点所在基因参与的pathway信息，示意如下 ? 同时还从文献中收集整理了增加患病风险的突变位点信息， 结果示意如下 ? 该数据库将基因组变异和转录组联系起来的分析思路值得我们借鉴。
项目实际意义 从水电工程建设进程来看，自改革开放以来市场竞争变得越来越激烈，工程地质勘察的工作周期变得越来越短。 工程地质专业迫切需要一个能够实现外业数据采集无纸化、外业成果到内业数据转换自动化、勘察数据管理系统化、数据分析智能化的技术方案做支撑，从地质信息的数据采集、存储、加工、分析、制图、以及建立三维地质模型并进行相应的空间分析和决策等整个生产过程进行统一管理 葡萄城技术服务对于项目的价值 目前，项目开发的过程中，用到最多的就是葡萄城的GCDN论坛帮助，遇到不懂得问题只要在论坛发帖都能得到很快的回复并提出可行的解决方案。 —— 朱夏甫 工程师 中国电建集团北京勘测设计研究院有限公司 关于葡萄城 赋能开发者，葡萄城公司成立于 1980 年，是全球领先的集开发工具、商业智能解决方案、管理系统设计工具于一身的软件和服务提供商。 西安葡萄城是其在中国的分支机构，面向全球市场提供软件研发服务，并为中国企业的信息化提供国际先进的开发工具、软件和研发咨询服务。
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