cdo无法处理坐标系（指griddes中xval和yval）中含有missing value的格点。NCL同样不行（见这个ppt）。这种情况往往出现在曲线网格curvilinear中。...对于曲线网格的守恒插值，往往需要提供xbound和ybound。...对于一些网格，特别是卫星数据，出现cdo remapcon (Abort): Source grid cell corner coordinates missing! 的原因往往出在这里。...= y yunits = "meters" xfirst = xinc = yfirst = yinc = 其中，最后四个常数非常重要，需要针对不同的资料寻找对应的格点值...对于写好的网格描述文件，可以使用setgrid将描述文件赋给netCDF，之后就可以使用remapcon插值了。
•插值：和指定权重的方式不同，插值方法是根据给定的输入文件的变量信息，采用线性插值的方式得到输出结果。 上述操作对坐标变量和字符变量无效。...ncks可以完成ncdump和nccopy的大部分功能，同时还可以实现文件的提取、分割等操作，还可以根据给定的网格文件对数据进行插值。...ncrcat无法解包数据，只能简单的从输入文件拷贝数据和元数据到输出文件。...ncremap—netCDF Reapper ncremap是在NCO V4.5.4引入的新工具，可以将输入文件中的数据重新插值到map_fl、grd_dst或dst_fl选项给定的网格，并输出。...其主要应用是进行不同网格投影的数据插值变换，比如将WRF模式Lambert投影结果插值到lat-lon投影，或者是对不同模式的网格化结果进行插值变换。
还是以NetCDF数据集为演示，在演示之前，为了方便操作，从原始数据集中仅提取出单个时步单个变量的某一层数据。...-10-04_06\:00\:00 wrfoutsub_06.nc 使用 cdo info 查看数据集信息可以得到： cdo info wrfoutsub_03.nc -1 :...CDO同时提供了多字段条件选择操作符 ifthenelse。同样以 infile1为参考，然后从 infile2 和 infile3 文件中选择数据。看下图 ?...使用方法和 ifthen/ifnotthen 相同，只需要把 infile1 换为常数即可。 ? 自定义掩膜 在条件选择操作符中，最重要的应该就是自定义掩膜操作符了。...：GRIB格式不能存储非结构网格数据，因此只能输出为 NetCDF数据集。
---- 1、前言 前面已经给大家介绍过如何用cdo配合shape文件提取CMIP6指定区域数据，这个思路首先需要用gdal将shape文件转为netCDF格式的文件，然后再用cdo ifthen进行裁剪...注意：其实第三行的代码是可以去掉的，但是本人的shp文件可能存在一点问题，当没有提取sfcWind数据而直接保存时，第四行代码在执行时出现问题，故采取了折中的处理方式，大家在实际操作过程中，如何保存数据...这里还需要注意一点的是，经过掩码之后，output.nc文件跟CMIP6.nc文件大小(基本上)还是一样大，至于原因，我想可能是这个操作只是根据shape文件，把shape文件之外的区域值全部设置为nan...60度的范围内 从图中可以看出CMIP6.nc和output.nc文件大小是一样大，但是经过selbox操作之后，output2.nc文件就很小了。...其实只看图片效果，可能还想不明白，为什么output2的文件大小会减少的如此之多，但结合nc文件的lat和lon数据，就能想明白了，这里的数据已经不是全球180x360的数据了。 ----
在进行数据处理和分析的过程中或是基于其他原因，为了方便进一步的处理，有时需要将NetCDF数据格式转换为GRIB数据格式。...在格式转换的过程中，首先要确定NetCDF格式数据中是否全部变量都包含网格信息，或是网格类型为非 generic。因为CDO不支持上述两种情况下的格式转换。...在CDO中 generic 表示的只是点，其中不包含任何网格信息。...注意： 编译CDO时，要使用--with*选项指定要支持的操作，比如支持NetCDF，GRIB数据格式，需要指定 --with-netcdf, --with-grib_api 选项。...（即ecCodes）支持grib_api的功能，但是在使用老版本的CDO时，对于初学者来说仍建议使用grib_api。
前言 CDO全称The Climate Data Operators ，是一款相当强大的气象数据处理软件，包含一系列的统计参量和算术函数，用于处理GRIB和NetCDF格式数据有着相当方便指令操作。...用法展示 对于小伙伴们比较常用的时间、空间平均，相关系数，最值处理，乃至EOF分析 在CDO都只需要一行代码 对的，你没有看错，只需要一行代码！...在系统上安装后,只需要将函数后面接上你输入输出的文件，就可以轻松实现数据的处理. 从数据文件中提取、增加、删除变量，改变维数再输入至新的文件. 全部都只需要一个指令，即可完成！...安装教程 废话不多说，我们直接上安装教程 CDO的安装其实很简单，这里我们主要讲述在LINUX系统上的安装 前期需要的软件有6个，本文给出的是博主已经安装成功的版本。...make check’ and ‘make install’ 在安装好eccodes后，要记得在自己的.bashrc中添加eccodes的库环境变量，否则在后面编译cdo时会报错，找不到libeccode.so
CDO在处理气候及模式数据方面有着非常强大的功能，而且其中包含有一些简单的统计和计算函数，数据选择以及空间差值函数。支持常见的气象数据格式，比如GRIB，NetCDF等。...CDO有超过700个可用的数据操作，易于扩展，并且可以如Linux中的管道操作一样直接执行多个操作，而无需产生中间文件，从而省却很多不必要的磁盘空间。...除此之外，大部分操作都支持缺省值处理，而且处理大数据集也相对容易。 说了这么多好处，最好的是可以利用Cygwin在windows上安装CDO，当然也支持Unix/Linux和MacOS-X系统。...CDO的一些扩展功能需要安装一些额外的依赖包，比如：安装NetCDF库以支持NetCDF数据集处理；如果要处理GRIB2格式文件则需要安装ECMWF的GRIB_API库；szip库和HDF5库可用于处理...-m 设置非NetCDF数据集的缺省值。
CDO：一个命令行工具 $ cdo [options] CDO操作的类别 文件信息和文件操作符 选择和比较 元数据的修改 算术操作符 统计分析 回归和内插 矢量和谱转换...赋值和连接 合并场和时间 按变量/层次/格点/时间分割场 一些例子 To copy a file and convert the output to NetCDF: $ cdo −f nc copy...可以用一些不同的方法选择数据包括： 变量码，名称或者属性 层次 时间 空间区域（纬度/经度） 操作符：2.选择 用id选择变量：“SSTK”和”CI”: $ cdo selname,SSTK,CI...$ cdo ydrunpctdl,p,nts infile minfile maxfile outfile 该运算符写滑动的百分值对于一年中的每一天，从infile写到outfile。...T是一个可选的参数，其缺省值T=20℃。 除此之外CDO还能做什么？ CDO有许多通用的命令行开关，可以与（大多数）运算符一起使用。
二进制文件和文本数据 气象中的二进制文件是指利用ASCII及扩展ASCII字符编写的数据或程序指令的文件，一般没有格式，用文本编辑器打开只能看到无意义的乱码，需要特定的解码说明才能使用，例如气象雷达的数据...数据处理的介绍，有感兴趣的同学可以关注公众号查看历史精彩文章使用python处理NetCDF格式文件，这里介绍大家利用CDO如何处理netCDF格式的文件 CDO（Climate Data Operators...）是用来处理气候数据的命令行的集合，支持netCDF3/4以及Grib1/2数据格式，常用功能： cdo info a.nc ###查看文件信息 cdo -f grb copy a.nc a.grb...cdo -f nc copy a.grb a.nc ###grb和nc文件转换 cdo mergetime *nc test.nc ###合并netCDF文件 cdo -selyear,2019 -selmonth...255 33 ###提取过后经纬度点的数值 wgrib2 a.grb2 -set_grib_type c2 -small_grib 109:110 35:37 a_china.grb2 ###将文件裁剪到中国区域范围
同时，在我们之前的文章Python批量读取NC数据的时间维信息中，就介绍过基于netCDF4库，对一个文件夹下大量.nc格式数据文件的某一维的信息加以提取的方法。...、变量与其他参数）——其中我们重点观察数据中的因变量（也就是上图中的swvl1），需要留意一下其后不同维的排序顺序，在后面我们按照维提取变量数据的时候会用到。 ...首先，我们指定一个处于.nc文件成像范围内的目标经度longitude_need和目标纬度latitude_need，并使用argmin()函数找到目标经、纬度值与文件中经度、纬度的维数据值最接近的索引值...我们可以在ArcGIS中打开这个.nc文件的第一景数据，找到代码中目标经、纬度（也就是longitude_need和latitude_need所指向的数据）所对应的像元，并查看其像素值；如下图所示。 ...可以看到，上图在ArcGIS提取出来的像素值，与上上图在Python中提取出来的像素值一致，说明我们的代码无误。 至此，大功告成。
所谓自描述就是自带属性信息，这和一般的雷达基数据格式不同，一般的雷达数据也是二进制的，但不是自描述的，而是需要额外的数据格式文档来说明数据格式，而NetCDF文件中包含了描述变量和维度的元数据信息。...通常包含以下三个部分： 维度 变量 属性 维度部分记录的是每个变量的维度名及长度，而变量包含了维度，属性（如数据单位）信息及变量的值。属性部分包含了一些额外信息，比如文件创建者等。...io模块同样提供了 netcdf 文件处理方法，其所使用的外部模块和 netCDF4-python 使用的相同，都不需要使用 Unidata 提供的 netcdf C库。...:) sst = data->SST(1, :, :) 以上三种方法均可以处理netcdf文件，根据不同的需要使用不同的方法。...此节仅记录了怎么读netcdf文件，关于如何写netcdf文件下次再说。 除了上述三种工具之外，CDO和NCO在处理netcdf文件时有时会非常有用，关于这两部分的介绍有空再说。
之前说了如何利用CDO查看数据集信息 使用CDO查看气象数据信息。这一次说一下利用CDO从数据集中提取数据。这部分是非常使用的，尤其是当涉及到大数据集的时候，其优势就变得非常明显了。...比如，要提取某些时刻，某些变量在局部区域的数据： cdo -sellonlatbox,119.5,120.5,33.5,34.5 -selname,SCW,SCI,SCS,SCH,SCHL,SCR,SCTOT...# wrfsub.nc 输出文件名 上述命令表示先从输入文件中选取第1，7，13，19，24个时步的所有变量，然后从所得的结果中选择指定的八个变量，然后再从得到的结果中选择指定经纬度范围的数据，...over 5 timesteps ( 24.10s ) 从输出信息中可以看出，总耗时在1min左右，查看输出文件信息可以看到，输出文件大小为98M，而之前的输入文件大小为206G！...当然了，除了选择部分数据之外，也可以从数据集中删除数据。 选择字段 select 操作符可以从任意数量的输入文件中提取指定的信息，并输出到指定文件中。
CDO提供了一系列查看数据集信息的命令，可以非常方便的查看数据集信息，而不用想使用python，ncl，matlab等编程语言或软件一样，先读文件，然后再获取相关信息，可以通过命令行直接对文件操作，然后将文件信息输出到屏幕...以NetCDF数据集为例： info # 通过列出参数ID查看数据集信息 infon # 通过列出参数名查看数据集信息 map # 展示数据集信息和样本映射 执行 cdo info...图中最右列表示参数的ID，而将 info 改为 infon 之后，最右侧将变为参数名 ? 从左到右每一列分别表示序号，日期，时间，层序，网格大小，缺省值，最小值，平均值，最大值，参数ID/参数名。...也可以输出数据集中的参数数目，层数，年数，月数，网格数等信息。...上述获取数据集信息的操作符在进行数据处理之前是非常有用的，比如查看变量名，可以确定要处理的变量名称，查看日期和时间可以确定要处理哪一部分日期的数据等等。
PyNGL和PyNIO中的函数和绘图方式与NCL是非常类似的，可以非常顺畅的从NCL转到Python。...既然已经从NCL转到Python了，那么为什么一定要执着于PyNGL和PyNIO呢，今天就抛开PyNGL和PyNIO，介绍Python中其他常用库，实现真正的跨平台切换。...除了上述简单的数据处理库之外，python还提供了NCO和CDO工具的封装，pynco和cdo，提供了更多的便捷操作。...数据插值 •xESMF和ESMPy：气象数据空间插值，尤其是对于模式网格数据而言，提供了一些便捷的命令可对网格数据进行一些列插值操作•python-stratify：针对大气和海洋数据进行垂直插值•scipy.interpolate...模块提供了大量插值函数•python-geotiepoints：针对地理网格数据的空间插值 说到地球科学领域的数据处理，最离不开的应该也是模式输出数据了。
当然，大多数时候我们仅需要wrf-python已经提供的诊断函数和其它可调用函数，可能都不会使用到这些API。...用户API 方法 诊断 从WRF输出中返回基本诊断变量 插值 返回3D场插值到2D平面(指定垂直层)的值 坐标转换 返回经纬度坐标对应的X,Y坐标 网格去栅格 返回去栅格化后的变量，与NCL中的wrf_user_unstagger...函数效果相同 numpy 提取 返回 xarray.DataArray 实例中包含的 numpy.ndarray 数组 变量提取 从NetCDF文件或NetCDF文件对象序列中提取变量 辅助绘图 返回文件或是变量的地理边界...原始诊断方法 返回2D网格中一个线上的x,y点 配置方法 如果安装并打开了 xarray 则返回 True 其他 如果输入变量名是时间坐标则返回 True 类 异常 当诊断过程中发生错误是触发异常 CoordPair...装饰器 算法装饰器 从封装函数输出进行单位转换的装饰器 元数据装饰器 为封装函数的输出设置元数据的装饰器 装饰器工具 确定文件中包含哪个变量的可调用类 类 可迭代封装器类 一个生成器和自定义可迭代类的封装类
这是一篇告诉你如何更好的使用Python来解决地学领域问题的文章。 数据处理 •NetCDF格式 : netCDF4-python，h5py，h5netcdf，xarray等。...除了上述简单的数据处理库之外，python还提供了NCO和CDO工具的封装，pynco和cdo，提供了更多的便捷操作。...数据插值 •xESMF和ESMPy：气象数据空间插值，尤其是对于模式网格数据而言，提供了一些便捷的命令可对网格数据进行一些列插值操作•python-stratify：针对大气和海洋数据进行垂直插值•scipy.interpolate...模块提供了大量插值函数•python-geotiepoints：针对地理网格数据的空间插值 说到地球科学领域的数据处理，最离不开的应该也是模式输出数据了。...当然还有一些库不知道该怎么分类，因为分析画图的时候会用到，就放到这边吧： •geopandas：地理空间数据处理和可视化神器•pyshp，fiona等可处理常规的shapefile文件，常在画图的时候添加海岸线和边界线使用
近几年，python在气象领域的发展也越来越快，同时出现了很多用于处理气象数据的python包。比如和NCL中的 WRF_ARWUser库类似的 wrf-python模块。...如果指定值的话，那么从每个文件中提取变量时，指定值将应用于每个文件。在具有多个时刻的多个文件中，这样做可能是没有意义的，因为每个文件的第 n 个索引可能表示不同的时刻。...然而，在字典中所有的WRF文件都应包含相同的维度。结果是一个数组，最左侧的维度是字典中的键。同样允许使用嵌套字典。...=start_point, end_point=end_point, latlon=True) 使用中心点和角度 # 在网格坐标中定义中心点和角度, 中心点在网格的中心 pivot_point = CoordPair...插值2D场到一条线 使用 wrf.interpline 函数可以沿着一条线对2D场进行插值，这类似3D场的垂直剖面插值。为了定义插值的线，可以是线的起始和终止点。
这一篇主要来说一下WRF模式的前处理和后处理部分，后处理分为：数据提取、投影转换、插值和可视化。...WRF模式前处理 WRF模式后处理 数据提取 投影转换 插值 可视化 本文除了xarray之外，主要使用了 salem 和 xesmf 这两个库，salem 主要是进行前处理和部分后处理操作，xesmf...这里就数据提取、投影转换、插值和可视化几个部分说一下。 由于WRF模式的输出并不完全兼容NetCDF格式的CF标准，所以无法直接利用 xarray 的很多函数。...数据提取 数据提取和之前说的类似，主要是利用 .sel 和 .isel 等函数。这里还是以提取站点数据为例，强调一个数据提取需要注意的问题。...如果改为 xy[0].data 和 xy[1].data 得到的将是站点数x站点数的网格信息。这是因为在提取站点信息时，.sel这些函数接受的参数应该是 DataArray 对象。
，关于xarray插值方法的介绍官方文档已经给的比较详细了，也有公众号推送过相关文章 xarray指南：插值 基于xarray的气象场站点和格点插值，所以xarray的插值部分就不单独说了。...这一篇主要来说一下WRF模式的前处理和后处理部分，后处理分为：数据提取、投影转换、插值和可视化。...这里就数据提取、投影转换、插值和可视化几个部分说一下。 由于WRF模式的输出并不完全兼容NetCDF格式的CF标准，所以无法直接利用 xarray 的很多函数。...数据提取 数据提取和之前说的类似，主要是利用 .sel 和 .isel 等函数。这里还是以提取站点数据为例，强调一个数据提取需要注意的问题。...如果改为 xy[0].data 和 xy[1].data 得到的将是站点数x站点数的网格信息。这是因为在提取站点信息时，.sel这些函数接受的参数应该是 DataArray 对象。
数据具体介绍如下： 全球历史单产数据集（GDHYv1.2 + v1.3）提供了1981-2016年期间全球主要农作物的0.5度网格单产估计值的年度时间序列数据。...该数据集中主要作物是玉米，水稻，小麦和大豆。玉米和稻米具有两个生长季节（主要/次要）中每个季节的数据。...数据文件为NetCDF4格式，名称为XXXX / yield_YYYY.nc4，其中XXXX表示作物和作物季节（如maize_major, maize_second, rice_major, rice_second...数据预览如下 文件形式： ? 每个文件下具体的文件信息： ? 数据可视化结果 效果图01： ? 效果图02： ?...注: 该效果图为数据介绍效果图，但也可使用Python、R或者Arcgis 进行nc格式数据的处理和可视化绘制。 数据获取
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