为什么我的代码不能得到一个热图呢？ - 腾讯云开发者社区

并且做了一个简单的可视化，见：CellPhoneDB的单细胞通讯结果的可视化之气泡图，差不多让大家理解了所谓的细胞通讯，就是在两个不同单细胞亚群里面，各自高表达受体配体基因对里面的一个。...然后大家最感兴趣的是每个单细胞数据集里面的多个单细胞亚群各自两两之间的受体配体基因对的数量，其实就是一个热图，以及对应的数据，值得注意的是这个单细胞亚群各自两两之间的受体配体基因对的数量统计文件，其实是需要使用...主要是为了得到 count_network.txt 文件，里面的内容就是单细胞亚群各自两两之间的受体配体基因对的数量统计结果。...每个单细胞亚群跟其它单细胞亚群之间的连接数量，而上面的数值就是它与其它所有单细胞亚群连接数量的总和，还不如我们前面的热图展现的更加直观。...如果你确实需要把前面的单细胞亚群各自两两之间的受体配体基因对的数量热图，转换为蛋壳图，也是有成熟的代码，如下所示: rm(list = ls()) library(psych) library(qgraph

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为什么我代码里面选择top1000的sd基因绘制热图呢

实际上写完了这个全网最好的差异分析代码：免费的数据分析付费的成品代码我就可以收工用来，但是永远不能低估粉丝的疑惑数量，任何一个细节都会被拿出来剖析。...比如代码里面我挑选了top1000的sd基因绘制热图，然后就可以分辨出来自己处理的数据集里面的样本分组是否合理啦。其实这个热图差不多等价于PCA分析的图，被我称为表达矩阵下游分析标准3图！...左边的热图，说明我们实验的两个分组，normal和npc的很多基因表达量是有明显差异的中间的PCA图，说明我们的normal和npc两个分组非常明显的差异右边的层次聚类也是如此，说明我们的normal...为什么挑选top1000的sd基因绘制热图我这个热图是为了说明本分组是否合理，就是看样本的距离，这个时候你如果需要理解距离，那么你需要学习非常多细节知识。...和npc两个分组非常明显的差异为什么选择top1000的sd基因绘制热图其实就是个人爱好，你可以探索top500，1000，2000，5000是否有区别。

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是的

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我为什么要创建一个不能被实例化的类

摄影：产品经理感谢小何的上等牛肉当我们创建一个Python 类并初始化时，一般代码这样写： class People: def __init__(self, name): self.name...但如果有一天，你发现我写了这样一个类： class People: def say(self): print(f'我叫做：{self.name}') def __new...一个不能被初始化的类，有什么用？这就要引入我们今天讨论的一种设计模式——混入（Mixins）。 Python 由于多继承的原因，可能会出现钻石继承[1]又叫菱形继承。...('kingname', 28) pm = People('pm', 25) kingname > pm 显然，这样写会报错，因为两个类的实例是不能比较大小的：但在现实生活中，当我们说某人比另一个人大时...混入：不能包含状态（实例变量）。包含一个或多个非抽象方法。参考资料 [1]钻石继承: https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_inheritance

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为什么我建议线上高并发量的日志输出的时候不能带有代码位置

如果大家发现网上有抄袭本文章的，欢迎举报，并且积极向这个 github 仓库提交 issue，谢谢支持~ 本文是“为什么我建议”系列第二篇，本系列中会针对一些在高并发场景下，我对于组内后台开发的一些开发建议以及开发规范的要求进行说明和分析解读...往期回顾：为什么我建议在复杂但是性能关键的表上所有查询都加上 force index 在业务一开始上线的时候，我们线上日志级别是 INFO，并且在日志内容中输出了代码位置，格式例如： 2022-03...这些线程是 reactor-netty 处理业务的线程，观察其他实例，发现正常情况下，并不会有这么高的 CPU 负载。那么为啥会有这么高的负载呢？...并且并不是堆栈中的栈顶就是调用打印日志方法的代码位置，而是找到 log4j2 堆栈元素之后的第一个堆栈元素才是打印日志方法的代码位置 Log4j2 中是如何获取堆栈的我们先来自己思考下如何实现：首先...由此，我建议：对于微服务环境，尤其是响应式微服务环境，堆栈深度非常深，如果会输出大量的日志的话，这个日志是不能带有代码位置的，否则会造成严重的性能衰减。

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为什么我一行代码就可以完成3个R包的RNA-seq差异分析呢

，为什么这么神奇呢？...下面的图表是如何自动出来的呢？ ? 因为这个 run_DEG_RNAseq 函数的代码非常长，这里我就不贴在公众号了哈，大家可以在我的GitHub的GEO项目找到它！...GEO传奇代码一不留神，这个GEO项目就成为了点赞数最多的，直接孵化出12篇数据挖掘类SCI文章，至于间接的那些就不计其数了，因为大家都是偷偷的使用，也不告诉我，甚至某些别有用心者还不告诉身边的人，要一个人独享这些代码...这个时候是没有标准答案的，因为每个R包都非常热门，引用量都是好几千，你选择哪个都符合市场规律，不过，我这里有一个代码，对3个结果根据阈值筛选交集。...当然是啊，都会写代码了，还有什么是不能为所欲为的呢？同样的，代码也是在GitHub，需要你仔细理解，不过我有一个小小的要求，请不要把我的代码雪藏，或者刻意隐瞒。

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高分文章教你如何解释你的PCA结果

基本上你使用我教程的标准数据分析代码，从下载到表达矩阵，走标准分析流程，火山图，热图，GO/KEGG数据库注释等等，肯定可以出对应的图表。...学徒作业该文章的表达量矩阵是公开可以获取的，在: GSE157838, 感兴趣的小伙伴可以试试看，能不能得到类似的主成分分析图表，甚至是更进一步，出三张图！...然后呢，两个性别内部都有处理前后的分组，各自都可以差异分析，然后gsea分析，希望可以得到下面的两次差异分析对比结果！...pathways, whereas down-regulated proteins included immune-related pathways 题外话很多人拿到了我代码，喜欢问一个很“幼稚”的问题...，为什么同样的代码同样的数据分析结果不一样！

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番外特别篇之为什么我不建议你直接使用UIImage传值?--从一个诡异的相册九图连读崩溃bug谈起

关于"番外特别篇" 所谓"番外特别篇",就是系列文章更新期间内,随机插入的一篇文章.目前我正在更新的系列文章是实现iOS图片等资源文件的热更新化.但是,这两天,被一个自己App中诡异的相册读取的Bug...raw=true 当BOSS刚好是一个摄影爱好者在大多数情况下,是很少有用户触发这个问题的,但是BOSS是一个摄影爱好者,手机里有许多高像素图,一天他想往自己公司的App上传分享几张图片时,他竟然没法把一次性地从相册选取九张图...我能描述的,可能仅仅是我处理这个问题的一个相对的完整脑洞过程.部分分析过程间,明显不是有逻辑性的.越是诡异的问题,越是不能循规蹈矩,要时刻尝试去问自己最可能地问题是什么,而不是沿着一条路,一条道走到黑....,会很容易看到,这个内存占用,是飙升到G单位的.当然,我也没那么睿智,我是单个N个断点,最终确认了Crash的代码的准确位置.一个for循环,每次step 1,这下很明显地看到内存,几乎是 100M/张的速度在飙升...无法直接以UIImage格式,连续在轮播图上显示九张图此处对应的是一个本地大图预览功能,实现是在前一个页面把九张本地图的UIImage传递给轮播预览组件.此处的坑是: 把一个存放在数组中的UIImage

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怎么样才能正确的学习生信分析呢？—从学徒做起

学了大半年之后我对我自己做了这样的总结，因为我只会敲代码，而且这些都是流程化的，网上有的，简单来说就是照搬。但是，为什么这样分析？这样分析的意义在哪里呢？该怎样解释这样的分析呢？...2.绘制GSE2513数据集的火山图及热图这次的数据集很酷?，其中大有故事可讲，我已经在接下来的实战演练中详细讲解了。...`实战演练` 曾老师布置的学徒作业，针对GSE2513数据集绘制火山图和热图。按照GEO分析流程绘制完后发送给曾老师，结果得到的回复是全部都是错的，一万点暴击呀:sob:！！！...这样数据整齐，接下来就可以使用GEO流程来绘制热图和火山图了。 `PCA主成分分析` 为什么要有PCA呢？...使用这个包需要三个数据，在以上的代码中我都有制作：表达矩阵分组矩阵差异比较矩阵而且总共也只有三个步骤，在以上的代码中也有体现，现在只是总结 lmFit eBayes topTable `火山图和热图绘制

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Seurat包学习：如何查看R包函数源代码

我们很多时候都很好奇作者的r包是如何写出来的，手痒的时候就想学习一下源码，顺便改一问题来源为什么要写今天这个推文呢？...起因是因为我想使用seurat自带函数画热图，奈何这个图不是那么好看 DoHeatmap(pbmc,features = features,draw.lines = FALSE ) 于是，我想自己手动改一下这个热图...这里可能用到长数据和宽数据转换的技巧：ggplot2画图精髓——宽数据转为长数据或者你可以直接看我之前另外一种画单细胞热图的方法：20万单细胞的热图要这么画吗？...但是我发现环境栏中的p和通常的p好像不太一样（就是感觉为什么我有这个感觉呢，于是我自己画了一下热图结果发现，我的p2和seurat的p在环境栏中确实不一样于是就有了今天的故事，我就很想知道这究竟是什么原因...那为什么两个p不一样呢主要还是因为两个数据格式不一样嘛，一个是seurat产生的对象，另外一个是pheatmap产生的对象。如果感兴趣，可以去看看pheatmap的源码是什么，然后比较一下。

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直播后生信入门马拉松答疑合集

Rstudio画图，zoom方法后无论怎么调整大小，只有中间的图在缩放，但靠边上的文字都不能自动缩放。...另外用export尝试不同格式调整长度宽度保存可是没有办法得到平涂的PDF结果，请问这个怎末解决呢？...Q24：为什么我的jobs只有这点呢？...热图就变形了来源2022-08（生信入门，暑期，收官） PDF保存设置长宽 Q38：请教各位老师，我在用ggplot画柱状图的时候，如果想要把id倾斜45度显示会出现两边的id显示不全的情况，这种情况可以怎么处理呢...可以解决 Q39：老师们，这个问题是不是可以忽略，我必应了很久，说没有也是正确的结果，说明基因集太小，这个代码应该如何修改呢？

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简明教程 | 用 PPT 做卡通热图 - eFP Graph?!

类似的，那么画卡通热图，PPT一样靠谱。我们知道，Adobe Illustrator 和 CorelDraw 都是收费的。而很多人并不乐意花钱买，另外就是学习难度也不低。但是呢，PPT 就不一样。...下述，我用 PPT 给大伙演示，如果做出来可重复使用的优雅的卡通热图。注意，似乎版本 2016 或者更高级的版本才行。...当然，R,G,B代码也可以使用其他取色器工具获得。 [1240] 最后，我们准备一个简单的表达矩阵。...如下 [1240] 于是，我们可以导入 TBtools ，开始出图 [1240] 默认的输出框 [1240] 输入比如Gene1，即可看到 [1240] 当然，剩余的就是跟热图工具类似的参数 [1240...我的目的就是转换成 JIGplot 对象，这样我可以做各种各样的优化。当然，不止 M，还有其他大量解析代码的兼容。总的来说，我是崩溃的.... 为什么我要用 PPT 来搞？

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2021第二期_数据挖掘班_微信群答疑笔记

老师，为什么我这个csv读取出来，第一列表头是乱码，其他列又是好的呢因为这个文件用Excel表格打开过，读取乱码就把乱码的列名重新命名一下就行。...100，500，1000的差不多，你这个问题在于，热图没有zscore，没有使用我们的标准代码。见链接诶https://mp.weixin.qq.com/s?...，如果boxplot和PCA图没问题，热图再加个zscore修改一下的话，层次聚类图可以省略吗？...我想问一下，在lasso回归的时候，meta的数据中，有一个病人的event是na，这样的话做出来会报错，但是又要求expset和meta的病人一一对应，又不能去除那个na，这咋整呢？...为什么中间不能有空格儿？子图和子图之间本来就应该有间隔，如果你觉得非常重要，必须去掉，那你只能去搜一下ggpl里面怎样能把分面的时候两张图之间的间隔调整一下，有可能会有那样的参数。

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2022年3月_生信入门班_微信群答疑笔记

这里为什么不能加逗号呢？一句完整的R语言代码最后不需要加逗号的，这是一个规定好的基本语法，没有为什么。...老师我用pheatmap做了这张热图，想把这张热图中右边高表达的放在上面，应该怎么设置参数实现呢？没这个必要的。...老师，我想问一下，像这样用tr把文件里的字符替换之后再用>重定向给源文件，为什么源文件就空了呢？我重定向给一个新的文件名就没问题这是一个无解的问题，就是不能把同一个文件给重定向了，没有为什么的。...老师，这个图我已经能出结果了，不过为什么lable出来的总是setosa和virginica的P值呢？...老师请问这里为什么会报错呢？我是在英文输入法下输入的代码。括号前面加个c 老师，为什么我出来的重复值这么低，跟你们课堂里面演示的不一样？

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对于今日头条官方说明的致谢和几个追问

所以，也在此复述这些朋友们的问题，我也说出从我角度上的理解（或者还没有完全理解的地方），希望能够与头条同事、与圈子中的朋友讨论交流。 1 大家关心比较多的第一个问题：热图到底是怎么了？...但这个地方确实是比较关键的。而就这一疑问我们也会继续配合头条的同事，继续弄清楚。也欢迎热图工具提供方提出你们第三方的见解和说明。就这个机会，先对热图工具做一个说明。...我的朋友所用的热图工具，是Ptmind（铂金智慧）公司出品的Ptengine（铂金分析）工具。这个工具在全球有为数众多的客户。...我的朋友的公司亦采用了他们的解决方案，主要应用领域就是“单页推广”的着陆页的用户点击热图。在头条的官方说明中，这个热图是这样的： ? 而默认打开的热图是这样的： ? 为什么有这样的差异呢？...就这个问题，我也咨询了第三方工具方Ptmind，为什么要设置这样的热图展示方式。

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【数据分析篇】11个常见数据分析方法相关的问题集锦

“数据驱动的营销与运营”的知识星球，第9期精华问答汇总——数据分析专题。本期汇总整理常见的几种数据分析方法：归因分析、AB测试、RFM模型、热图分析、标签管理和同期群分析等11个精华问答。...把用户按照RFM来分类只是第一步，接下来就是制定相应的营销策略，或者分析这几类人群的兴趣特征等，再进行营销。 4 热图分析 Q8：公众账号文章能做热图分析吗？推荐用什么分析平台呢？...“ 回答：公众号里发出去的直接用公众号后台编辑的原生文章做不了热图监测，加不了监测代码。公众号发出去的H5页面可以。H5需要添加热图工具的监测代码，在热图工具里查看。...Q9：宋老师，关于热图还有疑问想请教。在做热图的数据分析时，有两个问题：大的标题或者一些文字描述、一些图片会有点击，比较纳闷为什么，因为用户明显知道这不是可点击的，我需要怎么调整呢？...“ 回答：用户并不一定知道这不是不能点击的。为什么你认为用户明显知道呢？我觉得可能用户并不知道这些不可点击的。不过，不排除随便点击的一些随机点。

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文章测序数据下载碰到的问题的小总结(南京站学员分享)

恰好看到一个学员开始主动思考，自行摸索，超出我们授课范围的知识点整理，主动投稿，下面请大家欣赏一下南京站学员分享：我目前的项目主要参考了一篇文献，我想借重复这篇文章的数据分析及表格制作来巩固学习3天的生信技能树培训内容...我打算下载一个文件看看大小，然后找到tablelist里与文件大小对应列，统计一下整列的值的和，就得到了所有样本的数据量。看看这个数据量是不是对应的这两个数字中的一个。...另外一个值的单位是bp，我猜想是数据读到的碱基数总和，为了验证我的猜想，我将下载下来的文件进行了SRA->Fastq文件的转换，并想用Fastqc统计总base数，结果发现Fastqc并不会统计这个值，...聪明的读者朋友，可以留言说出自己的看法，为什么不标记fastq文件的大小？...另外，推荐学徒数据挖掘第二期汇总之多分组基因注释代码大放送（compareCluster），部分精彩推文如下：热图、韦恩图、GO富集分析图纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度按基因在染色体上的顺序画差异甲基化热图

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这个机器学习模型是怎么办到的？

论文还提出了一种新的面部注意力丢失方法，并将其应用于每一步的训练中，通过增加像素差和热图值来更详细地恢复面部属性。最后，论文还提出一个压缩版本的人脸对齐网络（FAN）的标志热图提取。...利用所提出的FAN，可以提取出适合于人脸SR的热图，并减少了整体训练时间。实验结果证明，该方法在定性和定量测量方面都优于目前最先进的方法，尤其是在面部感知质量方面。...然而，论文中有一个没被提及的细节，就是最后输出的图片带有疤痕的比例非常高?，活脱脱都变成了哈利波特呢。...左：真人，中：原输入表情，右：输出结果仔细一看右图还真的怪吓人的，幸好农历七月已经过去了另外，该模型的最佳训练场景是输入的图像大小应该为16×16像素，并且需要使用与训练和测试模型完全相同的代码。...Twitch表情的输出效果如何？ ---- 令人惊讶的是，只需要一点点调整，爬行动物图片的输出结果，面部看起来更像人类了！说好的建国以后动物不能成精呢？！！

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那你知道InnoDB里的LRU怎么做的吗？

当链表满的时候，将链表尾部的数据丢弃。嗯，完美！很完美！反正innodb中不可能这样设计～那么为什么不能这么设计呢？...我只想说一件事，预读机制会预读一些额外的页到到BufferPool中。那么，如果这些预读页并不是高频的页呢？...剩下的就是young区的热数据。于是可以得到一张大概的LRU链表图，如下所示(图片出自网络) ? ps：一般生产的机器，内存比较大。...代码写的好，bug少，看起来像是一个闲人注释多，代码清晰，任何人可以接手，看起来就是谁都可以替代代码写的烂，每天惊动各大领导提流程改生产代码，解决生产问题，就是公司亮眼人才代码写的烂，只有自己看得懂...2、为什么你学不会递归？告别递归，谈谈我的一些经验 3、一文读懂一台计算机是如何把数据发送给另一台计算机的 4、一个故事讲完哈希洪荒攻击 5、算法数据结构中有哪些奇技淫巧？

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为什么百分百还原文献结果反而不对呢

，包括挑出来的基因进行热图可视化，如下： ?...挑出来的基因进行热图可视化如果你仔细看两个表达矩阵的PCA，你甚至完全看不出来： ?...两个表达矩阵的PCA 那么，我之前给出来的正确的答案的表达矩阵如何得到的呢，代码如下： rm(list = ls()) # https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series...现实狠狠的扇了我一巴掌，哪怕表达矩阵已经被zscore了，居然拿到的差异基因没有问题。本来呢，我是怀疑这个数据集本身的文献，2011发表的那个就错了。接下来我就比较了两次差异分析的区别： ?...但是，背后的统计学原理我还没有想清楚，为什么表达矩阵已经被zscore了却并不是非常的影响它的后续差异分析呢？

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Java系列 | 远程热部署在美团的落地实践

下面的动图就演示了多文件复查场景下的增量热部署：那么跟业界现有的产品相比，Sonic有哪些优劣势呢？...1.5 Sonic远程热部署落地推广的实践经验相信大家都知道，对于技术产品的推广，尤其是开发、测试阶段使用的产品，由于远离线上环境，推动力、执行力、产品功能闭环能否做好，是决定着该产品是否能在企业内部落地并得到大多数人认可的重要的一环...但是针对Class的HotSwap一直没有动作（比如Class添加method、添加field、修改继承关系等等），为什么会这样呢？因为复杂度过高，且没有很高的回报。...比如开发同学想修改一个Spring Bean，新增一个@Autowired字段，此类场景在实际应用时很多，所以Sonic对此类场景的支持必不可少。那么，具体是如何做到的呢？...：图 11 为什么Sonic不直接替换用户ClassPath下面的资源文件呢？

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明明是一个热图就能搞定的事情为什么要复杂到蛋壳图呢

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