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cytof数据处理难点之修改FCS文件

我们可以开始尝试分析一些文献公共数据集啦,不过在处理那些数据过程,我们还需要传授给大家几个小技巧。 修改FCS文件 FCS文件类型,流式细胞术数据文件标准。...读取fcs文件函数来自于 flowCore 我们读取fcs文件,可以读取一个文件夹下面的全部fcs文件,或者单个fcs文件独立读取。...文件 tmp=cytof_list[[1]][[1]] dim(tmp@exprs) tmp@parameters@data 首先需要明白读取fcs文件函数来自于 flowCore...: read.flowSet {flowCore} ## 批量读取文件夹下面的全部fcs文件 read.FCS {flowCore} ## 单个fcs读取 简单思考,既然是有read.FCS可以猜出应该是有...write.FCS {flowCore} 修改flowFrame-class 使用read.FCS {flowCore} 读取fcs文件后是一个 flowFrame-class,需要修改它就得先理解它

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R语言实现流式细胞数据分析

读取数据及可视化 首先我们看下flowCore读取数据函数read.FCS和read.flowSet: ? ?...那如果我们荧光素1对应通道可以检测其荧光信号,那么其它通道也产生荧光素1信号,那这些信号就成为溢出,组成荧光信号值矩阵也就是溢出矩阵,在flowCore作者提到了对溢出矩阵处理方法:...质量控制 我们主要是看下flowCleanclean函数进行对flowdata类型数据进行质量控制并获得质控之后数据,当然这个函数有一个缺点,那就是细胞数必须大于30000,不然没法进行质控: ?...我们看下flowCore数据标准化需要用到函数transfom,我们直接看一个对数转换实例: fs <-read.flowSet(path=system.file("extdata", "compdata...圈门以及可视化 首先我们看下通过算法自动圈门过程。我们看下flowCore几种方法: ?

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为什么SpringBoot jar文件读取不到?

1 猿与故事 今天故事发生在程序猿菜菜身上。 凡是对接过三方都知道,代码难免要加载很多三方分配证书等相关配置文件。...但是,后期业务扩展,三方接入证书配置很多,该怎么办? 这当然难不倒菜菜同学,发挥一下 CV 大法,于是乎一坨硬生生代码出现了(估计有很多同学都这么干,)。...问题很清晰了,通过上面这种方式获取 SpringBoot 打好 jar 资源文件不太可行,需要换方案。...3 菜菜侃大山 1、如何获取 SpringBoot jar 指定文件夹下资源文件子目录?...菜菜曰:SpringBoot 没办法通过 File 形式访问 jar 里面的文件,借助 resource.getURL().getPath() 获取当前资源对应URL路径得以解决。

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cytofWorkflow之构建SingleCellExperiment对象(二)

上一讲我们提到了,跟着cytofWorkflow,可以使用read.flowSet函数全部FCS文件后,产生一个对象,这里面变量名是 samp 。...其实cytofWorkflow只是一个流程而已,这个read.flowSet函数来自于R。 但有了FCS文件不够,具体每个样本是有临床表型,而且呢,里面的抗体也是有对应生物学意义。...这3种信息组合起来,就是 CATALYST prepData函数该派上用场啦,官方示例代码如下: # construct SingleCellExperiment library(CATALYST...) 就是使用 CATALYST prepData函数把3个信息整合起来哈。...如果你有自己FCS文件,就需要使用read.flowSet函数读取,然后自己制作抗体表格,以及样本表型表格。必须要严格follow这里面的例子哦!

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cytofWorkflow之读入FCS文件(一)

这里演示其中5个文件,如下: 3.6M Nov 6 10:20 WT-UnRx 3-G2_CD45pos.fcs 13M Nov 6 10:27 WT-UnRx-1_CD45pos.fcs...读取FCS文件 只需要把全部下载成功FCS文件统一存放在一个文件夹,比如 paper_fcs文件夹,然后使用read.flowSet函数即可读取,示例代码如下: rm(list = ls()) require...= p1) samp 熟悉read.flowSet函数产生对象 使用read.flowSet函数全部FCS文件后,产生一个对象,这里面变量名是 samp 。...cytofWorkflow流程示例数据集 其实R HDCytoData 就内置了一些cytof数据集哈, 不同数据集,需要不同函数来下载,所以对网速要求比较高: library(HDCytoData...package 这个下载到fs变量,就就等价于前面的使用read.flowSet函数全部FCS文件后产生对象: > fs A flowSet with 16 experiments.

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从 vue-cli 源码发现了27行读取 json 文件有趣 npm

同时之前看到了vue-cli 源码 里有 read-pkg 这个。源码仅27行,非常值得我们学习。 阅读本文,你将学到: 1. 如何学习调试源码 2....用最新VSCode 打开项目,找到 package.json scripts 属性 test 命令。鼠标停留在test命令上,会出现 运行命令 和 调试命令 选项,选择 调试命令 即可。...返回:完全解析特定于平台 Node.js 文件路径。此函数可确保正确解码百分比编码字符,并确保跨平台有效绝对路径字符串。...new URL('data.txt', import.meta.url) 注意,Node.js 环境,import.meta.url 返回总是本地路径,即是file:URL协议字符串,比如 file...学 Node.js 可以多找找简单 npm 学习。比直接看官方文档有趣多了。不懂就去查官方文档。查多了,自然常用就熟练了。

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实战遇到C++流文件重置一个大陷阱 为什么ifstreamseekg函数无效

大家好,又见面了,是你们朋友全栈君。 分享一下老师大神的人工智能教程!零基础,通俗易懂!http://blog.csdn.net/jiangjunshow 也欢迎大家转载本篇文章。...下面, 我们先在工程当前目录下制作我们需要test.txt文件, 在里面输入几行字符串: ab cd ef gh 我们先看逐行读取文件: #include #include...很好,谢谢! 很好,谢谢!...当你完成了一篇文章写作, 在上方工具栏找到 文章导出 ,生成一个.md文件或者.html文件进行本地保存。...导入 如果你想加载一篇你写过.md文件或者.html文件,在上方工具栏可以选择导入功能进行对应扩展名文件导入, 继续你创作。

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原来网页显示背后隐藏着这些奇妙步骤(

每个被拆分数据块都会被放入单独网络,并在每个被拆分数据块添加TCP头信息,然后由IP模块来发送这些数据。...ARP 协议会以广播形式在以太网中发送一个请求,询问所有设备:“谁是拥有这个 IP 地址设备?请告诉 MAC 地址。”...然后,将会有一个设备回答:“这个 IP 地址是 MAC 地址是XXXX。” 如果对方设备和我们在同一个子网,通过上述操作就可以获取到对方 MAC 地址。...另外,末尾帧校验序列(FCS)也是非常重要。在数据传输过程,可能会发生噪声、干扰或其他错误,导致数据损坏。为了确保数据完整性,网卡在数据末尾添加了FCS。...接收方在接收数据时,利用FCS对数据进行校验,以检测是否有损坏或错误发生。如果校验结果与FCS不匹配,接收方将知道数据包在传输过程中发生了错误。

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openEuler22+GreatSQL+dbops玩转MGR

前者意味着是在 glibc 公共库版本为 2.17 系统下编译出来,因此,它不会包含大于 2.17 函数,兼容性更强。...选择支持是 minimal ,这个版本剔除了与调试相关二进制文件和调试符号,体积非常小,仅为常规三分之一,认为非 minimal 并无优势。...== 1 and db_type == 'greatsql' + delegate_to: 127.0.0.1 在正常情况下,您应该手动上传 GreatSQL 到 downloads/ 文件...如果在 downloads/ 文件没有找到对应,且在 common_config.yml 文件设置了 fcs_auto_download_mysql == 1(允许从互联网下载安装),并且...因此,之前已经在 dbops 工具中加入了在部署时选择使用 jemalloc 内存分配器功能,它是在 systemd 服务实现

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以太网

以太网因不同通信介质,所以通信速度会有所差异。10BASE,100BASE以及10GBASE10,100,10G分别指10Mbps,100Mbps,10Gbps。...有时候还会有10BASE-T等,后缀表示是传输介质。 以太网是不可靠,面向无连接服务。以太网将错误直接丢弃掉。 以太网帧前端有一个叫做前导码部分。...它由0,1交替形成,表示一个以太网帧开始,也是对端网卡能够保持同步标志。在这个前导码末尾是一个叫做SFD部分,它值是11,占两位(在IEEE802.3标准,SFD占8位)。...如下所示: 目标MAC地址 源MAC地址 帧长度(2字节) LLC(3字节) SNAP(5字节) 在IEEE802.3标准下,上层协议类型通常是LLC/SNAP。...在以太网数据帧末尾还会有一个FCS,它用于检查帧是否损坏。发送端会计算FCS,接收端也会计算FCS。 LLC,SNAP实际上是逻辑链路控制。

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计算机网络:网卡如何进行组装Frame

mac地址是tcpip模块从mac模块取出2.ip协议通过本地路由表找到发送方ip地址,并将数据传递给网卡,ip模块发送数据保存到网卡缓冲区;什么时候读取缓冲区进行数据发送呢?...网卡mac模块读取缓冲区数据 并将数字信号转换为通用信号并借助mai模块转换为网卡传输数据格式并发送到网线添加报头起始帧和fcs图片网卡取出缓冲区数据并切割,为每部分头部填充包头和起始帧;...尾部添加验证是否短缺尾部(检测错误帧校验序列)为什么需要添加报头和起始帧呢?...fcs末尾校验序列fcs用来检查传输过程因噪声导致波形紊乱、数据错误,它是一串32比特序列, 是根据中所有的内容带入一个公式中计算出来序列。...正在参与2023腾讯技术创作特训营第二期有奖征文,瓜分万元奖池和键盘手表

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【流式细胞仪软件】上海道宁为您带来FCS Express,让您轻松缩小流式细胞术和结果之间差距

​​FCS Express是一个完全集成分析、统计、图表和报告工具用于获取结果​FCS Express使用集成电子表格因此您图表和统计数据随着您变化而更新所有图形都以高分辨率直接导出到PowerPoint...使用 FCS Express,您可以直接在软件轻松自定义绘图各个方面,从而获得分析期间所需可视化效果。​03、批量处理只需单击一下即可为多个文件创建多个分析文档!...交流是科学关键,今天研究人员需要能够快速轻松地导出结果,通常是多种不同格式。FCS Express批处理使您可以通过各种导出模式和文件类型快速轻松地报告和共享您结果。...FCS Express 允许您在分析任何位置插入名为 Tokens 实时更新文本。它们可以显示绘图统计信息、文件关键字、门和布局属性,甚至来自您计算机系统信息。代币将加快您获得结果时间。​...在这种类型测定,细胞示踪染料(例如 CFSE)被掺入细胞。随着每一轮细胞分裂,染料相对荧光强度降低一半。其他软件提供有限数据建模功能或要求您完全使用单独软件。​

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浅谈ARP欺骗实现与防御

原理很简单,实现起来稍有一点难度:首先要先要获取本机IP地址和MAC地址,在下面的Deemo实现了SharpPacp获取本机IPv4地址和MAC地址方法: ?...ARP应答,启动线程发送一个后,检测网卡数据,并过滤出所有网卡ARP数据,然后对进行解析,如果源主机IP是构造目标主机证明这个是刚才发送请求应答,然后: 1.通知事件更新...除了要换掉包地址信息,还要在尾部加上FCS校验码:什么是FCS校验码?...FCS提供了一种错误检测机制,用来验证帧在传输过程完整性。 FCS采用了循环冗余校验CRC32校验算法,那么什么是CRC校验呢?...3.输入:netsh -c “i i” add neighbors 连接Idx号 网关IP 网关MAC 添加一条静态映射,已经添加过了,所以显示 对象已存在 netsh -c "i i" add

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网络基本功之细说交换机

如果已经存在该源地址 MAC 地址表项,则交换机重置老化计时器。通常一个表项保持5分钟。...在进入端口接收完整一帧之后,交换机将数据报最后一个字段帧校验序列(frame check sequence,FCS)与自己 FCS 进行比较。...例如,接收到一个以 1Gb/s 速率发出帧,转发至百兆以太网端口,就需要使用存储转发方式。当进入与输出端口速率不匹配时,交换机将整帧内容放入缓存,计算 FCS 校验,转发至输出缓存之后将帧发出。...如果网络中出现高差错率(无效帧),直通交换可能会对带宽造成不利影响,损坏以及无效帧造成带宽拥塞。在拥塞情况下,这种交换机必须像存储转发交换机那样缓存。...当设备发出二层广播,帧目的 MAC 地址被设置为全二进制数,广播域中所有设备都会接收到该帧。二层广播域也称为 MAC 广播域。MAC 广播域包含 LAN 上所有接收到广播帧设备。

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