方案 在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。..."package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...= 0) funlist <- funlist[-idx] # 创建一个数据框保存数据 objectlist <- data.frame(name = funlist, primitive...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version
一个需求，实现去除列表中的多个重复对象。 比如 a,b,c 在列表1 出现，bc 在列表2 出现，ad 在列表3 出现，那么仅仅保留1:abc, 2:空, 3:d。...这个列表中的对象可以是数据框，也可以是单个字符，也可以是列表，可以是任何类型的对象。...一个举例场景就是： 我有一个列表对象，这个列表对象里还有若干个列表，每个列表里面还有若干个对象，每个对象是一个存放基因名的向量。 这些不同的列表是不同的实验，而每个对象对应的是一个样本的富集基因。...思路就是循环列表中的每一个子集中的所有内容，去和之前的所有内容进行比较（%in%）；并且子集本身也是去重的。...10个列表组成，每个列表内容有若干个数据框。
前文我们讲到R处理数据面对的6种对象：向量，矩阵，数组，因子，列表，数据框。 A. 那我们就得好好给大家介绍一下这位能者的6个对象都长什么样子了。...1 1 r5 1 1 2 2 2 r6 1 1 1 1 1 #Tips：这个对象就像多个矩阵面的平行拼接，可以看成长方体。...· 4.因子 · 因子是使用向量创建的R对象，类似统计学中的分类变量，它将向量与向量中元素不同值一起存储成标签，而不论是哪种类型的向量，最后都存储成字符型元素。...许多R的内置函数计算结果不仅仅是一个向量，因此以列表的形式返回结果。可以理解为二维不规则数据。...到这里，我们R的对象就介绍完了。这部分的内容是一个基础的部分，可以让你理解R是怎样工作的。之后我们将继续揭开R的神秘面纱，敬请期待吧。
R语言中的基本数据类型（模式）包括数值型、字符型、逻辑型（TRUE/FALSE）、复数型（虚数）和原生型（字节）。 R拥有许多用于存储数据的对象类型，包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。...数据框可通过函数data.frame()创建：mydata <- data.frame(col1, col2, col3,...)其中的列向量col1、 col2、 col3等可为任何类型（如字符型、数值型或逻辑型...举例，假设有向量： diabetes <- c("Type1", "Type2", "Type1", "Type1") 语句diabetes <- factor(diabetes)将此向量存储为(1,...创建有序型变量，为factor()指定参数ordered=TRUE，通过指定levels选项来覆盖默认排序 6、列表 列表是一些对象的有序集合。...列表允许整合若干（可能无关的）对象到单个对象名下。类似于编程语言中的类或是结构体。某个列表中可能是若干向量、矩阵、数据框，甚至其他列表的组合。
数据结构 R数据结构如图2所示。 图2：R数据结构 数据结构即数据的组织方式，R数据结构包括向量、矩阵、数组、数据框和列表等。...(1,2,3,4) > b <- c(“one”, “two”, “three”, “four”) > c <- c(TRUE, TRUE, TRUE, TRUE) 向量元素数据类型必须相同，标量可以视为一个元素的向量...:52.0 R列表 R列表可以包含向量、矩阵、数据框、列表等。...工作于数据对象的有用函数 工作于数据对象的一些有用函数如图5所示： 图5：工作于数据对象的有用函数 总结 1 数据分析任务的挑战之一就是数据准备。...2R组织数据的方式，向量、矩阵、数组、数据库、列表等 3R数据导入方式 Resource: 1http://www.wangluqing.com/2014/06/r-in-action-note3/ 2
变量名只起提示作用，是赋值对象 ②、由已有的数据转换或处理得到：as.data.frame() ③、读取表格文件： df2 <- read.csv("gene.csv") df2 ④、R语言内置数据：如...df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05) df1 答案是不存在是增加，存在是修改 #改行名和列名 rownames(df1) <- c("r1","r2","r3",...如上图所示，colnames()<-c()列名重新赋值，t()转置，行和列互相转换，as.data.frame()将矩阵转换为数据框 m t(m) as.data.frame(m) 提个小问题：下图m的类型为什么前后不一致...大家再坚持坚持，还有列表一个知识点了? 三、列表 ①、列表新建和取子集 注意：只有列表有[[]]方法取子集。...列表取子集类比于套娃 #列表 l <- list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3), m2 = matrix(2:9, nrow = 2)) l l[[2]]
简单的介绍数据的对象类型及文件的读入，输出。 一、对象类型： 包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。 1)向量(vector)：用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。...C1 C2R1 1 3R2 2 4 3)数组(array):与矩阵类似，维度可以大于2。...data.frame()创建： mydata <- data.frame(col1, col2, col3,…) 其中的列向量col1, col2, col3,… 可为任何类型(如字符型、数值型或逻辑型...5)因子(factor)：类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子（factor），绘图时候重要。 6)列表(list)是R的数据类型中最为复杂的一种。...一般来说，列表就是一些对象（或成分，component）的有序集合。列表允许你整合若干（可能无关的）对象到单个对象名下。
对于data.frame大家应该很熟悉，它可以存储不同数据类型的向量数据。今天给大家介绍一个升级版的data.frame，其不仅可以存储不同数据类型还可以进行多列的并行运算。...as.data.table 将R对象转化为data.table格式的数据，其对象可以为列表，向量，data.frame。...setDT(x) 其直接将R对象转化为data.table数据类型，从而不改变数据地址。...DF =data.frame(x=rep(c("b","a","c"),each=3),y=c(1,3,6), v=1:9) DT=as.data.table(DF,keep.rownames=TRUE...接下来我们看下data.table数据类型的运算，其基础的运算既包含data.frame所有的运算方式，同时又有升级的运算： 1.
此外，函数 save( ) 可以将工作空间中的指定对象保存为以 .rdata 为扩展名的 R 数据文件。...) pain.f <- factor(pain, levels = 1:3, labels = c("mild", "medium", "severe")) patients <- data.frame...library(rio) data("infert") str(infert) # 'data.frame': 248 obs. of 8 variables: # $ education :...运行下面的命令将此数据框导出为 .csv 文件： export(infert, "infert.csv") 在当前工作目录中可以找到刚才导出的名为 infert.csv 的数据文件。...在 R 中，as 系列函数可以用于实现变量类型的转换。
长期更新列表： 视频讲解-R爬取生信软件列表到思维导图 生信技巧第二课-使用markdown记录和分享笔记 本期视频，学会R语言，方便你我他~~~ 为什么需要学习R语言呢？...xxxxx 获取当前工作区间getwd() 更改工作区间 setwd( "xxxxxx") 清除当前对象rm() 安装包你一定会遇到错误，请参考： R包终极解决方案！...用data.frame( 字段1,字段2,…. )创建 ) 列表：与数据框类似,区别就是每一列向量类型和长度可以不一致。...数据对象的高级操作 前面我们对向量，数据框，数组，列表都了解了，也知道如何查看数据的特性，但是要进行高级转换，就需要一些时间来学习apply系列函数，aggregate，split等函数的用法。...这是一个分水岭，用好了你就算是R入门了。也可以用一些包，比如reshape2，dplyr。 当然，R里面的字符串对象是另外完全不一样的操作模式，建议大家自行搜索学习。
25、时间序列 【往期回顾】 R语言 | 第一部分：数据预处理 R语言|第2讲：生成数据 R语言常用的数据输入与输出方法 | 第三讲 R语言数据管理与dplyr、tidyr | 第4讲 R语言 控制流...14、数据管理相关 vector：向量 numeric：数值型向量 logical：逻辑型向量 character；字符型向量 list：列表 data.frame：数据框 c：连接为向量或列表 length...：求长度 subset：求子集 seq，from:to，sequence：等差序列 rep：重复 NA：缺失值 NULL：空对象 sort，order，unique，rev：排序 unlist：展开列表...attr，attributes：对象属性 mode，typeof：对象存储模式与类型 names：对象的名字属性 15、字符串处理函数 character：字符型向量 nchar：字符数 substr...，write：输出对象 scan，read.table，load，dget：读入 23、工作环境 ls，objects：显示对象列表 rm, remove：删除对象 q，quit：退出系统 .First
integer浮点型dubble逻辑型logistic因子型factor2.数据结构零维标量：储存一个元素一维向量：储存多个元素（元素的数据类型必须相同）二维数据框dataframe：（元素的数据类型可以不同）列表.../list/matrix/array(DATA)is.vector/data.frame/list/matrix/array(DATA)DATA <- list()DATA <- c()DATA <-...data.frame()DATA <- array()DATA <- factor()cor(DATA, method = “perarson”) method 参数="kendall" "spearman...会自动处理成1个tab，从而串行，此时可尝试用sep = ‘/t’来指定分隔符 作业回答一个问题：save(a,file="test.RData")这句代码如果报错object a not found，是为什么...1.内存没有加载a这个DATA对象，重新运行前面给a赋值的代码 a <-^1 《R语言：从数据思维到实战》——朱雪凝
-数据框二维数据；约等于表格 但是：列有要求（同一列只允许同一种数据类型）；不是文件（可以导出来成为一个文件）；数据框单独拿出的一列是向量，视为一个整体；-矩阵二维数据；同一列同一行都只允许一种数据类型...；-列表什么都可以放；-class()函数可以用于判断数据类型/数据结构本节内容图片1.数据框来源-（1）用代码新建df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:...df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05) df1#改行名和列名rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames...#用list()函数生成listl <- list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3), m2 = matrix(2:9, nrow = 2))l#列表取子集，直接取出来的元素是列表...l [[2]] class(l[2]) #是列表class(l[[2]]) #是矩阵
在循环中对变量进行修改尤其低效， 因为R在修改某些数据类型的子集时会复制整个数据对象。（这个在前面提到过） R以向量、矩阵为基础运算单元， 在进行向量、矩阵运算时效率很高， 应尽量采用向量化编程。...ps:如果是列表的话，可以使用vector(n, mode = "list") 创建长度为n的空列表: set.seed(101) system.time({ M <- 1E5 x <- numeric...R 3.1.0版本以后列表元素在修改时不制作副本， 但数据框还会制作副本。...因此，对于重复较多且大的数据框对象，我们可以先将其用列表处理，最后再转换成数据框： set.seed(101) m <- 2E4; n <- 100 x <- as.data.frame(matrix(...将数据保存在列表中比保存在数据框中访问效率高， 数据框提供的功能更丰富。
列表是一种特别的对象集合，它的元素也由序号（下标）区分，但是各元素的类型可 以是任意对象，不同元素不必是同一类型。元素本身允许是其它复杂数据类型，比如，列表 的一个元素也允许是列表。...“列表名[[下标]]”的格式引用。...例如： > rec[[2]] [1] 30 > rec[[3]][2] [1] 76 修改列表 列表的元素可以修改，只要把元素引用赋值即可。...如： > rec$age <- 45 甚至 > rec$age <- list(19, 29, 31) （可以任意修改一个列表元素）。如果被赋值的元素原来不存在，则列表延伸以包含该新 元素。...当然，为什么要导出呢——因为要传给别的队友。。。 可以有两种办法： 1、批量写出，批量读入； 2、写写成一个data，然后导出，再写入。
R Python 数组 列表 列表 字典或对象列表 data.frame 数据框 ddply 在 R 中使用名为 df 的 data.frame 来按 month 汇总 x 的表达式： require...c(2,3,4)) data.frame(melt(a)) 在 Python 中，由于 a 是一个列表，你可以简单地使用列表推导式。...中使用名为 a 的列表来将其融合成一个 data.frame 的表达式： a <- as.list(c(1:4, NA)) data.frame(melt(a)) 在 Python 中，这个列表将是一个元组的列表...R Python array list lists 字典或对象列表 data.frame dataframe ddply 在 R 中使用名为 df 的 data.frame 表达式，您想要按 month...中使用名为a的列表的表达式，你想要将其融化成数据框： a <- as.list(c(1:4, NA)) data.frame(melt(a)) 在 Python 中，这个列表将是一个元组的列表，
R的使用 在Rstudioy中新建项目（R project） File-New Project-New Directory-New Project-Directory name-Creat...代表函数写错了或者还没有加载这个函数，function就是函数 错误（Error） object..not found 没有对象，代表函数写错了(忘加" "等 ) 错误（Error): no such...，视为一个整体,一列只能有一种类型。...df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4), change = rep(c("up","down"),each = 2...L <- list(m1 = matrix(1:9,nrow = 3), m2 = matrix(2:10,nrow = 3)) L$m2 #列表取子集 L[[2]] 与上同
本文节选自张丹的《R的极客理想》系列。 1. apply的家族函数 apply函数族是R语言中数据处理的一组核心函数，通过使用apply函数，我们可以实现对数据的循环、分组、过滤、类型控制等操作。...很多R语言新手，写了很多的for循环代码，也不愿意多花点时间把apply函数的使用方法了解清楚，最后把R代码写的跟C似得，我严重鄙视只会写for的R程序员。...参数列表： X:list、data.frame数据 FUN: 自定义的调用函数 …: 更多参数，可选 比如，计算list中的每个KEY对应该的数据的分位数。...数据集按列进行循环，但如果传入的数据集是一个向量或矩阵对象，那么直接使用lapply就不能达到想要的效果了。...4. sapply函数 sapply函数是一个简化版的lapply，sapply增加了2个参数simplify和USE.NAMES，主要就是让输出看起来更友好，返回值为向量，而不是list对象。
；structure 可以批量定义对象所有的属性。...mode(x3) [1] "numeric" > x4 <- gsub("a", "aa", x3) > x4 [1] "aa" "b" > mode(x4) [1] "character" 这也是为什么我们如果用...因子取子集，去除其他不包含levels的方法： 其他 日期 image.png 日期-时间 image.png 时间段 反映的是两段时间的差值： 列表 从大类上，list 是区别于atomic...数据框 识别非法名称 image.png tibble 可以使用运算符号创建 为什么要窄长的ggplot 类型数据，不要长宽数据 转换rownames 的方法： 数据框中定义列表的方法 数据框中定义矩阵与数据框的方法...nrow = 3) > dfm$z <- data.frame(a = 3:1, b = letters[1:3], stringsAsFactors = FALSE) > dfm <- data.frame
版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。...可见它是属于data.table和data.frame类，并且取列，维数，都可以采用data.frame的方法。...将一个R对象转化为data.table，R可以时矢量，列表，data.frame等，keep.rownames决定是否保留行名或者列表名，默认FALSE,如果TRUE,将行名存在"rn"行中，keep.rownames...,keep.rownames=TRUE) setDT(x, keep.rownames=FALSE, key=NULL, check.names=FALSE) 把一个R对象转化为data.table...，比as.data.table快，因为以传地址的方式直接修改原对象，没有拷贝 copy(x) 深度拷贝一个data.table，x即data.table对象。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
实时音视频
对象存储
云直播
