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R语言学习笔记之——数据处理神器data.table

合理选择一套自己数据处理工具组合算是挺艰难选择,因为这个涉及到使用习惯和迁移成本问题,比如你先熟知了R语言基础绘图系统,在没有强大驱动力情况下,你可能不太愿意画大把时间去研究ggplot2,...data.table 1、I/O性能: data.table被推崇重要原因就是他IO吞吐性能在R语言诸多包中首屈一指,这里以一个1.6G多2015年纽约自行车出行数据为例来检验其性能到底如何,..."https://raw.githubusercontent.com/wiki/arunsrinivasan/flights/NYCflights14/flights14.csv") 这里使用一个在线数据...使用fread函数导入之后便会自动转化为data.table对象,这是data.table所特有的高性能数据对象,同时继承了data.frame传统数据框类,也意味着他能囊括很多数据方法和函数调用。...(carrier,origin,dest) 先按照三个维度进行全部分组; .SDcols=c("arr_delay","dep_delay")则分别在筛选每一个子数据块儿上特定列; lapply(.

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【算法与数据结构】--算法基础--算法入门

算法是一组有序操作步骤,用于解决特定问题或执行特定任务。它是一种精确而有限计算过程,以输入数据作为起点,经过一系列明确定义步骤,最终产生输出结果。...输入(Input):算法需要接受输入数据,这些输入数据是解决问题所必需信息。 输出(Output):算法必须产生输出,即问题或者所需结果。...性能分析通常涉及以下几个关键方面: 时间复杂度(Time Complexity):时间复杂度是用来估计算法执行所需时间度量。它通常表示为一个函数,关于输入数据规模增长情况。...与时间复杂度类似,空间复杂度也通常表示为一个函数,关于输入数据规模增长情况。了解算法空间复杂度有助于我们在有限内存资源下进行程序设计和优化。...平方时间复杂度 - O(n^2): 平方时间复杂度表示算法执行时间与输入规模平方成正比。 例如:简单嵌套循环遍历二维数组、冒泡排序。

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For循环与向量化(Vectorization)

通过对水友们问题汇总,我们发现大多数水友存在一些R语言应用误区,在此出一期关于该问题解读。 问题提出 首先思考一个典型增长计算例子。假设我们有一列时间序列,每个都记录着时刻值。...现在我们希望针对每个计算当期增长率,其公式如下: 大家可能首先想到是利用For循环来做。假如一个向量长度为,那么我们就把上面的增长率公式应用遍。这种思路以标量(scalar)角度考虑问题。...通过运行结果可以发现,Rcpp调用底层循环略优于data.table向量化,运行时间在0.03s左右。...利用data.table行数据操作有着比R本身向量化更好效率表现,如果自身对效率要求更高,可以利用更底层语言接口进行编写。 最后还有一点需要注意:向量化并不能解决一切问题。...当遇到一些特殊情况,比如函数嵌套调用过多,或者数据迭代问题,对更为底层语言进行调用,则会显得更为有效。

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时间管理」JavaScript算法时间、空间复杂度分析

「空间复杂度:全称就是渐进空间复杂度,表示算法存储空间与数据规模之间增长关系。」 也就是说,算法执行效率由执行时间、存储空间两个方面决定。...复杂度分析就是用来分析算法执行效率与数据规模之间关系,包括时间复杂度和空间复杂度。 为什么搞出这两个概念呢?还嫌我需要理解概念不够多吗? 其实,你也可以进行事后统计法,俗称 「马后炮」。...T(n):代码执行时间 n:数据规模 f(n):每行代码执行次数总和 O:表示 T(n) 与 f(n) 成正比 注意,初学者可能会认为这种方法就代表真实代码执行时间,并不是这样,其代表是代码执行时间数据规模增长变化趋势...其中,指数阶和阶乘阶会随着数据规模 n 增大,执行时间急剧增长,十分低效,我们暂且不去分析。下面我们通过代码来逐一理解其余时间复杂度。...('前端食堂饭真香'); } } 平方阶就是把 O(n) 代码再嵌套一层循环,它时间复杂度就是 O(n^2)了。

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数据结构和算法

数据结构和算法 数据结构是为算法服务,算法要作用在特定数据结构。 ?...时间复杂度 表示代码执行时间数据规模增长变化趋势 空间复杂度 表示算法存储空间与数据规模之间增长关系 大O复杂度表示法: 分析技巧: 1、只关注执行次数最多一段代码2、加法规则:量级最大代码复杂度...3、乘法规则:嵌套代码复杂度等于内外复杂度乘积 T(n)代码执行时间,O(f(n))表示代码执行次数 T(n) = O(f(n)) 常用复杂度级别 多项式阶:随着数据规模增长,算法执行时间和空间占用...,按照多项式比例增长,包括,O(1)(常数阶)、O(logn)(对数阶)、O(n)(线性阶)、O(nlogn)(线性对数阶)、O(n^2)(平方阶)、O(n^3)(立方阶)。...非多项式阶:随着数据规模增长,算法执行时间和空间占用暴增,这列算法性能极差。包括,O(2^n)(指数阶)、O(n!)(阶乘阶) ?

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时间管理」JavaScript算法时间、空间复杂度分析

「空间复杂度:全称就是渐进空间复杂度,表示算法存储空间与数据规模之间增长关系。」 也就是说,算法执行效率由执行时间、存储空间两个方面决定。...复杂度分析就是用来分析算法执行效率与数据规模之间关系,包括时间复杂度和空间复杂度。 为什么搞出这两个概念呢?还嫌我需要理解概念不够多吗? 其实,你也可以进行事后统计法,俗称 「马后炮」。...T(n):代码执行时间 n:数据规模 f(n):每行代码执行次数总和 O:表示 T(n) 与 f(n) 成正比 注意,初学者可能会认为这种方法就代表真实代码执行时间,并不是这样,其代表是代码执行时间数据规模增长变化趋势...其中,指数阶和阶乘阶会随着数据规模 n 增大,执行时间急剧增长,十分低效,我们暂且不去分析。下面我们通过代码来逐一理解其余时间复杂度。...('前端食堂饭真香'); } } 平方阶就是把 O(n) 代码再嵌套一层循环,它时间复杂度就是 O(n^2)了。

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Part1:可解释机器学习-XAI – eXplainable Artificial Intelligence

image.png 本文主要介绍: 为什么要使用XAI 代码实现 1.为什么要使用XAI 目前,人工智能算法非常流行,通过快速调用机器学习包,完成模型预测目的,这些复杂算法,也称之为黑盒模型。...由于机器学习算法灵活性与复杂性,它们通常可发现变量之间复杂关系,学习出特定规律,让预测变得更加准确。因此,在达到精确预测同时,机器学习模型也损失了对现实课解释性。...2.代码实现 以apartments数据为例,(From Warsaw,在R和PythonDALEX包均可调用)。...数据描述了1000个公寓六个变量,如面积,地板,房间数,建设年代,每平方米均价,所处位置地区。我们将创建一个预测公寓价格模型,就从——随机森林(回归黑盒模型)开始。...::data.table(apartments)) #we created a random forest model using ranger library library(ranger) model

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算法——A算法通识

一、复杂度分析 A/时间复杂度 1、时间复杂度是衡量算法执行时间输入规模增长增率; 2、通过分析算法中基本操作执行次数来确定时间复杂度; 3、常见时间复杂度包括:常数时间 O(1)、线性时间 O...(n)、对数时间 O(log n)、平方时间O(n^2)等。...B/空间复杂度 1、空间复杂度是衡量算法执行过程中所需存储空间输入规模增长增长率。 2、通过分析算法中所使用额外存储空间大小来确定空间复杂度。...4、最坏情况分析:对于时间复杂度分析通常考虑最坏情况下执行时间。要考虑输入数据使得算法执行时间达到最大值情况。 5、善用结论:某些常见算法时间和空间复杂度已经被广泛研究和证明。...B/空间类型 空间可以是一个范围内所有数字(或二元组、字符串等数据),或者满足某个条件所有数字。

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数据结构与算法学习笔记之 复杂度分析

2.我们可以从执行时间和占用空间来评估数据结构和算法性能,也就空间复杂度、时间复杂度,统称为复杂度。 3.复杂度描述是算法执行时间(或占用空间)与数据规模增长关系。...大 O 时间复杂度并不具体表示代码真正执行时间,而是表示代码执行时间数据规模增长变化趋势,也叫作渐进时间复杂度,简称时间复杂度, 常量阶、低阶以及系数实际上对这种增长趋势不产决定性影响,所以在做时间复杂度分析时忽略这些项...多项式阶:随着数据规模增长,算法执行时间和空间占用,按照多项式比例增长。...包括, O(1)(常数阶)、O(logn)(对数阶)、O(n)(线性阶)、O(nlogn)(线性对数阶)、O(n^2)(平方阶)、O(n^3)(立方阶) 非多项式阶:随着数据规模增长,算法执行时间和空间占用暴增...当然,渐进式时间,空间复杂度分析只是一个理论模型,只能提供给粗略估计分析,我们不能直接断定就觉得O(logN)算法一定优于O(n), 针对不同宿主环境,不同数据,不同数据大小,在实际应用上面可能真正性能会不同

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学界 | Tomaso Poggio深度学习理论:深度网络「过拟合缺失」本质

其中特别强调了经验损失和分类误差之间差别,证明深度网络每一层权重矩阵可收敛至极小范数,并得出深度网络泛化能力取决于多种因素互相影响,包括损失函数定义、任务类型、数据类型等。...5.4 为什么分类比较不容易过拟合 由于这个是线性化系统极小范数,因此我们期望,对于低噪声数据,与交叉熵最小化相关分类误差中几乎很少或没有过拟合。...损失中过拟合可以通过正则化来显性(如通过权重衰减)或隐性(通过早停)地控制。分类误差中过拟合可以被避免,这要取决于数据类型,其中渐近是与特定极小值相关极大间隔(对于交叉熵损失来说)。...也就是说,本论文解释了为什么在参数数量增加并超过训练数据数量时,图 2 中测试分类误差没有变差,但没有解释为什么测试误差这么低。...根据这一框架,浅层网络与深度网络之间主要区别在于,基于特定任务组织结构,两种网络从数据中学习较好表征能力,或者说是逼近能力。

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数据结构学习笔记——算法

算法:算法是解决特定问题求解步骤描述,在计算机中表现为指令有限序列,并且每条指令表示一个或多个步骤。 算法定义 指令:能被人或者计算机装置执行。...算法时间复杂度 1、定义 在进行算法分析时,语句总执行次数 T(n) 是关于问题规模 n 函数,进而分析 T(n) n 变化情况并确定 T(n) 数量级。...它表示问题规模 n 增大,算法执行时间增长率和 f(n) 增长率相同,称作算法渐近时间复杂度,简称为时间复杂度。其中 f(n) 是问题规模 n 某个函数。...用大写 O( ) 来体现算法时间复杂度记法,叫做大O记法。 我们认为:随着 n 增长, T(n) 增长最慢算法为最优算法。...6、平方阶 O(n²) 嵌套循环中,内层循环条件初始值为外层条件当前值。 常见时间复杂度 ? 它们所消耗时间从小到大依次是: ?

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人类外周血多维单细胞分析揭示了衰老和虚弱免疫系统特征

###### step1:导入数据 ###### library(data.table) dir='GSE157007_RAW/outputs/' samples=list.files( dir...而与脐带血组相比,年轻组NK 1细胞群略有下降,但随后在老年和虚弱组中逐渐扩大到更大规模。 其它加分项 探究了T细胞亚型年龄增长动态变化 提取了簇1、2、3、6和9,用于第二轮聚类分析。...分析发现随着年龄增长,T细胞组成向更发达记忆性T细胞转移 通过细胞轨迹分析来检验各种免疫细胞类型是否以相同速度老化,幼稚T细胞是最大细胞群,占所分析细胞总数21.9%。...细胞轨迹分析描绘了来自不同年龄组幼稚T细胞沿着拟时间尺度递增 文章小结: 在确定免疫细胞类型中,观察到细胞异质性和转录组变异性年龄相关性积累。...在特定年龄段特定免疫细胞类型中,通过特定基因组表达,鉴定出具有特征转录因子。 通过轨迹分析显示,非虚弱和虚弱老年人细胞通常处于不同轨迹,尽管年龄相似。

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复杂度分析

大 O 表示法实际上并不具体表示代码真正执行时间,而是表示代码执行时间数据规模增长变化趋势,所以,也叫作渐进时间复杂度(asymptotic time complexity),简称时间复杂度。...# 时间复杂度分析要点 只关注循环执行次数最多一段代码 加法法则:总复杂度等于量级最大那段代码复杂度 乘法法则:嵌套代码复杂度等于嵌套内外代码复杂度乘积 # 最好、最坏和平均情况 最好情况时间复杂度...次加法,其时间复杂度和 N 大小完全一致 T(n) = O(n) 【示例】嵌套循环时间复杂度是多少?...T(n) = O(2^N) # 空间复杂度分析 时间复杂度全称是渐进时间复杂度,表示算法执行时间数据规模之间增长关系。...类比一下,空间复杂度全称就是渐进空间复杂度(asymptotic space complexity),表示算法存储空间与数据规模之间增长关系。

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复杂性分析与算法设计:解锁计算机科学奥秘

时间复杂度 时间复杂度是衡量算法执行时间输入规模增加而增加程度。通常用大O符号(O)来表示时间复杂度。常见时间复杂度包括: O(1):常数时间,表示算法执行时间与输入规模无关。...O(n^2):平方时间,通常出现在嵌套循环算法中,如选择排序。 O(2^n):指数时间,通常出现在穷举搜索等指数级算法中。 空间复杂度 空间复杂度是衡量算法在执行过程中所需内存空间量。...经典例子包括归并排序和快速排序。这些算法将大问题分解为较小子问题,然后将子问题合并在一起以获得原始问题。...算法选择和性能分析 在实际应用中,选择正确算法至关重要。不同算法可能在不同情况下表现出色。因此,性能分析是一项重要任务,可以帮助我们选择最适合特定问题算法。...性能分析通常涉及对算法时间复杂度和空间复杂度进行估算。时间复杂度告诉我们算法运行时间如何输入规模增加而增加,而空间复杂度告诉我们算法需要多少内存。 此外,还应考虑问题特定要求。

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健康大脑衰老和认知障碍期间脑脊液免疫失调单细胞数据分析

acc=GSE200164 59个样品 提供了counts.csv.gz文件,直接下载后按照数据整理对应文件,使用fread()函数读取即可,但是需要对数据进行一些整理。...###### step1:导入数据 ###### #读取数据并进行整理 ct=fread( 'GSE200164_counts.csv.gz',data.table = F) ct[1:4,1:10...主要包括CD4+和CD8+ T细胞、T调节细胞(Tregs)、自然杀伤细胞(NK)、浆细胞、B细胞、树突状细胞和三种经典、中间和非经典单核细胞,通过不同CD14和CD16表达和伪时间分析来区分。...(DEGs) 并且绘制年龄变化差异基因,分析发现CD4 + 和CD8 + T细胞中分化簇74(CD74)表达增加 与健康大脑衰老相关非线性脑脊液免疫转录组变化 当可视化基因表达年龄增长时,脑脊液免疫基因以明显非线性模式波动...通过局部估计散点图绘制在非经典单核细胞中检测到 7,980 个基因年龄增长表达图,显示出波浪形表达轨迹,并使用分层聚类来识别基因表达年龄变化不同模式 为了进一步验证基因表达年龄变化,基于模型单细胞转录组学

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MIT教授Tomaso Poggio演讲与专访:智能背后科学与工程

现在,对于某些我们称之为局部组分函数(local compositional function)特定类别的函数,虽然浅网络参数数量还是会维度而指数增长,但深度网络参数只会维度线性增长,从而能够避开维度灾难...而深度学习给出了针对一类特定函数独特方法:如果近似的对象是一个组合函数,换言之,是一个函数嵌套函数大函数,那么深度网络拟合它所需单元数和函数维度是线性关系。...根据贝祖定理(Bézout's theorem),此时数量比宇宙中原子数量还多。另外,参数多于数据量带来了「退化」(degenerate)性质:每一个都对应着一个无限大。...「在过去几十年机器学习发展史中,我们学到一课是,如果你数据没有大到排除过拟合可能性,那么在一个特定数据最佳方法通常是过拟合、无法扩展到其他数据。...并不是说学者们『偷看』了验证测试,而是当一个社区学者都在用不同方法进行试错,那么一段时间最佳做法通常是过拟合了这个特定数据。」

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来来来,让咱重新认识一下算法复杂度!

Motivation - 为什么需要复杂度分析 事后统计法(也就是把代码运行一遍,通过统计、监控得到运行时间和占用内存大小)测试结果非常依赖测试环境以及受数据规模影响程度非常大。...但是实际上,大 O 时间复杂度并不具体表示代码执行真正执行时间,而是表示代码执行时间数据规模增长变化趋势,也叫做渐进时间复杂度,简称时间复杂度。...又比如 T(n) = O(n^2),那么表示代码执行时间数据规模 n 增长变化趋势是 n 平方。下面这张图是不同时间复杂度,数据规模增长执行时间变化 ? 3....时间复杂度全称叫做渐进时间复杂度,表示算法执行时间数据规模之间增长关系。那么空间复杂度全称叫做渐进空间复杂度,表示算法存储空间与数据规模之间增长关系。...比如 n^2 中,当 n 值越来越大时候,O(n^2) 这个算法执行时间是成平方增长,而 O(n) 这个算法执行时间是成直线型增长,因此 O(n^2) 时间复杂度是更高(见第一张图)。

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机器学习中问题解决方案:解析vs数值

你有没有如下这些疑问: 什么数据最适合我问题? 什么算法最适合我数据? 如何实现算法最优配置? 这篇文章会让你了解为什么没人能告诉你要使用什么算法,或如何为特定数据配置算法。...数值意味着在解法中进行猜测,并测试问题,直到得到足够好解法。比如平方根就可以用这两种方法任意一种解决。 我们一般更喜欢解析,因为它速度更快,而且解法精确。...然而,由于时间或硬件容量限制,有时我们必须采用数值。...机器学习中广泛经验主义解法 机器学习算法核心——数值优化问题,是嵌套在更广泛问题内。具体优化问题受许多因素影响,所有因素都为最终解决方案精华部分做出了巨大贡献,而且这里面不包含解析。...另外你应该也理解了: 解析是产生精确逻辑步骤; 数值是一种较慢试误过程,可以得到近似; 数值是应用机器学习核心,用调整过思维模式来为特定预测建模问题选择数据、算法和配置。

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前端轻松学算法:时间复杂度

为什么需要时间复杂度 时间复杂度怎么表示 怎样分析一段代码时间复杂度 相信认真阅读过本文,面对一些常见算法复杂度分析,一定会游刃有余,轻松搞定。...于是乎,我们需要一个不受硬件,宿主环境和数据影响指标来衡量算法执行效率,它就是算法复杂度分析。 二、时间复杂度怎么表示 我们知道了为什么需要时间复杂度,那要怎么来表示它呢?...大O表示法表示代码执行时间数据规模增长变化趋势 下面是大O表示法公式:   T(n) = O(F(n))  n: **代表数据规模, 相当于上面例子中n F(n):表示代码执行次数总和...现在已经知道了大O表示法公式含义,我们尝试着把上面例子得出公式改写成大O表示法,结果如下: 1 T(n) = O(2n + 3) 上面已经说过,大O表示法表示代码执行时间数据规模增长变化趋势,只是表示趋势...四、常见时间复杂度 最常见时间复杂度有常数阶O(1),对数阶O(logn),线性阶O(n),线性对数阶O(nlogn),平方阶O(n²) 从下图可以清晰看出常见时间复杂度对比: 1 O(1) <

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Python基本数据结构:深入探讨列表、元组、集合和字典

列表是可变,允许添加、删除和修改元素。如果需要频繁修改数据集合,列表通常是一个不错选择。 元组:用于存储不可变数据,例如坐标点或日期时间信息。元组在创建后不可修改,因此适用于保存不变数据。...数据结构性能考虑 在选择数据结构时,还需要考虑其性能特性。不同数据结构具有不同时间复杂度,因此在大型数据或需要频繁操作数据情况下,性能可能成为一个关键问题。...列表:在插入和删除元素时,列表性能列表大小线性增长(O(n))。在访问元素时,可以通过索引直接访问元素,因此性能为O(1)。 元组:由于元组是不可变,插入、删除和修改元素都不可行。...理解这些性能特性将有助于你在编写代码时做出明智选择,以确保程序在不同条件下具有良好性能。 10. 数据结构嵌套 Python允许嵌套不同类型数据结构,以构建更复杂数据组织方式。...", "History")} 这种嵌套结构允许你更灵活地表示和操作数据,适应不同应用需求。

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