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记录一下fail2ban不能正常工作的问题 & 闲扯安全

今天我第一次学习使用fail2ban,以前都没用过这样的东西,小地方没有太多攻击看上,但是工作之后这些安全意识和规范还是会加深认识,fail2ban很简单的远离,分析日志,正则匹配查找,iptables...ban ip,然后我今天花了很长时间都没办法让他工作起来,我写了一个简单的规则ban掉尝试暴力登录phpmyadmin的ip,60秒内发现3次ban一个小时。...我通过fail2ban-regex测试工具测试的时候结果显示是能够正常匹配的,我也试了不是自己写的规则,试了附带的其他规则的jail,也是快速失败登录很多次都不能触发ban,看fail2ban的日志更是除了启动退出一点其他日志都没有...后面我把配置还原,重启服务,这次我注意到重启服务之后整个负载都高了起来,fail2ban-server直接是占满了一个核,这种情况居然持续了十几分钟的样子,简直不能忍。

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R tips:使用TCGAbiolinks包下载TCGA数据

但是也由于是下载好的数据,不能保证数据都是全新的。TCGAbiolinks包是实时调用GDC的API,所以可以获取最新的数据。...如果需要进行Gene间的比较,那么需要对基因长度做Normalization,否则的话,基因越长,获得的基因Counts也就越多; 文库组成:比如样本A是敲除样本,而样本B是过表达样本,那么这个时候我们就不能假定两个样本的转录组总表达量是一致的...对生存数据做数据清洗,关键信息是vital_status, days_to_death, days_to_last_follow_up,根据vital_status选择生存数据,但是有些病例的生存数据比较奇怪:正常情况下如果...Primary Tumor") %>% mutate(status = ifelse(vital_status == 'Dead', "1", "0")) %>% mutate( OS = case_when...Primary Tumor") %>% mutate(status = ifelse(vital_status == 'Dead', "1", "0")) %>% mutate( OS = case_when

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生信马拉松 Day22 TCGA实践

用一个值来量化它5、模型预测和评估:ROC曲线,C-index,评估模型的质量6、突变数据的处理:其实是外显子组的下游分析,每一个基因在每个病人的哪个位点上发生了变化,突变频谱图泛癌比较复杂,一般的电脑不能使用...xena(尚未更新)是2019年的基因版本,与现在有一定的出入,但也能用没有正常样本怎么做差异分析1.不做T-N差异分析,只做亚型,或根据某基因的表达量高低来做分析2.和Gtex联合分析,原因是在xena...GEO数据库找T-N的数据做差异分析,差异基因在TCGA里面继续分析(因为TCGA数据量大且齐全,适合做生存分析)combat_seq函数可以处理转录组批次效应#一个按条件筛选的小技巧library(dplyr...k1 = data$gene1=='Negative'&data$gene2=='Negative'k2 = data$gene1=='Negative'&data$gene2=='Positive'case_when

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生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

2.1.3 为什么用Rdata而不是表格文件来衔接?变量,自带变量名称,不需要再次赋值,也没有参数。undefined表格文件需要赋值,读取参数不同导致读取结果不同,不能在后续代码中同等处理。...,以上两个代码不能读取成功。...)/xxx.Rdata")#访问隔壁文件夹的文件代码,..的意思是工作目录的上一级。...代码2实现结果和代码1相同2.6 练习library(dplyr)x = c(-1,-1,4,5,2,0)case_when(x>0 ~ "A", x==0 ~ "0",...数据挖掘生信技能树小洁老师7.1 为什么数据挖掘?广义基因6w+个;哪些和自己感兴趣点有关?数据分析筛选。表达矩阵:一行是一个基因在所有样品里的表达,一列是一个样本里所有基因的表达。

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生信技能树- R语言-day7

A") # 竖线 代表着或者6.字符删除str_remove(x," ")str_remove_all(x," ")玩转数据框arrange,数据框按照某一列排序sort是给向量排序的library(dplyr...else2, ifelse(,,ifelse)在ifelse里加一个ifelse补充 case_when练习题1.加载deg.Rdata,根据a、b两列的值,按照以下条件生成向量x:load("deg.Rdata...par(mfrow = c(2,2)),把图按照(2,2)的排列方式展示for(i in 1:4){plot(iris[,i],col = iris[,5])}#批量装包pks = c("tidyr","dplyr...paste0("test",1:6)exp[,1:3] = exp[,1:3]+1 # 1-3列的数字在数值上加1exp数据框如下library(tidyr)library(tibble)library(dplyr...dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件file.create("douhua.txt") #用代码创建文件file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在

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懒癌必备-dplyr和data.table让你的数据分析事半功倍

接下来,我就为大家分享几个我在工作当中最常用来做数据分析用到的包,dplyr和data.table,我保证你get到这两个包后,就再也不想用R里面自带的基础包函数进行数据分析了!!...在编程语言里面,说语法简单,意味着编程语言与我们正常人的逻辑思维是一致的。它相对于R自带的筛选方法会更高效,我们不需要花很多时间去等待机器反应。...dplyr很庆幸,都提供了关于常用方法的一些函数。...data.table包 dplyr已经可以满足我们数据分析工作中大部分的需求,后来该包的作者又开发了一个炫酷吊炸天的包“data.table” 如果你的日常处理数据在几万到十几万行,那么用dplyr...小伙伴们一定不能错过的绝世好包! 铺垫了这么多,来来来,数据分析神器data.table走起来!! 还是那句话,讲几个最常用的函数,就算你的数据量大到逆天,data.table跑起来都是游刃有余的。

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广义估计方程和混合线性模型在R和python中的实现

,1=有;macro:基线是否有大量蛋白尿,0=正常蛋白组,1=有;研究问题患者GFR是否受到基线年龄、性别、尿蛋白情况以及化验时间影响。...在校正年龄和性别下,基线的GFR在micro - 正常蛋白组(micro->1; 正常蛋白组->0)估计值:-20.23 (-23.75, -16.72);平均GFR年下降率(斜率)time(正常蛋白组...):-1.63 (-2.36, -0.9)micro - 正常蛋白组:-1.56 (-2.58, -0.54)macro - 正常蛋白组:-1.06 (-2.43, 0.31) python实现方式library...患者的随机效应捕捉了在患者之间的GFR变异性,这不能由固定效应解释# 第一种方法# library(lmerTest)# mlm_fit <- lmerTest::lmer(GFR ~ age + gender...mod_lme.fit()print(modf_lme.summary())参考线性混合效应模型入门之二 - 实例操作及结果解读(R、Python、SPSS实现)混合线性模型介绍--Wiki广义估计方程中工作相关矩阵的选择及

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「R」dplyr 编程

这让 dplyr 代码有两个主要优点: 数据框的操作可以简洁地表达,因为你不需要重复输入数据框名称。...有两个主要缺点: 大多数dplyr参数不是透明。这意味着你不能用一个看似等价的对象代替一个在别处定义的值。...[x == y, ] 这在交互式工作时非常有用(因为它可以节省打字时间和减少打字量,快速发现问题),但使创建函数比你想要的更不可预测。...幸运的是,dplyr 提供了克服这些挑战的工具。他们需要多一点打字,但少量的前期工作是值得的,因为他们从长远来看可以帮助你节省时间。...这篇文章有两个目标: 演示如何使用dplyr的pronouns和quasiquotation编写可靠的函数,以减少数据分析代码中的重复。

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