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从零开始异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

," ") #函数将一个向量拆分成一个列表了 x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #提取拆分后列表元素进行后续计算 图片 y = c("jimmy 150","nicker...(x," ") x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 ### 4.字符检测 str_detect(x2,"h") ##用来检测元素中字符,生成与向量元素相等逻辑值向量..., 10:5) l2 <- list() l2[[1]] <- 1:10 l2[[2]] <- 10:5 ##生成列表方式,直接生成以及生成一个空列表添加元素 identical...list,使用下标循环,可以将每次循环结果都保存到列表中 ## cbind 按列拼接 a = rnorm(10) b = 1:10 cbind(a,b) ##do.call() 函数是对列表 list...test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test #返回值是列表,对列表每个元素(向量)求均值(试试方差var,分位数quantile) lapply

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Redis跳跃表是如何添加元素

Redis 有序集合 ZSet 是由 ziplist (压缩列表) 或 skiplist (跳跃表) 组成。...跳跃表由一个带有多层节点链表组成,每一层都是原始链表一个子集。最底层是一个完整有序链表,包含所有元素。每个更高层级都是下层级子集,通过添加额外指针来跳过一些元素。...所谓随机层数指的是每次添加节点之前,会先生成当前节点随机层数,根据生成随机层数来决定将当前节点存在几层链表中。 为什么这样设计呢? 这样设计目的是为了保证 Redis 执行效率。...为什么生成随机层数,而不是制定一个固定规则,比如上层节点是下层跨越两个节点链表组成,如下图所示: 如果制定了规则,那么就需要在添加或删除时,为了满足其规则,做额外处理,比如添加了一个新节点...第四个元素生成随机层数是 1,所以把它按顺序保存到最后一层中即可。 其他新增节点以此类推。

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Redis跳跃表是如何添加元素

Redis 有序集合 ZSet 是由 ziplist (压缩列表) 或 skiplist (跳跃表) 组成。...跳跃表由一个带有多层节点链表组成,每一层都是原始链表一个子集。最底层是一个完整有序链表,包含所有元素。每个更高层级都是下层级子集,通过添加额外指针来跳过一些元素。...所谓随机层数指的是每次添加节点之前,会先生成当前节点随机层数,根据生成随机层数来决定将当前节点存在几层链表中。为什么这样设计呢?这样设计目的是为了保证 Redis 执行效率。...为什么生成随机层数,而不是制定一个固定规则,比如上层节点是下层跨越两个节点链表组成,如下图所示:图片如果制定了规则,那么就需要在添加或删除时,为了满足其规则,做额外处理,比如添加了一个新节点,如下图所示...第四个元素生成随机层数是 1,所以把它按顺序保存到最后一层中即可。其他新增节点以此类推。

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生信入门马拉松之R语言基础- R语言作图(Day 6)

1.4 主题【小洁老师语录】作图不用默认主题,追求颜值!!!theme_bw()#改主题,该代码可去掉默认主题中灰色格子。...;列表里必须是长度为2向量组成;第三这些向量里""里值必须是图横坐标;三个要求缺一就会报错!!!...x### 1.检测字符串长度str_length(x)#返回42(字符串长度)length(x)#返回1(向量元素)### 2.字符串拆分str_split(x," ")#为何拆分成列表?...列表第几个元素,就是拆分出向量第几个元素class(str_split(x," "))#列表x2 = str_split(x," ")[[1]];x2#提取出向量y = c("jimmy 150","...对表格按照第一列排序,默认从小到大arrage(test,desc(Sepal.Length))#从大到小排序,没有为什么哦!

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

(字符串,"拆分符号") 拆分字符串 图片 -(1)拆分之后成为了了列表列表每个元素对应原来每个元素拆分结果 -(2)列表使用不方便——simplify = T简化结果,简化成矩阵 -(3)注意...y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152") str_split(y," ") str_split(y," ",simplify = T) #简化拆分结果,简化成返回矩阵而不是列表...; -(2)当逻辑值为TRUE时执行大括号内代码,如果为FALSE就不执行; -(3)如果执行代码只有一行可以不加大于号; -(4)实例:安装R包满分操作——根据一个包是否已安装来决定要不要安装这个包...如何挑出30个数里最大五个 -(1)排序 -(2)取最后五个 图片 3.向量/列表隐式循环-lapply() 对列表/向量中每个元素实施相同操作 lapply(1:4,rnorm) #批量画图...,但顺序不同;对比之后发现我是按排序前原本先后顺序列出(因为一个一个检查是否是最大/最小前十个);如果先arrange一下再%in%就可以跟老师顺序一样了。

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R语言基础提升与总结

xstr_length(x)length(x)1.2 str_split() 拆分字符串有分隔符号拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y =...m=list()m[[1]]=iris[1:50,]m[[2]]=iris[51:100,] #列表新建另一种方式m0=list(iris[1:50,],iris[51:100,])identical...,按列拼接成为一个矩阵 do.call完成批量操作4 表达矩阵画箱线图4.1 表达矩阵概念基因表达数据通常使用表达矩阵来表示其中矩阵行代表某个基因在不同样本(不同处理,或时间点等)中表达水平列表示某个样本中各个基因表达水平...ggplot画图library(ggplot2)p = ggplot(pdat,aes(gene,count))+ geom_boxplot(aes(fill = group))+ theme_bw()添加分面...)5.2 列表隐式循环——lapply 不涉及行和列test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);testlapply(test,mean)lapply(test

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一个list 里面存放实体类,根据多个字段进行分组,最后将结果都保存,返回一个map 集合,一层一层map 集合

一层一层 2 实现 如果你想在最后一层列表数据上进行计算,并将计算结果保存并返回一个Map集合,可以按照以下方式修改代码: import java.util.List; import java.util.Map...calculateValue方法接收一个最后一层列表数据,并根据实际需求进行计算,并返回计算结果。这样,最终分组结果将包含计算结果Map集合。...如果在最后一层,需要传另外参数 如果calculateValue方法需要接收一个最后一层列表数据和一个额外字符串变量,你可以将该变量添加到方法参数列表中,并在Collectors.collectingAndThen...}); }); System.out.println(); }); } // 根据最后一层列表数据和额外参数计算值方法...,calculateValue方法参数列表添加了一个String类型额外参数extraParameter。

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PHP数组与字符串互相转换实例

这里如果字符串没有任何符号可以进行分割的话,就需要考虑别的方法了 str_split — 将字符串转换为数组 <?...php $str = "Hello Friend"; $arr1 = str_split($str); $arr2 = str_split($str, 3); print_r($arr1);...当把一个数组转换成一个字符串时,将会设置胶合符——将被插入到生成字符串中数组值之间字符或代码。 相反,当把字符串转换成数组时,指定分隔符,它用于标记什么应该变成独立数组元素。...索引为0,Tue 索引为1,等等。...s2=implode(‘,’,days_array); $s2 变量现在是一个用逗号分隔一个星期中各天列表:Mon,Tue,Wed,Thu,Fri 到此这篇关于PHP数组与字符串互相转换实例文章就介绍到这了

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既然可以看感兴趣基因生存情况,当然就可以批量做完全部基因生存分析

前言 年前我提出了一个问题:为什么不用TCGA数据库来看感兴趣基因生存情况 就是一篇文章并没有使用TCGA数据库指定癌症生存信息去看自己感兴趣基因生存效应,反而舍近求远去下载BMC Cancer...所以就安排学徒来完成,下面是他表演: 接下来,对GSE20685所有基因做生存分析(表达量中位值分组),获取统计学显著差异基因列表。 ? 1....批量生存分析,获取统计学显著差异基因列表 rm(list=ls()) options(stringsAsFactors = F) options(warn = -1) library(AnnoProbe...(dat$status,":"),function(x) {return(x[2])}))) dat$OS.time <- as.numeric(unlist(lapply(str_split(dat$...对生存分析显著基因列表做富集分析 参考:为R包写一本书(像Y叔致敬) 01 获取列表基因ENTREZID rm(list=ls()) load("surv_diff_genes.rdata") surv.diff.genes

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Modern C++ 最核心变化是什么?

右值引用是 C++11 中最重要新特性之一,它解决了 C++ 中大量历史遗留问题,使 C++ 标准库实现在多种场景下消除了不必要额外开销(如 std::vector, std::string),...等等,这个 2B 解答听起来很耳熟,这不就是 C++ 中移动一个对象时所做事情吗? “移动”,这是一个三岁小孩都明白概念。...v2 = str_split("1,2,3");  注:v 拷贝构造调用有可能被优化掉,尽管如此在语义上仍然是有一次拷贝操作。 同样代码,在支持移动语义世界里就变得更美好了。...vector str_split(const string& s); // 返回vector用以移动构造对象v。v直接取走临时对象堆上内存,无需新申请。...如果你往容器内放入超大对象,那么版本 2 自然是不 2 选择。

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Redis 有序集合使用跳表到底是什么

那么总共需要索引节点个数就是 因此,跳表总空间复杂度还是 O(n),也就说使用跳表查询数据时,需要额外 n 个节点存储空间。虽然空间复杂度还是没变,但是使用额外空间还是有点多。...但是定位到插入位置时间复杂度是 O(n),比如原始链表中数据有序,那么需要遍历链表才能找到插入位置。...当我们往跳表中插入数据时候,我们通过一个随机函数,来决定将这个在哪几层索引层中添加。比如随机函数生成了值 k,那么我们就在第一级到第 k 级这 k 级索引中添加相应索引节点。...为什么使用跳表而不是红黑树实现呢?最主要是跳表它支持区间查找。...那么,我们可以结合散列表,也就相当于把散列表和跳表结合。此时,根据 key 来查找、删除、插入一个成员对象时间复杂度就变成了 O(1)。 ” 4.

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Learn R 专题1-3

:字符串,一个引号中所有的东西 #引号内单个字母/数字/符号:字符 2.字符串拆分 代码2 str_split() >str_split(x," ") #以空格为分隔符号把x拆分开 [[1]..." > y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152") > str_split(y," ") [[1]] #列表1 [1] "jimmy" "150" [[2...1.9 virginica 15.66 #注意此时test仍为5列 因为没有赋值 > test$new=test$Sepal.Length*test$Sepal.Width #以这种方式才是真正添加一列...#每次都在列表里面加一个元素 } result #一列表形式储存了结果 [[1]] [1] 5 5 [[2]] [1] 6 11 [[3]] [1] 0 11 [[4]] [1] 3 14...$z [1] 30 29 28 27 返回值是列表,对列表每个元素(向量)求均值(试试方差var,分位数quantile) > lapply(test,mean) #输出结果仍为列表 $x [1]

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生信马拉松 Day7

;x 1.1 检测字符串长度 str_length(x) #注意包括空格,空格也算一个 #[1] 42 length(x) #算是向量有多少个元素 #[1] 1 1.2 字符串拆分 str_split...(y," ") str_split(y," ",simplify = T) #list到matrix,所以simplify这个参数必不可少 # [,1] [,2] #[1,] "jimmy...条件和循环,if,for 碎碎念:这个东西每次好久不用就想不起格式重新查,脑子是个好东西,就是漏厉害 rm(list=ls()) #if格式 if (){ #if后面的括号里只能是一个逻辑值...4.9500000 3.3833333 1.4500000 0.2333333 apply(test, 1, sum) ### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表...()系列函数,两个数据框连接 碎碎念:这个没啥好仔细展示,含义也很直观,主要是记住有这个函数,等需要用时候回来找 test1 <- data.frame(name = c('jimmy','nicker

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