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《高效R语言编程》4-高效工作流

这是《高效R语言编程》学习笔记,前面的笔记在这里: 高效R编程 《高效R语言编程》笔记 这是《高效R语言编程》学习笔记,前面的笔记在这里: 我们将实践、习惯、提升生产力系统环境定义工作流。...本人觉得是先实现呢 创建包 用户接口用户文档,代码风格审查,鲁棒性测试也很重要 报告发布 需要多少代码才能得到结论和会创建多少输出 应用 Shiny App或者嵌入到大型服务器代码,健壮性恰当地处理错误...通过R可视化项目计划 项目进度绘图包: plan(进度图、甘特图) plotrix(甘特图) install.packages("plotrix") library(plotrix) example(gantt.chart...包选择 低效、缺乏技术支持过时包会浪费不少时间,CRAN上有大量不好包,易出错。使用R包可以避免重复造轮子,提高效率。...可以用这个网址查看https://cranlogs.r-pkg.org/badges/last-month/ggplot2 ? 发布 文档化你工作:动态报告与R包。

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简单绘制一个3D效果饼图吧

我们来演示一下使用plotrix、dplyrggsci等库来生成一个3D饼图,plotrix提供了pie3D函数,dplyr用于数据处理,ggsci提供了调色板pal_jama。...df$color, # 向量,表示每个扇形填充颜色 labelcol = "black", # 字符串,表示标签文本颜色 labelcex = 1.2,...# 数值,表示标签文本字符大小倍数 explode = 0.1, # 数值,表示每个扇形偏移量,模拟3D效果 shade = 0.75 # 数值,...尽量使用简单2D图表。 添加标签数据表格: 在图表上添加数值标签提供数据表格,以便更清晰地呈现数据。 使用更直观颜色: 考虑使用更易于区分颜色,避免引起混淆。...考虑使用其他图表类型: 根据数据特点,考虑使用更适合图表类型,如堆积条形图直方图等。

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常用 7 大类型图形可视化——群体关系图形

那么,什么样图形才最适合自己数据呢?一个有效图形应具备以下特点: 能正确传递信息,而不会产生歧义; 样式简单,但是易于理解; 添加图形美学应辅助理解信息; 图形上不应出现冗余无用信息。...加载数据集 使用 ggplot2自带数据集作为示例数据集。...library(ggplot2) library(plotrix) data("midwest", package = "ggplot2") #加载数据集 midwest 数据集 全局主题设置 全局配色...clustering # plot ggdendrogram(hc, rotate = TRUE, size = 2) 谱系图 7.2 聚类图 可以使用 geom_surround() 来显示不同组...如果数据集有多个特征,还可以计算主成分,并使用 PC1 PC2 作为 X Y 轴绘制散点图。geom_encircle() 可用于框选所需组。

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快速完整基于点云闭环检测激光SLAM系统

由于该单元格是3D空间固定分区,因此其中心位置是静态,不需要更新哈希表现有条目(哈希表 虽然正在动态增长)。新插入立方体根据中心坐标也被添加到八叉树地图中。...2D直方图描述了关键帧特征方向Eulerangles分布。 cell特征类型方向 每个关键帧由一百次扫描结果组成,对于每个cell,我们利用每个特征点相关特征方向来确定他形状。...,H_P0,同时计算旋转矩 对于关键帧每个cell 如果cell是线特征 把特征×旋转矩阵 计算旋转后特征pitchyaw ?...利用旋转不变cell特征方向我们计算2D直方图: 选择X分量,计算特征分量pitchyaw 利用60*60矩阵表示2D直方图(每个pitchyaw都有3度分辨率) 利用pitch...yaw确定这个cell在位置 对每个2D直方图进行高斯滤波以提升鲁棒性 快速闭环检测 通过计算新帧2D直方图其他所有帧相似度来检测闭环,这个关键帧地图匹配然后地图利用位姿图优化方进行更新

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R语言绘图 | 气泡矩阵图

今天,小编教大家用R语言绘制常用多维数据展示图——气泡矩阵图。 首先,我们需要准备输入文件。 ?...如上图所示,准备四列数据,分别为X轴、Y轴、数值(控制气泡大小)分类(控制气泡颜色,可为字符数字),以"Tab"分隔符。...准备好输入文件后,我们就可以打开R画图啦~ ## 导入R包 library("ggplot2") ## 导入数据 data <- read.table("input.txt",header = T,sep...执行完命令后,气泡图就画好啦~气泡颜色反映我们输入数据不同类型,气泡大小反映我们输入数值高低。...简单几步,气泡矩阵图就画好啦~大家赶快试试吧! 具体细节大家可以搜索ggplot2相关参数,根据自己需求调整或者将图片导出PDF格式,通过Adobe illustrator调整。

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表 - 现代数据分析必不可少报表工具

表由矩阵(Matrix)控件演化而来,矩阵可将存储原始Detail 数据,通过【行分组】(即垂直显示字段值)【列分组】(即水平显示字段值),将数据二维展示出来,然后计算每一行合计;也可以将字段值作为行号列标...,在每个行列交汇处计算出各自数量,然后计算小计总计。...表可以将存储在数据库静态二维表(只有列头有含义表数据),转换成具有汇总和统计数据透视表,且这些数据均是根据表结构自动生成,不需要手动添加每行每列。...,同样在纵向展示销售类目时,也不需要手动添加多行类目,只需要指定类目到单元格表会自动生成所有类目行。...实例 - 使用表创建【产品销售数据分析表】 在设计器添加 表 将订购月指定到【行分组】单元格,将【类别名称】指定到列分组单元格,在最下方单元格中指定合计方法: =Sum(Sum(Fields

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重磅!开放EasyCharts插件源代码!

EasyCharts插件主要实现以下功能: 图表风格自动转换:使用Excel绘制图图表后,选择“背景风格”项目“R ggplot2”、“Python Seaborn”、“Matlab 2013”...、“Matlab 2014”、“Excel Simple”等图表风格,自动实现图表背景风格设定与转换; 颜色主题自动转换:使用Excel绘制图图表后,选择“颜色主题”项目“R ggplot2...Set1”、“R ggplot2 Set2”、“R ggplot2 Set3”、“Tableau 10 Medium”、“Tableau 10”、“Python seaborn hsul”、“Python...、南丁格尔玫瑰图、马赛克图、子弹图等图表,部分图表如图2所示; 数据分析自动实现:使用“数据分析”可以实现频率直方图、核密度估计图、相关系数矩阵图、Loess数据平滑Fourier数据平滑等数据分析与图表自动绘制...; Excel辅助工具使用:“辅助工具”包括颜色拾取、数据小偷、色轮参考、图表保存、截图等功能,尤其是“数据小偷”可以通过读入现有的柱形图曲线图,自动手动方法,读取并获得图表原始数据。

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R语言绘图 | 给气泡矩阵图上个色

上次小编教大家用R语言绘制气泡矩阵图后,好多朋友都在后台留言问小编怎么给气泡矩阵图上色,今天小编就教大家怎么给气泡矩阵图上个色 ! 不管我们做什么组学分析,分析到最后总是躲不过富集分析。...但有时候我们富集分析结果是用其他工具做出来,或者想要更改气泡图显示内容时,又该怎么样做出Y叔一样气泡图呢? 如,我想展示结果A-D四个GO term富集倍数、q值count数。...准备输入文件(分为四列,第一列GO term描述,第二列富集倍数,第三列q值,第四列count数,以"Tab"分隔符): ?...准备好输入文件后,输入以下代码 : ## 导入R包 library("ggplot2") ## 导入数据 data <- read.table("input.txt",header = T,sep="...这样我们就完成气泡图<em>的</em>上色过程啦! 如果想要更改其他颜色,可以在scale_color_gradient 函数<em>中</em>修改。 参考资料: <em>ggplot2</em>|详解八大基本绘图要素

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ggcor |相关系数矩阵可视化

mapping对应ggplot()mapping参数,当空(默认)时,根据cor_tbl变量情况添加,基础形式是aes(x = x, y = y, r = r, fill = r)。...*均是fill颜色映射函数相关参数。 若fill.scale.addFALSE不添加颜色映射函数。若为TRUE(默认),则会在初始化自动添加颜色映射函数。...从这个规律我们不难算出默认xlim、ylim取值范围。注意,对cor_tbl数据框,或者说是ggcor包函数操作数据,均不会改变每个数据单元格在图中坐标位置。...该参数主要意义是处理图形覆盖问题,当在每个单元格画半径0.5方块、圆等图标时,会相互覆盖掉背景网格线,影响视觉效果。该参数默认值是0.48。...很多情况下,连续性颜色棒并不是很好分区每个单元格对应数值区间,这时根据相关系数大小对颜色进行分组可能更适合。

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【发布】Excel新版图表插件-EasyShu正式发售

、相关系数矩阵图。...图表辅助功能 图表辅助功能主要包括图表主题模块辅助功能模块,可以帮助用户更好地调整图表元素格式、数据形式等。...; 【图表导出】可以将图表导出成不同分辨率且不同格式图片,包括jpg、tiff、png、bmp等不同图片格式; 【取色器】可以供用户拾取电脑屏幕内任意处颜色数值,并可以以该颜色填充图表图形区域或者设定文本...;同时也提供了“颜色模板”不同颜色主题方案颜色供用户直接使用; 【数据标签】可以帮助用户添加数据系列标签,并设定其数值单位与格式,同时也可以设定饼图与圆环图数据标签排布格式,包括按标签位置切线与射线排布两种方式...其平均用户年费1889元。很多人或许会有疑问,这个价格比Microsoft Excel本身年费还高。但是事实就是如此。

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【好文重发】Excel新版图表插件-EasyShu安装与学习

、相关系数矩阵图。...图表辅助功能 图表辅助功能主要包括图表主题模块辅助功能模块,可以帮助用户更好地调整图表元素格式、数据形式等。...; 【图表导出】可以将图表导出成不同分辨率且不同格式图片,包括jpg、tiff、png、bmp等不同图片格式; 【取色器】可以供用户拾取电脑屏幕内任意处颜色数值,并可以以该颜色填充图表图形区域或者设定文本...;同时也提供了“颜色模板”不同颜色主题方案颜色供用户直接使用; 【数据标签】可以帮助用户添加数据系列标签,并设定其数值单位与格式,同时也可以设定饼图与圆环图数据标签排布格式,包括按标签位置切线与射线排布两种方式...其平均用户年费1889元。很多人或许会有疑问,这个价格比Microsoft Excel本身年费还高。但是事实就是如此。

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优化Jupyter Notebook:提示,技巧,nbextension,Productivity tips

快捷键 按Ctrl+Shift+p单击菜单栏小键盘图标以获取命令调色板列表 命令编辑模式快捷方式: Shift + Enter 运行当前单元格,在下面选择 Ctrl + Enter 运行选定单元格...通过点击确保处于命令模式Esc: 使用UpDown键向上向下滚动单元格。 按AB在活动单元格上方下方插入新单元格。 M 将活动单元格转换为Markdown单元格。...计算完成(失败)后播放声音 将通知与您操作系统集成(GNOME shell做好准备) 跳转到变量,函数定义 rpy2启用自动完成(非常适合ggplot2) 在一个漂亮表格视图中汇总字典...(单元格链)执行时间超过几秒,可以将Jupyter配置播放声音。...但是%%R到目前为止,单元格自动完成不包括R对象(如果已加载,也不包括ggplot函数)。

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R包reshape2 |轻松实现长、宽数据表格转换

蓝色阴影表示我们想要表示各个行ID变量,红色表示想要转换成列名变量名,灰色表示要在单元格填充数据。...,会返回一条提示信息: ## Aggregation function missing: defaulting to length 查看输出数据时发现,每个单元格填充数据每个记录天数,并非每个测量指标值...12个ggplot2扩展包帮你实现更强大可视化 编程模板-R语言脚本写作:最简单统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格矢量图输出 R语言统计入门课程推荐——生物科学数据分析Data...recharts 交互式可视化CanvasXpress 聚类分析factoextra LDA分析、作图及添加置信-ggord 解决散点图样品标签重叠ggrepel 添加P值显著性标记ggpubr Alpha...factoextra LDA分析、作图及添加置信-ggord 解决散点图样品标签重叠ggrepel 添加P值显著性标记ggpubr Alpha多样性稀释曲线rarefraction curve 堆叠柱状图各成分连线画法

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【重发】Excel新版图表插件-EasyShu正式发售

EasyShu,是使用C#语言编写一款Microsoft Excel图表专业插件,是原Excel图表插件EasyCharts1.0升级版,由微信公众号【Excel催化剂】【EasyShu】历时365...、相关系数矩阵图。...图表辅助功能 图表辅助功能主要包括图表主题模块辅助功能模块,可以帮助用户更好地调整图表元素格式、数据形式等。...; 【图表导出】可以将图表导出成不同分辨率且不同格式图片,包括jpg、tiff、png、bmp等不同图片格式; 【取色器】可以供用户拾取电脑屏幕内任意处颜色数值,并可以以该颜色填充图表图形区域或者设定文本...;同时也提供了“颜色模板”不同颜色主题方案颜色供用户直接使用; 【数据标签】可以帮助用户添加数据系列标签,并设定其数值单位与格式,同时也可以设定饼图与圆环图数据标签排布格式,包括按标签位置切线与射线排布两种方式

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提高效率 |ArcGIS Pro 中所有快捷键一网打尽

注: 这是 ArcGIS Pro 可用键盘快捷键完整列表,并且在每个软件版本中都会更新。...在 2D ,向前平移一个屏幕宽度。在 3D ,照相机在保持照相机角度高度不变同时会向前移动一个屏幕宽度。 向下翻页键 向下移动一个屏幕大小。 在 2D ,向下平移一个屏幕宽度。...验证运行 用于验证运行键盘快捷键 键盘快捷键 操作 Ctrl+Shift+V 验证模型所有数据元素参数值。 Ctrl+Shift+R 运行。...Ctrl+D 选定模型元素选中添加到显示。 Ctrl+Shift+D 选定模型元素取消选中添加到显示。 Ctrl+I 选定模型元素选中中间数据。...Ctrl+V 将剪贴板内容粘贴到单元格单元格区域中。 F2 编辑单元格内容。 Enter 提交当前编辑。 Esc 取消单元格编辑并恢复原始值。

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R」自己动手进行R基础绘图

相关阅读: 「R」传统图形绘制 「RR 基本图形绘制 「Rggplot2数据可视化 解构一个图 在学习R之后,用户可以很快开始通过调用plot()、hist()barplot()生成各种图形...rect() # 绘制矩形 polygon() # 绘制复杂多边形 text() # 在图形添加文本 mtext() # 在图边缘添加文本...基本绘图函数几乎所有参数都是向量化。例如,在绘制矩形时,用户不必在一个循环内逐个添加每个矩形每个点。相反,他她可以用一个函数调用绘制所有相关对象,同时每个对象指定不同位置参数。...我们使用了一个特殊函数matlines(),该函数矩阵每一列绘制一行。...在上面的代码,第5行第6行完成了这项工作。之后绘图几乎与前面的示例相同。在图例上还有一个额外技巧,我们使用“inset”将它推到另一边。 使用来自“mtcars”数据集变量相关矩阵图

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(附练习数据)绘图技巧 | 矩形树状图绘图技巧分享

绘制树形图使用R或者Python都是可以绘制,今天我们还是使用R进行绘制(Python绘制结果交互式,后面统一介绍相应库)。在R中有专门包-treemapify包进行绘制。...今天内容主要如下: 树形矩阵图(Treemap)简介 树形矩阵图(Treemap)R实例演示 树形矩阵图(Treemap)简介 在数据可视化分析,在面对大量分层结构(树状结构) 数据时,要想准确使用图表去展示时...树形矩阵图(Treemap)R实例演示 R-treemapify包可以很好绘制树形矩阵图(Treemap),其官网:https://wilkox.org/treemapify/index.html,...geom_treemap() geom_treemap_text() geom_treemap_subgroup_border() geom_treemap_subgroup_text() 等绘图函数进行树形矩阵图元素添加...下面我们通过一个实例演示R-treemapify包是如何绘制树形矩阵图

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同时展现两种数据正确姿势 -- 双坐标轴来了(R语言)

y轴,每个y轴都有自己刻度范围,数据波动就更加一目了然啦!...R语言plotrix包,可以帮助我们实现双坐标轴图形绘制。...以7名患者DNA测序质控信息例,绘制靶向捕获测序深度重复率关系: #load plotrix library(plotrix) #Data preparation ID=1:7 PID=paste...data:待绘制双轴图形数据框 main:设置图形标题 xlim:限制横坐标值范围 lylim,rylim:限制左、右纵坐标值范围 mar:设置图形边界距,默认值(5,4,4,4) lcol,rcol...xticklab:设置横坐标轴刻度标签 halfwidth:设置用户给定条形图宽度一半 axislab.cex:设置坐标轴标签刻度标签大小 do.first:通过该参数可以往图形添加背景色网格

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