这是《高效R语言编程》的学习笔记,前面的笔记在这里: 高效R编程 《高效R语言编程》笔记 这是《高效R语言编程》的学习笔记,前面的笔记在这里: 我们将实践、习惯、提升生产力的系统环境定义为工作流。...本人觉得是先实现呢 创建包 用户接口和用户文档,代码风格和审查,鲁棒性的测试也很重要 报告和发布 需要多少代码才能得到结论和会创建多少输出 应用 Shiny App或者嵌入到大型服务器中的的代码,健壮性和恰当地处理错误...通过R可视化项目计划 项目进度绘图包: plan(进度图、甘特图) plotrix(甘特图) install.packages("plotrix") library(plotrix) example(gantt.chart...包的选择 低效、缺乏技术支持或过时的包会浪费不少时间,CRAN上有大量不好的包,易出错。使用R包可以避免重复造轮子,提高效率。...可以用这个网址查看https://cranlogs.r-pkg.org/badges/last-month/ggplot2 ? 发布 文档化你的工作:动态报告与R包。
我们来演示一下使用plotrix、dplyr和ggsci等库来生成一个3D饼图,plotrix提供了pie3D函数,dplyr用于数据处理,ggsci提供了调色板pal_jama。...df$color, # 向量,表示每个扇形的填充颜色 labelcol = "black", # 字符串,表示标签文本的颜色 labelcex = 1.2,...# 数值,表示标签文本的字符大小倍数 explode = 0.1, # 数值,表示每个扇形的偏移量,模拟3D效果 shade = 0.75 # 数值,...尽量使用简单的2D图表。 添加标签或数据表格: 在图表上添加数值标签或提供数据表格,以便更清晰地呈现数据。 使用更直观的颜色: 考虑使用更易于区分的颜色,避免引起混淆。...考虑使用其他图表类型: 根据数据的特点,考虑使用更适合的图表类型,如堆积条形图或直方图等。
那么,什么样的图形才最适合自己的数据呢?一个有效的图形应具备以下特点: 能正确传递信息,而不会产生歧义; 样式简单,但是易于理解; 添加的图形美学应辅助理解信息; 图形上不应出现冗余无用的信息。...加载数据集 使用 ggplot2 包中自带数据集作为示例数据集。...library(ggplot2) library(plotrix) data("midwest", package = "ggplot2") #加载数据集 midwest 数据集 全局主题设置 全局配色...clustering # plot ggdendrogram(hc, rotate = TRUE, size = 2) 谱系图 7.2 聚类图 可以使用 geom_surround() 来显示不同的簇或组...如果数据集有多个特征,还可以计算主成分,并使用 PC1 和 PC2 作为 X 和 Y 轴绘制散点图。geom_encircle() 可用于框选所需的组。
R语言自带的cor函数得到,但是R并没有对矩阵提供可视化方法。...今天小编就将给大家分享一个精美的R语言绘制相关系数矩阵的软件包:ggcorr。ggcorr函数主要用于绘制相关矩阵图,它的主要依赖包是ggplot2。...它使用ggplot2包中的“grammar of graphics”来实现可视化,其结果在图形上接近corrplot函数的结果。...)##依赖包为ggplot2 ggcorr的使用 01 函数介绍 ggcorr( data,##包含连续数据的数据框或矩阵 method = c("pairwise", "pearson")...max_size = 6,##当geom设置为“圆”时,圆的最大尺寸。 label = FALSE,##是否向绘图中添加相关系数。
, ] # 选择一年数据 # X轴文本的标签和 break 值 brks <- economics_y$date[seq(1, length(economics_y$date), 12)] lbls...这意味着,所有列的列名和各自的值被存放在两个变量中(分别是 variable 和 value)。...data(economics_long, package = "ggplot2") head(economics_long) 在下面的代码中,在 geom_line() 函数中设置绘图对象为 value...这样,只要调用一次 geom_line,就会绘制多条彩色线,每条线代表 variable 列中的每个唯一 value 。...此外,关于坡度图的绘制,也有些大佬已经集成 R 包了,例如:CGPfunctions[6] 包中的 newggslopegraph() 、slopegraph [7] 包中的 ggslopegraph(
由于该单元格是3D空间的固定分区,因此其中心位置是静态的,不需要更新哈希表中的现有条目(哈希表 虽然正在动态增长)。新插入的立方体根据中心坐标也被添加到八叉树地图中。...2D直方图描述了关键帧中特征方向的Eulerangles的分布。 cell中特征的类型和方向 每个关键帧由一百次扫描的结果组成,对于每个cell,我们利用每个特征点和相关的特征的方向来确定他的形状。...,H_P为0,同时计算旋转矩 对于关键帧中的每个cell 如果cell是线特征 把特征×旋转矩阵 计算旋转后特征的pitch和yaw ?...利用旋转不变的cell特征的方向我们计算2D直方图: 选择X的分量为正的,计算特征分量的pitch和yaw 利用60*60的矩阵表示2D的直方图(每个pitch和yaw都有3度的分辨率) 利用pitch...和yaw确定这个cell在矩中的位置 对每个2D直方图进行高斯滤波以提升鲁棒性 快速闭环检测 通过计算新帧的2D直方图和其他所有帧的相似度来检测闭环,这个关键帧和地图匹配然后地图利用位姿图优化的方进行更新
今天,小编教大家用R语言绘制常用的多维数据展示图——气泡矩阵图。 首先,我们需要准备输入文件。 ?...如上图所示,准备四列数据,分别为X轴、Y轴、数值(控制气泡大小)和分类(控制气泡颜色,可为字符或数字),以"Tab"为分隔符。...准备好输入文件后,我们就可以打开R画图啦~ ## 导入R包 library("ggplot2") ## 导入数据 data <- read.table("input.txt",header = T,sep...执行完命令后,气泡图就画好啦~气泡颜色反映我们输入数据的不同类型,气泡大小反映我们输入数值的高低。...简单几步,气泡矩阵图就画好啦~大家赶快试试吧! 具体细节大家可以搜索ggplot2的相关参数,根据自己的需求调整或者将图片导出为PDF格式,通过Adobe illustrator调整。
矩表由矩阵(Matrix)控件演化而来,矩阵可将存储的原始Detail 数据,通过【行分组】(即垂直显示字段值)和【列分组】(即水平显示字段值),将数据二维的展示出来,然后计算每一行或列的合计;也可以将字段值作为行号或列标...,在每个行列交汇处计算出各自的数量,然后计算小计和总计。...矩表可以将存储在数据库中的静态二维表(只有列头有含义的表数据),转换成具有汇总和统计的数据透视表,且这些数据均是根据表结构自动生成的,不需要手动添加每行每列。...,同样在纵向展示销售类目时,也不需要手动添加多行类目,只需要指定类目到单元格,矩表会自动生成所有类目行。...实例 - 使用矩表创建【产品销售数据分析表】 在设计器中添加 矩表 将订购月指定到【行分组】单元格中,将【类别名称】指定到列分组单元格中,在最下方单元格中指定合计方法: =Sum(Sum(Fields
EasyCharts插件主要实现的以下功能: 图表风格的自动转换:使用Excel绘制图图表后,选择“背景风格”中的项目“R ggplot2”、“Python Seaborn”、“Matlab 2013”...、“Matlab 2014”、“Excel Simple”等图表风格,自动实现图表背景风格的设定与转换; 颜色主题的自动转换:使用Excel绘制图图表后,选择“颜色主题”中的项目“R ggplot2...Set1”、“R ggplot2 Set2”、“R ggplot2 Set3”、“Tableau 10 Medium”、“Tableau 10”、“Python seaborn hsul”、“Python...、南丁格尔玫瑰图、马赛克图、子弹图等图表,部分图表如图2所示; 数据分析的自动实现:使用“数据分析”可以实现频率直方图、核密度估计图、相关系数矩阵图、Loess数据平滑和Fourier数据平滑等数据的分析与图表的自动绘制...; Excel辅助工具的使用:“辅助工具”包括颜色拾取、数据小偷、色轮参考、图表保存、截图等功能,尤其是“数据小偷”可以通过读入现有的柱形图或曲线图,自动或手动的方法,读取并获得图表的原始数据。
上次小编教大家用R语言绘制气泡矩阵图后,好多朋友都在后台留言问小编怎么给气泡矩阵图上色,今天小编就教大家怎么给气泡矩阵图上个色 ! 不管我们做什么组学分析,分析到最后总是躲不过富集分析。...但有时候我们的富集分析结果是用其他工具做出来的,或者想要更改气泡图显示的内容时,又该怎么样做出和Y叔一样的气泡图呢? 如,我想展示结果中A-D四个GO term的富集倍数、q值和count数。...准备输入文件(分为四列,第一列为GO term的描述,第二列为富集倍数,第三列为q值,第四列为count数,以"Tab"为分隔符): ?...准备好输入文件后,输入以下代码 : ## 导入R包 library("ggplot2") ## 导入数据 data <- read.table("input.txt",header = T,sep="...这样我们就完成气泡图<em>的</em>上色过程啦! 如果想要更改其他颜色,可以在scale_color_gradient 函数<em>中</em>修改。 参考资料: <em>ggplot2</em>|详解八大基本绘图要素
mapping对应ggplot()中的mapping参数,当为空(默认)时,根据cor_tbl中的变量情况添加,基础形式是aes(x = x, y = y, r = r, fill = r)。...*均是fill颜色映射函数相关的参数。 若fill.scale.add为FALSE不添加颜色映射函数。若为TRUE(默认),则会在初始化中自动添加颜色映射函数。...从这个规律我们不难算出默认的xlim、ylim取值范围。注意,对cor_tbl数据框,或者说是ggcor包中函数操作数据,均不会改变每个数据单元格在图中的坐标位置。...该参数的主要意义是处理图形覆盖问题,当在每个单元格画半径为0.5的方块、圆等图标时,会相互覆盖掉背景网格线,影响视觉效果。该参数默认值是0.48。...很多情况下,连续性颜色棒并不是很好分区每个单元格对应的数值区间,这时根据相关系数大小对颜色进行分组可能更适合。
、相关系数矩阵图。...图表辅助功能 图表辅助功能主要包括图表主题模块和辅助功能模块,可以帮助用户更好地调整图表的元素格式、数据形式等。...; 【图表导出】可以将图表导出成不同分辨率且不同格式的图片,包括jpg、tiff、png、bmp等不同图片格式; 【取色器】可以供用户拾取电脑屏幕内任意处的颜色数值,并可以以该颜色填充图表图形区域或者设定文本...;同时也提供了“颜色模板”不同颜色主题方案的颜色供用户直接使用; 【数据标签】可以帮助用户添加数据系列的标签,并设定其数值单位与格式,同时也可以设定饼图与圆环图的数据标签排布格式,包括按标签位置切线与射线排布两种方式...其平均用户年费为1889元。很多人或许会有疑问,这个价格比Microsoft Excel本身的年费还高。但是事实就是如此。
快捷键 按Ctrl+Shift+p或单击菜单栏中的小键盘图标以获取命令调色板列表 命令和编辑模式中的快捷方式: Shift + Enter 运行当前单元格,在下面选择 Ctrl + Enter 运行选定的单元格...通过点击确保处于命令模式Esc: 使用Up和Down键向上和向下滚动单元格。 按A或B在活动单元格的上方或下方插入新单元格。 M 将活动单元格转换为Markdown单元格。...计算完成(或失败)后播放声音 将通知与您的操作系统集成(为GNOME shell做好准备) 跳转到变量,函数或类的定义 为rpy2启用自动完成(非常适合ggplot2) 在一个漂亮的表格视图中汇总字典...(或单元格链)的执行时间超过几秒,可以将Jupyter配置为播放声音。...但是%%R到目前为止,单元格中的自动完成不包括R对象(如果已加载,也不包括ggplot函数)。
蓝色阴影表示我们想要表示的各个行的ID变量,红色表示想要转换成列名的变量名,灰色表示要在单元格中填充的数据。...,会返回一条提示信息: ## Aggregation function missing: defaulting to length 查看输出数据时发现,每个单元格填充的数据为每个月的记录天数,并非每个测量指标值...12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化 编程模板-R语言脚本写作:最简单的统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出 R语言统计入门课程推荐——生物科学中的数据分析Data...recharts 交互式可视化CanvasXpress 聚类分析factoextra LDA分析、作图及添加置信-ggord 解决散点图样品标签重叠ggrepel 添加P值或显著性标记ggpubr Alpha...factoextra LDA分析、作图及添加置信-ggord 解决散点图样品标签重叠ggrepel 添加P值或显著性标记ggpubr Alpha多样性稀释曲线rarefraction curve 堆叠柱状图各成分连线画法
EasyShu,是使用C#语言编写的一款Microsoft Excel图表专业插件,是原Excel图表插件EasyCharts1.0的升级版,由微信公众号【Excel催化剂】和【EasyShu】历时365...、相关系数矩阵图。...图表辅助功能 图表辅助功能主要包括图表主题模块和辅助功能模块,可以帮助用户更好地调整图表的元素格式、数据形式等。...; 【图表导出】可以将图表导出成不同分辨率且不同格式的图片,包括jpg、tiff、png、bmp等不同图片格式; 【取色器】可以供用户拾取电脑屏幕内任意处的颜色数值,并可以以该颜色填充图表图形区域或者设定文本...;同时也提供了“颜色模板”不同颜色主题方案的颜色供用户直接使用; 【数据标签】可以帮助用户添加数据系列的标签,并设定其数值单位与格式,同时也可以设定饼图与圆环图的数据标签排布格式,包括按标签位置切线与射线排布两种方式
注: 这是 ArcGIS Pro 中可用的键盘快捷键的完整列表,并且在每个软件版本中都会更新。...在 2D 中,向前平移一个屏幕宽度。在 3D 中,照相机在保持照相机角度和高度不变的同时会向前移动一个屏幕宽度。 向下翻页键 向下移动一个屏幕大小。 在 2D 中,向下平移一个屏幕宽度。...验证和运行 用于验证和运行的键盘快捷键 键盘快捷键 操作 Ctrl+Shift+V 验证模型中的所有数据元素和参数值。 Ctrl+Shift+R 运行。...Ctrl+D 为选定的模型元素选中添加到显示。 Ctrl+Shift+D 为选定的模型元素取消选中添加到显示。 Ctrl+I 为选定的模型元素选中中间数据。...Ctrl+V 将剪贴板中的内容粘贴到单元格或单元格区域中。 F2 编辑单元格的内容。 Enter 提交当前编辑。 Esc 取消单元格中的编辑并恢复原始值。
相关阅读: 「R」传统图形绘制 「R」R 的基本图形绘制 「R」ggplot2数据可视化 解构一个图 在学习R之后,用户可以很快开始通过调用plot()、hist()或barplot()生成各种图形...rect() # 绘制矩形 polygon() # 绘制复杂多边形 text() # 在图形中添加文本 mtext() # 在图的边缘添加文本...基本绘图函数的几乎所有参数都是向量化的。例如,在绘制矩形时,用户不必在一个循环内逐个添加每个矩形的每个点。相反,他或她可以用一个函数调用绘制所有相关的对象,同时为每个对象指定不同的位置和参数。...我们使用了一个特殊的函数matlines(),该函数为矩阵中的每一列绘制一行。...在上面的代码中,第5行和第6行完成了这项工作。之后的绘图几乎与前面的示例相同。在图例上还有一个额外的技巧,我们使用“inset”将它推到另一边。 使用来自“mtcars”数据集的变量的相关矩阵图。
绘制树形图使用R或者Python都是可以绘制的,今天我们还是使用R进行绘制(Python绘制结果为交互式,后面统一介绍相应的库)。在R中有专门的包-treemapify包进行绘制。...今天内容主要如下: 树形矩阵图(Treemap)简介 树形矩阵图(Treemap)R实例演示 树形矩阵图(Treemap)简介 在数据可视化分析中,在面对大量分层结构(树状结构) 的数据时,要想准确的使用图表去展示时...树形矩阵图(Treemap)R实例演示 R-treemapify包可以很好的绘制树形矩阵图(Treemap),其官网为:https://wilkox.org/treemapify/index.html,...geom_treemap() geom_treemap_text() geom_treemap_subgroup_border() geom_treemap_subgroup_text() 等绘图函数进行树形矩阵图的元素的添加...下面我们通过一个实例演示R-treemapify包是如何绘制树形矩阵图的。
y轴,每个y轴都有自己的刻度范围,数据的波动就更加一目了然啦!...R语言plotrix包,可以帮助我们实现双坐标轴图形的绘制。...以7名患者的DNA测序的质控信息为例,绘制靶向捕获测序深度和重复率的关系: #load plotrix library(plotrix) #Data preparation ID=1:7 PID=paste...data:待绘制双轴图形的数据框 main:设置图形标题 xlim:限制横坐标值的范围 lylim,rylim:限制左、右纵坐标值的范围 mar:设置图形边界距,默认值为(5,4,4,4) lcol,rcol...xticklab:设置横坐标轴刻度标签 halfwidth:设置用户给定条形图宽度的一半 axislab.cex:设置坐标轴标签和刻度标签的大小 do.first:通过该参数可以往图形中添加背景色或网格
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