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不同GSE数据不同临床信息,不同分组技巧

最近,我发现学徒在学习GEO数据挖掘过程中,遇到了第一个也是至关重要一个难题就是对下载后数据进行合适分组,因为只有对样本进行合适分组,才有可能得到我们想要信息。...但是不同GSE数据不同临床信息,那么我们应该挑选合适临床信息来进行分组呢?...GSE子集GSE53757 下载数据、提取表达矩阵与临床信息方法与前面一直,这里就不赘述,也是从有差异地方开始。...通过table函数,我们看到总共144个样本,其中有72个正常与72个肿瘤样本;第三期肿瘤和正常样本总各有14个,下面我们就需要提取我们需要数据 patient_t = pd[pd$`tissue:ch1...,在不同情况下选取最合适当下方法,方便自己去做后续数据分析。

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matplotlib设置不同主题

所谓主题,其实就是一套样式规则,对背景色,坐标轴,标题等图形基本元素样式进行设定。R语言ggplot2中,通过theme来指定图片主题,既可以采用系统自带主题,也可以自定义其中各个元素。...不指定style情况下,默认输出结果如下 ? 可以看到,简单修改主题,就可以得到外观不一样图片。那么主题到底设定了哪些元素样式呢?...本质上,style就是对matplotlibrc配置文件中部分属性进行了预先定义,而rcParams作用也是对该配置文件中属性进行定义,而且优先级是最高,所以可以覆盖style中已经定义好值。...当我们自定义属性过多且经常使用时,可以订制一个自己style, 其实内置style也是以文件形式保存在安装目录下,截图如下 ?...本公众号深耕耘生信领域多年,具有丰富数据分析经验,致力于提供真正有价值数据分析服务,擅长个性化分析,欢迎有需要老师和同学前来咨询。

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MySQL不同字符所占用不同字节大小

不同字符数据库不代表其所有字段字符都是库所使用字符,每个字段可以拥有自己独立字符!库字符是约束字段字符!...不同字符数据库不代表其所有字段字符都是库所使用字符,每个字段可以拥有自己独立字符!库字符是约束字段字符!...不同字符数据库不代表其所有字段字符都是库所使用字符,每个字段可以拥有自己独立字符!库字符是约束字段字符!...FROM testChatSet; 输出: utf8字段 utf16字段 utf8字符长度 utf16字符长度 字符类型 字符类型 utf8字节长度 utf16字节长度 你 你 1 1 utf8mb4...如果发现本文资料不全,可访问本人Java博客搜索:标题关键字。以获取全部资料 ❤

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Recoverit不同数据丢失情况分别制定了不同数据恢复方式

经常使用电脑的人有时候可能会误删文件,特别是一些重要文件如果误删了特别麻烦,甚至可能造成不可估量损失。...但误删文件也是一项难以避免事情,遇到这种情况最好办法就是进行数据恢复,市面上有不少数据恢复软件,今天就推荐一款国产数据恢复软件。 ?...这就是万兴开发Recoverit,万兴最出名软件要数万兴神剪手了,不过这款软件也还不错,目前不支持简体中文,你看到简体中文界面其实是汉化而来。 ?...Recoverit不同数据丢失情况分别制定了不同数据恢复方式,能基本满足你数据恢复要求,你有需要恢复数据吗?快去试试吧!...注意事项 你需要尽量减少对需要数据恢复磁盘上读写操作,千万不要对该硬盘进行碎片整理或者执行任何磁盘检查工具,并尽快进行数据恢复操作。

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GEE中核函数在不同缩放级别区别

内核都采用单位参数,可以是像素或米,文档指出: 内核测量系统(“像素”或“米”)。如果内核以米单位指定,则当缩放级别更改时它将调整大小。...我认为这是不正确,如果内核以像素单位指定,它会随着金字塔级别的变化而改变缩放级别吗?您可以在上面的代码中比较圆内核 (m) 与圆内核 (px) 来确认此行为。...我尝试通过在像素单元内核上使用手动重投影来测试这一点,但是它运行速度比米版本慢得多,所以我认为这不是它完成方式,并且它得到了完全不同视觉结果。...我要求主要原因是计算效率,指定以米单位比例是否比以像素单位成本更高? 3....解决方案 半径“3 像素”内核在任何投影/比例中始终 7x7“像素”,这将导致每个比例米数不同

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不同batch_size对训练和验证影响

1 问题 我们知道,不同batch_size对我们训练和验证得出结果精度和loss都会产生影响,是设置batch_size越大我们得到精度越好,loss越好。...2 方法 我们使用是python可视化技术进行问题探究,我们需要在图像中看到当batch_size由小到大过程中对训练精度和loss以及验证精度和loss值变化曲线。...利用python画出batch_size对训练精度影响,我们可以在下图中看见并不是batch_size越大,我们训练精度就越好,在我给出这几个batch_size中8才是最好。...下图就是不同batch_size对训练loss变化 下图是不同batch_size对验证精度变化 下图是不同batch_size对验证loss变化 其中画图工具就是用python...3 结语 在本次博客中,我们通过实验证明了我们设置batch_size并不是越大越好,也不是越小越好,做这样验证,而是其中有一些值会趋近很好,这样我们就需要通过大量实验来证明,在实验过程中,我们使用程序就需要执行很久

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Echarts请求不同格式json数据处理

步骤说明: 1:x轴和y轴分别定义一个数组:类别数组(实际用来盛放X轴,y轴坐标值) var names = []; //类别数组(实际用来盛放X轴坐标值) var series = [...]; 2:在ajax请求成功之后,在success方法里面对请求json数据进行处理,首先要遍历一下data数据(请求成功时执行该函数内容,data即为服务器返回json对象),对数据进行遍历并且挨个取出类别并填入上一步已经定义好类别数组里面...'line', data: series }] 这种json数据处理方式和以下写法是相类似的:Echarts饼状图交互数据:https://www.jianshu.com/p/7124385eebbd...-- ECharts准备一个具备大小(宽高)Dom --> <div id="main" class="col-md-12 col-sm-12 col-xs-12" style="...success: function(data) { //请求成功时执行该函数内容,data即为服务器返回<em>的</em><em>json</em>

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【RecyclerView】 九、 RecyclerView 设置不同布局样式

文章目录 一、 RecyclerView 设置不同布局样式 二、完整代码 三、RecyclerView 相关资料 一、 RecyclerView 设置不同布局样式 ---- RecyclerView...设置不同布局样式流程 : ① 自定义 RecyclerView.Adapter 泛型类型 : 适配器泛型类型需要设置 RecyclerView.ViewHolder , 这是所有 ViewHolder...( ) 方法 : 这里不同位置组件设置不同布局类型 ; @Override public int getItemViewType(int position) {...} ③ 根据布局类型加载不同布局文件 : 在 onCreateViewHolder( ) 方法中 , 根据当前 int viewType 参数 , 加载不同布局文件 ; @Override...RecyclerView.ViewHolder onCreateViewHolder(@NonNull ViewGroup parent, int viewType) { // 根据不同组件类型加载不同类型布局文件

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RR与RC隔离级别下MySQL不同加锁解锁方式

|  RC与RR隔离级别下MySQL不同加锁解锁方式 ---- MySQL5.7.21 数据准备 root@localhost : pxs 05:26:27> show create table dots...如果设置1,会禁用gap锁,但对于外冲突检测(foreign-key constraint checking)或者重复检测(duplicate-key checking)还是会用到gap锁。  ...启用innodb_locks_unsafe_for_binlog产生影响等同于将隔离级别设置RC,不同之处是: 1)innodb_locks_unsafe_for_binlog是全局参数,影响所有session...2)innodb_locks_unsafe_for_binlog只能在数据库启动时候设置;但隔离级别可以随时更改。   ...因为前面所讲启用innodb_locks_unsafe_for_binlog会产生作用1与作用2,所以整个加锁与解锁情况与RC隔离级别类似。

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vissE--提供不同基因富集分析方法!

vissE 另一个功能是基于基因之间相似性网络执行一种新型基因富集分析。...生物学家会利用这些结果,提取与他们感兴趣实验有关相关功能。vissE包提供了自动化提取结果功能。 下面的示例可用于任何富集分析结果。...library(igraph) #鉴定clusters grps = cluster_walktrap(gs_ovnet) #提取聚类结果 grps = groups(grps) #按cluster大小排序...(msigdb_hs, grps[1:6], type = 'Short') 05 可视化基因cluster基因水平统计数据 可视化每个基因cluster基因水平统计数据,以更好地了解对基因有贡献基因...对于 vissE 识别的每个基因集群,通过文本挖掘来表征生物功能和过程。我们提供了不同基因功能富集分析思路,大家可以多多动手尝试!

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【ApiPost个人使用经验】Apipost不同脚本区别

utm_source=10006 在使用国产接口测试和接口文档生成工具Apipost时候,在使用预/后执行脚本时候,会发现有接口预/后执行脚本、全局脚本和目录脚本。...apipost接口中预/后执行脚本主要针对是此接口进行脚本使用。例如:在接口预执行脚本中发送一个请求获取一个请求值。这个值是token,然后本接口需要使用这个返回token....在预执行脚本中发送请求,然后在使用环境变量或许请求返回token值 然后我们在引用token 这是单接口需要引用token值怎么使用脚本方法, 多接口或一整个目录接口需要使用一个变量时候,我们可以直接在目录中脚本进行编写和使用获取变量...目录中编辑脚本,发送一个请求别获取响应中token值 token值获取到之后,我们在目录中body中调用token 只要在这个目录下接口都会在发送时候,携带token这个参数 全局脚本和全局参数也是一样设置...,但是全局脚本和全局参数是针对于整个项目的,只要在全局脚本和全局参数中进行了设置,整个项目的接口都会进行调用携带 这就是apipost,接口脚本、目录脚本和全局脚本区别 Apipost官方链接:https

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不同数据不同Scaling law?而你可用一个压缩算法来预测它

那么,神经 Scaling law 对训练用 token 序列数据哪些性质敏感呢?换句话说,如果我们想要准确预测如何以最佳方式训练过程分配计算量,我们该观测数据哪些属性?...实验中,通过调整 PCFG 句法性质,他生成了 6 个具有不同复杂度数据。...对于每个数据,他又训练了 6 个不同大小语言模型(参数量从 4.4M 到 1.4B),并记录了这些语言模型在 6 种不同训练步数(100K 到 100M token)下结果。...然后,他每个数据都拟合了一个 Scaling law,发现 Scaling law 参数会随句法复杂度而有意义地变化。...为了确定数据 Scaling law,该研究者在不同大小数据子集(100K、1M、5M、20M、50M、100M token)上训练了几个不同大小(参数量 4.2M、8.8M、20.3M、59.0M

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Android解析相同接口返回不同格式json数据方法

背景原因 目前由双牛掌柜为主导框架开发一系列产品中,网络请求框架请求到数据是默认解析成Model类。即项目中不会手动去解析网络请求到json数据。...根据上面两种不同格式,清楚发现这是两种不同格式,一个是字符串,一个是键值对对象。这种情况在双牛掌柜网络请求框架中目前是不存在解析方式。所以要给出一种简便可复用解决方案。...双牛掌柜支付过程.png 在项目实际使用过程中,只需复写网络请求获取信息,和回调支付这两个地方,因为不同支付位置会使用不同支付接口,接口会变。其他地方不会发生变化。...解决方案一 接口返回不同数据这个问题很早就出现了,当时由于项目紧张,采取了一个接口根据返回数据不同,分成了两个接口;在进行逻辑处理时候,手动判断调用对应接口。...1.手动解析json数据,让框架不在解析。 此处操作乍一看挺复杂,但是实际操作过程中并不是很复杂。将接口返回数据泛型替换成ResponseBody就可以获取到未解析数据了。

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