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KEGG数据库不会下载?了解API

相信生物领域的学习者和研究者都或多或少对KEGG数据库有一定的了解,尤其是对研究者,KEGG是十分有力的分析工具。然而需要使用KEGG做大规模比较功能组学研究的人,可能对于KEGG数据库是又爱又恨。...不过,KEGG也并非如此“闭关锁国”,似乎给我们留了一条小小的“缝隙”从而可以深入“虎穴”,这个小小的“缝隙”就是KEGG API。...KEGG API是和KEGG内核数据库进行交互的程序界面,允许用户基于该界面检索KEGG数据库,其主页为(https://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi.html),该界面的运行基于用户电脑的浏览器...下面基于KEGG API我们一步步获取最新的KEGG数据库。...list操作可以列出所有的KO、pathway、genome,但是无法列出所有的genes(KEGG可能在这里故意设置了限制),但是我们可以通过其他方法link到genes,例如先list所有的KO,然后使用

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「微服务架构」我们如何设计配额微服务来防止资源滥用

各公司还开发了服务间通信的速率限制解决方案,例如Doorman (https://github.com/youtube/doorman/blob/master/doc/design.md)、Ambassador...设计配额 配额确保Grab内部服务可以通过限制向它们发出的“过多”API请求来保证它们的服务水平协议(SLA),从而避免级联失败。...通过尽早通过节流拒绝这些调用,可以防止服务耗尽关键资源,如数据库、计算资源等。 配额的两个主要目标是: 帮助客户服务及时地控制过多的API请求。 最小化对客户服务的延迟影响。...它提供一个API来检查客户端上给定API方法的速率限制决策。另外,服务B与配额中间件连接,以拦截API请求。...由于配额数据使用的性质,Redis缓存中存储的大多数数据都是时间敏感的,并使用生存时间(time-to-live, TTL)值存储。

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谷歌解释了最近 YouTube 和 Gmail 宕机的原因

勒索软件的攻击,12月14日,星期一,用户在将近一个小时的时间里无法访问 Gmail, 在宕机期间,用户无法通过 Gmail 移动应用程序发送电子邮件,也无法通过 POP3为桌面客户端接收电子邮件,而 YouTube...“大多数认证服务都经历了类似的控制平面冲击: 所有 Google 云平台和 Google Workspace api 及控制台的错误率都有所提高。”...它还将用户帐户数据存储在一个分布式数据库文件夹中,该文件夹利用 Paxos 协议协调身份验证期间的更新。...「现时有关实施配额限制的宽限期延缓了最终到期的影响,触发自动配额系统,减少用户身份证服务的配额,并引发这次事件。」...尽管设置了安全检查以防止计划外的配额更改,但是它们无法对零报告负载单个服务的场景做出正确的反应。 “结果是,账户数据库的配额减少了,这使得 Paxos 的领导人无法写作,” Google 补充道。”

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使用 Admission Webhook 机制实现多集群资源配额控制

1 要解决的问题 集群分配给多个用户使用时,需要使用配额限制用户的资源使用,包括 CPU 核数、内存大小、GPU 卡数等,以防止资源被某些用户耗尽,造成不公平的资源分配。...API server:集群请求入口,调用 validating admission webhook 以验证请求 API:准入服务接口,使用集群约定的 AdmissionReview 数据结构作为请求和返回...检查发现 apply + usage <= quota 则认为没有超过配额,请求通过,并最终返回给 API server。 以上就是实现资源配额检查的基本流程。...为了解决这个问题,后台服务会定时全局更新每个应用组的 usage 值。...此时 deployment1 的信息恰好尚未存入 etcd,所以全局更新会把 usage 重新更新为旧值,这样会导致 dployment2 也能被通过,从而超过了配额限制

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大规模分布式架构中,怎样设计和选择 API 限流技术?

的分级,比如针对付费用户和免费用户,提供不同的 API QPS 额度; API 市场中的 API 商品,会通过 API 限流来满足商品库存的调用限制。...API 的限流能力 现在我们大致了解API 限流主要解决的问题,我们也对 API 限流需要具备的能力做一些总结和归纳。 我将它分成了三类: 基础限流 a. ...如果出现故障,需要有相应的降级策略 3.关键指标的可观测性 四、分布式限流实践方案 现在我们了解API 限流系统设计在分布式架构中需要关注的主要技术点,接下来我们结合腾讯云 API 网关产品的案例...我们还需要另外一个数据平台,它从服务端采集到服务的负载状态等信息,通过实时分析,计算出服务能够承载的请求上限。之后再将数据更新到配额服务中,最后由配额服务重新复配给客户端,这样就完成了一个周期。...最终是否能分发给客户端这么多配额,是由配额服务上面的一些配置策略决定的。我们甚至还可以基于 AI 算法通过历史数据来预测未来的一些配额可能发生变化,来对配额进行预分配。

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有3亿用户的美版“小红书”Pinterest如何平稳扩展K8s?

写入请求数量的爆发导致 etcd 提前到达其总数据量的限制,并开始拒绝所有的写入请求,平台无法继续管理负载。...为确保其稳定性,单个命名空间的资源使用量都应有一定限制,这一点很重要。 这项任务的难点之一在于,在每一个命名空间强制执行资源配额需要一个潜在条件:所有的 Pod 和容器都需规定资源的请求和限制。...在 Kubernetes 的 API 请求处理链中,每个请求在最开始都需要通过一连串的过滤器。最大机上 API 调用的限制则是在过滤器链中实现的。...Kubernetes API 调用类型分类  可调试性 为了能更好地了解 Kubernetes 控制面板的性能和资源消耗,我们还用 boltdb 库和 flamegraph 搭建了一个 etcd 数据存储分析工具...我们希望能够探索出一种主动的容量规划方案,根据历史数据、增长轨迹,以及涵盖资源配额API 配额的复杂的容量模型进行预测。这种更主动,也更准确的容量规划可以有效防止平台的过度承诺和交付不足。

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CDP中Kafka配置

配额 了解配额以及如何设置配额。 Kafka可以对生产和获取请求时强制执行配额。生产者和消费者可以使用大量数据。这会垄断代理资源,导致网络饱和,并且通常会拒绝向其他客户端和代理本身提供服务。...配额可以防止这些问题,并且对于大型的多租户集群非常重要,在该集群中,使用少量数据的少量客户端可能会降低用户体验。 配额是按客户端ID定义的字节速率阈值。客户端ID在逻辑上标识发出请求的应用程序。...该配额作为单个实体应用于所有实例。例如,如果客户端ID的生产配额为10 MB / s,则该配额在具有相同ID的所有实例之间共享。 当将Kafka作为服务运行时,配额可以强制执行API限制。...在每个节点上冗余存储数据意味着必须倍增存储空间需求,因为数据也在节点之间复制。 改进的性能:与HDFS一样,RAID-10配置中最慢的磁盘也限制了整体吞吐量。写入需要通过RAID控制器。...设置Kafka的用户限制 了解有关Kafka用户的限制以及如何监控它们。 Kafka可以同时打开许多文件。对于大多数类Unix系统,最大打开文件数的默认设置1024是不够的。

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知名图片分享平台 Pinterest 如何有把握地扩展 Kubernetes

爆发性的写入操作使 etcd 达到其总数据量大小限制并开始拒绝所有的写入请求,于是平台在工作负载管理方面丢失了可用性。...强制在每个命名空间中执行资源配额面临的一个挑战是所有 Pod 都需要显式地指定资源请求与限制 [4]。...同时我们创建了一个定时任务去监控配额使用情况并在项目使用达到一定限制时向该项目团队发送警报。该措施鼓励项目所有者更好地进行能力规划,并提出资源配额变更需求。资源配额变更会在人工审查通过后自动完成。...可调试性 为了更好地了解 Kubernetes 控制平面的性能和资源消耗情况,我们还利用了 boltdb[13] 库和 flamegraph [14] 构建了 etcd 数据存储分析工具,以可视化数据存储故障...我们需要探索一种更具前瞻性的容量规划方式,基于历史数据,增长轨迹和复杂的容量模型进行预测,不仅可以涵盖资源配额,还可以涵盖 API 配额

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开源KMS之vault part1

与 Vault 的每一次交互,无论是将机密放入键/值存储中还是为 MySQL 数据库生成新的数据库用户名密码,都需要调用 Vault 的 API。...Vault 提供了资源配额功能,允许 Vault 操作员指定对 Vault 中使用的资源的限制。具体来说,Vault 允许维护者创建和配置 API 速率限制。...Vault 允许操作员创建速率限制配额,使用令牌桶算法强制执行 API 速率限制。创建配额时可以指定路径,可以在根级别、命名空间级别或挂载点上定义速率限制配额。...速率限制器基于每个 Vault 节点应用于每个唯一的客户端 IP 地址(速率限制配额的消耗信息不会再集群内复制)。客户端可以在任意 1 秒内发起 rate 次请求,每秒都是如此。...在根级别(也就是 path 为空)定义的速率限制配额会被所有命名空间和挂载点继承。它将充当整个 Vault API 的单一速率限制器。

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Typecho博客必备插件:Lopwon IP,帮你显示评论者的IP地址归属地

不过需要注意的是,这些地图都有配额限制,如果你的网站访问量很大,可能会超过配额限制,导致 IP 地址被替换为错误码。...为了解决这个问题,Lopwon IP 新版新增了自定义 API 接口项,可以让你自由地定制自己的 API 接口,从而解决配额限制的局限。...创建完成后,会生成一个 API 秘钥(AK),将该秘钥填入插件设置中的"百度地图 API 秘钥 AK"字段。...四、自定义接口 插件默认自带有一条网络上找到的免费 API 接口链接,如果获取数据不稳定,请自行网络搜索其他可用的接口链接替换。...如果其中一个配额达到上限,可以在插件中切换到另一个服务。如果能找到其他免费的 IP 定位 API 接口,更可以使用四个服务进行切换。

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数据埋点好帮手,这个Beacon API ,建议每位前端开发者了解

在页面卸载或关闭时,可以使用Beacon API将这些性能数据发送到服务器进行分析和监测,以便了解页面的加载和性能情况。...异常日志记录:当页面发生异常或错误时,开发人员可以使用Beacon API将相关错误信息发送到服务器进行记录和分析。这有助于开发人员了解页面中可能存在的问题,并及时采取措施进行修复。...通过将这些行为数据发送到服务器,可以对用户行为进行分析,了解用户的偏好和行为模式,从而优化用户体验和改进产品设计。 数据收集:在某些场景下,开发人员需要收集用户数据或特定事件的数据。...此外,Beacon API还具有一些附加功能,例如指定请求的Content-Type、设置请求的Credentials、指定请求的优先级等。您可以根据具体需求查阅官方文档来了解更多详细的用法和选项。...Beacon API的缺点 虽然Beacon API具有多项优势,但也有一些限制和注意事项: a) 有限的数据负载:Beacon API对可发送的数据负载有大小限制,通常限制在几千字节,超过大小的数据可能会被截断或丢弃

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分析Youtube数据的文本分类技术

对于这个问题,需要一些关于属于不同类别的视频的元数据。欢迎手动收集数据并构建数据集。将使用Youtube API v3。它是由Google自己创建的,通过一段专门编写的代码与Youtube进行交互。...注意:Youtube API与Google提供的任何其他API一样,适用于配额系统。根据您的计划,每封电子邮件每天/每月都会提供一套配额。...API的文档非常简单,在使用8个以上的电子邮件帐户来补偿所需的配额后,收集了以下数据并将其存储在.csv文件中。如果希望将此数据集用于自己的项目,可以在此处下载。...API api_key = "AIzaSyAS9eTgOEnOJ2GlJbbqm_0bR1onuRQjTHE" youtube_api = build('youtube','v3', developerKey...但发现在从Youtube搜索结果中抓取数据的情况下,它只返回一个搜索查询的25个结果。 数据清理和预处理 数据预处理过程的第一步是处理丢失的数据

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在 Android 12 中使用 WorkManager

Android 12 (API 级别为 31) 引入了 前台服务启动限制。...除少部分 特殊场景 外,如果您的应用的 targetSdkVersion 是 Android 12 或者更高 API 级别的话,应用在后台运行时将不能再启动前台服务。...加急任务受基于 应用待机群组 (App Standby Buckets) 的配额限制,当您的应用尝试在超出配额的情况下执行加急任务时,WorkManager 会根据 OutOfQuotaPolicy 参数做出相应的行为...加急任务很重要,但并不意味着它可以一直执行,您需要将配额视为执行加急任务的时间限制。 WorkManager 2.7 是向后兼容的,可以在 Android 12 之前的系统上运行。...想了解 WorkManager 中 setExpedited() API 的 实战,请参阅官方 示例 和 文档。

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性能百万s:腾讯轻量级全局流控方案详解

流控分类 升级流控之前,先简单了解不同流控方式的优缺点: ? 对比可知,全局流控能能弥补单机流控的缺点,而动态流控又是在全局流控的基础上做更精细化的流控。...方案涉及几个功能简单、清晰的角色: 1、管理定时器: 根据配置,将频率限制任务的配额值,写入多个带时间信息的key。...3、流控API: 业务通过流控api,请求先扣减本地配额(原子操作),如果配额<=0,就从ckv拉取配额到共享内存中,如果没配额拉取,就做说明流控生效。...流控方案升级 流控升级下一步是从全局流控升级到动态流控,所需健康度数据已经上报,而接入的方式目前可以直接在管理定时器上面增加配额调整的能力,这个扩展很方便。...重点应该是怎么去根据上报的健康数据分析并实现动调整当前配额值。 配额调整大致的思路如下: ?

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深入了解数据校验(Bean Validation):ValidatorFactory和Validator等核心API【享学Java】

本文将继续讲解它的余下执行过程~ 在这里先说一句,因为Bean Validation涉及到的API关键类实在是太多了(感叹:hibernate validation实现这一套复杂度非常之高),为此我专门写了一个关键类打点篇...,若不熟悉关键组件的,本人强烈建议先花几分钟去浏览一下:深入了解数据校验(Bean Validation):基础类打点(ValidationProvider、ConstraintDescriptor、ConstraintValidator...章节此处不会放过~ Validator:验证器 官方的解释简单明了:校验Bean实例~ ,介绍得非常简单但却又是这么回事有木有 到此处,就正式和Bean的校验开始打交道了,也是我们最直接能出效果的一个API...和上文不一样的是,这两个API应该是我们使用者最应该关注的,所以他们提供的接口方法,希望小伙伴可以稍微留点心,记点忆。...上面也说了,hibernate validation它对数据校验的实现非常非常的复杂,毕竟它提供的能力也是非常强大的(当然弱弱说一句:作者打代码能力也是有待讨论的)。

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添加 K8S CPU limit 会降低服务性能?

因为当你在容器编排器中设置硬 CPU 限制时,内核使用完全公平调度程序 (CFS) Cgroup来强制执行这些限制。CFS Cgroup 机制使用两个设置来管理 CPU 分配:配额和周期。...当应用程序在给定时间段内使用超过其分配的 CPU 配额时,它会受到限制,直到下一个时间段。...配额和期间设置位于cpu.cfs_quota_us和中cpu.cfs_period_us。 您还可以查看限制指标 cpu.stat。...本质上来说,这个问题是 linux 内核导致,具体可以看下这个视频:https://www.youtube.com/watch?v=UE7QX98-kO0 这个视频大概意思是这样的。...这就是为什么我们注意到在更高核心数的机器上运行同一应用程序时会增加限制。 总结来说,时钟偏差限制问题,这导致每个时期的配额都受到严格限制

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性能百万s:腾讯轻量级全局流控方案详解

(二)流控逻辑架构 方案涉及几个功能简单、清晰的角色: 1、管理定时器: 根据配置,将频率限制任务的配额值,写入多个带时间信息的key。...3、流控API: 业务通过流控api,请求先扣减本地配额(原子操作),如果配额<=0,就从ckv拉取配额到共享内存中,如果没配额拉取,就做说明流控生效。...据了解,时间同步是通过ntp服务来完成,精度在1~50ms之间,一般情况是<10ms。 目前的时间间隔都是1s以上,ntp服务的精度已经满足。...(二)流控方案升级 流控升级下一步是从全局流控升级到动态流控,所需健康度数据已经上报,而接入的方式目前可以直接在管理定时器上面增加配额调整的能力,这个扩展很方便。...重点应该是怎么去根据上报的健康数据分析并实现动调整当前配额值。

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为云开发API接口的最佳方案

开发API接口的步骤 以下是为云平台/服务开发高效和有效接口的一系列步骤 了解API特性 分析云平台/服务提供的API支持 确定API操作 验证API终端 验证API授权 检查配额 分析云资源定价 API...REST正在逐渐成为标准,并且取代了一些旧的SOAP API。根据文章后面的表1中的数据,这一点非常明显。 API认证 每个云平台都使用不同类型的认证机制来访问API了解这些认证机制很重要。...鼓励服务提供商和其他读者更新其云端的API端点,以便作为开发人员的简单参考。 API操作 通过API文档了解您的平台支持的API操作,并确定您想要使用的操作。...API授权 在API验证之后,我们需要知道云平台或服务对给定用户的授权情况。 配额 云平台/服务为用户帐户使用的资源强加限额。最好先了解配额限制。...了解某些提供程序和平台设置的API速率限制(用户在一段时间内可以对API端点进行的API请求数),因为它显示了我们可以多频繁地调用端点。

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现代 WorkManager API 已发布

如果您更喜欢通过视频了解此内容,请 点击此处 查看。 本文将着重探讨 WorkManager 的 API 以及用法,帮助您深入了解它的运行机制,以及在实际开发中的使用方式。...系统以配额的形式限制了加急工作的数量。当应用处于前台时,加急工作不存在任何配额限制,但是当应用转到后台运行时,就必须遵从这些限制配额的大小取决于应用的待机存储分区和进程重要性 (如优先级)。...由于受到配额限制,加急工作也不可以取代长时间运行的工作。当您的用户想要发送一条重要信息时,WorkManager 会尽可能保证这条消息尽快发送。...由于所能安排的工作存在配额限制,所以您需要表明当应用的配额用尽时该怎么处理,有两种备选方案: 其一是将加急请求变成常规工作请求,其二是在配额耗尽时放弃新的工作请求。...其实进程内调度程序所在的进程选择非常重要,由于它不受其他持久性调度器的限制影响,所以调整其所在的进程可以显著提升数据吞吐量。

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