展开

关键词

huARdb:单细胞水平克隆型-转录组分析的原受

适应性免疫反应激活需要 T 或 B 细胞上表达的受识别原,分别称为 T 细胞受 (TCR) 或 B 细胞受 (BCR)。 在T细胞和B细胞成熟过程中,随机的V(D)J基因重组产生每个细胞独一无二的TCR/BCR,在内形成具有高度多样性的TCRs/BCRs。以应对环境中丰富多样的病原生物。 然而,目前尚没有方法可以对已发表的单细胞免疫组进行再利用和无偏的整合分析。 huARdb收集了215份单细胞免疫组。 这些来自于493个不同的测序文, 24种不同组织和12种不同疾病模型。作者通过使用统一的处理流程对每个单细胞免疫组处理,得到每个集的单细胞水平TCR/BCR和转录组特征。 概况 收集了 14 个类单细胞免疫分析集,包括GEO、SRA和Genome Sequence Archive,包含来自 24 种组织类型和 12 种疾病的细胞。

14220

血液外泌

今天小编给大家介绍一个在线外泌:exoRBase(http://www.exorbase.org)。 它是一个环状RNA(circRNA),长非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)的存储,这些RNA来源于类血液外泌的RNA-seq分析,还包括已发表文献的实验验证。 该基于标准化的RNA-seq(涵盖正常个和不同疾病的患者)对RNA表达谱进行整合和可视化。旨在收集和表征血液外泌中所有长的RNA。 这里小编给大家简要介绍一下该的使用。 Browse exoRBase为用户提供了提取感兴趣的RNA候选物的功能。这里我们点击 “浏览”页面的“lncRNA和mRNA”部分。 点击Gene symbol列内基因的超链接,可转至该基因在其他疾病中的表达情况、基因的详细基本信息及通往其他的链接。

6320
  • 广告
    关闭

    什么是世界上最好的编程语言?丨云托管征文活动

    代金券、腾讯视频VIP、QQ音乐VIP、QB、公仔等奖励等你来拿!

  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    TSNAdb:肿瘤新

    TSNAdb是一个肿瘤特异性新原的,从TCGA和TCIA中收集了16种肿瘤共7748个肿瘤样本的细胞突变和HLA alleles信息,然后分别使用NetMHCpan v2.8和NetMHCpan v4.0两款软件来预测突变的肽段与HLA之间的亲和力,对应的文章链接如下 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6203688/ 的网址如下 亲和性值等具信息。 Validation 利用IEDB中提供的肽段与HLA亲和性进行验证,结果示意如下 ? 4. Download 将分析结果按照不同的肿瘤类型分开,示意如下 ? 通过TSNAdb可以快速检索肿瘤新原,分析查找多种肿瘤中共享的新原,有助于寻找新的免疫治疗靶点。

    1.2K30

    exoRBase:类血液外泌RNA

    exoRBase是一个类血液外泌中RNA的,网址如下 http://www.exorbase.org/ 从GEO中收集血液外泌的转录组测序,共收集了来自6个实验共87个样本的, 对于这92个样本的,采用如下所示的pipeline分析其中的RNA ? 在以上分析结果的基础上,又通过在pubmed中检索外泌RNA相关文献,新增了部分RNA,所有来源的RNA量汇总如下 ? 对于mRNA和lncRNA, 结合GTEx项目中的不同组织的表达谱,计算了其组织特异性。 通过导航栏的Browse菜单,可以查看外泌中的各种RNA信息,示意如下 ? 通过导航栏的Search菜单,可以方便的检索该,示意如下 ? 该针对外泌中的RNA进行研究,其构建的思路值得借鉴。

    29430

    HLA Epitope Registry-HLA原表位

    多种原分子之间会存在共有的原表位,由这些共同的原表位刺激机而产生的可以与多种原分子相结合,这种想象叫做交叉反应。 HLA Epitope Registry 是一个在线的,存储了HLA Allel 对应的原表位信息。 网址如下: http://epregistry.ufpi.br/ 对于不同的HLA 基因座,采用了不同的子进行存储,共有以下几个子 ABC DRB DQB+DQA DPB + DPA MICA 以ABC为例,该存储的是HLA-A , HLA-B, HLA-C 这3个经典的HLA I 型基因的原表位信息,网址如下 http://epregistry.ufpi.br/index/databases 第一列是原表位的名字,第二列代表该基团是否暴露在原分子表面,第三列信息和第一列一样, 第四列表示频率, 可以连接到ANFD, 第五列表示反应,如果存在实验证支持,取值为confirmed

    42250

    系结构

    索引的列的基越大,索引的效果越好。

    13540

    Hyperf 初验-

    本节和进行一次访问,包括迁移、增删改查等操作 仔细阅读文档 仔细阅读文档 仔细阅读文档 重要的是说三遍!!! 创建连接 Hyperf 的连接配置在 config\autoload\database.php 文件中 <? DB_COLLATION=utf8mb4_unicode_ci DB_PREFIX= REDIS_HOST=localhost REDIS_AUTH= REDIS_PORT=6379 REDIS_DB=0 执行迁移 function delete() { $user = User::query()->find(1); return $user->delete(); } } 关于操作

    1.5K30

    Netflix媒:媒时间线模型

    如何设计高效的视频,Netflix的NMDB给出了答案。本文是系列文章的第二篇,感谢Hulu的小伙伴们的技术审校。 source=collection_home---4------0--------------------- 在本系列的前一篇文章中,我们描述了Netflix的一些重要业务需求以及被称为“Netflix媒 更重要的是,许多流行的分布式文档索引,如Elasticsearch和MongoDB使用JSON文档。选择JSON作为我们的序列化格式,可以使用任何这些可伸缩文档来索引媒文档实例。 以下示例显示了一个完整的媒文档实例,该实例通过图3所示的视频序列的时间轴表示脸检测元。所讨论的视频序列是高清视频序列(1920x1080空间分辨率),帧率为23.976帧每秒。 此外,由于开发员需要在他们的媒文档定义中保持灵活性,并且随着时间发展,常常需要逐步演化其特定域的元,或更广泛地演化特定域的媒文档类型,因此我们允许更新媒文档模式。

    7420

    系梳理

    本文类似于一个提纲,是用来帮助梳理的学习系的,勉强凑一篇文章吧。 是什么? 为什么要有的分层设计 的分层设计是为了实现的高性能、低成本、高效率、高质量使用。 范式建模 用实加关系描述的模型描述企业业务架构,在范式理论上符合3NF,站在企业角度面向主题的抽象,而不是针对某个具业务流程的实对象关系抽象。 的实现形式 在传统企业大多会用 Oracle、DB2 等这些实现,但是随着 Hadoop 兴起,也有了用平台实现的方式。

    41220

    LNCipedia:类lncRNA

    不像起步很早的miRNA, lncRNA在最近十几年年才逐渐兴起,目前的现状是很多,不同对于lncRNA的命名方式不统一,这种混乱的命名模式,增加了研究的难度。 LNCipedia是一个综合性的类lncRNA,整合了多个中,多篇文章中的lncRNA记录,并赋予了它们统一的ID, 网址如下 https://lncipedia.org/ 该中的lncRNA 信息来源于以下几个 LncRNAdb Broad Institute Ensembl Gencode Refseq NONCODE FANTOM 同时也包含了Nielsen, Hangauer 来获取对应的信息,示意如下 https://lncipedia.org/api/transcript/HOTAIR:1 https://lncipedia.org/api/gene/HOTAIR 通过这种综合性的 ,可以避免不同中命名方式不同带来的不便。

    57820

    』这篇的文章真没看--完整性

    文章目录 实完整性 参照完整性 用户定义的完整性 完整性约束命名子句 域中的完整性限制 触发器 激活触发器 删除触发器 小结 什么是的完整性 ➢ 的正确性和相容性 ➢ 防止不合语义的进入。 ➢ 完整性:真实地反映现实世界 的完整性和安全性是两个不同概念 的完整性 ➢防止中存在不符合语义的,也就是防止中存在不正确的 ➢防范对象:不合语义的、不正确的 的安全性 :模型的组成部分约束的语义。 DBMS应提供定义完整性约束条件,并把它们作为模式的一部分存入中。

    37720

    之mariadb整概述

    一、的安装方式及其安装步骤 1、安装方式 rpm包安装,yum安装,二进制包安装,编译安装 2、安装步骤 (本文是使用二进制包安装) 1)下载mariadb相应版本的,解压 tar on 4)给/etc/my.cnf加上如下项 datadir=/mydata/data skip-name-resolve=ON innodb-file-per-table=ON 5)初始化及其启动 3、mariadb命令行客服端命令 常用帮助参如下注释 ? 4、常用类型 1)字符型 char,varchar,binary,varbinary,txt,blob... 2)值型 int,float,double,tinyint... 3)枚举型 1、定义语言(DDL),主要用于管理组件,例如索引,视图,用户,存储过程,主要命令有:create,alter,drop。

    46760

    国产化大金仓工具:oracle12c转kingbase8.6大金仓实例演示

    oracle12c大金仓实例演示 第一章:准备 ① 大金仓建建用户 ② 大金仓授权表空间 ③ 大金仓创建 schema 表 第二章:转演示 ① 转工具准备 ② 创建源和目的连接 ③ 创建迁移任务 ④ 启动迁移任务 ⑤ 迁移完成,查看迁移结果 第一章:准备 ① 大金仓建建用户 切换大金仓用户,然后创建用户和,名称要和 oracle 的用户名一致。 根自己的实际需要来设置即可。 schema 表 退出,用自己的建的用户登录,建个 schema 表,这个也要和 oracle 的用户一致。 windows 版迁移工具获取:小蓝枣的csdn资源仓 ② 创建源和目的连接 新建连接。 建一个源 oracle 的连接。 然后再建个目标大金仓的连接。

    30510

    理论系总结--管理与全链路

    那么说到这里,我们先说下中,OLTP和OLAP系统的区别:  OLTP:操作主要是随机读写,主要采用满足3NF的实关系模型存储,从而在事务处理中解决的冗余和一致性问题。 该模型有以下几部分组成: Hub:是企业的核心业务实,由实Key、序列代理键、装载时间、来源组成。 Link:代表Hub之间的关系。 备份机制:开发员需要保证内存可以通过外部存储恢复,因此在计算中用到的中间结果需要备份到外部存储中。    方法:同时订阅一份相同的,在系统中进行逻辑校验,当校验不通过时,以报警的形式披露出来给到规则订阅,以完成的校对。 离线风险点监控:主要包括对 准确性 和 产出及时性 的监控。 准确性:由离线开发员进行配置来确保准确性。

    1.2K42

    Oracle 机的崛起

    传统 IOE 架构的问题 对于Oracle系统来说,IOE是一种非常经典的架构。过去的十几年,它已经在许多行业中证明了自己存在的合法性。那为什么会出现机这样基于新架构的产品呢? 为了构建一个系统,需要从多个不同的厂商采购不同的硬件和软件,然后再将这些部件重新集成,这个过程成本很高,包括资金、力和时间成本。 从目前的发展趋势来看,机非常有可能成为它的替代者。 但对于新生的事物,们或多或少都会对它有一些排斥或者质疑,就像哥白尼提出的日心说,特斯拉发明的交流电。 IB网络之前由于成本高昂,并没有在中心普及,但在超算(HPC)领域,比如石油、天然气、气象、口普查等,早已经广泛使用。 机的优势 刚才提到,IOE架构很可能会被一机所取代,显然,它可以解决前者所面临的问题。

    848100

    Oracle 机的崛起

    摘要 机并不是一个新生的事物,它已经有了10年的历史,经过了许多行业和应用场景的考验,是非常成熟稳定的产品。 传统IOE架构的问题 对于Oracle系统来说,IOE架构是一种非常经典的架构。过去的十几年,它已经在许多行业中证明了自己存在的合法性。那为什么我们要用机这样的新架构去取代它? 为了构建一个系统,需要从多个不同的厂商采购不同的硬件、软件,然后再将这些部件重新集成,这个过程成本很高,包括资金、力和时间成本。 从目前的发展趋势来看,机非常有可能成为它的替代者。但对于新生的事物,们或多或少都会对它有一些排斥或者质疑,就像哥白尼提出的日心说,特斯拉发明的交流电。 机的优势 刚才提到,IOE架构很可能会被一机所取代,显然,它可以解决前者所面临的问题。

    87780

    通过生成实

    通过生成实类 说明 ​ 这只是一个简单的解析建表语句之后,根解析结果生成java文件的一个简单工具。写的原因有两个。 ​ 1:项目中没有写实类的注释,字段的注释,现有的工具也没法根的注释自动添加到class文件上。 ​ 2:自己写一个也似乎不是很难。 ​ 所以就自己写了一个。 想要根中的建表语句来创建java文件首先要先知道中都有那些表。 配置的相关信息 在获取链接前,我们先写一个文件用来保存链接的各种信息。 useSSL=true jdbc.username:的用户名。 jdbc.password:的密码。 这样就配置好了。

    69220

    国产部署初

    达梦管理系统是达梦公司推出的具有完全自主知识产权的高性能管理系统,简称DM。本次将进行DM8的开发版本的部署。 ? bash dmdba 2.2 创建目录并上传安装包 /** 创建专属路径 */mkdir -p /data/dmcd /data/dm/** 将下载的安装包上传至此路径 *//** 创建软件目录及目录 dbdbms/** 修改目录权限 */chown -R dmdba:dinstall /data/dm/** 修改安装包的权限 */chmod 775 DMInstall.bin 3 系统软件安装 初始化 ? 完成后,/data/dm/data目录下生成如下内容 ? 5. -h 帮助 其中-i 参中的/data/dm/data/testdb/dm.ini文件是在上一步初始化后生成的。

    40240

    PostrageSQL-变比较文件

    要为一个特定平台消除虚假的测试“失败”,你可以首先选择或创建一个变结果文件,然后在resultmap文件中增加一行。 因此,我们提供一个变比较文件float8-small-is-zero.out,其中包括了在这些系统上的期望结果。 resultmap中的其他行为其他平台选择变比较文件。 第二种变比较文件的选择机制更加自动:它简单地在多个提供的比较文件中采用“最佳匹配”。 回归测试驱动器脚本对一个测试考虑两种标准比较文件,testname.out以及名为testname_digit.out的变文件(其中digit是任何单一字0-9)。 这种机制的一个限制是测试驱动器不能说出哪个变对当前环境是真正“正确的”,它将只是选择看起来工作得最好的变。因此对你认为在所有上下文中具有同等合法性的变结果使用这种机制才是最安全的。

    10410

    相关产品

    • 对话机器人

      对话机器人

      云小微对话机器人基于完全自研的AI全链路能力,对用户输入的文本或语音识别的文本做语义理解、识别用户真实意图,记忆上下文和联想分析,面向用户提供快速、精准的信息问询体验。同时还为客户提供运营工具,通过对线上用户日志的挖掘,以及腾讯海量线上数据挖掘,提炼出各种问法,最终提高用户服务体验的满意度,减轻人工服务压力。

    相关资讯

    热门标签

    扫码关注云+社区

    领取腾讯云代金券