适应性免疫反应激活需要 T 或 B 细胞上表达的受体识别抗原，分别称为 T 细胞受体 (TCR) 或 B 细胞受体 (BCR)。 在T细胞和B细胞成熟过程中，随机的V(D)J基因重组产生每个细胞独一无二的TCR/BCR，在人体内形成具有高度多样性的TCRs/BCRs库。以应对环境中丰富多样的病原生物。 然而，目前尚没有方法可以对已发表的单细胞免疫组库数据进行再利用和无偏的整合分析。 huARdb数据库收集了215份单细胞免疫组库数据。 这些数据来自于493个不同的测序文库， 24种不同组织和12种不同疾病模型。作者通过使用统一的数据处理流程对每个单细胞免疫组库数据处理，得到每个数据集的单细胞水平TCR/BCR和转录组特征。 数据库概况 收集了 14 个人类单细胞免疫分析数据集，包括GEO、SRA和Genome Sequence Archive，包含来自 24 种组织类型和 12 种疾病的细胞。
今天小编给大家介绍一个在线外泌体数据库：exoRBase（http://www.exorbase.org）。 它是一个环状RNA（circRNA），长非编码RNA（lncRNA）和信使RNA（mRNA）的存储库，这些RNA来源于人类血液外泌体的RNA-seq数据分析，还包括已发表文献的实验验证。 该数据库基于标准化的RNA-seq数据（涵盖正常个体和不同疾病的患者）对RNA表达谱进行整合和可视化。旨在收集和表征人血液外泌体中所有长的RNA。 这里小编给大家简要介绍一下该数据库的使用。 Browse exoRBase数据库为用户提供了提取感兴趣的RNA候选物的功能。这里我们点击 “浏览”页面的“lncRNA和mRNA”部分。 点击Gene symbol列内基因的超链接，可转至该基因在其他疾病中的表达情况、基因的详细基本信息及通往其他数据库的链接。
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TSNAdb是一个肿瘤特异性新抗原的数据库，从TCGA和TCIA数据库中收集了16种肿瘤共7748个肿瘤样本的体细胞突变和HLA alleles信息，然后分别使用NetMHCpan v2.8和NetMHCpan v4.0两款软件来预测突变的肽段与HLA之间的亲和力，对应的文章链接如下 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6203688/ 数据库的网址如下 亲和性数值等具体信息。 Validation 利用IEDB数据库中提供的肽段与HLA亲和性数据进行验证，结果示意如下 ? 4. Download 将分析结果按照不同的肿瘤类型分开，示意如下 ? 通过TSNAdb可以快速检索肿瘤新抗原，分析查找多种肿瘤中共享的新抗原，有助于寻找新的免疫治疗靶点。
exoRBase是一个人类血液外泌体中RNA的数据库，网址如下 http://www.exorbase.org/ 从GEO数据库中收集血液外泌体的转录组测序数据，共收集了来自6个实验共87个样本的数据， 对于这92个样本的数据，采用如下所示的pipeline分析其中的RNA ? 在以上分析结果的基础上，又通过在pubmed数据库中检索外泌体RNA相关文献，新增了部分RNA数据，所有来源的RNA数量汇总如下 ? 对于mRNA和lncRNA, 结合GTEx项目中的不同组织的表达谱数据，计算了其组织特异性。 通过导航栏的Browse菜单，可以查看外泌体中的各种RNA信息，示意如下 ? 通过导航栏的Search菜单，可以方便的检索该数据库，示意如下 ? 该数据库针对外泌体中的RNA进行研究，其构建的思路值得借鉴。
多种抗原分子之间会存在共有的抗原表位，由这些共同的抗原表位刺激机体而产生的抗体可以与多种抗原分子相结合，这种想象叫做交叉反应。 HLA Epitope Registry 是一个在线的数据库，存储了HLA Allel 对应的抗原表位信息。 网址如下: http://epregistry.ufpi.br/ 对于不同的HLA 基因座，采用了不同的子数据库进行存储，共有以下几个子数据库 ABC DRB DQB+DQA DPB + DPA MICA 以ABC为例，该数据库存储的是HLA-A , HLA-B, HLA-C 这3个经典的HLA I 型基因的抗原表位信息，网址如下 http://epregistry.ufpi.br/index/databases 第一列是抗原表位的名字，第二列代表该基团是否暴露在抗原分子表面，第三列信息和第一列一样， 第四列表示频率， 可以连接到ANFD数据库， 第五列表示抗体反应，如果存在实验证据支持，取值为confirmed
索引的列的基数越大，索引的效果越好。
本节和数据库进行一次访问，包括数据库迁移、增删改查等操作 仔细阅读文档 仔细阅读文档 仔细阅读文档 重要的是说三遍！！！ 创建数据连接 Hyperf 数据库的连接配置在 config\autoload\database.php 文件中 <? DB_COLLATION=utf8mb4_unicode_ci DB_PREFIX= REDIS_HOST=localhost REDIS_AUTH= REDIS_PORT=6379 REDIS_DB=0 执行数据库迁移 function delete() { $user = User::query()->find(1); return $user->delete(); } } 关于数据库操作
如何设计高效的视频数据库，Netflix的NMDB给出了答案。本文是系列文章的第二篇，感谢Hulu的小伙伴们的技术审校。 source=collection_home---4------0--------------------- 在本系列的前一篇文章中，我们描述了Netflix的一些重要业务需求以及被称为“Netflix媒体数据库 更重要的是，许多流行的分布式文档索引数据库，如Elasticsearch和MongoDB使用JSON文档。选择JSON作为我们的序列化格式，可以使用任何这些可伸缩文档数据库来索引媒体文档实例。 以下示例显示了一个完整的媒体文档实例，该实例通过图3所示的视频序列的时间轴表示人脸检测元数据。所讨论的视频序列是高清视频序列（1920x1080空间分辨率），帧率为23.976帧每秒。 此外，由于开发人员需要在他们的媒体文档定义中保持灵活性，并且随着时间发展，常常需要逐步演化其特定域的元数据，或更广泛地演化特定域的媒体文档类型，因此我们允许更新媒体文档模式。
本文类似于一个提纲，是用来帮助梳理数据仓库的学习体系的，勉强凑一篇文章吧。 数据仓库是什么？ 为什么要有数据仓库？ 数据仓库的分层设计 数据仓库的分层设计是为了实现数据仓库的高性能、低成本、高效率、高质量使用。 范式建模 用实体加关系描述的数据模型描述企业业务架构，在范式理论上符合3NF，站在企业角度面向主题的抽象，而不是针对某个具体业务流程的实体对象关系抽象。 数据仓库的实现形式 数据仓库在传统企业大多会用 Oracle、DB2 等这些数据库实现，但是随着 Hadoop 兴起，也有了用数据平台实现的方式。
不像起步很早的miRNA, lncRNA在最近十几年年才逐渐兴起，目前的现状是数据库很多，不同数据库对于lncRNA的命名方式不统一，这种混乱的命名模式，增加了研究的难度。 LNCipedia是一个综合性的人类lncRNA数据库，整合了多个数据库中，多篇文章中的lncRNA记录，并赋予了它们统一的ID, 网址如下 https://lncipedia.org/ 该数据库中的lncRNA 信息来源于以下几个数据库 LncRNAdb Broad Institute Ensembl Gencode Refseq NONCODE FANTOM 同时也包含了Nielsen, Hangauer 来获取对应的信息，示意如下 https://lncipedia.org/api/transcript/HOTAIR:1 https://lncipedia.org/api/gene/HOTAIR 通过这种综合性的数据库 ，可以避免不同数据库中命名方式不同带来的不便。
文章目录 实体完整性 参照完整性 用户定义的完整性 完整性约束命名子句 域中的完整性限制 触发器 激活触发器 删除触发器 小结 什么是数据库的完整性 ➢ 数据的正确性和相容性 ➢ 防止不合语义的数据进入数据库。 ➢ 完整性：真实地反映现实世界 数据的完整性和安全性是两个不同概念 数据的完整性 ➢防止数据库中存在不符合语义的数据，也就是防止数据库中存在不正确的数据 ➢防范对象：不合语义的、不正确的数据 数据的安全性 ：数据模型的组成部分约束数据库中数据的语义。 DBMS应提供定义数据库完整性约束条件，并把它们作为模式的一部分存入数据库中。
一、数据库的安装方式及其安装步骤 1、安装方式 rpm包安装，yum安装，二进制包安装，编译安装 2、安装步骤 (本文是使用二进制包安装) 1）下载mariadb相应版本的数据库，解压 tar on 4)给/etc/my.cnf加上如下项 datadir=/mydata/data skip-name-resolve=ON innodb-file-per-table=ON 5)初始化数据库及其启动数据库 3、mariadb数据库命令行客服端命令 常用帮助参数如下注释 ? 4、数据库常用数据类型 1）字符型 char，varchar,binary,varbinary,txt,blob... 2)数值型 int,float,double,tinyint... 3)枚举型 1、数据定义语言(DDL)，主要用于管理数据库组件，例如索引，视图，用户，存储过程,主要命令有：create，alter，drop。
oracle12c数据库转人大金仓数据库实例演示 第一章：数据准备 ① 人大金仓建库建用户 ② 人大金仓授权表空间 ③ 人大金仓创建 schema 表 第二章：转库演示 ① 转库工具准备 ② 创建源库和目的库数据库连接 ③ 创建迁移任务 ④ 启动迁移任务 ⑤ 迁移完成，查看迁移结果 第一章：数据准备 ① 人大金仓建库建用户 切换人大金仓用户，然后创建用户和数据库，名称要和 oracle 的用户名一致。 根据自己数据库的实际需要来设置即可。 schema 表 退出，用自己的建的用户登录，建个 schema 表，这个也要和 oracle 数据库的用户一致。 windows 版迁移工具获取：小蓝枣的csdn资源仓库 ② 创建源库和目的库数据库连接 新建数据库连接。 建一个源库 oracle 的连接。 然后再建个目标库人大金仓数据库的连接。
那么说到这里，我们先说下数据仓库中，OLTP和OLAP系统的区别： OLTP：数据操作主要是随机读写，主要采用满足3NF的实体关系模型存储数据，从而在事务处理中解决数据的冗余和一致性问题。 该模型有以下几部分组成： Hub：是企业的核心业务实体，由实体Key、数据仓库序列代理键、装载时间、数据来源组成。 Link：代表Hub之间的关系。 备份机制：开发人员需要保证内存数据可以通过外部存储恢复，因此在计算中用到的中间结果数据需要备份到外部存储中。 方法：同时订阅一份相同的数据，在系统中进行逻辑校验，当校验不通过时，以报警的形式披露出来给到规则订阅人，以完成数据的校对。 离线数据风险点监控：主要包括对 数据准确性 和 数据产出及时性 的监控。 数据准确性：由离线开发人员进行配置来确保数据准确性。
传统 IOE 架构的问题 对于Oracle数据库系统来说，IOE是一种非常经典的架构。过去的十几年，它已经在许多行业中证明了自己存在的合法性。那为什么会出现数据库一体机这样基于新架构的产品呢？ 为了构建一个数据库系统，需要从多个不同的厂商采购不同的硬件和软件，然后再将这些部件重新集成，这个过程成本很高，包括资金、人力和时间成本。 从目前的发展趋势来看，数据库一体机非常有可能成为它的替代者。 但对于新生的事物，人们或多或少都会对它有一些排斥或者质疑，就像哥白尼提出的日心说，特斯拉发明的交流电。 IB网络之前由于成本高昂，并没有在数据中心普及，但在超算（HPC）领域，比如石油、天然气、气象、人口普查等，早已经广泛使用。 数据库一体机的优势 刚才提到，IOE架构很可能会被一体机所取代，显然，它可以解决前者所面临的问题。
摘要 数据库一体机并不是一个新生的事物，它已经有了10年的历史，经过了许多行业和应用场景的考验，是非常成熟稳定的产品。 传统IOE架构的问题 对于Oracle数据库系统来说，IOE架构是一种非常经典的架构。过去的十几年，它已经在许多行业中证明了自己存在的合法性。那为什么我们要用数据库一体机这样的新架构去取代它？ 为了构建一个数据库系统，需要从多个不同的厂商采购不同的硬件、软件，然后再将这些部件重新集成，这个过程成本很高，包括资金、人力和时间成本。 从目前的发展趋势来看，数据库一体机非常有可能成为它的替代者。但对于新生的事物，人们或多或少都会对它有一些排斥或者质疑，就像哥白尼提出的日心说，特斯拉发明的交流电。 数据库一体机的优势 刚才提到，IOE架构很可能会被一体机所取代，显然，它可以解决前者所面临的问题。
通过数据库生成实体类 说明 这只是一个简单的解析数据库建表语句之后，根据解析结果生成java文件的一个简单工具。写的原因有两个。 1：项目中没有人写实体类的注释，字段的注释，现有的工具也没法根据数据库的注释自动添加到class文件上。 2：自己写一个也似乎不是很难。 所以就自己写了一个。 想要根据数据库中的建表语句来创建java文件首先要先知道数据库中都有那些表。 配置数据库的相关信息 在获取数据库链接前，我们先写一个文件用来保存数据库链接的各种信息。 useSSL=true jdbc.username：数据库的用户名。 jdbc.password：数据库的密码。 这样就配置好了。
达梦数据库管理系统是达梦公司推出的具有完全自主知识产权的高性能数据库管理系统，简称DM。本次将进行DM8的开发版本的部署。 ? bash dmdba 2.2 创建目录并上传安装包 /** 创建专属路径 */mkdir -p /data/dmcd /data/dm/** 将下载的安装包上传至此路径 *//** 创建软件目录及数据目录 dbdbms/** 修改目录权限 */chown -R dmdba:dinstall /data/dm/** 修改安装包的权限 */chmod 775 DMInstall.bin 3 数据库系统软件安装 初始化数据库 ? 完成后，/data/dm/data目录下生成如下内容 ? 5. -h 帮助 其中-i 参数中的/data/dm/data/testdb/dm.ini文件是在上一步初始化数据库后生成的。
要为一个特定平台消除虚假的测试“失败”，你可以首先选择或创建一个变体结果文件，然后在resultmap文件中增加一行。 因此，我们提供一个变体比较文件float8-small-is-zero.out，其中包括了在这些系统上的期望结果。 resultmap中的其他行为其他平台选择变体比较文件。 第二种变体比较文件的选择机制更加自动：它简单地在多个提供的比较文件中采用“最佳匹配”。 回归测试驱动器脚本对一个测试考虑两种标准比较文件，testname.out以及名为testname_digit.out的变体文件（其中digit是任何单一数字0-9）。 这种机制的一个限制是测试驱动器不能说出哪个变体对当前环境是真正“正确的”，它将只是选择看起来工作得最好的变体。因此对你认为在所有上下文中具有同等合法性的变体结果使用这种机制才是最安全的。
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