创建包的好处和挑战 必要条件 开始创建你的第一个包 发布包 向 CRAN 做贡献后的体验 附加提示 Additional resources 1. 什么是 R 包?...创建 R 包的过程既有趣又富有挑战性,尤其是在首次创建时。我开始学的是创建包的基本结构和流程。 当我编码完包后,我就学会了如何将它发布在 CRAN 上共享给其他社区成员。...将包提交至像 CRAN 之类的主要仓库时需通过严格的质量测试。 不断进行更新。如果包的维护人员在 CRAN 上的更新活动不活跃,他的包就会被遗弃。 4....在创建完源码包后,你可提交在此(https://cran.r-project.org/submit.html)提交在 CRAN 上发布此包的申请。...向 CRAN 做贡献后的体验 我无法表达出将包发布在 CRAN 后的感受。这个包的可用性对外部世界可能无足轻重,但是这无关紧要。对于我而言,我知道我已开始使我最喜爱的工具变得更强。
在R语言的广泛包中,大部分可以直接install.packages()直接命令安装,但是有些包安装过程比较复杂,例如'lightgbm,ggplot2所依赖的‘rlang’包,devtools所依赖的‘...pkgload’,这三个包是我目前经常遇到的需要编译的包,安装过程比较复杂且慢。...当我首先发现install.packages()安装rlang和pkgload时出错 ? ?...首先: 下载Rtools,根据R语言版本选择对应的Rtools 下载Rtools过程注意选择默认路径,且将Rtools下载路径加入系统变量path 重启Rstudio,重新安装上述包 getOption...lib="D:/R.Rstudio/R/R-3.3.3/library") install.packages('devtools', repo='https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN
针对这两种问题,我的解决思路是:手工下载包,然后本地手动安装 操作步骤如下: 1、到R镜像下载页面 根据你的系统点击不同下载入口 选择你的运行环境:linux/mac/windows https://mirrors.ustc.edu.cn.../CRAN/ (我的是windows) 2、点击contrib 3、点击contrib进入R包下载目录页(根据不同版本选择) 4、进入到Index of /CRAN/bin/windows/contrib.../3.6/ R包列表页 ctri+F 查找你需要下载的包 5、R-studio手动安装本地包 相信接下来你也知道怎么做啦 【拓展阅读】 1.通过Github仓库名和包名安装 不是所有的R包都提交上传到...CRAN,如Github存放一些R包,所以偶尔也会遇到安装github上的R包 install.packages("devtools")library(devtools)install_github("...Github上的R包路径") 2.更新R包列表(Rstudio) 这里仅说明Rstudio中的一键更新功能。
在 windows 使用 R,尤其是安装 R 包的时候,经常会遇到一些 Rtools 的问题,今天聊一下。 Rtools 是什么 Rtools 作用很大,但我们一般不怎么会直接使用。...Rtools 安装 在 RStudio 中安装shiny包的时候,就出现了要安装 Rtools 的 warning,提示信息中还给出了下载的链接地址。...或者下载 R 版本对应 Rtools: ✎ 注意 当我们通过下面的链接直接访问清华大学 CRAN 的 Rtools 时: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/...方法二 第二种方法,我是在网络上看到,大家也可以参考一下。...(installr) install.Rtools() 这是通过设置清华大学 CRAN 后,先安装installr包,再通过这个包直接下载安装 Rtools,速度上同样也是杠杠的。
这里汇总的信息和视频解读推荐每个想要进阶和学习 R 包开发的读者看一看,是我两年开发经验的一个总结。...内容: 开发工具 RStudio usethis (devtools may be helpful) - usethis 是目前的开发核心包,里面有特别多的工具函数,自己开发时多看一看、试一试效果。...CRAN/Bioconductor devtools::check() rhub::check_for_cran() 这个包提供的测试功能比较丰富 先测试好再提交 devtools::submit_cran...() Bioconductor没提交过,官网有说明,照着做。...总结一下要点: 掌握 R 包结构 掌握 usethis 、devtools包 编写简约有效的函数代码 处理好 devtools::check() 显示的 NOTE/WARNING/ERROR 逐步学习写示例
本来我这个段位,就不应该为安装包发愁了,毕竟统计学不会可以理解,编程学不好忍忍就过去了,但是说安装包出错,是可忍孰不可忍? 统计编程我惹不起就算了,你一个安装包我还搞不定了???...测试成功安装ggplot2 现在最新的R版本是4.2.1,因为有些包只能运行在3.6版本中,因此我需要安装3.6,这里安装常用的ggplot2时报错了,总结一下问题解决的方法。...2,安装rlange1.0.0 如果现在网上搜索R包的地址,包括其不同的版本,可以键入: https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ 如果知道包的名称...在这里插入图片描述 找到rlang包的链接:https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rlang/rlang_1.0.1.tar.gz 然后复制包的链接...这种方法可以推广到R3.5,R4.0,R4.1,windows系统安装Rtools就是为了防止本地编译时出错,里面有C,C++,Fortran等各种编译器,一篮子满满的。有了它,就不怕R包安装了。
在本教程中,我们将安装R并演示如何从官方的Comprehensive R Archive Network(CRAN)添加软件包。...准备 学习本教程,需要一台安装好Ubuntu系统的服务器,我建议您使用腾讯云免费的开发者专属在线实验平台进行试验。...sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 当我们运行命令时...截至撰写本文时,CRAN的最新稳定版R为3.5.1,当您启动R时会显示对应的版本号。 由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例包,我们将以root身份启动R,以便所有用户可以自动使用这些库。...任何预编译的包都可以从CRAN安装install.packages()。要了解有关可用内容的更多信息,您可以通过CRAN 找到按官方软件包列表。
在本教程中,我们将安装R并演示如何从官方的Comprehensive R Archive Network(CRAN)添加软件包。如果您还没有腾讯云的服务器,可以先点击这里进行免费套餐的试用。...sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 当我们运行命令时...截至撰写本文时,CRAN的最新稳定版R为3.5.1,当您启动R时会显示对应的版本号。 由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例包,我们将以root身份启动R,以便所有用户可以自动使用这些库。...任何预编译的包都可以从CRAN安装install.packages()。要了解有关可用内容的更多信息,您可以通过CRAN 找到按官方软件包列表。...若您想在实验室环境抢先体验搭建自己的网站,博客或者各类应用,我推荐您到腾讯云实验室页面进行选择,不仅有步骤指导,还可以免费上机,帮助您快速掌握开发知识!
介绍 R是一种流行的开源编程语言,专门用于统计计算和图形。它被统计学家广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R的优势之一是允许用户创作和提交自己的包,因此它具有高度且易于扩展的特点。...没有服务器的同学可以在这里购买,不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验,学会安装后再购买服务器。 第1步 - 设置APT 要安装R,我们将使用APT(高级打包工具)工具。...当安装R时,它会自动安装许多默认包,但为了在R中做任何真正有意义的事情,你可能需要安装额外的包。为了安装许多软件包,至少有1 GB的RAM是很重要的。...我们还将指定repos参数,以便从RStudio CRAN存储库下载包,这与我们下载R本身时使用的相同。...与CRAN软件包一样,在安装GitHub软件包时,您需要从系统shell运行该命令,以使所有用户都可以使用该软件包。让我们尝试安装shinyjsGitHub包,它可以为shiny包添加功能。
我使用的是macOS, x86_641) SueratObject v5.0.0是基于Matrix 1.6-1 package的,所以我在CRAN官网:https://cran.r-project.org.../web/packages/Matrix/index.html 下载了安装包, 官网有两个1.6-1 版本。...我估计是针对macOS and windows的。 我首先下载了: Matrix 1.6-1.1.tar.gz....,我当时也不知道解决的办法。)...所以我得回到2)的位置,考虑一下compilation的问题Error: compilation failed for package "Matrix"通过搜索,我发现R包有时候是需要编译器的 (这里我不知道描述的是否准确
可能还有我不知道的类型…(请发现的同学通知我!) 环境空间,在进行R包开发时,是必备的一个知识点。每个环境空间都是环境类型的一个实例。...当我们切换到base的环境空间时,就可以找到sum()的函数定义了。...1.2.4 R语言包的开发 R包的开发,是R语言编程中比较难的,又不得不面对的问题,不仅要把上文中所提到的各种R语言技术综合运用在一起,还要符合R包的开发规范,并用Latex写好文档,最后提交给CRAN...我写的gridgame游戏包和chinaWeather天气包,改了很多次,都没能通过,都到了要放弃的边缘了。 换个角度想,只有审核严格才能保证用户在安装第三方的R包时候不会出错。...这样就可以脱离CRAN的束缚,以个人的名义发布各种奇思妙想的R包,甚至是“不误正业”的R包。嘿嘿!!
在撰写本文时,ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包!在包中使用ggplot2编程增加了几个约束,特别是如果你想将包提交给CRAN。...同样地,导入ggplot2全部450个导出对象到你的命名空间会让分离你的包和ggplot2包的责任变得困难,特别是读者会搞不清这些函数到底来自哪里。 我个人碰到过很多这种情况。...有时候在开发R包时为了保证正常运行,不得不将依赖包列入Depdens。...不应该停止你创建自己的函数可视化对象! 创建一个新的主题 当创建一个新的主题时,从已有主题出发总是好的实践(例如,theme_grey()),然后使用%+replace%替换需要该包的元素。...如果出于一些原因你想要将其保留在Suggests,那么可以利用vctrs::s3_register()仅当ggplot2被安装时才注册你的泛型函数。
在本教程中,我们将安装R并演示如何从官方的Comprehensive R Archive Network(CRAN)添加软件包。...sudo apt-key adv --keyserver keys.gnupg.net --recv-key 'E19F5F87128899B192B1A2C2AD5F960A256A04AF' 当我们运行命令时...截至撰写本文时,CRAN的最新稳定版R为3.5.1,当您启动R时会显示。 由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例包,我们将以root身份启动R,以便所有用户可以自动使用这些库。... > 这证实我们已经成功安装了R并进入了它的交互式shell。 第3步 - 从CRAN安装R软件包 R的优势之一是其可用的附加包装丰富。...任何预编译的包都可以用install.packages()从CRAN安装。要了解有关可用内容的更多信息,您可以通过“ 按名称列出的可用CRAN包”列表找到按名称组织的官方软件包列表。
回想当时学习 R 语言时也是非常戏剧性的,开始科研生活时到处发邮件要源代码,发完最后一封本以为又是无功而返,很意外的收到了秒回的邮件,邮件中附上了由 R 语言编写的实验代码。...当我们需要去学习一门新的编程语言时,自然是我们掌握的工具、资源已经无法满足解决新问题的需要,那么新学习的语言必然要拥有丰富的解决方案供我们使用。...CRAN(Comprehensive R Archive Network)是 R 的源代码、文档以及各种包的托管,R 的安装包也需要通过 CRAN 下载。...通常各所大学都会提供 CRAN 的镜像, CRAN 所有的镜像列表可通过此网站获得:https://cran.r-project.org 。选择下载相应平台的安装包即可。 ...提示 R 语言社区包含了许多入门文档:https://cran.r-project.org/doc ✏️ 练习 1. 试着安装一下网络分析包 “igraph”; 2.
("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))#设置镜像#1.CRAN的直接installinstall.packages("...tidyr")#2.BiocManager的包要在它里面下install.packages('BiocManager')BiocManager::install("ggplot2")#3.github的包要写作者...require(string))install.packages("stringr")包是否下载成功的唯一标准是library()没有error,当提示package not available时,原因可能为...:1.名字写错;2.安装命令错误;3.包与R语言版本不符合(极少数);4.包过时。...proj的文件夹内的文件时,写全路径多用tabfread函数读取快且遇空行不易出错引用自生信技能树马拉松课程小洁老师R语言基础
(1)R包安装 按需索取,目的不是学会某个具体的R包,而是找所有R包使用的规律。 不需要安装所有的R包,需要哪一个,装哪一个。...来源和安装方式是对应的,从哪里来/怎么安装 (1)CRAN网站 install.packages() (2)biocounductor....根据反馈出来的逻辑值判断是否安装成功。 require() 返回逻辑值是TRUE时,说明已经安装,而 !...图片 ##例如常用的画图软件的安装和加载,可以运行如下程序 #设置镜像 options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/...补充:列出一个包里都有哪些函数或者数据 ls("package:stringr") #不能直接写 stringr ,必须写上package: , 不能写成package= 如果出错,可能是因为没有加载
包的安装方式进行安装。...--------------------------------------- 安装依赖: apt install libssl-dev 安装UCSCXenaShiny成功后,进一步关注App启动时的依赖安装...类似Ubuntu,直接用CRAN方式安装。...原因是最新版本仅支持 R≥4.0(测试使用的3.6)。...root/.R vi /root/.R/Makevars 在文件中加入内容: CXX11=/opt/rh/devtoolset-9/root/usr/bin/g++ -std=c++11 其他 有意思的是我发现在安装后对容器大小进行查看
看到 gt 包终于被宣告提交到 CRAN 了。这个包挂在 GitHub 上非常久了,基于它包好像都有几个。我今天把冷饭拿出来再炒一炒,或许有读者会喜欢。...另外,该包作者将表格相关的包做了个汇总,我也把它更新到了本文的下方。本文应当可以成为读者使用 R 构建表格的一大入口,值得点赞收藏。 RStudio 提供了出版级的表格解决方案gt包。...使用简单的表格展示gt基础 让我们使用一个R datasets包中不是很流行的数据集islands:它是一个命名向量。...给简单的表格加点料 gt包可以通过添加要素来让结果的gt Table更好地表达你所要展示的信息。...前面的gt Table仅展示了两种要素,即Column Labels(列标签)和Table Body(表格主体)。接下来的例子会展示目前可以使用的其他表格要素。 一个表格的所有要素可以和谐地统一。
,数据包中是没有携带cookie的。...和客户同步了相关情况后,客户提出了新的疑问: 这里重新使用Google浏览器进行了测试,打开F12查看数据流观察一下: 这里我们发现,当我们去轻轻的点击了我们构造的测试链接时,浏览器发了四个请求:...最后一次请求用获取的Cookie在次向接口请求,但是请求方法变成了GET,而删除操作的参数是在POST数据包中,并没有提交过来,所以即使接口返回成功,但是并没有删除。...当我正准备提交测试结果,并说明无法复现的时候,老大叫到了我说:“这不是CSRF可以删除吗?你为什么删不掉呢”,我过去瞅了一眼,确实执行并成功删除了,这接口看眼缘?...换言之,只有当前网页的 URL 与请求目标一致,才会带上 Cookie。但是这种情况用户体验不太友好。
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