执行组合功能的函数c()可用来创建向量（类似于编程语言中的一维数据 int[]、Object[]等，访问元素的方式和数组相同，使用下标从1开始）。...2、矩阵 矩阵是一个二维数组，只是每个元素都拥有相同的数据类型（数值型、字符型或逻辑型） 。可通过函数matrix()创建矩阵，阵中仅能包含一种数据类型 。...如上所示，创建了一个4行5列的矩阵，矩阵中的元素按照行填充，分表定义了行名、列名。 我们可以使用下标和方括号来选择矩阵中的行、 列或元素。...数组可通过array函数创建。其中vector包含了数组中的数据， dimensions是一个数值型向量，给出了各个维度下标的最大值，dimnames是可选的、各维度名称标签的列表。...每一列数据的模式必须唯一，不过你却可以将多个模式的不同列放到一起组成数据框。 访问数据框中元素的方式有若干种。
x <- c(x, 0) # 向 x 中添加元素 0 向量元素的访问 向量中的元素通过“[索引]”的形式访问。需要注意的是 R 语言中的索引不代表偏移量，而代表第几个，即索引从 1 开始。...想要从向量中取出多个元素需要在方括号内传递索引的向量，即“[c(索引)]”。...你可以将矩阵看成一个二维数组（array），或是由多个向量（vector）构成。在 R 语言中使用 matrix() 函数来创建矩阵。...如果为列表元素定义名称的话，列表更像是 Python 中的字典，但 R 语言中的列表中的元素是有序的。在 R 语言中使用 list() 函数来创建列表。...将其输入到 R 终端中，细心的你会发现这与矩阵计算特征值和特征向量的函数 eigen() 返回的类型一致。这种定义了名称的列表对于包含多个返回值的函数非常方便。
到目前为止，我们只使用了一个参数的函数，并将它们应用于数据。apply家族最棒的部分是，它们也处理具有多个参数的函数！...我创建了一个简单的表，告诉我们返回的类型： 返回值 每个元素的长度 输出 列表 1个 向量 列表 > 1并且长度相同 矩阵 列表 > 1，且长度可变 列表 我们将看到上述所有场景的示例： 场景1...使用tapply()非常容易，因为它会自动从item_cat 向量 中获取唯一的值，并几乎立即对数据应用所需的函数。...因此，mapply函数用于对通常不接受多个列表/向量作为参数的数据执行函数。当你要创建新列时，它也很有用。...尾注 到目前为止，我们学习了R中apply()函数族中的各种函数。这些函数集提供了在一瞬间对数据应用各种操作的极其有效的方法。本文介绍了这些函数的基础知识，目的是让你了解这些函数是如何工作的。
R语言作为一种编程语言，在生物信息和生物统计学中应用非常广泛。学习R语言的初期和学习其他编程语言一样，我们首先要了解在R语言中的各种数据类型及其用法。...向量的创建 执行组合功能的函数c()可用来创建向量，c是英文concatenate的缩写，代表连接的意思，可以将多个散在的元素合并成一个向量。如图2所示： ?...向量的索引 所谓“索引（index）”就是获取向量中的某一个元素的内容。具体怎么索引呢？我们在创建向量之后，通过在方括号中给定元素所在位置的数值就可以访问向量中的元素。如图3所示： ?...矩阵（matrix） 要求：掌握 矩阵的创建 矩阵是一个二维数组，和向量类似的是，矩阵中的每个元素也拥有相同的模式。可以用函数matrix()创建。如图4所示： ?...在之后的学习或者使用R语言的过程中，遇到新的函数，也可以用同样的办法查看帮助文档。切记：不会的东西就打问号？哦。 矩阵的索引 创建好矩阵之后，对矩阵中元素的访问和向量很类似，如图6所示。 ?
R中的数据结构： 向量、标量 矩阵 数组 列表 数据框 因子 时间序列 ······ 接下来我们将一一介绍这些对象的概念、以及如何创建、访问、修改并运算这些对象。...3 向量、标量 向量是R中最重要的概念，构成其他数据结构的基础。与数学中的向量概念不同。R中的向量类似于数学上集合的概念，由一个或多个元素构成。...向量适用于存储数值型、字符型或者逻辑型数据的一维数组。 3.1 向量基本概念 用函数c()来创建向量。...正整数索引 根据元素在集合中的位置索引，R中元素位置从1开始 x <- c(1:100) length(x) x[1] # 输出结果为1 x[-19] # 输出除了第19个元素外其他元素 x[c(4:18...向量与列表 在模式上与向量类似，都是一维数据集合 向量只能存储一种数据类型，列表中的对象可以是R中的任何数据结构，包括列表本身 6.1 创建列表 > a <- 1:20 > b <- matrix(1:
R语言 数据结构创建数据集数据集就是由数据构成的一个矩形数组，行表示观测值，列表示变量。..., TRUE)#逻辑型注意：单个向量中的数据必须拥有相同的类型或模式标量是只含一个元素的向量，eg：a <- 3, g <- "US", h <- TRUE在方括号中给定元素所在位置的数值，我们可以访问向量中的元素...重复2次二、矩阵矩阵是一个二维数组，只是每个元素都有相同的模式，可通过函数matrix()创建三、数组与矩阵相似，但是维度可以大于2，可通过函数array()创建四、数据框由于不同的列可以包含不同模式的数据...，数据框较矩阵更为常见，可用函数data.frame()创建五、列表列表是数据类型中最为复杂的一种，列表就是一些对象或成分的有序集合，可能包含若干向量、矩阵、数据框甚至其他列表，可用函数list()来创建...制表符/、换行或回车从向量中提取元素1、根据元素位置x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5
数据的保持与对象的清除 R所创建、操作的实体是对象。对象可以是变量、数组、字符串、函数以及由这些元素组成的其它结构； > objects() 用来显示目前存储在R中的对象的名字。...，并在其它的R任务中被使用。...外部文件：创建数据帧最简单的方法应当是使用read.table()函数从外部文件中读取整个数据帧。...这样我们可以很简单的在同一个目录下处理多个问题，而且对每个问题都可以使用x,y,z这样的变量名。 七 从文件中读取数据 7.1 函数read.table() 该函数可以直接将文件中完整的数据帧读入。...(Hershey) 12.3 图形的交互 R提供了函数，使用户可以通过鼠标从图形中释放信息或添加信息。
¶ map 函数是Python内置函数之一，它用于对可迭代对象（如列表、元组等）中的每个元素应用指定的函数，并返回一个包含应用结果的新可迭代对象。...map 函数的工作原理是将函数 function 应用于 iterable 中的每个元素，然后返回一个包含应用结果的新的可迭代对象。...iterable 是一个可迭代对象，如列表、元组等。 filter 函数的工作原理是将函数 function 应用于 iterable 中的每个元素，并根据函数返回的布尔值来决定是否保留该元素。...总结起来，filter 函数用于过滤可迭代对象中的元素，只保留满足指定条件的元素，而 map 函数用于对可迭代对象中的每个元素应用指定的函数，并返回一个包含应用结果的新可迭代对象。...首先，代码导入了 NumPy 库，并使用不同的函数创建了多个数组。
看下面的例子： numpy.where()它从我们的条件中创建一个布尔数组，并在条件为真或假时返回两个参数，它对每个元素都这样做。这对于在Dataframe中创建新列非常有用。...它向量化了你的函数，而不一定是这个函数如何应用于你的数据，这有很大的不同！...这是我们第一次尝试将多个条件从.apply()方法转换为向量化的解决方案。向量化选项将在0.1秒多一点的时间内返回列，.apply()将花费12.5秒。...4、使用来自其他行的值 在这个例子中，我们从Excel中重新创建了一个公式： 其中A列表示id，L列表示日期。...因此，如果你有一个4核的i7，你可以将你的数据集分成4块，将你的函数应用到每一块，然后将结果合并在一起。注意：这不是一个很好的选择！ Dask是在Pandas API中工作的一个不错的选择。
查看R的数据结构 从数据结构中对数据进行子集化。...我们使用的R中的函数将取决于我们引入的数据文件的类型（例如文本，Stata，SPSS，SAS，Excel等）以及该文件中的数据如何分开或分隔。下表列出了可用于从常见文件格式导入数据的函数。...您还可以从RStudio的“environment”选项卡中获取此信息。 数据检查函数列表 已经看到函数head()和str()可以查看data.frame的内容和结构。...数据框或矩阵只是组合在一起的向量集合。因此，从向量开始，学习如何访问不同的元素，然后将这些概念扩展到数据框。...（1）向量 选择使用索引 从向量中提取一个或多个值，可以使用方括号[ ]语法提供一个或多个索引。索引表示一个向量中的元素数目（桶中的隔室编号）。R索引从1开始。
函数（function）是可以保存在项目工作空间的R 对象。该对象为R 提供了一个简单而又便利的功能扩充方法。见编写你自己的函数 在R会话过程中，对象是通过名字创建和保存的。...对象持久化 R 会话中创建的所有对象可以永久地保存在一个文件中以便于以后的R 会话调用。在每一次R 会话结束的时候，你可以保存当前所有可用的对象。...函数is.na(x)返回一个和x同等长度的向量。它的某个元素值为TRUE 当且仅当x中对应元素是NA。...可以根据索引数组去给数组中不规则的元素集合赋值或者将数组中特定的元素返回到一个向量中 array() 除了用设定一个向量dim 属性的方法来构建数组，它还可直接通过函数array将向量转换得到....读数据 大的数据对象常常是从外部文件中读入，而不是在R 对话时用键盘输入的。 read.table()函数 为了可以直接读取整个数据框，外部文件常常要求有特定的格式。
更多内容请参考《R语言编程艺术》 ——————————————— 向量类型是R语言的核心。深入理解向量对R中数据结构及其操作，函数的开发和应用有着重要意义。...也就是说，向量的所有元素必须属于同种模式（mode），或数据类型（见1.2），比如数值型，字符型等。其类型可以用typeof()查看。 标量只含有一个元素，在R中没有0维度或标量类型。...为什么叫原子型(atomic):向量的元素已经是最小的，不可再分的。 列表型，又叫递归型，因为是列表中可以继续包括列表。列表中的“元素”就是列表的各组件，其名称叫标签（tag）。...5 列表和数据框（都不是向量） 5.1 列表 列表创建及基本结构 向量的元素要求同种类型，而列表list与向量不同，可以组合多个不同类型的对象。所以列表不是向量。...tapply()执行的操作是，暂时将x分组，每组对应一个因子水平（多个因子对应一组因子组合），得到x的子向量，然后对这些子向量应用函数g() > ages <- c(25,26,55,37,21,42)
学习目标 演示如何从现有的数据结构中取子集，合并及创建新数据集。 导出数据表和图以供在R环境以外使用。...我们将filter()在后面的课程中更详细地探讨该功能。 2.列表 从列表中选择组件需要略有不同的表示法，即使理论上列表是向量（包含多个数据结构）。...列表的组件命名数据框的列命名使用的函数都是names()。 查看list1组件的名称： names(list1) 创建列表时，将species向量与数据集df和向量number组合在一起。...从list1中提取species： list1[[1]] list1[["species"]] list1$species ---- 练习 练习结合从目前为止我们所讲过的数据结构中提取数据的方法： 设置在上一个练习中创建的列表...从random列表中提取向量 age的第三个元素。 从random列表中的数据框 metadata中提取基因型信息。 ---- 3.导出文件 到目前为止只修改了R中的数据; 文件保持不变。
或 字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量 #一个向量作为数据框中的一列x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。...重复2次x#重复赋值会覆盖，最后一次为准从向量中提取元素根据元素位置x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素...向量(Vectors)：向量是一个一维数组，可以容纳数值型、字符型或逻辑型数据。你可以使用c()函数创建向量。...列表(Lists)：列表是一种多功能的数据结构，可以容纳不同类型的元素，包括其他列表、向量、矩阵、数据框等。你可以使用list()函数创建列表。...当你使用save()将a保存到文件时，R会将整个对象a以及其结构和数据保存到文件中，无论a是数据框、矩阵、列表或任何其他受支持的数据类型。
从历史上看，尽管把两者分割开来是因为教育背景：统计学家们倾向用R，而程序员则选择了Python语言。...而在以下领域中，R比Python更有优势： ◆统计分析选项：尽管Python的SciPy和 Pandas以及 statsmodels的组合提供了很大的一套统计分析工具，而R是专门围绕着统计分析应用等创建的...sys模块包含了系统具体的参数和函数，在这里，我们只对 argv的属性感兴趣。这个argv属性是所有被传递到当前正在执行脚本的参数列表。表中的第 一个元素是正在被执行的脚本的完整路径。...接下来，我们将讨论如何在R和Python中直接调用并在内存中输出。...在Python中的形式以一个字符串列表表示，其相应的元素如下所示: [‘’, ‘’, ‘arg1’ , ‘arg2’, ‘arg3’, ‘arg4’] 下面代码是运行在Python中调用R的一个例子：
从历史上看，尽管把两者分割开来是因为教育背景：统计学家们倾向用R，而程序员则选择了Python语言。...而在以下领域中，R比Python更有优势： 统计分析选项：尽管Python的SciPy和 Pandas以及 statsmodels的组合提供了很大的一套统计分析工具，而R是专门围绕着统计分析应用等创建的...sys模块包含了系统具体的参数和函数，在这里，我们只对 argv的属性感兴趣。这个argv属性是所有被传递到当前正在执行脚本的参数列表。表中的第一个元素是正在被执行的脚本的完整路径。...接下来，我们将讨论如何在R和Python中直接调用并在内存中输出。...在Python中的形式以一个字符串列表表示，其相应的元素如下所示: ['', '', 'arg1' , 'arg2', 'arg3', '
数据结构是指在计算机中存储和组织数据的方式，不同的数据结构有不同的特点和适用场景。R语言中的常用数据结构，包括向量、矩阵、数组、列表和数据框。...为方便大家理解记忆，对每种数据结构的基本操作概括为四大类：创建数据结构往里面添加数据从里面查询数据对里面的数据进行修改这篇文章我们将介绍矩阵的使用矩阵矩阵是R语言中的一种二维数据结构，它是由一系列相同类型的元素组成的矩形数组...矩阵有两个维度，分别表示行数和列数，可以用dim()函数来获取。矩阵应用举例：创建矩阵创建矩阵的一种常用方法是使用matrix()函数，它可以将一个向量或多个向量组合成一个矩阵。...rbind()和cbind()函数，它们可以将多个向量或矩阵按行或按列组合成一个新的矩阵。...行列索引号从1开始，表示第一行或第一列，负数表示排除对应位置的元素。也可以使用逗号,来分隔行列索引号，表示同时访问多个元素。
基于S语言开发的商业软件S-plus，可以方便地编写函数、建立模型，具有良好的扩展性，在国外学术界应用很广。商业软件嘛，毕竟是要收费的。...矩阵(matrix)：矩阵是一个二维的元素向量组，在数学上被广泛运用(如协方差矩阵)，在R中，矩阵里的元素可以是任意类型，但必须相同。...数组(array)：数组就像是更高维的矩阵，通常使用dim()函数来创建所需要的维度。内部元素类型需相同。...因子(factor)：因子是使用向量创建的R对象，它将向量与向量中元素不同值一起存储成标签，而不论是哪种类型的向量，最后都存储成字符型元素。有点类似统计学中的分类变量或者定性变量。...列表(list)：列表可以包含许多不同的元素，且每层可含有不同的元素类型。把多个对象复合在一起的时候可以用到列表，同时列表也可以嵌套列表。
数据结构是指在计算机中存储和组织数据的方式，不同的数据结构有不同的特点和适用场景。R语言中的常用数据结构，包括向量、矩阵、数组、列表和数据框。...为方便大家理解记忆，对每种数据结构的基本操作概括为四大类：创建数据结构往里面添加数据从里面查询数据对里面的数据进行修改这篇文章我们将介绍向量的使用向量向量是R语言中最基本的数据结构，它是由一系列相同类型的元素组成的一维数组...创建向量创建向量的一种常用方法是使用c()函数，它可以将多个元素组合成一个向量。...另一种创建向量的方法是使用序列生成函数，如seq()和rep()。...例如：# 使用seq()函数创建一个从1到10，步长为2的数值向量a <- seq(from = 1, to = 10, by = 2)a# [1] 1 3 5 7 9# 使用rep()函数创建一个重复
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