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【Python 数据科学】Dask.array:并行计算利器

Dask.array将数组拆分成多个小块,并使用延迟计算方式来执行操作,从而实现并行计算。这使得Dask.array能够处理大型数据,同时充分利用计算资源。...例如,我们可以通过读取大型数据文件来创建Dask.array: import dask.array as da # 大型数据文件创建Dask数组 arr = da.from_array_file('...from dask.distributed import Client # 创建一个分布式客户端 client = Client() # 大型数据文件创建Dask数组,并在分布式集群上执行计算 arr...Dask.array可以帮助我们高效地处理多维气象数据: import dask.array as da import netCDF4 # 多个NetCDF文件创建Dask数组 arr = da.stack...多个NetCDF文件创建了一个三维数组,其中每个二维数组表示一个气象数据

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什么是Python中Dask,它如何帮助你进行数据分析?

后一部分包括数据、并行数组和扩展到流行接口(如pandas和NumPy)列表。...事实上,Dask创建者Matthew Rocklin先生确认Dask最初是为了并行化Pandas和NumPy而创建,尽管它现在提供了比一般并行系统更多好处。...Dask数据非常适合用于缩放pandas工作流和启用时间序列应用程序。此外,Dask阵列还为生物医学应用和机器学习算法提供多维数据分析。...这就是为什么运行在10tb上公司可以选择这个工具作为首选原因。 Dask还允许您为数据数组构建管道,稍后可以将其传输到相关计算资源。...('myfile.hdf5') x = da.from_array(f['/big-data'], chunks=(1000, 1000)) 对于那些熟悉数据数组的人来说

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让python快到飞起 | 什么是 DASK

Dask 集合是底层库并行集合(例如,Dask 数组由 Numpy 数组组成)并运行在任务调度程序之上。...Dask 包含三个并行集合,即 DataFrame 、Bag 和数组,每个均可自动使用在 RAM 和磁盘之间分区数据,以及根据资源可用性分布在集群中多个节点之间数据。...对于可并行但不适合 Dask 数组或 DataFrame 等高级抽象问题,有一个“延迟”函数使用 Python 装饰器修改函数,以便它们延迟运行。...它基于 Dask-cuDF 库构建,可提供高级抽象层,从而简化大规模高性能 ETL 运算创建。...Dask-ML 是一个用于分布式和并行机器学习库,可与 Scikit-Learn 和 XGBoost 一起使用,以针对大型模型和数据创建可扩展训练和预测。

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并行计算框架Polars、Dask数据处理性能对比

测试内容 这两个脚本主要功能包括: 两个parquet 文件中提取数据,对于小型数据集,变量path1将为“yellow_tripdata/ yellow_tripdata_2014-01”,对于中等大小数据集...下面是每个库运行五次结果: Polars Dask 2、中等数据集 我们使用1.1 Gb数据集,这种类型数据集是GB级别,虽然可以完整加载到内存中,但是数据体量要比小数据集大很多。...Polars Dask 3、大数据集 我们使用一个8gb数据集,这样大数据集可能一次性加载不到内存中,需要框架处理。...Polars Dask 总结 结果中可以看出,Polars和Dask都可以使用惰性求值。...但是,Dask在大型数据集上平均时间性能为26秒。 这可能和Dask并行计算优化有关,因为官方文档说“Dask任务运行速度比Spark ETL查询快三倍,并且使用更少CPU资源”。

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安利一个Python大数据分析神器!

1、什么是Dask? Pandas和Numpy大家都不陌生了,代码运行后数据都加载到RAM中,如果数据集特别大,我们就会看到内存飙升。但有时要处理数据并不适合RAM,这时候Dask来了。...而并行处理数据就意味着更少执行时间,更少等待时间和更多分析时间。 下面这个就是Dask进行数据处理大致流程。 ? 2、Dask支持哪些现有工具?...3、Dask安装 可以使用 conda 或者 pip,或源代码安装dask 。...Dask使用是非常清晰,如果你使用NumPy数组,就从Dask数组开始,如果你使用Pandas DataFrame,就从Dask DataFrame开始,依此类推。...Dask delayed函数可修饰inc、double这些函数,以便它们可延迟运行,而不是立即执行函数,它将函数及其参数放入计算任务图中。 我们简单修改代码,用delayed函数包装一下。

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干货 | 数据分析实战案例——用户行为预测

这里关键是使用dask库来处理海量数据,它大多数操作运行速度比常规pandas等库快十倍左右。...这就是Dask DataFrame API发挥作用地方:通过为pandas提供一个包装器,可以智能将巨大DataFrame分隔成更小片段,并将它们分散到多个worker()中,并存储在磁盘中而不是...具体操作就是对每个分区并 行或单独操作(多个机器的话也可以并行),然后再将结果合并,其实直观上也能推出Dask肯定是这么做。...Dask已将数据分为几块加载,这些块存在 于磁盘上,而不存在于RAM中。如果必须输出数据,则首先需要将所有数据都放入RAM,将它们缝合在一 起,然后展示最终数据。...其实dask使用了一种延迟数 据加载机制,这种延迟机制类似于python迭代器组件,只有当需要使用数据时候才会去真正加载数据

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四种Python并行库批量处理nc数据

它提供了高级数据结构,如分布式数组Dask Array)和数据Dask DataFrame),使得用户能够在分布式内存中处理数据,就像操作常规NumPy数组或Pandas DataFrame一样...multiprocessing multiprocessing 是Python标准库一部分,用于创建多进程应用程序。它允许程序利用多核处理器能力,通过创建独立进程来执行任务,从而实现并行计算。...它特别擅长于重复任务并行执行,如交叉验证、参数扫描等,并提供了对numpy数组友好序列化机制,减少了数据传输成本。joblib一个重要特点是它智能缓存机制,可以避免重复计算,加速训练过程。...特长与区别: 特长:针对数值计算优化,高效内存缓存,易于在数据科学和机器学习中集成。 区别:相比Dask,joblib更专注于简单并行任务和数据处理,不提供复杂分布式计算能力。...小结 以上测试均为七次循环求平均 获胜者为joblib 当然只是这里任务比较特别,要是涉及到纯大型数组计算可能还是dask更胜一筹 简单说一下,当资源为2核8g或者数据量较小时,并行可能并无优势,可能调度完时循环已经跑完了

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资源 | Pandas on Ray:仅需改动一行代码,即可让Pandas加速四倍

数据科学家应该用 DataFrame 来思考,而不是动态任务图 Dask 用户一直这样问自己: 我什么时候应该通过 .compute() 触发计算,我什么时候应该调用一种方法来创建动态任务图?...这个调用在 Dask 分布式数据中是不是有效? 我什么时候应该重新分割数据? 这个调用返回Dask 数据还是 Pandas 数据?...使用 Pandas on Ray 时候,用户看到数据就像他们在看 Pandas 数据一样。...我们要速度,也要扩展性 Dask 默认是以多线程模式运行,这意味着一个 Dask 数据所有分割部分都在一个单独 Python 进程中。...尽管多线程模式让一些计算变得更快,但是一个单独 Python 进程并不能利用机器多个核心。 或者,Dask 数据可以以多进程模式运行,这种模式能够生成多个 Python 进程。

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Dask教程:使用dask.delayed并行化代码

我们将通过创建 dask.distributed.Client 来使用分布式调度器。现在,这将为我们提供一些不错诊断。稍后我们将深入讨论调度器。...一些需要考虑问题 为什么我们 3s 变成了 2s?为什么我们不能并行化到 1s? 如果 inc 和 add 函数不包括 sleep(1) 会发生什么?Dask 还能加速这段代码吗?...如果我们在上面的例子中延迟了 is_even(x) 计算会发生什么? 你对延迟 sum() 有什么看法?这个函数既是计算又运行快速。 创建数据 运行此代码以准备一些数据。...这将下载并提取 1990 年至 2000 年间纽约出发航班一些历史航班数据数据最初来自此处。...client.close() 参考 dask-tutorial https://github.com/dask/dask-tutorial Dask 教程 简介 延迟执行 相关文章 使用 Dask 并行抽取站点数据

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Python处理大数据,推荐4款加速神器

但这些库都仅仅受限于单机运算,当数据量很大时,比如50GB甚至500GB数据集,这些库处理能力都显得捉襟见肘,打开都很困难了,更别说分析了。...,能以一种更方便简洁方式处理大数据量,与Spark这些大数据处理框架相比较,Dask更轻。...GPU 上实现 Numpy 数组库。...基于 Numpy 数组实现,GPU 自身具有的多个 CUDA 核心可以促成更好并行加速。CuPy 接口是 Numpy 一个镜像,并且在大多情况下,它可以直接替换 Numpy 使用。...Vaex采用了内存映射、高效外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以在瞬间打开它(0.052 秒)。

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【科研利器】Python处理大数据,推荐4款加速神器

但这些库都仅仅受限于单机运算,当数据量很大时,比如50GB甚至500GB数据集,这些库处理能力都显得捉襟见肘,打开都很困难了,更别说分析了。...,能以一种更方便简洁方式处理大数据量,与Spark这些大数据处理框架相比较,Dask更轻。...GPU 上实现 Numpy 数组库。...基于 Numpy 数组实现,GPU 自身具有的多个 CUDA 核心可以促成更好并行加速。CuPy 接口是 Numpy 一个镜像,并且在大多情况下,它可以直接替换 Numpy 使用。...Vaex采用了内存映射、高效外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以在瞬间打开它(0.052 秒)。

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又见dask! 如何使用dask-geopandas处理大型地理数据

dask理解有问题,想要请教一下大佬 读者问题涉及到地理信息系统(GIS)操作一系列步骤,具体包括将栅格数据转换为点数据、为这些点数据添加XY坐标、通过空间连接给这些点添加行政区属性、以及计算指定行政区质心...针对这个情况,我们可以几个方面进行分析和建议: 性能瓶颈分析: ArcGIS和GeoPandas在处理大量数据时可能会遇到性能问题,特别是在普通硬件上运行时。...dask-geopandas使用: dask-geopandas旨在解决类似的性能问题,通过并行计算和延迟执行来提高处理大规模地理空间数据效率。...优化建议: 资源分配:确保有足够计算资源(CPU和内存)来处理数据。对于dask-geopandas,可以通过调整Dask工作进程数和内存限制来优化性能。...python import dask.dataframe as dd import dask_geopandas CSV 文件读取数据 ddf = dd.read_csv('...') # 使用你文件路径替换

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dask解决超高精度tif读取与绘图难问题

481805534 values with dtype=int16 那没事了 这时候就需要dask出动 什么是dask Dask 是一个灵活并行计算库,旨在处理大型数据集。...它提供了一种能够处理比内存更大数据方法,并能够以并行和延迟加载方式执行计算任务。...延迟加载: Dask 支持延迟加载(lazy evaluation),这意味着它只有在真正需要执行计算时才会加载数据并执行操作。...分布式计算: Dask 支持分布式计算,可以在分布式环境中运行,处理跨多台计算机大规模数据集。 适用范围: Dask 可以用于各种数据类型,包括数组、DataFrame 和机器学习模型等。...总之,Dask 提供了一种便捷方式来处理大型数据集,并且能够有效地进行并行计算,从而加速数据处理过程。

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Spark vs Dask Python生态下计算引擎

本文基于Gurpreet Singh大佬在 Spark+AI SUMMIT 2020 公开课编写 0x00 对于 Python 环境下开发数据科学团队,Dask 为分布式分析指出了非常明确道路,但是事实上大家都选择了...low level api中提供了延迟执行方法。...并且可以通过 Dask 提供延迟执行装饰器使用 Python 编写支持分布式自定义算法。...) Debug dask分布式模式不支持常用python debug工具 pySparkerror信息是jvm、python混在一起报出来 可视化 将大数据集抽样成小数据集,再用pandas展示...或者不希望完全重写遗留 Python 项目 你用例很复杂,或者不完全适合 Spark 计算模型(MapReduce) 你只希望本地计算过渡到集群计算,而不用学习完全不同语言生态 你希望与其他

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有比Pandas 更好替代吗?对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

主要操作包括加载,合并,排序和聚合数据 Dask-并行化数据框架 Dask主要目的是并行化任何类型python计算-数据处理,并行消息处理或机器学习。扩展计算方法是使用计算机集群功能。...看起来Dask可以非常快速地加载CSV文件,但是原因是Dask延迟操作模式。加载被推迟,直到我在聚合过程中实现结果为止。这意味着Dask仅准备加载和合并,但具体加载操作是与聚合一起执行。...他们还无法击败Pandas而 Vaex目标是做到这一点。 作者创建该库是为了使数据基础分析更加快速。Vaex虽然不支持Pandas全部功能,但可以计算基本统计信息并快速创建某些图表类型。...1.5开始,您可以通过julia -t n或julia --threads n启动julia,其中n是所需内核数。 使用更多核处理通常会更快,并且julia对开箱即用并行化有很好支持。...这就是为什么在load_identity步骤中看不到任何延迟原因,因为CSV读取之前已经进行了编译。 ? Modin 在结束有关Pandas替代品讨论之前,我必须提到Modin库。

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NumPy 高级教程——并行计算

使用 NumPy 通用函数(ufuncs) 通用函数是 NumPy 中一种机制,它允许对数组进行逐元素操作。通用函数在底层使用编译代码执行操作,因此可以实现并行计算。...import numpy as np import concurrent.futures # 创建大规模数组 arr_large = np.random.rand(1000000) # 非并行计算...使用 Dask 加速计算 Dask 是一个用于并行计算灵活工具,可以与 NumPy 结合使用,提供分布式和并行计算能力。...import dask.array as da # 将 NumPy 数组转换为 Dask 数组 arr_dask = da.from_array(arr_large, chunks=len(arr_large...使用 Cython 进行编译优化 Cython 是一种将 Python 代码转换为 C 代码工具,从而提高执行速度。通过使用 NumPy 数组,可以在 Cython 中实现并行计算。

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用于ETLPython数据转换工具详解

究竟什么不同,名字上就可以看到,人家已经将倒数据过程分成3个步骤,E、T、L分别代表抽取、转换 和装载。 其 实ETL过程就是数据流动过程,从不同数据源流向不同目标数据。...应用角度来说,ETL过程其实不是非常复杂, 这些工具给数据仓库工程带来和很大便利性,特别是开发便利和维护便利。但另一方面,开发人员容易迷失在这些工具中。...本质上讲,Dask扩展了诸如Pandas之类通用接口,供在分布式环境中使用-例如,Dask DataFrame模仿了。...使用Spark主要优点是Spark DataFrames使用分布式内存并利用延迟执行,因此它们可以使用集群处理更大数据集,而Pandas之类工具则无法实现。...使用CSV等数据格式会限制延迟执行,需要将数据转换为Parquet等其他格式 缺少对数据可视化工具(如Matplotlib和Seaborn)直接支持,这两种方法都得到了Pandas良好支持 进一步阅读

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数据科学学习手札150)基于dask对geopandas进行并行加速

2 dask-geopandas使用   很多朋友应该听说过dask,它是Python生态里非常知名高性能计算框架,可以针对大型数组数据框及机器学习模型进行并行计算调度优化,而dask-geopandas...()将其转换为dask-geopandas中可以直接操作数据框对象,其中参数npartitions用于将原始数据集划分为n个数据块,理论上分区越多并行运算速度越快,但受限于机器CPU瓶颈,通常建议设置...,可以看到,在与geopandas计算比较中,dask-geopandas取得了约3倍计算性能提升,且这种提升幅度会随着数据集规模增加而愈发明显,因为dask可以很好处理内存紧张时计算优化:...  当然,这并不代表我们可以在任何场景下用dask-geopandas代替geopandas,在常规中小型数据集上dask-geopandas反而要慢一些,因为徒增了额外分块调度消耗。   ...除了上述内容外,dask-geopandas还有一些实验性质功能,如基于地理空间分布spatial_partitions数据分块策略优化等,待它们稳定之后我会另外发文为大家介绍。

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八大工具,透析Python数据生态圈最新趋势!

Bokeh Bokeh是一个不需服务器就可以在浏览器中实现互动可视化Python库。它可以处理非常大数据集而且速度很快也能嵌入在网页当中。想要快速方便地创建互动图表和数据应用的话这个库非常有用。...Bokeh对处理大型数据集时性能问题着墨颇多。还有另外一点就是开发这些互动图表只需要Python一种语言即可。 Dask Dask是一款主要针对单机Python调度工具。...它能帮助你将数据分成块并负责并行处理调度工作。Dask是用纯Python写成,它自己也使用了一些开源Python库。...现在Python生态圈中有很多库看起来功能都差不多比如说Blaze、Dask和Numba,但其实应该用在数据处理不同层面上,做一个类比的话Blaze就相当于数据库中查询优化器,而Dask则相当于执行查询引擎...虽然API很像,但两者处理数据方式有着很大差别。Spark处理数据流时其实进行是批处理,所以其实只是流处理一个近似。平常是没有问题,但如果对延迟要求高的话Spark就会比较慢或者出错。

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